BLASTN 2.2.3 [Apr-24-2002]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= At5g55820.F
(5481 letters)
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
29,161 sequences; 44,058,232 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
At5g55820.1 68418.m06956 expressed protein 1.087e+04 0.0
At2g35020.1 68415.m04296 UTP--glucose-1-phosphate uridylylt... 46 0.003
At1g12830.1 68414.m01490 expressed protein 46 0.003
At5g63740.1 68418.m08000 zinc finger protein-related 44 0.013
At2g05400.1 68415.m00568 meprin and TRAF homology domain-co... 42 0.050
>At5g55820.1 68418.m06956 expressed protein
Length = 5481
Score = 1.087e+04 bits (5481), Expect = 0.0
Identities = 5481/5481 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgatcagggacagcgaaaataagacgacgacggcgaaagtattaaaagatagagagaaa 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atgatcagggacagcgaaaataagacgacgacggcgaaagtattaaaagatagagagaaa 60
Query: 61 cgacatcgtatgaaaaagagtaggtcgtcggcgatgttttccgtcaaggagaatccgagg 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 cgacatcgtatgaaaaagagtaggtcgtcggcgatgttttccgtcaaggagaatccgagg 120
Query: 121 gggaagacggcgaatgtgaagattgagaatcttttcgttcagatctttgagaggaagagg 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gggaagacggcgaatgtgaagattgagaatcttttcgttcagatctttgagaggaagagg 180
Query: 181 cgaatcgtcgagcaggttcagcaacaagtagatctctatgaccagcatttagcttccaaa 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 cgaatcgtcgagcaggttcagcaacaagtagatctctatgaccagcatttagcttccaaa 240
Query: 241 tgcctactcgccggagtatctcctccgtcgtggctctggtctccgtctctaccttcccaa 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tgcctactcgccggagtatctcctccgtcgtggctctggtctccgtctctaccttcccaa 300
Query: 301 acttccgagttaaataaggaggagattatatcagaacttctatttccttcatcaagacct 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 acttccgagttaaataaggaggagattatatcagaacttctatttccttcatcaagacct 360
Query: 361 tccatcgtttgtcctagcagtcgtcccttttcataccaacggcctgtcaggtttctagct 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 tccatcgtttgtcctagcagtcgtcccttttcataccaacggcctgtcaggtttctagct 420
Query: 421 gacaatgtagtaagacaagacctgacctctgtggtaaataacccgctagaagagcagttg 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gacaatgtagtaagacaagacctgacctctgtggtaaataacccgctagaagagcagttg 480
Query: 481 cttgaagaggaaccgcaacacaacctctcacacaacttagtcagacaagtttcgaatcat 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 cttgaagaggaaccgcaacacaacctctcacacaacttagtcagacaagtttcgaatcat 540
Query: 541 tctcatgagcaggatgttaatattgcatctcctagagatgtacatgagaaagagagattg 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 tctcatgagcaggatgttaatattgcatctcctagagatgtacatgagaaagagagattg 600
Query: 601 ccagaaagtgtctcaatcgattgcagagagaatcaaagttgttcatctcccgaacactcc 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 ccagaaagtgtctcaatcgattgcagagagaatcaaagttgttcatctcccgaacactcc 660
Query: 661 aagaatcagagagttgaaactaatcttgatgctacatctcctggatgtagccaaggggaa 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 aagaatcagagagttgaaactaatcttgatgctacatctcctggatgtagccaaggggaa 720
Query: 721 aaggttcccaaatgtgtctcaactactggttgtaagcggaaatcttcatctcttggttat 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 aaggttcccaaatgtgtctcaactactggttgtaagcggaaatcttcatctcttggttat 780
Query: 781 tgtcaagaggaaattgaaccagacacttgcattgaccctggattatcacttgctaagatg 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 tgtcaagaggaaattgaaccagacacttgcattgaccctggattatcacttgctaagatg 840
Query: 841 cagagatcaaggtcacgtcaaaaagctttggagcttcgtagtagtgcaaaagcgtcaaaa 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 cagagatcaaggtcacgtcaaaaagctttggagcttcgtagtagtgcaaaagcgtcaaaa 900
Query: 901 agccgttcaaacagtagaaatgagctcaaaccttctccgggtggtgatataggctttggg 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 agccgttcaaacagtagaaatgagctcaaaccttctccgggtggtgatataggctttggg 960
Query: 961 attgcttcattaaggtctgatagtgttagtgagataaagttatttaagcatgatgaaaat 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 attgcttcattaaggtctgatagtgttagtgagataaagttatttaagcatgatgaaaat 1020
Query: 1021 gatgaagagtgtcgagaagaagtggagaacagtaattctcaaggtaaaagaggagatcaa 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 gatgaagagtgtcgagaagaagtggagaacagtaattctcaaggtaaaagaggagatcaa 1080
Query: 1081 tgtattaagattagtgtacctacagagtcttttaccttgcatcatgaagtggattcagtg 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 tgtattaagattagtgtacctacagagtcttttaccttgcatcatgaagtggattcagtg 1140
Query: 1141 tcaatatcttcaagtggtgatgcttatgcttctattgtaccagaatgtctactcgagtct 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 tcaatatcttcaagtggtgatgcttatgcttctattgtaccagaatgtctactcgagtct 1200
Query: 1201 ggtcatgtgaatgacattgatatattacagtccattgagacaattgatgaagcgtctggc 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1201 ggtcatgtgaatgacattgatatattacagtccattgagacaattgatgaagcgtctggc 1260
Query: 1261 aaagtagatgagcaagtggatgatcccaaaagcagaagttgctatgaaacagcttatctc 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1261 aaagtagatgagcaagtggatgatcccaaaagcagaagttgctatgaaacagcttatctc 1320
Query: 1321 gatggaagtacaagatctaaaagctcaattcaagataactccaagaggaaacatcaaaaa 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1321 gatggaagtacaagatctaaaagctcaattcaagataactccaagaggaaacatcaaaaa 1380
Query: 1381 tcaagcaactccttttctggtaattttctgttaacaaattcaaatccctctcactgggct 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1381 tcaagcaactccttttctggtaattttctgttaacaaattcaaatccctctcactgggct 1440
Query: 1441 gatcatgaagtagaattacctcaagcaataactacgactagtgaagtttctatggtgaca 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1441 gatcatgaagtagaattacctcaagcaataactacgactagtgaagtttctatggtgaca 1500
Query: 1501 gatgcgggaacgagcatctttcagtctgaaatcattgcaagatctagaagtaatgctcga 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1501 gatgcgggaacgagcatctttcagtctgaaatcattgcaagatctagaagtaatgctcga 1560
Query: 1561 gaaaatagatccaagaccgagcattcaggctctgttgagtcttcttcaattaacttggag 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1561 gaaaatagatccaagaccgagcattcaggctctgttgagtcttcttcaattaacttggag 1620
Query: 1621 ccaagagattcaattccagtactgcaaggtagccatgtaaaagattcactgaatccctct 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1621 ccaagagattcaattccagtactgcaaggtagccatgtaaaagattcactgaatccctct 1680
Query: 1681 agtgttgatgctgaaggtttagtagttgaaaatattactagcagcgatcaatcaaaagaa 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1681 agtgttgatgctgaaggtttagtagttgaaaatattactagcagcgatcaatcaaaagaa 1740
Query: 1741 acgggtgaatgtgttgacactaacagatgttcaagtgctgaaagggtaagccaaactggt 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1741 acgggtgaatgtgttgacactaacagatgttcaagtgctgaaagggtaagccaaactggt 1800
Query: 1801 atctccccagatgagaccacatttgcgggtgcaatccaagactctatatcccagatcgag 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1801 atctccccagatgagaccacatttgcgggtgcaatccaagactctatatcccagatcgag 1860
Query: 1861 cttttgagctttgttgagtcctcttcaattgaactgcagtcgagacactcagtcaagcaa 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1861 cttttgagctttgttgagtcctcttcaattgaactgcagtcgagacactcagtcaagcaa 1920
Query: 1921 tcagacgatgaaagtgtattgttgaagcccgttactgttaatggcgaagctttattagtg 1980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1921 tcagacgatgaaagtgtattgttgaagcccgttactgttaatggcgaagctttattagtg 1980
Query: 1981 gaggaagataacaatggtgagtcaactgaaattagcggtatttcaaaatctagaagttta 2040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1981 gaggaagataacaatggtgagtcaactgaaattagcggtatttcaaaatctagaagttta 2040
Query: 2041 agccaaactgacatcacggtagttttgccagtggtggtggaatctattcttaatgaaagt 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2041 agccaaactgacatcacggtagttttgccagtggtggtggaatctattcttaatgaaagt 2100
Query: 2101 ggtactccggaaaaattgattgaccattctaaaagatgtgatatcagttgtgggtccaag 2160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2101 ggtactccggaaaaattgattgaccattctaaaagatgtgatatcagttgtgggtccaag 2160
Query: 2161 gaagtacagccactgggttcattgaccgaagtggggagtaaccaaagccatggaataatt 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2161 gaagtacagccactgggttcattgaccgaagtggggagtaaccaaagccatggaataatt 2220
Query: 2221 agtagggcaagaagctcactcatagaagaggaatcagcaaatgactataaggctctttct 2280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2221 agtagggcaagaagctcactcatagaagaggaatcagcaaatgactataaggctctttct 2280
Query: 2281 gatgggtctaatcataaatcggctgacaaacaacttgaagttagagaaggaaattcattg 2340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2281 gatgggtctaatcataaatcggctgacaaacaacttgaagttagagaaggaaattcattg 2340
Query: 2341 ctgagaacccctgatcgccctgtttttgtggacaacttcgatgaggttccagagaatagt 2400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2341 ctgagaacccctgatcgccctgtttttgtggacaacttcgatgaggttccagagaatagt 2400
Query: 2401 cgagaaaaatcaagcatggagaaggtccccaccccagcacccaccgcaagggtgtttgat 2460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2401 cgagaaaaatcaagcatggagaaggtccccaccccagcacccaccgcaagggtgtttgat 2460
Query: 2461 gtcccatctctcactgattctggagtaaatttatcggcaaacaatgaaatgaatgacatt 2520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2461 gtcccatctctcactgattctggagtaaatttatcggcaaacaatgaaatgaatgacatt 2520
Query: 2521 gaagatcacaatgggttaaacatagaaatggtagcagaaatggaatcgtatgcaagccac 2580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2521 gaagatcacaatgggttaaacatagaaatggtagcagaaatggaatcgtatgcaagccac 2580
Query: 2581 cctggcttaaaagtgggagagaatgaacctacagagtcaaatacattcactggccatata 2640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2581 cctggcttaaaagtgggagagaatgaacctacagagtcaaatacattcactggccatata 2640
Query: 2641 gatgcattgacaaagagacctcaacatgaaacatcctctgaaaaagctgttcccccaatt 2700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2641 gatgcattgacaaagagacctcaacatgaaacatcctctgaaaaagctgttcccccaatt 2700
Query: 2701 aaaagagatgtaacatgtacagaagcagatgaatgtcatgatctagagagcccgattcaa 2760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2701 aaaagagatgtaacatgtacagaagcagatgaatgtcatgatctagagagcccgattcaa 2760
Query: 2761 gaatttttctgctctagttcccccatggggggttccatgcggcagaataagcggagaaga 2820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2761 gaatttttctgctctagttcccccatggggggttccatgcggcagaataagcggagaaga 2820
Query: 2821 atcctggaaaaaccaactagaagagagctttcgtcaagtccagggggagacattctcgag 2880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2821 atcctggaaaaaccaactagaagagagctttcgtcaagtccagggggagacattctcgag 2880
Query: 2881 tcagattatgttagggaagcagtacatcatagggaggaagccgcatgtcacaacgtcgat 2940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2881 tcagattatgttagggaagcagtacatcatagggaggaagccgcatgtcacaacgtcgat 2940
Query: 2941 aactatgacgttgagttacagaagttgattggatctgcatcttcacatcactatagtgtt 3000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2941 aactatgacgttgagttacagaagttgattggatctgcatcttcacatcactatagtgtt 3000
Query: 3001 gagttacaaaaaatgattggatctgcatcgtcagctgagttacgatttgaagagggagac 3060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3001 gagttacaaaaaatgattggatctgcatcgtcagctgagttacgatttgaagagggagac 3060
Query: 3061 attctcgagtcagattatgttagagaagcagtacatcatagggaggaagccgcatgtcac 3120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3061 attctcgagtcagattatgttagagaagcagtacatcatagggaggaagccgcatgtcac 3120
Query: 3121 aacgtcgataactatgacgttgagttacagaagttgattggatctgcatcttcacatcac 3180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3121 aacgtcgataactatgacgttgagttacagaagttgattggatctgcatcttcacatcac 3180
Query: 3181 tatagtgttgagttacaaaaaatgattggatctgcatcgtcagctgagttacgatttgaa 3240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3181 tatagtgttgagttacaaaaaatgattggatctgcatcgtcagctgagttacgatttgaa 3240
Query: 3241 gagagttatttactcaaggaagctggattgatgagtcctgcctcgctttcctacagaaca 3300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3241 gagagttatttactcaaggaagctggattgatgagtcctgcctcgctttcctacagaaca 3300
Query: 3301 gaacagctaagtgtacagaggagtcaaattgctccagatcacagagttggatcagaaaat 3360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3301 gaacagctaagtgtacagaggagtcaaattgctccagatcacagagttggatcagaaaat 3360
Query: 3361 attaacttttttccatatgctggtgaaacctcacatggattagctagttgtattgttcgc 3420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3361 attaacttttttccatatgctggtgaaacctcacatggattagctagttgtattgttcgc 3420
Query: 3421 gactcagatagttctccttgcttaacacccttgggtttgataagctcagacgatggaagc 3480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3421 gactcagatagttctccttgcttaacacccttgggtttgataagctcagacgatggaagc 3480
Query: 3481 ccccctgtcttggagggttttattatccagactgatgatgaaaatcaaagcggctccaaa 3540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3481 ccccctgtcttggagggttttattatccagactgatgatgaaaatcaaagcggctccaaa 3540
Query: 3541 aaccagttaaatcatgacagcttccaacttccaagaactacagcagaaagtgcagccatg 3600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3541 aaccagttaaatcatgacagcttccaacttccaagaactacagcagaaagtgcagccatg 3600
Query: 3601 atagagcagatttgcaagtctgcttgcatgaacactccgtcattacatctggctaaaaca 3660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3601 atagagcagatttgcaagtctgcttgcatgaacactccgtcattacatctggctaaaaca 3660
Query: 3661 tttaagttcgatgaaaaactagacttggatcagtctgtttcaaccgagctgtttgatggc 3720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3661 tttaagttcgatgaaaaactagacttggatcagtctgtttcaaccgagctgtttgatggc 3720
Query: 3721 atgtttttcagtcagaatctcgagggtagctctgtctttgataacttggggattaaccat 3780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3721 atgtttttcagtcagaatctcgagggtagctctgtctttgataacttggggattaaccat 3780
Query: 3781 gattatacaggaagatcgtacactgactctttgcctggtactggctcatctgctgaggct 3840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3781 gattatacaggaagatcgtacactgactctttgcctggtactggctcatctgctgaggct 3840
Query: 3841 aggaatccttgcatgtcaccaactgagaagctgtggtatagaagtttgcaaaagtcttcc 3900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3841 aggaatccttgcatgtcaccaactgagaagctgtggtatagaagtttgcaaaagtcttcc 3900
Query: 3901 agttcagagaaacgaagcactcagacaccagacctaccttgcattagcgaagagaatgag 3960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3901 agttcagagaaacgaagcactcagacaccagacctaccttgcattagcgaagagaatgag 3960
Query: 3961 aacatagaagaggaagctgagaacttatgtacgaacactccaaagtctatgaggtcagag 4020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3961 aacatagaagaggaagctgagaacttatgtacgaacactccaaagtctatgaggtcagag 4020
Query: 4021 aagcgaggaagttcaattccggaacttccttgcatagctgaagagaacgaaaacatagat 4080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4021 aagcgaggaagttcaattccggaacttccttgcatagctgaagagaacgaaaacatagat 4080
Query: 4081 gagatatctgatgctgtcaatgaagcatctggttctgaaagggagaatgtgtctgctgaa 4140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4081 gagatatctgatgctgtcaatgaagcatctggttctgaaagggagaatgtgtctgctgaa 4140
Query: 4141 aggaaacctcttggtgatgttaatgaagatcctatgaagcttcttccatctgtttctgaa 4200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4141 aggaaacctcttggtgatgttaatgaagatcctatgaagcttcttccatctgtttctgaa 4200
Query: 4201 gccaagattcctgccgatagacagagtctagactctgtcagtactgcattcagcttttca 4260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4201 gccaagattcctgccgatagacagagtctagactctgtcagtactgcattcagcttttca 4260
Query: 4261 gctaagtgcaacagtgtcaaaagtaaagtgggaaagctgagtaaccgaagattcacgggt 4320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4261 gctaagtgcaacagtgtcaaaagtaaagtgggaaagctgagtaaccgaagattcacgggt 4320
Query: 4321 aaaggtaaagagaaccaaggtggagcaggtgctaaaagaaatgttaaaccgcctagtagc 4380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4321 aaaggtaaagagaaccaaggtggagcaggtgctaaaagaaatgttaaaccgcctagtagc 4380
Query: 4381 aggttcagtaagcctaagttgtcttgcaactcgagtttgacaactgtaggtccacggtta 4440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4381 aggttcagtaagcctaagttgtcttgcaactcgagtttgacaactgtaggtccacggtta 4440
Query: 4441 caagaaaaagaacctaggcacaacaacattgtctcaaacatcacttcgttcgttccacta 4500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4441 caagaaaaagaacctaggcacaacaacattgtctcaaacatcacttcgttcgttccacta 4500
Query: 4501 gtgcagcagcaaaaaccagcacctgcactaattacagggaaaagggatgtcaaagtaaag 4560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4501 gtgcagcagcaaaaaccagcacctgcactaattacagggaaaagggatgtcaaagtaaag 4560
Query: 4561 gccctggaggctgctgaggcttcaaaacgtattgctgaacagaaagagaatgatcgtaag 4620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4561 gccctggaggctgctgaggcttcaaaacgtattgctgaacagaaagagaatgatcgtaag 4620
Query: 4621 ctgaagaaggaagctatgaagcttgaacgggcaaaacaggaacaggaaaatctgaaaaag 4680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4621 ctgaagaaggaagctatgaagcttgaacgggcaaaacaggaacaggaaaatctgaaaaag 4680
Query: 4681 caagagatagagaagaaaaagaaagaagaagatcgaaagaaaaaggaggcagaaatggct 4740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4681 caagagatagagaagaaaaagaaagaagaagatcgaaagaaaaaggaggcagaaatggct 4740
Query: 4741 tggaagcaggagatggaaaagaaaaagaaagaagaagaaaggaagagaaaggagtttgaa 4800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4741 tggaagcaggagatggaaaagaaaaagaaagaagaagaaaggaagagaaaggagtttgaa 4800
Query: 4801 atggctgataggaaaaggcagagggaagaagaagacaaaaggttgaaggaagctaaaaaa 4860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4801 atggctgataggaaaaggcagagggaagaagaagacaaaaggttgaaggaagctaaaaaa 4860
Query: 4861 agacaacgcattgcagattttcaaagacaacaaagagaggctgatgaaaagcttcaagct 4920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4861 agacaacgcattgcagattttcaaagacaacaaagagaggctgatgaaaagcttcaagct 4920
Query: 4921 gaaaaagaattgaaaagacaagctatggatgcgagaataaaagcacaaaaggaactcaaa 4980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4921 gaaaaagaattgaaaagacaagctatggatgcgagaataaaagcacaaaaggaactcaaa 4980
Query: 4981 gaagaccaaaataatgctgagaaaaccaggcaagcgaattctaggatcccagcggtgaga 5040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4981 gaagaccaaaataatgctgagaaaaccaggcaagcgaattctaggatcccagcggtgaga 5040
Query: 5041 tcaaagagtaattctagtgatgataccaatgcttcaagaagctctagagaaaatgatttc 5100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5041 tcaaagagtaattctagtgatgataccaatgcttcaagaagctctagagaaaatgatttc 5100
Query: 5101 aaggtgataagcaatccagggaacatgtctgaagaagccaacatgggaattgaagaaatg 5160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5101 aaggtgataagcaatccagggaacatgtctgaagaagccaacatgggaattgaagaaatg 5160
Query: 5161 gaagagtcgtacaacatctctccatacaaatgctcagatgacgaagatgaagaggaagac 5220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5161 gaagagtcgtacaacatctctccatacaaatgctcagatgacgaagatgaagaggaagac 5220
Query: 5221 gacaatgacgacatgtccaacaaaaaattcgctcctacttgggccagcaagagcaatgta 5280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5221 gacaatgacgacatgtccaacaaaaaattcgctcctacttgggccagcaagagcaatgta 5280
Query: 5281 cggctcgctgtcatttcccaacaaaacattgatcccgatgttacttttcctgcaaaaagc 5340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5281 cggctcgctgtcatttcccaacaaaacattgatcccgatgttacttttcctgcaaaaagc 5340
Query: 5341 gcctgtgatataagtaacggttctgttgattttcctagtggaaagagccaggtgctgaaa 5400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5341 gcctgtgatataagtaacggttctgttgattttcctagtggaaagagccaggtgctgaaa 5400
Query: 5401 gcaagagatttgttctttttcaatataaccaaattctcactacttttcaatgtcgacttc 5460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5401 gcaagagatttgttctttttcaatataaccaaattctcactacttttcaatgtcgacttc 5460
Query: 5461 gtcaaaataacttttggataa 5481
|||||||||||||||||||||
Sbjct: 5461 gtcaaaataacttttggataa 5481
Score = 40.1 bits (20), Expect = 0.20
Identities = 20/20 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 4220 gacagagtctagactctgtc 4239
||||||||||||||||||||
Sbjct: 4239 gacagagtctagactctgtc 4220
>At2g35020.1 68415.m04296 UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase family
protein similar to SP|Q16222 UDP-N-acetylhexosamine
pyrophosphorylase (Antigen X) {Homo sapiens}; contains
Pfam profile PF01704: UTP--glucose-1-phosphate
uridylyltransferase
Length = 1813
Score = 46.1 bits (23), Expect = 0.003
Identities = 26/27 (96%)
Strand = Plus / Minus
Query: 4687 atagagaagaaaaagaaagaagaagat 4713
||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 1627 atagataagaaaaagaaagaagaagat 1601
Score = 40.1 bits (20), Expect = 0.20
Identities = 20/20 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 4759 aagaaaaagaaagaagaaga 4778
||||||||||||||||||||
Sbjct: 1621 aagaaaaagaaagaagaaga 1602
>At1g12830.1 68414.m01490 expressed protein
Length = 921
Score = 46.1 bits (23), Expect = 0.003
Identities = 26/27 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5197 gatgacgaagatgaagaggaagacgac 5223
||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 412 gatgaagaagatgaagaggaagacgac 438
>At5g63740.1 68418.m08000 zinc finger protein-related
Length = 681
Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.013
Identities = 22/22 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1010 atgatgaaaatgatgaagagtg 1031
||||||||||||||||||||||
Sbjct: 383 atgatgaaaatgatgaagagtg 404
>At2g05400.1 68415.m00568 meprin and TRAF homology domain-containing protein /
MATH domain-containing protein supported by tandem
duplication of meprin and TRAF homology (MATH) domain
protein (GI:4914358) (TIGR_Ath1:At2g05420) [Arabidopsis
thaliana]
Length = 1415
Score = 42.1 bits (21), Expect = 0.050
Identities = 21/21 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 4755 ggaaaagaaaaagaaagaaga 4775
|||||||||||||||||||||
Sbjct: 1013 ggaaaagaaaaagaaagaaga 1033
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
Posted date: Jun 25, 2004 12:58 PM
Number of letters in database: 44,058,232
Number of sequences in database: 29,161
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 218,755
Number of Sequences: 29161
Number of extensions: 218755
Number of successful extensions: 5893
Number of sequences better than 10.0: 86
length of query: 5481
length of database: 44,058,232
effective HSP length: 19
effective length of query: 5462
effective length of database: 43,504,173
effective search space: 237619792926
effective search space used: 237619792926
T: 0
A: 40
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 18 (36.2 bits)