BLASTN 2.2.3 [Apr-24-2002]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= At4g32820.F
(5454 letters)
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
29,161 sequences; 44,058,232 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
At4g32820.1 68417.m04668 expressed protein ; expression sup... 1.081e+04 0.0
At5g47500.1 68418.m05865 pectinesterase family protein cont... 38 0.77
At5g39785.2 68418.m04819 expressed protein 38 0.77
At5g39785.1 68418.m04818 expressed protein 38 0.77
At5g16730.1 68418.m01959 expressed protein weak similarity ... 38 0.77
>At4g32820.1 68417.m04668 expressed protein ; expression supported by MPSS
Length = 5454
Score = 1.081e+04 bits (5454), Expect = 0.0
Identities = 5454/5454 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgttttcgattgcagcgatcaatgatacggagtccacagagaagtgggaacctttagct 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atgttttcgattgcagcgatcaatgatacggagtccacagagaagtgggaacctttagct 60
Query: 61 cctagcaaagaagctcaggagtttcatctgtcacaaacatatcatgatggtcttctcaag 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 cctagcaaagaagctcaggagtttcatctgtcacaaacatatcatgatggtcttctcaag 120
Query: 121 ctgcaagctaaagactatgacaaggctcgggagctgctagaatctatccttaaagatcct 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ctgcaagctaaagactatgacaaggctcgggagctgctagaatctatccttaaagatcct 180
Query: 181 attataaccaactccaaagtggagactattgcaaacgacaatcatctccatcatctcaga 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 attataaccaactccaaagtggagactattgcaaacgacaatcatctccatcatctcaga 240
Query: 241 tttttggctctgaagaatcttgccactgtctttcttgagcttggttcaagtcactacgag 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tttttggctctgaagaatcttgccactgtctttcttgagcttggttcaagtcactacgag 300
Query: 301 aatgctctaaactgttatcttcaagctatagacttagatgcaaaagattctgtgctctgg 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 aatgctctaaactgttatcttcaagctatagacttagatgcaaaagattctgtgctctgg 360
Query: 361 aaccatcttggaaccctatcatgttctatgggattactgagtatttcacgatgggcattt 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 aaccatcttggaaccctatcatgttctatgggattactgagtatttcacgatgggcattt 420
Query: 421 gaacagggacttctctgcagccccaataactggaactgcatggagaaacttctagaagtt 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gaacagggacttctctgcagccccaataactggaactgcatggagaaacttctagaagtt 480
Query: 481 ctcattgccgtaggtgatgaagtttcctgtctttcagttgcaaatctgattttaaggcat 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 ctcattgccgtaggtgatgaagtttcctgtctttcagttgcaaatctgattttaaggcat 540
Query: 541 tggccatcacattctcgtgctttgcatgttaaacattgtattgaagacacagattcagct 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 tggccatcacattctcgtgctttgcatgttaaacattgtattgaagacacagattcagct 600
Query: 601 ccttttgctcccaagggtatagataaacttgaacctcagcacgttcggctcaaatttctt 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 ccttttgctcccaagggtatagataaacttgaacctcagcacgttcggctcaaatttctt 660
Query: 661 ggcaaaagaaaggtgtctgacatgaatcaggacatggatgctacctccaagaagttaaga 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 ggcaaaagaaaggtgtctgacatgaatcaggacatggatgctacctccaagaagttaaga 720
Query: 721 aaaagagtgcaatttaaacttcctgaagcttcatgggtggcactgctaaatattctaatt 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 aaaagagtgcaatttaaacttcctgaagcttcatgggtggcactgctaaatattctaatt 780
Query: 781 gggatagtgcatccttcgcgtgaaactgtgggcatatcagctgatataccgataaccatt 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 gggatagtgcatccttcgcgtgaaactgtgggcatatcagctgatataccgataaccatt 840
Query: 841 gaattatcccttagtacagaggctgttatgcaaggtatgaaaaagaaggatcattgtgtg 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 gaattatcccttagtacagaggctgttatgcaaggtatgaaaaagaaggatcattgtgtg 900
Query: 901 gattcagattcaagtaatgtgtctgttaaggattgcaacatcgagagagaaagtggtggt 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 gattcagattcaagtaatgtgtctgttaaggattgcaacatcgagagagaaagtggtggt 960
Query: 961 tctgtaaaagaaaaagagcctgtgttttctgaagaacacccccaagagaggcggagtact 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 tctgtaaaagaaaaagagcctgtgttttctgaagaacacccccaagagaggcggagtact 1020
Query: 1021 cgtcttgaacggcttcggaaccagaaacctgagaaggaagggttagaatttgataacagt 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 cgtcttgaacggcttcggaaccagaaacctgagaaggaagggttagaatttgataacagt 1080
Query: 1081 aaggatcctagcagtgacatccttcaatatcttgagaaatttgtccttaaaaggggtttt 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 aaggatcctagcagtgacatccttcaatatcttgagaaatttgtccttaaaaggggtttt 1140
Query: 1141 gacagagagtctgctggttctttctgcaatgaagaatctgatccaatttctgaacacgcc 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 gacagagagtctgctggttctttctgcaatgaagaatctgatccaatttctgaacacgcc 1200
Query: 1201 gtcgtttctaattttgtgaaggaaaatttagaaaattatggtgcgtatcatatgggtcac 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1201 gtcgtttctaattttgtgaaggaaaatttagaaaattatggtgcgtatcatatgggtcac 1260
Query: 1261 ttgcttctagaatatattgctaataaatgtgaacatgtattgagtcgtgagactgccttg 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1261 ttgcttctagaatatattgctaataaatgtgaacatgtattgagtcgtgagactgccttg 1320
Query: 1321 aaaattttggagttagaaaagcttacaagacattggggccgagatcggaaacctgaatgc 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1321 aaaattttggagttagaaaagcttacaagacattggggccgagatcggaaacctgaatgc 1380
Query: 1381 agtctttttctcgccgagctgtaccatgactttgactctaaacgatcagatatccctgat 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1381 agtctttttctcgccgagctgtaccatgactttgactctaaacgatcagatatccctgat 1440
Query: 1441 gccccatcatgcatggtagaagtaacataccatctctctaagataattgaatctgtttcc 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1441 gccccatcatgcatggtagaagtaacataccatctctctaagataattgaatctgtttcc 1500
Query: 1501 cttgattatgctatcgactctacacctagttctcgagggaaaatgttttctgactcctca 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1501 cttgattatgctatcgactctacacctagttctcgagggaaaatgttttctgactcctca 1560
Query: 1561 tttaagagttttcaaggtgatgaggctgctaaggaggtgttagattatgatacaagatct 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1561 tttaagagttttcaaggtgatgaggctgctaaggaggtgttagattatgatacaagatct 1620
Query: 1621 ttctgggctcgatatttctggctgagtgcacggttatcaattttggaggataataaagct 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1621 ttctgggctcgatatttctggctgagtgcacggttatcaattttggaggataataaagct 1680
Query: 1681 aaagcacttgaagaatatctcaggtgtttgtcattgttgggcagggaaggtatcggagaa 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1681 aaagcacttgaagaatatctcaggtgtttgtcattgttgggcagggaaggtatcggagaa 1740
Query: 1741 gctcctgtcttaattcagcgacctcattgcagaagagttcgagagctgaccatcaataga 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1741 gctcctgtcttaattcagcgacctcattgcagaagagttcgagagctgaccatcaataga 1800
Query: 1801 atcattcatgaaattaatctgcttaagattgatttcctgttggaaaataacatacctgag 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1801 atcattcatgaaattaatctgcttaagattgatttcctgttggaaaataacatacctgag 1860
Query: 1861 atgatggagaaagaattttattcggagtgtgtaaatttactggcacctcttttgtttcca 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1861 atgatggagaaagaattttattcggagtgtgtaaatttactggcacctcttttgtttcca 1920
Query: 1921 gataaagacatcttgcctgcatacgctgtaaaaacggaagaagggatctcctctgttgag 1980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1921 gataaagacatcttgcctgcatacgctgtaaaaacggaagaagggatctcctctgttgag 1980
Query: 1981 ttatcggcacttgaggttttaataaaagcatgccagaagagtaagcctatagatgtagag 2040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1981 ttatcggcacttgaggttttaataaaagcatgccagaagagtaagcctatagatgtagag 2040
Query: 2041 gtttatatgaactgtcatagaagaaagttgcaagttctcttagattcaactggtacggga 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2041 gtttatatgaactgtcatagaagaaagttgcaagttctcttagattcaactggtacggga 2100
Query: 2101 gaatctgttgtgacacctaaaacctcgtccaaaaattcaagtgagagttgggatcacttg 2160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2101 gaatctgttgtgacacctaaaacctcgtccaaaaattcaagtgagagttgggatcacttg 2160
Query: 2161 gtggcggaggaagtcaaggcaattcttctctgtatctctcaagtgaagaactcccttgac 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2161 gtggcggaggaagtcaaggcaattcttctctgtatctctcaagtgaagaactcccttgac 2220
Query: 2221 cagtcaggaaactctagatattcagattctcaaaatgctgatgggattgaagaagagaag 2280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2221 cagtcaggaaactctagatattcagattctcaaaatgctgatgggattgaagaagagaag 2280
Query: 2281 aagtcttgctttctcgatgcagctattggattctgtaaacttcagcaccttgatgctact 2340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2281 aagtcttgctttctcgatgcagctattggattctgtaaacttcagcaccttgatgctact 2340
Query: 2341 atatctactaaataccaagttgagttgatcataagactccatgatttgcttgctgaatat 2400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2341 atatctactaaataccaagttgagttgatcataagactccatgatttgcttgctgaatat 2400
Query: 2401 gggctctgctgtgctggtaaaaattgtgcgggggaggaaggagcttttcttagatttgcg 2460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2401 gggctctgctgtgctggtaaaaattgtgcgggggaggaaggagcttttcttagatttgcg 2460
Query: 2461 attaagcatttattggcagtggacatgaaagtcaaatccagtattaactccccagatggt 2520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2461 attaagcatttattggcagtggacatgaaagtcaaatccagtattaactccccagatggt 2520
Query: 2521 cttggacatgatatgggactgcctgacaaattatgcagaaatgaagtaaaatcatttctc 2580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2521 cttggacatgatatgggactgcctgacaaattatgcagaaatgaagtaaaatcatttctc 2580
Query: 2581 gaagaggtgcatgttgagaaaaacgaaaacaacaaaactgagtctaagaaggatggttct 2640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2581 gaagaggtgcatgttgagaaaaacgaaaacaacaaaactgagtctaagaaggatggttct 2640
Query: 2641 gaagaacaagttggttatagggagaaagaacagtcagaacaacaaagcaaacagattcca 2700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2641 gaagaacaagttggttatagggagaaagaacagtcagaacaacaaagcaaacagattcca 2700
Query: 2701 gaacacacagaagaagttgctgaagaagaaaaagatgaacttgagttgttaatcaacaac 2760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2701 gaacacacagaagaagttgctgaagaagaaaaagatgaacttgagttgttaatcaacaac 2760
Query: 2761 gctttagatcaatgctttttttgcctgtatggtctaaatctgagagtcgatggttcctac 2820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2761 gctttagatcaatgctttttttgcctgtatggtctaaatctgagagtcgatggttcctac 2820
Query: 2821 gaagatgagcttgctgtgcacaaaaacactagccgcggagattatcagaccaaggaacaa 2880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2821 gaagatgagcttgctgtgcacaaaaacactagccgcggagattatcagaccaaggaacaa 2880
Query: 2881 tgtgttgatgtcttccagtacatactaccctatgccaaagcttcatctagaactggacta 2940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2881 tgtgttgatgtcttccagtacatactaccctatgccaaagcttcatctagaactggacta 2940
Query: 2941 gttaaactccggagagtcttgagagcaataaaaaagcatttttcacaaccaccagatgat 3000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2941 gttaaactccggagagtcttgagagcaataaaaaagcatttttcacaaccaccagatgat 3000
Query: 3001 ctcctaattggcaatgtgatagataaattcttagatgaccctgaattatgtgaagacaaa 3060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3001 ctcctaattggcaatgtgatagataaattcttagatgaccctgaattatgtgaagacaaa 3060
Query: 3061 ctctcatatgaggctggttctgaaggtttccttgaaactataactaaatgtctaattccc 3120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3061 ctctcatatgaggctggttctgaaggtttccttgaaactataactaaatgtctaattccc 3120
Query: 3121 agcagaactctaactcaatccgaagaagttagtgctagtgataaatggcccggttttgtt 3180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3121 agcagaactctaactcaatccgaagaagttagtgctagtgataaatggcccggttttgtt 3180
Query: 3181 ctgacaaaggaaggagaagagtttgaacagcagaatacaaatctgttcaaatatgatctg 3240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3181 ctgacaaaggaaggagaagagtttgaacagcagaatacaaatctgttcaaatatgatctg 3240
Query: 3241 ctctataatcctctccgctttgagagttgggaaaagcttggcaatatatacgacgaggca 3300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3241 ctctataatcctctccgctttgagagttgggaaaagcttggcaatatatacgacgaggca 3300
Query: 3301 ggttctttcattcgttcttgttgttactgttattttgaaaatgtaccttcaaatagcaga 3360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3301 ggttctttcattcgttcttgttgttactgttattttgaaaatgtaccttcaaatagcaga 3360
Query: 3361 tggaggaagaattccgctctttcgcaaagagttgagacaagtagaagaagaagcagacgt 3420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3361 tggaggaagaattccgctctttcgcaaagagttgagacaagtagaagaagaagcagacgt 3420
Query: 3421 tgcctgctaatgagtttggcattggcaaattcaccagatcaacagtctgagatacatgag 3480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3421 tgcctgctaatgagtttggcattggcaaattcaccagatcaacagtctgagatacatgag 3480
Query: 3481 cttttggcgctggtctactatgacagccttcagagtgttgtgccgttttatgatcagcgg 3540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3481 cttttggcgctggtctactatgacagccttcagagtgttgtgccgttttatgatcagcgg 3540
Query: 3541 tctgtgcttccctccaaggatgcaacatggacaagattttgtgagaactcaatgaagcat 3600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3541 tctgtgcttccctccaaggatgcaacatggacaagattttgtgagaactcaatgaagcat 3600
Query: 3601 ttcaacaaagccttttcacatcgacaagattggtcacatgcattctacatgggaaaactc 3660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3601 ttcaacaaagccttttcacatcgacaagattggtcacatgcattctacatgggaaaactc 3660
Query: 3661 agtgagaagcttgggcactcgtatgaaatttctttatcctattataagcaagccatgaca 3720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3661 agtgagaagcttgggcactcgtatgaaatttctttatcctattataagcaagccatgaca 3720
Query: 3721 ttgaatccgtcagccgtagatcctgtgtatagaatgcatgcttctcgtttgaagctgcta 3780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3721 ttgaatccgtcagccgtagatcctgtgtatagaatgcatgcttctcgtttgaagctgcta 3780
Query: 3781 aatgcatgcgggaaacaaaacttagaagccttaaaggtcctcgcttcttattgctttgat 3840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3781 aatgcatgcgggaaacaaaacttagaagccttaaaggtcctcgcttcttattgctttgat 3840
Query: 3841 gaatctataaaggatacggctatgacaatcattggcacaacgacttttggatcctctcgt 3900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3841 gaatctataaaggatacggctatgacaatcattggcacaacgacttttggatcctctcgt 3900
Query: 3901 acactggaagaagctcaagatggaaacttggaagcatgttatgctaaatctggagagggg 3960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3901 acactggaagaagctcaagatggaaacttggaagcatgttatgctaaatctggagagggg 3960
Query: 3961 tcaattcagatggaaggggtatggcatatgctctacaacgacagcctctctgcacttgga 4020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3961 tcaattcagatggaaggggtatggcatatgctctacaacgacagcctctctgcacttgga 4020
Query: 4021 atttgtgtagaaggagatcttaaacactttcataaggcgagatacatgcttgctcaaggt 4080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4021 atttgtgtagaaggagatcttaaacactttcataaggcgagatacatgcttgctcaaggt 4080
Query: 4081 ctgtacagaaggggtgggagcagtgatctgcaaagagcaaaggaagaactttccttttgt 4140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4081 ctgtacagaaggggtgggagcagtgatctgcaaagagcaaaggaagaactttccttttgt 4140
Query: 4141 ttcaaatcatcacggtcaagttttacgatcaatatgtgggagattgatggcatggttaaa 4200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4141 ttcaaatcatcacggtcaagttttacgatcaatatgtgggagattgatggcatggttaaa 4200
Query: 4201 aagggaaggcgaaaaactccaggtttggctgggaacaagaaggctcttgaagttaacctg 4260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4201 aagggaaggcgaaaaactccaggtttggctgggaacaagaaggctcttgaagttaacctg 4260
Query: 4261 ccagaaagttcacggaaattcataacttgcattcgcaaatacttactgttctatttgaga 4320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4261 ccagaaagttcacggaaattcataacttgcattcgcaaatacttactgttctatttgaga 4320
Query: 4321 ctattggaggaaactgaagatgtcaacacactagaacgagcctttaattctcttcgatca 4380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4321 ctattggaggaaactgaagatgtcaacacactagaacgagcctttaattctcttcgatca 4380
Query: 4381 gataagaggttctctctatgcgttgaagaccttgtaccagttgcaataggaagatacgta 4440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4381 gataagaggttctctctatgcgttgaagaccttgtaccagttgcaataggaagatacgta 4440
Query: 4441 aaagcactggtttcctcgatgagtcgggttgagtctgcaggagcaataatcaaccctgat 4500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4441 aaagcactggtttcctcgatgagtcgggttgagtctgcaggagcaataatcaaccctgat 4500
Query: 4501 agccagctagagaaaatattttccctctttatagaacaaggaagcatatggccagacata 4560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4501 agccagctagagaaaatattttccctctttatagaacaaggaagcatatggccagacata 4560
Query: 4561 tgcaattttcctgaaacaagaggtccagaaacctcagagagcagcttatacagatatcta 4620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4561 tgcaattttcctgaaacaagaggtccagaaacctcagagagcagcttatacagatatcta 4620
Query: 4621 catcaatacatcgtatctcttgagctagacaacaaggttgagaccctggaaaccataaat 4680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4621 catcaatacatcgtatctcttgagctagacaacaaggttgagaccctggaaaccataaat 4680
Query: 4681 gaaaagattcgaaagcgtttcaagaatccaaagttgtctaatagtttttcggcaaaagtt 4740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4681 gaaaagattcgaaagcgtttcaagaatccaaagttgtctaatagtttttcggcaaaagtt 4740
Query: 4741 ggcagacatgcttctcttgcttggtgccgagctctgattataagcttggcactgataact 4800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4741 ggcagacatgcttctcttgcttggtgccgagctctgattataagcttggcactgataact 4800
Query: 4801 cccttgcagccagtatcctcggaggaaagtcaagcaataactccatcatttggtttactg 4860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4801 cccttgcagccagtatcctcggaggaaagtcaagcaataactccatcatttggtttactg 4860
Query: 4861 gaaaacagacgggtgctttgtgttgatctccagtctgaattctggagttcttcgttcgag 4920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4861 gaaaacagacgggtgctttgtgttgatctccagtctgaattctggagttcttcgttcgag 4920
Query: 4921 gatcccttagaatcccaaatgcttgaggcaaaatggcgccctgttctgtccaagattaag 4980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4921 gatcccttagaatcccaaatgcttgaggcaaaatggcgccctgttctgtccaagattaag 4980
Query: 4981 aacgtactgatttttaataaagttgtggaggggaatttggagatcgctaattccctactt 5040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4981 aacgtactgatttttaataaagttgtggaggggaatttggagatcgctaattccctactt 5040
Query: 5041 aaaagctgttacaatttcttccgagaaactgcttcggtgacactcccttctgatatcaac 5100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5041 aaaagctgttacaatttcttccgagaaactgcttcggtgacactcccttctgatatcaac 5100
Query: 5101 ctctatttcgcactgccccgactcgcaccagctggagaacttcttccaggcaatgaagga 5160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5101 ctctatttcgcactgccccgactcgcaccagctggagaacttcttccaggcaatgaagga 5160
Query: 5161 gttgaagtcattgatgtaagcatcccaaggaagcttcttttgtgggcttacacgttgttt 5220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5161 gttgaagtcattgatgtaagcatcccaaggaagcttcttttgtgggcttacacgttgttt 5220
Query: 5221 catggacattgtggaagcatctctcaggtcgtgaaatatatggaagaaaataccaagaaa 5280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5221 catggacattgtggaagcatctctcaggtcgtgaaatatatggaagaaaataccaagaaa 5280
Query: 5281 ttgtttgtgacaatcgcagccaaaaatgaagagaggagcctcaacttcatcagtggttcc 5340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5281 ttgtttgtgacaatcgcagccaaaaatgaagagaggagcctcaacttcatcagtggttcc 5340
Query: 5341 ttcggttcaatcaggtttgttaagatattacttttgggggaatcctatggaaagattcgg 5400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5341 ttcggttcaatcaggtttgttaagatattacttttgggggaatcctatggaaagattcgg 5400
Query: 5401 aacatcttatatagcaaaaatgtcgacgctactcagtgtggattttcctattga 5454
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5401 aacatcttatatagcaaaaatgtcgacgctactcagtgtggattttcctattga 5454
>At5g47500.1 68418.m05865 pectinesterase family protein contains Pfam profile:
PF01095 pectinesterase
Length = 1421
Score = 38.2 bits (19), Expect = 0.77
Identities = 19/19 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 944 agagagaaagtggtggttc 962
|||||||||||||||||||
Sbjct: 324 agagagaaagtggtggttc 342
>At5g39785.2 68418.m04819 expressed protein
Length = 1954
Score = 38.2 bits (19), Expect = 0.77
Identities = 19/19 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2264 ggattgaagaagagaagaa 2282
|||||||||||||||||||
Sbjct: 827 ggattgaagaagagaagaa 845
>At5g39785.1 68418.m04818 expressed protein
Length = 1949
Score = 38.2 bits (19), Expect = 0.77
Identities = 19/19 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2264 ggattgaagaagagaagaa 2282
|||||||||||||||||||
Sbjct: 827 ggattgaagaagagaagaa 845
>At5g16730.1 68418.m01959 expressed protein weak similarity to microtubule binding
protein D-CLIP-190 [Drosophila melanogaster] GI:2773363,
SMC2-like condensin [Arabidopsis thaliana] GI:14279543
Length = 2632
Score = 38.2 bits (19), Expect = 0.77
Identities = 19/19 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1673 ataaagctaaagcacttga 1691
|||||||||||||||||||
Sbjct: 359 ataaagctaaagcacttga 377
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
Posted date: Jun 25, 2004 12:58 PM
Number of letters in database: 44,058,232
Number of sequences in database: 29,161
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 189,905
Number of Sequences: 29161
Number of extensions: 189905
Number of successful extensions: 4613
Number of sequences better than 10.0: 34
length of query: 5454
length of database: 44,058,232
effective HSP length: 19
effective length of query: 5435
effective length of database: 43,504,173
effective search space: 236445180255
effective search space used: 236445180255
T: 0
A: 40
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 18 (36.2 bits)