BLASTN 2.2.3 [Apr-24-2002]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= ycF2.F
(6885 letters)
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
29,161 sequences; 44,058,232 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
AtCg00860 ycf2.1#hypothetical protein 1.365e+04 0.0
AtCg01280 ycf2.2#hypothetical protein 1.365e+04 0.0
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At5g37680.1 68418.m04538 ADP-ribosylation factor, putative ... 42 0.062
At5g10900.1 68418.m01265 calcineurin-like phosphoesterase f... 40 0.25
>AtCg00860 ycf2.1#hypothetical protein
Length = 6885
Score = 1.365e+04 bits (6885), Expect = 0.0
Identities = 6885/6885 (100%)
Strand = Plus / Plus
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apospory-associated protein C; APOC [Chlamydomonas
reinhardtii] GI:6970044; contains Pfam profile PF01263:
Aldose 1-epimerase
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Strand = Plus / Plus
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Sbjct: 1 aatccttttccttcttcttgttgc 24
>At5g37680.1 68418.m04538 ADP-ribosylation factor, putative ADP-ribosylation
factor, Leishmania major, EMBL:LMFP1421 and
ADP-ribosylation factor-like protein 1 (ARL1) (SP:P40616)
Homo sapiens; contains PF00025: ADP-ribosylation factor
family
Length = 886
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Strand = Plus / Plus
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Sbjct: 107 ttcgaaaagatcaaatctttg 127
>At5g10900.1 68418.m01265 calcineurin-like phosphoesterase family protein contains
Pfam profile: PF00149 calcineurin-like phosphoesterase
Length = 1803
Score = 40.1 bits (20), Expect = 0.25
Identities = 23/24 (95%)
Strand = Plus / Minus
Query: 893 agcatgtttcccatctcttctcga 916
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Sbjct: 1343 agcatgtttcccatgtcttctcga 1320
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
Posted date: Jun 25, 2004 12:58 PM
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Lambda K H
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