BLASTN 2.2.3 [Apr-24-2002]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= At5g40480.F
(5760 letters)
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
29,161 sequences; 44,058,232 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
At5g40480.1 68418.m04909 expressed protein ; expression sup... 1.142e+04 0.0
At5g41020.1 68418.m04986 myb family transcription factor co... 40 0.21
At5g10590.1 68418.m01226 expressed protein 40 0.21
At5g10580.2 68418.m01225 expressed protein contains Pfam pr... 40 0.21
At4g19865.1 68417.m02911 kelch repeat-containing F-box fami... 40 0.21
>At5g40480.1 68418.m04909 expressed protein ; expression supported by MPSS
Length = 5760
Score = 1.142e+04 bits (5760), Expect = 0.0
Identities = 5760/5760 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggttcccgtctcgttctgcttcttctttctccttctcttgctctctgctggagagagt 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atggttcccgtctcgttctgcttcttctttctccttctcttgctctctgctggagagagt 60
Query: 61 tcatcgcaattagtttctggtccacacatcaccgatgttaacatactcttacctcccaag 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tcatcgcaattagtttctggtccacacatcaccgatgttaacatactcttacctcccaag 120
Query: 121 atgaagaatccggttgagtatcgccttcaaggaagtgatggctgcttcaaatggtcatgg 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 atgaagaatccggttgagtatcgccttcaaggaagtgatggctgcttcaaatggtcatgg 180
Query: 181 gatcatcatgatattctatcagtcacacctgagtttaattcgagcagtcattgttcgacc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 gatcatcatgatattctatcagtcacacctgagtttaattcgagcagtcattgttcgacc 240
Query: 241 agcgcgcgtctcagatcgatttctccgtatagtggtagaaaggagactgcagtttatgcc 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 agcgcgcgtctcagatcgatttctccgtatagtggtagaaaggagactgcagtttatgcc 300
Query: 301 actgatatacagactgggatggtgattcgctgcaaggtctttattgacaacttctcacgg 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 actgatatacagactgggatggtgattcgctgcaaggtctttattgacaacttctcacgg 360
Query: 361 attcagatttttcataattctatcaagcttgatcttgatggtctttccatgcttagagtc 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 attcagatttttcataattctatcaagcttgatcttgatggtctttccatgcttagagtc 420
Query: 421 cgcgcttttgataatgaagataacgagttctcctcactggtgggtctacaattcatttgg 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 cgcgcttttgataatgaagataacgagttctcctcactggtgggtctacaattcatttgg 480
Query: 481 aagctaatgcctgagagtggtggatcaacacatcatcttgctcatgtgcctttgaaggaa 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aagctaatgcctgagagtggtggatcaacacatcatcttgctcatgtgcctttgaaggaa 540
Query: 541 tctccgttgactgactgtggaggactgtgtggctacttagatatccagaaaaagcttgaa 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 tctccgttgactgactgtggaggactgtgtggctacttagatatccagaaaaagcttgaa 600
Query: 601 gatagtggtgtatttgcagatttgtttgttgtgaagggaactaaaattggacatgagaag 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gatagtggtgtatttgcagatttgtttgttgtgaagggaactaaaattggacatgagaag 660
Query: 661 gtttcagttcatctgcttgaggctcctctgacccatatagctgatgaaattgtattaacg 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 gtttcagttcatctgcttgaggctcctctgacccatatagctgatgaaattgtattaacg 720
Query: 721 gttgcagaagccatgtctcttgaacctcgctcacctgtctatgtcctgatgggagcttct 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 gttgcagaagccatgtctcttgaacctcgctcacctgtctatgtcctgatgggagcttct 780
Query: 781 tttggttacacgttaaaggtcatgcgtggaaatgttcctcaagccgtggatctaccatca 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 tttggttacacgttaaaggtcatgcgtggaaatgttcctcaagccgtggatctaccatca 840
Query: 841 ccacatcatagatggtctgtgttaaactcttctgttgctcaagtggattctttgataggt 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 ccacatcatagatggtctgtgttaaactcttctgttgctcaagtggattctttgataggt 900
Query: 901 ctgactaaagcgttaagcttgggggtaacaacagttgttgttgaggatacccgggtcgct 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 ctgactaaagcgttaagcttgggggtaacaacagttgttgttgaggatacccgggtcgct 960
Query: 961 ggccacattcaaggatcatctattaatgttgtcactccagatactcttatcttgtacata 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 ggccacattcaaggatcatctattaatgttgtcactccagatactcttatcttgtacata 1020
Query: 1021 tcaccttggtcaatgtcaggggatcttattacagaatccaaaccttttccatcatctatg 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 tcaccttggtcaatgtcaggggatcttattacagaatccaaaccttttccatcatctatg 1080
Query: 1081 cattggtatgtggtgtctggtcgtcaatatctaattcaaatgaagattttctctggaaga 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 cattggtatgtggtgtctggtcgtcaatatctaattcaaatgaagattttctctggaaga 1140
Query: 1141 cctgatgcacatgaaatctatataactgagacggatgacataaaactgtatggaaaagat 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 cctgatgcacatgaaatctatataactgagacggatgacataaaactgtatggaaaagat 1200
Query: 1201 tcagattattggaaaatcgtctcactgccagatgaactttcctctgaatatggtcagcga 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1201 tcagattattggaaaatcgtctcactgccagatgaactttcctctgaatatggtcagcga 1260
Query: 1261 aattctagaattttgaacgcaatctcaccaggattaggagagctgacatctacattgact 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1261 aattctagaattttgaacgcaatctcaccaggattaggagagctgacatctacattgact 1320
Query: 1321 tacttcagtgggcatcaagagtcaaaagaggttctcaaggttgtccaagaaattagggtt 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1321 tacttcagtgggcatcaagagtcaaaagaggttctcaaggttgtccaagaaattagggtt 1380
Query: 1381 tgtgaaaaagtgcagttcacattgaacagtgaagatgacacacctaaggttctactccca 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1381 tgtgaaaaagtgcagttcacattgaacagtgaagatgacacacctaaggttctactccca 1440
Query: 1441 tggacccctgctgtttatcaggagatggagctaattgtgacaggaggttgtgcaaaagca 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1441 tggacccctgctgtttatcaggagatggagctaattgtgacaggaggttgtgcaaaagca 1500
Query: 1501 tcgagtgactacaagtggtttacttcagatataagcattttgtcggtgtcagcttatgga 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1501 tcgagtgactacaagtggtttacttcagatataagcattttgtcggtgtcagcttatgga 1560
Query: 1561 attatccaggcaaagaggcccggtatagccactgtgaaggtggtgtcgactttcgattca 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1561 attatccaggcaaagaggcccggtatagccactgtgaaggtggtgtcgactttcgattca 1620
Query: 1621 caaaattttgatgaggttattgttgaagtttccattccatcctctatggttatgttgcaa 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1621 caaaattttgatgaggttattgttgaagtttccattccatcctctatggttatgttgcaa 1680
Query: 1681 aacttcccagtagagacagttgttggatcacacctgaaagctgctgtcacaatgaaggct 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1681 aacttcccagtagagacagttgttggatcacacctgaaagctgctgtcacaatgaaggct 1740
Query: 1741 ttaaatggtgcaacgttctctagatgtgatgcttttaattcattgataaagtggaagacg 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1741 ttaaatggtgcaacgttctctagatgtgatgcttttaattcattgataaagtggaagacg 1800
Query: 1801 gggagtgagtcttttgttattgttaatgcaacatctgagatgatgatgttggacgaacta 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1801 gggagtgagtcttttgttattgttaatgcaacatctgagatgatgatgttggacgaacta 1860
Query: 1861 agaagcatggactccagccctccttgttcacgggcttctatatatactgcatctactggc 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1861 agaagcatggactccagccctccttgttcacgggcttctatatatactgcatctactggc 1920
Query: 1921 cgcacagtattacaagcaactctggcaaaagagttccattattttgataagtctttgagt 1980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1921 cgcacagtattacaagcaactctggcaaaagagttccattattttgataagtctttgagt 1980
Query: 1981 gaatcaatagatttgaaagcaactttaactatcggggcctatctgccactttctgtcaga 2040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1981 gaatcaatagatttgaaagcaactttaactatcggggcctatctgccactttctgtcaga 2040
Query: 2041 caagatagtgacgggaatcatcatggtggatattggtttgataaggcacaagaggaaact 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2041 caagatagtgacgggaatcatcatggtggatattggtttgataaggcacaagaggaaact 2100
Query: 2101 gattttggtgttagtaagctatatcttgtacctggtacatatgttgacgttatgcttctg 2160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2101 gattttggtgttagtaagctatatcttgtacctggtacatatgttgacgttatgcttctg 2160
Query: 2161 ggtggacctgaaaggtgggatgacaatgttgagttcaccgagactgtgaagacattatat 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2161 ggtggacctgaaaggtgggatgacaatgttgagttcaccgagactgtgaagacattatat 2220
Query: 2221 gaagatgaggaggatcttacaagcagagttaacgtccatcatgaggttgaccgccgtgct 2280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2221 gaagatgaggaggatcttacaagcagagttaacgtccatcatgaggttgaccgccgtgct 2280
Query: 2281 aacatgtatagaatttcatgccagaagcttggctcctataaactggtcttcttgcgtggg 2340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2281 aacatgtatagaatttcatgccagaagcttggctcctataaactggtcttcttgcgtggg 2340
Query: 2341 aatctgctgggtatagaccatcctgtacctgcagttgcagaagctttattgtctgttcat 2400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2341 aatctgctgggtatagaccatcctgtacctgcagttgcagaagctttattgtctgttcat 2400
Query: 2401 tgcagcttaccatcctctgttgtgctcattgttgatgaacctgttaacaagcttgatgtg 2460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2401 tgcagcttaccatcctctgttgtgctcattgttgatgaacctgttaacaagcttgatgtg 2460
Query: 2461 attagagctgctagtcaagctgacagggcaccaggacgacttcgtgtaactcctgtgact 2520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2461 attagagctgctagtcaagctgacagggcaccaggacgacttcgtgtaactcctgtgact 2520
Query: 2521 gtggcaaatgggcaaataattcgtgtggctgctgttggtattagcgagtttggagaagct 2580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2521 gtggcaaatgggcaaataattcgtgtggctgctgttggtattagcgagtttggagaagct 2580
Query: 2581 ttttcaaactcctcaactctttctctcaggtgggaattgaccagttgcaacaatttggca 2640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2581 ttttcaaactcctcaactctttctctcaggtgggaattgaccagttgcaacaatttggca 2640
Query: 2641 tactgggacgatgattataactcaaaaatgacaaagtctggctgggagagatttctggct 2700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2641 tactgggacgatgattataactcaaaaatgacaaagtctggctgggagagatttctggct 2700
Query: 2701 ctacgcaatgaatcaggattgtgcactgttcgagccaccgtttctggtattgattattct 2760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2701 ctacgcaatgaatcaggattgtgcactgttcgagccaccgtttctggtattgattattct 2760
Query: 2761 ttcaaaagccaatactcaactctgcttccacaaggttctgaaagtactctcactgatgct 2820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2761 ttcaaaagccaatactcaactctgcttccacaaggttctgaaagtactctcactgatgct 2820
Query: 2821 gtacgcttacagttggtttccacactaagagtcacaccagagttcaacctggtctttttc 2880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2821 gtacgcttacagttggtttccacactaagagtcacaccagagttcaacctggtctttttc 2880
Query: 2881 aatcctaatgccaaggtaaacttgtcaatgactggagggagctgtttgtgggaagcagtt 2940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2881 aatcctaatgccaaggtaaacttgtcaatgactggagggagctgtttgtgggaagcagtt 2940
Query: 2941 gtgaataattctcgtgtagcagaagttattcgacccccatctggcctgcaatgctcgcaa 3000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2941 gtgaataattctcgtgtagcagaagttattcgacccccatctggcctgcaatgctcgcaa 3000
Query: 3001 atgatgctatctccaaaagggttggggactacaatcgtgacagtatacgacattggagtt 3060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3001 atgatgctatctccaaaagggttggggactacaatcgtgacagtatacgacattggagtt 3060
Query: 3061 tctcctccactttcagctcttgcgttgataaaagttgcagatgtggactggataaagatt 3120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3061 tctcctccactttcagctcttgcgttgataaaagttgcagatgtggactggataaagatt 3120
Query: 3121 gcatctggggatgagataagtataatggaaggaagtacacactccattgatctcttgact 3180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3121 gcatctggggatgagataagtataatggaaggaagtacacactccattgatctcttgact 3180
Query: 3181 ggcattgacgatggaatgacctttgattcttcccagtactcacttatggacattatggtg 3240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3181 ggcattgacgatggaatgacctttgattcttcccagtactcacttatggacattatggtg 3240
Query: 3241 catattgaggatgatctcgtggagcatgtcactgttgatgaggattcactttctgttggt 3300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3241 catattgaggatgatctcgtggagcatgtcactgttgatgaggattcactttctgttggt 3300
Query: 3301 gaacacgtggcaacttcctcttttaaaattgctgctagacgactgggaatcacaacccta 3360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3301 gaacacgtggcaacttcctcttttaaaattgctgctagacgactgggaatcacaacccta 3360
Query: 3361 tatgtcagcgcaagacaacaatcaggaggtaaagtgctaagccaaactattaaagtcgaa 3420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3361 tatgtcagcgcaagacaacaatcaggaggtaaagtgctaagccaaactattaaagtcgaa 3420
Query: 3421 gtttattccccaccaagacttcacccacaaggaatatttcttgttcctggtgcttcctat 3480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3421 gtttattccccaccaagacttcacccacaaggaatatttcttgttcctggtgcttcctat 3480
Query: 3481 gtgctcactattgaaggaggcccgaccatgaatgtttctgttgactacaccactgtggat 3540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3481 gtgctcactattgaaggaggcccgaccatgaatgtttctgttgactacaccactgtggat 3540
Query: 3541 aacgaagttgcaaagatcgaaaaatcaggacgcctatatgcaacatctcccggcaacacg 3600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3541 aacgaagttgcaaagatcgaaaaatcaggacgcctatatgcaacatctcccggcaacacg 3600
Query: 3601 acaatctatgcaacaatttacgggagtgaaggtgctgtaatttgtcaggcaattggaaat 3660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3601 acaatctatgcaacaatttacgggagtgaaggtgctgtaatttgtcaggcaattggaaat 3660
Query: 3661 gccgaagtaggacttcctgctactgcaatgctggtagctcaaagtgacactgtggccgtt 3720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3661 gccgaagtaggacttcctgctactgcaatgctggtagctcaaagtgacactgtggccgtt 3720
Query: 3721 ggccatgaaatgcctgtatccccatcatttcctgagggtgaccttttatctttttatgag 3780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3721 ggccatgaaatgcctgtatccccatcatttcctgagggtgaccttttatctttttatgag 3780
Query: 3781 ctctgcagcgcttacaaatggactattgaagatgaaaaggtgttaattttcattgcatca 3840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3781 ctctgcagcgcttacaaatggactattgaagatgaaaaggtgttaattttcattgcatca 3840
Query: 3841 tccatcaatgtggaagagaatgctggctttgttaatgtcgtccaaggaagatcagctggc 3900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3841 tccatcaatgtggaagagaatgctggctttgttaatgtcgtccaaggaagatcagctggc 3900
Query: 3901 aaaaccagagttacaattgccttctcatgtgatttcgtgtctcctggcttgtactctgaa 3960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3901 aaaaccagagttacaattgccttctcatgtgatttcgtgtctcctggcttgtactctgaa 3960
Query: 3961 tctagaacatatgaagcgtcaatgattttatctgttgtgcctgatctccctctttcgctt 4020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3961 tctagaacatatgaagcgtcaatgattttatctgttgtgcctgatctccctctttcgctt 4020
Query: 4021 ggggctcctatgacttgggttcttccgcctttttatacatcatctggtctattaccttca 4080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4021 ggggctcctatgacttgggttcttccgcctttttatacatcatctggtctattaccttca 4080
Query: 4081 tcttcagagccacagaagcatagagatggacaaagtcacagaggcaatatagtctactcc 4140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4081 tcttcagagccacagaagcatagagatggacaaagtcacagaggcaatatagtctactcc 4140
Query: 4141 atattgaaagactgcagctctcgggctgattttgaacgagataccatatcaattaatggc 4200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4141 atattgaaagactgcagctctcgggctgattttgaacgagataccatatcaattaatggc 4200
Query: 4201 gggagtgtcaaaacaactgatagcaacaatgttgcatgtattcaagccaaagaccgcaca 4260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4201 gggagtgtcaaaacaactgatagcaacaatgttgcatgtattcaagccaaagaccgcaca 4260
Query: 4261 agtggaaggattgagattgctgcttgcgtgagagttgcagaggttgctcaaataagaatg 4320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4261 agtggaaggattgagattgctgcttgcgtgagagttgcagaggttgctcaaataagaatg 4320
Query: 4321 aagagtgaggggatccctttccacgtgatagatcttgctgttggcggtgaacttgaactt 4380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4321 aagagtgaggggatccctttccacgtgatagatcttgctgttggcggtgaacttgaactt 4380
Query: 4381 ccaataaattactatgacactttaggaatcccttttctcgaagcacatggtgttactaca 4440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4381 ccaataaattactatgacactttaggaatcccttttctcgaagcacatggtgttactaca 4440
Query: 4441 tacaatgtcgaaaccaatcatcgtgatgttgtatttattaagactgtcaatgaccaacca 4500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4441 tacaatgtcgaaaccaatcatcgtgatgttgtatttattaagactgtcaatgaccaacca 4500
Query: 4501 agtgcctacattaagggaataaaacatggcaaagctctcattcgggtttccattggtgat 4560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4501 agtgcctacattaagggaataaaacatggcaaagctctcattcgggtttccattggtgat 4560
Query: 4561 aatctcaggaaatcagattacgttctggtttcagttggggcgcatatctttcctcaaaac 4620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4561 aatctcaggaaatcagattacgttctggtttcagttggggcgcatatctttcctcaaaac 4620
Query: 4621 ccggtcattcacactggaaatttgttaaatttcagcataacaggggctgataatgaagtc 4680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4621 ccggtcattcacactggaaatttgttaaatttcagcataacaggggctgataatgaagtc 4680
Query: 4681 actggtcaatggtttacatcaaacagaagtgtcatatccgtcaatgtggcatctggccaa 4740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4681 actggtcaatggtttacatcaaacagaagtgtcatatccgtcaatgtggcatctggccaa 4740
Query: 4741 gctaaagcgatcagccaaggctcaactcacggtcatggtttgaaactgcaaacaaaagtc 4800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4741 gctaaagcgatcagccaaggctcaactcacggtcatggtttgaaactgcaaacaaaagtc 4800
Query: 4801 acagtgctatttggaaacaccatatatgtcgactctccaggagaaacactgacaaatgtc 4860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4801 acagtgctatttggaaacaccatatatgtcgactctccaggagaaacactgacaaatgtc 4860
Query: 4861 cacgtccctgcagaaggatataagtttccagtgaaattcagggagaacaagtttgcagtc 4920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4861 cacgtccctgcagaaggatataagtttccagtgaaattcagggagaacaagtttgcagtc 4920
Query: 4921 actgaacatggaaacaaggccacgtttaactgccaagtagaccctccgtttataggatac 4980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4921 actgaacatggaaacaaggccacgtttaactgccaagtagaccctccgtttataggatac 4980
Query: 4981 acaaagccatggatggatctcgatacgggcaacacttattgtcttttcttcccatactca 5040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4981 acaaagccatggatggatctcgatacgggcaacacttattgtcttttcttcccatactca 5040
Query: 5041 ccagagcatcttgttcactccatgtctataacaaaagacatgaaacctcatgtgtcattc 5100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5041 ccagagcatcttgttcactccatgtctataacaaaagacatgaaacctcatgtgtcattc 5100
Query: 5101 tccgttgatgcttcacttaaagaagctcgacgtgtttcgggatctgcatctgcacttctt 5160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5101 tccgttgatgcttcacttaaagaagctcgacgtgtttcgggatctgcatctgcacttctt 5160
Query: 5161 ataggagggttttctgtaacagggccagataagctgaatataaacccggattcaaacacg 5220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5161 ataggagggttttctgtaacagggccagataagctgaatataaacccggattcaaacacg 5220
Query: 5221 accatcatttcattagtggggaacaccgatgttcaaattcactgccgcaacaaaggtagg 5280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5221 accatcatttcattagtggggaacaccgatgttcaaattcactgccgcaacaaaggtagg 5280
Query: 5281 ttatcaatcagcttgattaaaagagacgattttggtatcgcagggcatgcacaatacaag 5340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5281 ttatcaatcagcttgattaaaagagacgattttggtatcgcagggcatgcacaatacaag 5340
Query: 5341 gtaaatgtgttaagatcagagcaattcacagatagaatcatcatcactctacctgctact 5400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5341 gtaaatgtgttaagatcagagcaattcacagatagaatcatcatcactctacctgctact 5400
Query: 5401 ggccaaattgtagaaatcgatgtctgctatgacacaggagagtcactagtagcttcgtct 5460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5401 ggccaaattgtagaaatcgatgtctgctatgacacaggagagtcactagtagcttcgtct 5460
Query: 5461 aaagatggttactctgttttgttgaagatactatggggcgttttggtgttggttgtatca 5520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5461 aaagatggttactctgttttgttgaagatactatggggcgttttggtgttggttgtatca 5520
Query: 5521 gtgatcatcttgatgaaagtgatagatcgacaagtgcccacaggagctactggaacggca 5580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5521 gtgatcatcttgatgaaagtgatagatcgacaagtgcccacaggagctactggaacggca 5580
Query: 5581 acatacagtggaaatgcagcacagggaacaccagaaagaagaagcggcacagttatatac 5640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5581 acatacagtggaaatgcagcacagggaacaccagaaagaagaagcggcacagttatatac 5640
Query: 5641 catgaggaatctccaagaacaccatcaccatttatggagtatgtgaagagaacagtggat 5700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5641 catgaggaatctccaagaacaccatcaccatttatggagtatgtgaagagaacagtggat 5700
Query: 5701 gaaactccctactacagaagagaaggaagaagaaggtttaatcctcaaaacactatgtag 5760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5701 gaaactccctactacagaagagaaggaagaagaaggtttaatcctcaaaacactatgtag 5760
>At5g41020.1 68418.m04986 myb family transcription factor contains Pfam profile:
PF00249 Myb DNA binding domain
Length = 1915
Score = 40.1 bits (20), Expect = 0.21
Identities = 20/20 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5716 agaagagaaggaagaagaag 5735
||||||||||||||||||||
Sbjct: 858 agaagagaaggaagaagaag 877
>At5g10590.1 68418.m01226 expressed protein
Length = 243
Score = 40.1 bits (20), Expect = 0.21
Identities = 26/28 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5248 gatgttcaaattcactgccgcaacaaag 5275
||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct: 16 gatgttcaaattcactggcgcaaaaaag 43
>At5g10580.2 68418.m01225 expressed protein contains Pfam profile PF04654: Protein
of unknown function, DUF599
Length = 1588
Score = 40.1 bits (20), Expect = 0.21
Identities = 26/28 (92%)
Strand = Plus / Minus
Query: 5248 gatgttcaaattcactgccgcaacaaag 5275
||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct: 1061 gatgttcaaattcactggcgcaaaaaag 1034
>At4g19865.1 68417.m02911 kelch repeat-containing F-box family protein contains
F-box domain Pfam:PF00646 and Kelch motif Pfam:PF01344
Length = 1410
Score = 40.1 bits (20), Expect = 0.21
Identities = 20/20 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5716 agaagagaaggaagaagaag 5735
||||||||||||||||||||
Sbjct: 341 agaagagaaggaagaagaag 360
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
Posted date: Jun 25, 2004 12:58 PM
Number of letters in database: 44,058,232
Number of sequences in database: 29,161
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 179,700
Number of Sequences: 29161
Number of extensions: 179700
Number of successful extensions: 4447
Number of sequences better than 10.0: 45
length of query: 5760
length of database: 44,058,232
effective HSP length: 19
effective length of query: 5741
effective length of database: 43,504,173
effective search space: 249757457193
effective search space used: 249757457193
T: 0
A: 40
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 18 (36.2 bits)