BLASTN 2.2.3 [Apr-24-2002]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= BX834944.r
(1014 letters)
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
29,161 sequences; 44,058,232 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
At1g61150.3 68414.m06891 expressed protein similar to Prote... 1966 0.0
At1g61150.1 68414.m06890 expressed protein similar to Prote... 1966 0.0
At1g61150.2 68414.m06889 expressed protein similar to Prote... 1966 0.0
At1g61160.1 68414.m06892 expressed protein 1043 0.0
At2g37570.1 68415.m04609 expressed protein 38 0.14
>At1g61150.3 68414.m06891 expressed protein similar to Protein C20orf11
(Swiss-Prot:Q9NWU2) [Homo sapiens]
Length = 2182
Score = 1966 bits (992), Expect = 0.0
Identities = 1013/1016 (99%), Gaps = 3/1016 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 ttgttttcatattttgtaacaaattattaaatgtataaaactcgatgaattattgacccg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2182 ttgttttcatattttgtaacaaattattaaatgtataaaactcgatgaattattgacccg 2123
Query: 61 cag-cagaccaggtcgatcaagacatctggtgaaccaaaaaactttgagctcacaggggt 119
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2122 caggcagaccaggtcgatcaagacatctggtgaaccaaaaaactttgagctcacaggggt 2063
Query: 120 agttggggaggaggatcagccaccccgagaagcttctgagcgcgga-ccttcgatgagtc 178
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 2062 agttggggaggaggatcagccaccccgagaagcttctgagcgcggagccttcgatgagtc 2003
Query: 179 taagctggttgacgtcaacattgccttgagctgggaagcctttgaggtgaagcaaggaac 238
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2002 taagctggttgacgtcaacattgccttgagctgggaagcctttgaggtgaagcaaggaac 1943
Query: 239 agagacagtgcgtgagtattataacgagttccttaagaaggtcaagaacctcggaagaga 298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1942 agagacagtgcgtgagtattataacgagttccttaagaaggtcaagaacctcggaagaga 1883
Query: 299 gttggaggaagagcagctggcgtgtctgttccaggaagggctacgcgaggagttgcagga 358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1882 gttggaggaagagcagctggcgtgtctgttccaggaagggctacgcgaggagttgcagga 1823
Query: 359 aggggtatgtgcagcgaactgcggatggatccttaattatgtgtcagatgtagttgatga 418
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1822 aggggtatgtgcagcgaactgcggatggatccttaattatgtgtcagatgtagttgatga 1763
Query: 419 agctgagaaggtagaggccaaacttagaagcatcaaggaaaaggtgccgctcgtgtctga 478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1762 agctgagaaggtagaggccaaacttagaagcatcaaggaaaaggtgccgctcgtgtctga 1703
Query: 479 ggagtttgcagatgttgactgcggacaaagcaatttgggccgacccgcatccgaagatga 538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1702 ggagtttgcagatgttgactgcggacaaagcaatttgggccgacccgcatccgaagatga 1643
Query: 539 ggtggagagcaaaccctccaaatcctatgatccggaagaccatatcatgcaagattgaga 598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1642 ggtggagagcaaaccctccaaatcctatgatccggaagaccatatcatgcaagattgaga 1583
Query: 599 tggctagagtcaacataaggtcttgagtcttgtggattatgtttcctattttatatatca 658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1582 tggctagagtcaacataaggtcttgagtcttgtggattatgtttcctattttatatatca 1523
Query: 659 aaaagttgctattactacttccctttatttacttcgtaccatgtcatgcaagattcaaag 718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1522 aaaagttgctattactacttccctttatttacttcgtaccatgtcatgcaagattcaaag 1463
Query: 719 ctgtgtcagtaccaaaataatattttgcgaagaagaagaaaaatcaaatgatgtttcagt 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1462 ctgtgtcagtaccaaaataatattttgcgaagaagaagaaaaatcaaatgatgtttcagt 1403
Query: 779 acggttcgcagagattctccatttcgacggtaacagcactcaattcaataggtcatgttg 838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1402 acggttcgcagagattctccatttcgacggtaacagcactcaattcaataggtcatgttg 1343
Query: 839 ctttctaggtaagtaggaaccgtgccaagttgattcattgattcatgtaactatacatgg 898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1342 ctttctaggtaagtaggaaccgtgccaagttgattcattgattcatgtaactatacatgg 1283
Query: 899 gatgaataagccatctctcttgtttacaattcgaacctttttggaacaaaaatattcctc 958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1282 gatgaataagccatctctcttgtttacaattcgaacc-ttttggaacaaaaatattcctc 1224
Query: 959 aaaacaaacacaaagatccaaacaaagtcgataacttcattcaaatcaaatgcacg 1014
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1223 aaaacaaacacaaagatccaaacaaagtcgataacttcattcaaatcaaatgcacg 1168
>At1g61150.1 68414.m06890 expressed protein similar to Protein C20orf11
(Swiss-Prot:Q9NWU2) [Homo sapiens]
Length = 2117
Score = 1966 bits (992), Expect = 0.0
Identities = 1013/1016 (99%), Gaps = 3/1016 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 ttgttttcatattttgtaacaaattattaaatgtataaaactcgatgaattattgacccg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2117 ttgttttcatattttgtaacaaattattaaatgtataaaactcgatgaattattgacccg 2058
Query: 61 cag-cagaccaggtcgatcaagacatctggtgaaccaaaaaactttgagctcacaggggt 119
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2057 caggcagaccaggtcgatcaagacatctggtgaaccaaaaaactttgagctcacaggggt 1998
Query: 120 agttggggaggaggatcagccaccccgagaagcttctgagcgcgga-ccttcgatgagtc 178
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 1997 agttggggaggaggatcagccaccccgagaagcttctgagcgcggagccttcgatgagtc 1938
Query: 179 taagctggttgacgtcaacattgccttgagctgggaagcctttgaggtgaagcaaggaac 238
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1937 taagctggttgacgtcaacattgccttgagctgggaagcctttgaggtgaagcaaggaac 1878
Query: 239 agagacagtgcgtgagtattataacgagttccttaagaaggtcaagaacctcggaagaga 298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1877 agagacagtgcgtgagtattataacgagttccttaagaaggtcaagaacctcggaagaga 1818
Query: 299 gttggaggaagagcagctggcgtgtctgttccaggaagggctacgcgaggagttgcagga 358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1817 gttggaggaagagcagctggcgtgtctgttccaggaagggctacgcgaggagttgcagga 1758
Query: 359 aggggtatgtgcagcgaactgcggatggatccttaattatgtgtcagatgtagttgatga 418
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1757 aggggtatgtgcagcgaactgcggatggatccttaattatgtgtcagatgtagttgatga 1698
Query: 419 agctgagaaggtagaggccaaacttagaagcatcaaggaaaaggtgccgctcgtgtctga 478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1697 agctgagaaggtagaggccaaacttagaagcatcaaggaaaaggtgccgctcgtgtctga 1638
Query: 479 ggagtttgcagatgttgactgcggacaaagcaatttgggccgacccgcatccgaagatga 538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1637 ggagtttgcagatgttgactgcggacaaagcaatttgggccgacccgcatccgaagatga 1578
Query: 539 ggtggagagcaaaccctccaaatcctatgatccggaagaccatatcatgcaagattgaga 598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1577 ggtggagagcaaaccctccaaatcctatgatccggaagaccatatcatgcaagattgaga 1518
Query: 599 tggctagagtcaacataaggtcttgagtcttgtggattatgtttcctattttatatatca 658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1517 tggctagagtcaacataaggtcttgagtcttgtggattatgtttcctattttatatatca 1458
Query: 659 aaaagttgctattactacttccctttatttacttcgtaccatgtcatgcaagattcaaag 718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1457 aaaagttgctattactacttccctttatttacttcgtaccatgtcatgcaagattcaaag 1398
Query: 719 ctgtgtcagtaccaaaataatattttgcgaagaagaagaaaaatcaaatgatgtttcagt 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1397 ctgtgtcagtaccaaaataatattttgcgaagaagaagaaaaatcaaatgatgtttcagt 1338
Query: 779 acggttcgcagagattctccatttcgacggtaacagcactcaattcaataggtcatgttg 838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1337 acggttcgcagagattctccatttcgacggtaacagcactcaattcaataggtcatgttg 1278
Query: 839 ctttctaggtaagtaggaaccgtgccaagttgattcattgattcatgtaactatacatgg 898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1277 ctttctaggtaagtaggaaccgtgccaagttgattcattgattcatgtaactatacatgg 1218
Query: 899 gatgaataagccatctctcttgtttacaattcgaacctttttggaacaaaaatattcctc 958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1217 gatgaataagccatctctcttgtttacaattcgaacc-ttttggaacaaaaatattcctc 1159
Query: 959 aaaacaaacacaaagatccaaacaaagtcgataacttcattcaaatcaaatgcacg 1014
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1158 aaaacaaacacaaagatccaaacaaagtcgataacttcattcaaatcaaatgcacg 1103
>At1g61150.2 68414.m06889 expressed protein similar to Protein C20orf11
(Swiss-Prot:Q9NWU2) [Homo sapiens]
Length = 2118
Score = 1966 bits (992), Expect = 0.0
Identities = 1013/1016 (99%), Gaps = 3/1016 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 ttgttttcatattttgtaacaaattattaaatgtataaaactcgatgaattattgacccg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2118 ttgttttcatattttgtaacaaattattaaatgtataaaactcgatgaattattgacccg 2059
Query: 61 cag-cagaccaggtcgatcaagacatctggtgaaccaaaaaactttgagctcacaggggt 119
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2058 caggcagaccaggtcgatcaagacatctggtgaaccaaaaaactttgagctcacaggggt 1999
Query: 120 agttggggaggaggatcagccaccccgagaagcttctgagcgcgga-ccttcgatgagtc 178
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 1998 agttggggaggaggatcagccaccccgagaagcttctgagcgcggagccttcgatgagtc 1939
Query: 179 taagctggttgacgtcaacattgccttgagctgggaagcctttgaggtgaagcaaggaac 238
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1938 taagctggttgacgtcaacattgccttgagctgggaagcctttgaggtgaagcaaggaac 1879
Query: 239 agagacagtgcgtgagtattataacgagttccttaagaaggtcaagaacctcggaagaga 298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1878 agagacagtgcgtgagtattataacgagttccttaagaaggtcaagaacctcggaagaga 1819
Query: 299 gttggaggaagagcagctggcgtgtctgttccaggaagggctacgcgaggagttgcagga 358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1818 gttggaggaagagcagctggcgtgtctgttccaggaagggctacgcgaggagttgcagga 1759
Query: 359 aggggtatgtgcagcgaactgcggatggatccttaattatgtgtcagatgtagttgatga 418
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1758 aggggtatgtgcagcgaactgcggatggatccttaattatgtgtcagatgtagttgatga 1699
Query: 419 agctgagaaggtagaggccaaacttagaagcatcaaggaaaaggtgccgctcgtgtctga 478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1698 agctgagaaggtagaggccaaacttagaagcatcaaggaaaaggtgccgctcgtgtctga 1639
Query: 479 ggagtttgcagatgttgactgcggacaaagcaatttgggccgacccgcatccgaagatga 538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1638 ggagtttgcagatgttgactgcggacaaagcaatttgggccgacccgcatccgaagatga 1579
Query: 539 ggtggagagcaaaccctccaaatcctatgatccggaagaccatatcatgcaagattgaga 598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1578 ggtggagagcaaaccctccaaatcctatgatccggaagaccatatcatgcaagattgaga 1519
Query: 599 tggctagagtcaacataaggtcttgagtcttgtggattatgtttcctattttatatatca 658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1518 tggctagagtcaacataaggtcttgagtcttgtggattatgtttcctattttatatatca 1459
Query: 659 aaaagttgctattactacttccctttatttacttcgtaccatgtcatgcaagattcaaag 718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1458 aaaagttgctattactacttccctttatttacttcgtaccatgtcatgcaagattcaaag 1399
Query: 719 ctgtgtcagtaccaaaataatattttgcgaagaagaagaaaaatcaaatgatgtttcagt 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1398 ctgtgtcagtaccaaaataatattttgcgaagaagaagaaaaatcaaatgatgtttcagt 1339
Query: 779 acggttcgcagagattctccatttcgacggtaacagcactcaattcaataggtcatgttg 838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1338 acggttcgcagagattctccatttcgacggtaacagcactcaattcaataggtcatgttg 1279
Query: 839 ctttctaggtaagtaggaaccgtgccaagttgattcattgattcatgtaactatacatgg 898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1278 ctttctaggtaagtaggaaccgtgccaagttgattcattgattcatgtaactatacatgg 1219
Query: 899 gatgaataagccatctctcttgtttacaattcgaacctttttggaacaaaaatattcctc 958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1218 gatgaataagccatctctcttgtttacaattcgaacc-ttttggaacaaaaatattcctc 1160
Query: 959 aaaacaaacacaaagatccaaacaaagtcgataacttcattcaaatcaaatgcacg 1014
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1159 aaaacaaacacaaagatccaaacaaagtcgataacttcattcaaatcaaatgcacg 1104
>At1g61160.1 68414.m06892 expressed protein
Length = 540
Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0
Identities = 533/534 (99%), Gaps = 1/534 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 64 cagaccaggtcgatcaagacatctggtgaaccaaaaaactttgagctcacaggggtagtt 123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 7 cagaccaggtcgatcaagacatctggtgaaccaaaaaactttgagctcacaggggtagtt 66
Query: 124 ggggaggaggatcagccaccccgagaagcttctgagcgcgga-ccttcgatgagtctaag 182
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 67 ggggaggaggatcagccaccccgagaagcttctgagcgcggagccttcgatgagtctaag 126
Query: 183 ctggttgacgtcaacattgccttgagctgggaagcctttgaggtgaagcaaggaacagag 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 127 ctggttgacgtcaacattgccttgagctgggaagcctttgaggtgaagcaaggaacagag 186
Query: 243 acagtgcgtgagtattataacgagttccttaagaaggtcaagaacctcggaagagagttg 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 187 acagtgcgtgagtattataacgagttccttaagaaggtcaagaacctcggaagagagttg 246
Query: 303 gaggaagagcagctggcgtgtctgttccaggaagggctacgcgaggagttgcaggaaggg 362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 247 gaggaagagcagctggcgtgtctgttccaggaagggctacgcgaggagttgcaggaaggg 306
Query: 363 gtatgtgcagcgaactgcggatggatccttaattatgtgtcagatgtagttgatgaagct 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 307 gtatgtgcagcgaactgcggatggatccttaattatgtgtcagatgtagttgatgaagct 366
Query: 423 gagaaggtagaggccaaacttagaagcatcaaggaaaaggtgccgctcgtgtctgaggag 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 367 gagaaggtagaggccaaacttagaagcatcaaggaaaaggtgccgctcgtgtctgaggag 426
Query: 483 tttgcagatgttgactgcggacaaagcaatttgggccgacccgcatccgaagatgaggtg 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 427 tttgcagatgttgactgcggacaaagcaatttgggccgacccgcatccgaagatgaggtg 486
Query: 543 gagagcaaaccctccaaatcctatgatccggaagaccatatcatgcaagattga 596
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 487 gagagcaaaccctccaaatcctatgatccggaagaccatatcatgcaagattga 540
>At2g37570.1 68415.m04609 expressed protein
Length = 2497
Score = 38.2 bits (19), Expect = 0.14
Identities = 19/19 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 747 gaagaagaagaaaaatcaa 765
|||||||||||||||||||
Sbjct: 4 gaagaagaagaaaaatcaa 22
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
Posted date: Jun 25, 2004 12:58 PM
Number of letters in database: 44,058,232
Number of sequences in database: 29,161
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 44,889
Number of Sequences: 29161
Number of extensions: 44889
Number of successful extensions: 1339
Number of sequences better than 10.0: 103
length of query: 1014
length of database: 44,058,232
effective HSP length: 18
effective length of query: 996
effective length of database: 43,533,334
effective search space: 43359200664
effective search space used: 43359200664
T: 0
A: 40
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 16 (32.2 bits)