BLASTN 2.2.3 [Apr-24-2002]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= At4g17610.F
(5553 letters)
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
29,161 sequences; 44,058,232 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
At4g17610.1 68417.m02633 tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)... 1.101e+04 0.0
At3g58470.1 68416.m06517 expressed protein several hypothet... 46 0.003
At5g66600.1 68418.m08395 expressed protein contains Pfam pr... 40 0.20
At5g55920.1 68418.m06975 nucleolar protein, putative simila... 40 0.20
At2g23980.1 68415.m02863 cyclic nucleotide-regulated ion ch... 40 0.20
>At4g17610.1 68417.m02633 tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU) family protein
similar to TAR RNA loop binding protein [Homo sapiens]
GI:1184692; contains Pfam profile PF00588: SpoU rRNA
Methylase (RNA methyltransferase, TrmH) family
Length = 5553
Score = 1.101e+04 bits (5553), Expect = 0.0
Identities = 5553/5553 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgggttcgtcagtgattacttcattgtcactgagcttcaagcaagttccaccagcagct 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atgggttcgtcagtgattacttcattgtcactgagcttcaagcaagttccaccagcagct 60
Query: 61 attcctgctttccttgactgtgttttaagctccacaggcgtatctccttcaactcttttc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 attcctgctttccttgactgtgttttaagctccacaggcgtatctccttcaactcttttc 120
Query: 121 gaatctctcattgagcaattcccttttcgtttagaggatacggtaaatggggacaagaga 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gaatctctcattgagcaattcccttttcgtttagaggatacggtaaatggggacaagaga 180
Query: 181 tttgattctgatgattgcaaccacatagcttcattggtggctgggctttgtcatctacta 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tttgattctgatgattgcaaccacatagcttcattggtggctgggctttgtcatctacta 240
Query: 241 aagaattttggctttgttgctgcggataatcataatgcgttgcagctatttgtgtggaga 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 aagaattttggctttgttgctgcggataatcataatgcgttgcagctatttgtgtggaga 300
Query: 301 gtgtttattccattgatgaagatggttcgtgcatatgatttggatatgcttaataagatt 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtgtttattccattgatgaagatggttcgtgcatatgatttggatatgcttaataagatt 360
Query: 361 gtagaatcgttctttgatgtagtgatcgagactaatgtattggatatgttgggagtgagc 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gtagaatcgttctttgatgtagtgatcgagactaatgtattggatatgttgggagtgagc 420
Query: 421 ttggtgccatttttactaagatcagttggtttttcgatgggaatgcgtcaacacgaagaa 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ttggtgccatttttactaagatcagttggtttttcgatgggaatgcgtcaacacgaagaa 480
Query: 481 tcagatttcatcaaatggggcgacctctgcctccgtgattctttgaatacaatagatatg 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 tcagatttcatcaaatggggcgacctctgcctccgtgattctttgaatacaatagatatg 540
Query: 541 gatgaaaactacattgcacagttgtctggatcatttccaattccattgtcgtgccatctt 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gatgaaaactacattgcacagttgtctggatcatttccaattccattgtcgtgccatctt 600
Query: 601 ctgaatttgattctgaatgctgcttttcaaagtcaccaagcagctccgaaggtggaaagt 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 ctgaatttgattctgaatgctgcttttcaaagtcaccaagcagctccgaaggtggaaagt 660
Query: 661 tttgcagctggtatgctttgggatttgtgtaatacgactgagcggcttttgtcacaaagt 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 tttgcagctggtatgctttgggatttgtgtaatacgactgagcggcttttgtcacaaagt 720
Query: 721 gtagaacatcgttcttgtgctgttagtttcctcctccctgctattttcaaggcattctct 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 gtagaacatcgttcttgtgctgttagtttcctcctccctgctattttcaaggcattctct 780
Query: 781 tctcagtcatccttgaagatctcacaccaaggaaatctgttcatactttcaaggaatggc 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 tctcagtcatccttgaagatctcacaccaaggaaatctgttcatactttcaaggaatggc 840
Query: 841 ttcataaaaagaatttgggaatgctgcaagaagctgttctcggttggatcaatagagaga 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 ttcataaaaagaatttgggaatgctgcaagaagctgttctcggttggatcaatagagaga 900
Query: 901 agggatgcttacagtgttctgtctttgtgtctttcttctggctcttggactgacggaact 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 agggatgcttacagtgttctgtctttgtgtctttcttctggctcttggactgacggaact 960
Query: 961 gaaagttttgtttcagaaaaagacgctgttcaatttgacttgaggtctgaacaagagttt 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 gaaagttttgtttcagaaaaagacgctgttcaatttgacttgaggtctgaacaagagttt 1020
Query: 1021 tgggatgaaatcaagataggcttggttgttgatgagagcttagtaaggaagcagtcattg 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 tgggatgaaatcaagataggcttggttgttgatgagagcttagtaaggaagcagtcattg 1080
Query: 1081 catatacttaaatcagttttatccattattgaagtgagtgagaccatttctgagaagaag 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 catatacttaaatcagttttatccattattgaagtgagtgagaccatttctgagaagaag 1140
Query: 1141 cccgaagggaattcagttaatcggtctatgacaagaaaggagacgtgggcagaaaaggaa 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 cccgaagggaattcagttaatcggtctatgacaagaaaggagacgtgggcagaaaaggaa 1200
Query: 1201 gccaagtcgcttggcgtcggagaattgtatggctctgtcgactctgggttgactagtcag 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1201 gccaagtcgcttggcgtcggagaattgtatggctctgtcgactctgggttgactagtcag 1260
Query: 1261 cagggatggcaagcttttctgctcttgtatgagatgcttgaggagtacggcactcatctt 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1261 cagggatggcaagcttttctgctcttgtatgagatgcttgaggagtacggcactcatctt 1320
Query: 1321 gtagaagcagcatggagtaaccagattgatttattaatcaagtcatctctcagatatgat 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1321 gtagaagcagcatggagtaaccagattgatttattaatcaagtcatctctcagatatgat 1380
Query: 1381 ggaaccttgaaatccgactgtaataactctcatcatggtcacatggaaactccagatgaa 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1381 ggaaccttgaaatccgactgtaataactctcatcatggtcacatggaaactccagatgaa 1440
Query: 1441 gaagctaaaatttttaattggttagaggttctttggaatcgaggctttcgtcatgataac 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1441 gaagctaaaatttttaattggttagaggttctttggaatcgaggctttcgtcatgataac 1500
Query: 1501 cctctagtcaggtgcacggtcatggagtcatttttcggtatcgagtggagaagatacaaa 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1501 cctctagtcaggtgcacggtcatggagtcatttttcggtatcgagtggagaagatacaaa 1560
Query: 1561 acatgtacacaatcaatgtcccaaactttcgttcttggtcctttcatagagggtttgaat 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1561 acatgtacacaatcaatgtcccaaactttcgttcttggtcctttcatagagggtttgaat 1620
Query: 1621 gatcctacacaccacaaggattttgggctgaaaggaatctatacatcaagaacaattgaa 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1621 gatcctacacaccacaaggattttgggctgaaaggaatctatacatcaagaacaattgaa 1680
Query: 1681 ggtgcagctcaatatgtgagtgcgtacacaagttgcctcaacccaaggaatcgggttgga 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1681 ggtgcagctcaatatgtgagtgcgtacacaagttgcctcaacccaaggaatcgggttgga 1740
Query: 1741 tttttgatcaacctggcatctcttgcgaagaaacagtctttttgtagagctggatttatg 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1741 tttttgatcaacctggcatctcttgcgaagaaacagtctttttgtagagctggatttatg 1800
Query: 1801 gctctcgtacaatgtattgtttctacggcatatgtagttggaggatacggggacaaggaa 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1801 gctctcgtacaatgtattgtttctacggcatatgtagttggaggatacggggacaaggaa 1860
Query: 1861 atggggcacctcgaagataaattctctgggactgcccaggaatcttcttgtggacattta 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1861 atggggcacctcgaagataaattctctgggactgcccaggaatcttcttgtggacattta 1920
Query: 1921 agtcaagatgatatgacacatatactggatgtcttgaagtttgttgcagagagcagcaga 1980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1921 agtcaagatgatatgacacatatactggatgtcttgaagtttgttgcagagagcagcaga 1980
Query: 1981 cagcattttaatcataaataccgtattcgagcttccctcacgatattaaacacactaaaa 2040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1981 cagcattttaatcataaataccgtattcgagcttccctcacgatattaaacacactaaaa 2040
Query: 2041 ttccttcttttgattgttcttttccattttctagtttatcaaaaagtgttagaaactgct 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2041 ttccttcttttgattgttcttttccattttctagtttatcaaaaagtgttagaaactgct 2100
Query: 2101 gcttctgtggtgaacccttgtaatgttcctcttggaacactattgcagtttgtttcagca 2160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2101 gcttctgtggtgaacccttgtaatgttcctcttggaacactattgcagtttgtttcagca 2160
Query: 2161 attcctcgggagtttactgaccatgatggtttattgcgcaaaatgatgttagaatggctc 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2161 attcctcgggagtttactgaccatgatggtttattgcgcaaaatgatgttagaatggctc 2220
Query: 2221 caggggtgcaacagaaagacttccaacagtttatgtactgatggcactcgtcttctggcg 2280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2221 caggggtgcaacagaaagacttccaacagtttatgtactgatggcactcgtcttctggcg 2280
Query: 2281 agcctttatgagtatctgaaaggatttaccagtgataatgttgagagttttgatgatgaa 2340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2281 agcctttatgagtatctgaaaggatttaccagtgataatgttgagagttttgatgatgaa 2340
Query: 2341 gacttggaggcatgggattcccaaacaaaacgatgggcaagagtatttttcctcatgatt 2400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2341 gacttggaggcatgggattcccaaacaaaacgatgggcaagagtatttttcctcatgatt 2400
Query: 2401 aataaagaagagcatctcaccgatatcataatgtttgtgcaaaataacggccttagtttt 2460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2401 aataaagaagagcatctcaccgatatcataatgtttgtgcaaaataacggccttagtttt 2460
Query: 2461 ttccaagagaagaaccatttaaaacgagcacctgcgaagtttttaatctttattctgagt 2520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2461 ttccaagagaagaaccatttaaaacgagcacctgcgaagtttttaatctttattctgagt 2520
Query: 2521 atgcttttagagctccagaacatgcaagatggaatttctgagcttagttcttcggtgaaa 2580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2521 atgcttttagagctccagaacatgcaagatggaatttctgagcttagttcttcggtgaaa 2580
Query: 2581 agcaagtcaggcattggctctgatgagcaaactggcaagcagattgttgtcgatgcttcc 2640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2581 agcaagtcaggcattggctctgatgagcaaactggcaagcagattgttgtcgatgcttcc 2640
Query: 2641 agtattaagaaaaagtttgctgtagttctcttatcaatactgaaggagctgattccattt 2700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2641 agtattaagaaaaagtttgctgtagttctcttatcaatactgaaggagctgattccattt 2700
Query: 2701 gctgattcatcttgttcaatattctggtctcatactactgtggagaatggtgctctgcct 2760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2701 gctgattcatcttgttcaatattctggtctcatactactgtggagaatggtgctctgcct 2760
Query: 2761 ggttctgtcataggaaaactagggggtccaagtcaacgccggctatctgttcctactaca 2820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2761 ggttctgtcataggaaaactagggggtccaagtcaacgccggctatctgttcctactaca 2820
Query: 2821 acagctgtactggaagctgtattgtcggtgaaaactattgggttgatctcgtcatactgt 2880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2821 acagctgtactggaagctgtattgtcggtgaaaactattgggttgatctcgtcatactgt 2880
Query: 2881 gctcaattcactagtggtgttggtgaactcaaattggcattggctttcttttggaagttc 2940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2881 gctcaattcactagtggtgttggtgaactcaaattggcattggctttcttttggaagttc 2940
Query: 2941 acccagcatactatatcatctcaaatttgtaattctgaggccgcagctgagatctatctt 3000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2941 acccagcatactatatcatctcaaatttgtaattctgaggccgcagctgagatctatctt 3000
Query: 3001 gcagcatttgaggcgctagcttcagtactgaatgcatttgtgtccttgtgctcagctgga 3060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3001 gcagcatttgaggcgctagcttcagtactgaatgcatttgtgtccttgtgctcagctgga 3060
Query: 3061 gctttcaaccttttagaaaacgatagtacattgttatccatggtagatggtgaattttgg 3120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3061 gctttcaaccttttagaaaacgatagtacattgttatccatggtagatggtgaattttgg 3120
Query: 3121 ttacaagtttcggttccggctttcgtccgtaacattaaccatcttctcacagcaggagtt 3180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3121 ttacaagtttcggttccggctttcgtccgtaacattaaccatcttctcacagcaggagtt 3180
Query: 3181 ctggtaagaagtagaagggcagttctgctaagctggaagtggctttgtgtggagtctctg 3240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3181 ctggtaagaagtagaagggcagttctgctaagctggaagtggctttgtgtggagtctctg 3240
Query: 3241 ttatcagtcatgcatattcttgatgccagacgtattccagaggatagaaagtcgttcttt 3300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3241 ttatcagtcatgcatattcttgatgccagacgtattccagaggatagaaagtcgttcttt 3300
Query: 3301 tcagatgatacagttaaaagcatttttcaagatattgtagagagccttgaaaatgctggg 3360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3301 tcagatgatacagttaaaagcatttttcaagatattgtagagagccttgaaaatgctggg 3360
Query: 3361 gagggttctgctttgcctatgctgaaatctgtcagactcgctttggggatacttgcgtct 3420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3361 gagggttctgctttgcctatgctgaaatctgtcagactcgctttggggatacttgcgtct 3420
Query: 3421 gggaaatcatctttggatggtttctcgggtgtggatactcagacgatgtggcagttggtc 3480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3421 gggaaatcatctttggatggtttctcgggtgtggatactcagacgatgtggcagttggtc 3480
Query: 3481 aaatcatgttggatattgcatatcagctgtaagaaaagaagggttgcacccattgctgcg 3540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3481 aaatcatgttggatattgcatatcagctgtaagaaaagaagggttgcacccattgctgcg 3540
Query: 3541 cttttgtcttctgtgttgcattcttctttgtttagtaataaagatatgcacataactgaa 3600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3541 cttttgtcttctgtgttgcattcttctttgtttagtaataaagatatgcacataactgaa 3600
Query: 3601 gatgagcatggtccgctgaagtggttcgttgaaaaagtacttgaggaaggtcagaaaagt 3660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3601 gatgagcatggtccgctgaagtggttcgttgaaaaagtacttgaggaaggtcagaaaagt 3660
Query: 3661 ccacgcacaattcgccttgcagcgttgcacctatcaggactctggctcatgtacccaagg 3720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3661 ccacgcacaattcgccttgcagcgttgcacctatcaggactctggctcatgtacccaagg 3720
Query: 3721 acgataaagtactacattaaagaattgaggcttctgactctctatggttctgttgcattt 3780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3721 acgataaagtactacattaaagaattgaggcttctgactctctatggttctgttgcattt 3780
Query: 3781 gatgaagattttgaagctgaattgtctgacaataatgatgccagaactgaagtatcatta 3840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3781 gatgaagattttgaagctgaattgtctgacaataatgatgccagaactgaagtatcatta 3840
Query: 3841 ttggccaaaagcccagaccctgaactgacagaactttttatcaacacggagttgtatgca 3900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3841 ttggccaaaagcccagaccctgaactgacagaactttttatcaacacggagttgtatgca 3900
Query: 3901 cgtgtctctgtcgctggtctgtttcagaagctggctaatttggcctatatggttgaacca 3960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3901 cgtgtctctgtcgctggtctgtttcagaagctggctaatttggcctatatggttgaacca 3960
Query: 3961 gcaagtcaaaatcaagattgtcaggatgctcttgtggctggaaaattgtttctattggag 4020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3961 gcaagtcaaaatcaagattgtcaggatgctcttgtggctggaaaattgtttctattggag 4020
Query: 4021 cttcttgatgcagcggtgcatgataaagacttggcaaaggagctttacaagaagtacagt 4080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4021 cttcttgatgcagcggtgcatgataaagacttggcaaaggagctttacaagaagtacagt 4080
Query: 4081 gctatccatagacggaaaatacgtgcttggcagatgatatgcattatgtcgcgatttgtc 4140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4081 gctatccatagacggaaaatacgtgcttggcagatgatatgcattatgtcgcgatttgtc 4140
Query: 4141 tgcaatgacattgttggccaagtaatggacagtgtgcacatatgcttacatgtaagttta 4200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4141 tgcaatgacattgttggccaagtaatggacagtgtgcacatatgcttacatgtaagttta 4200
Query: 4201 caagaacagactgaaagaaacaacctgcctgctgttcgacaatacctggaaacatttgcc 4260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4201 caagaacagactgaaagaaacaacctgcctgctgttcgacaatacctggaaacatttgcc 4260
Query: 4261 atcaacatttacctgaaatttccagcattggtgaaagagcagttagttcctatactaaaa 4320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4261 atcaacatttacctgaaatttccagcattggtgaaagagcagttagttcctatactaaaa 4320
Query: 4321 aattatgacagtaaagctcaggtaaatttacgcaaaactaagatgattgtatttgccaat 4380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4321 aattatgacagtaaagctcaggtaaatttacgcaaaactaagatgattgtatttgccaat 4380
Query: 4381 gttatcctccacgcagaaaagatagctcaacagacacatctaagagaacttcttccacca 4440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4381 gttatcctccacgcagaaaagatagctcaacagacacatctaagagaacttcttccacca 4440
Query: 4441 atactaccgttactaacttctcatcatcatagcttacgtggtttcgcgcagttattagtg 4500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4441 atactaccgttactaacttctcatcatcatagcttacgtggtttcgcgcagttattagtg 4500
Query: 4501 catcgagtactctttagactgtttccccctgtagagtctacatcctctcatacaatatcc 4560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4501 catcgagtactctttagactgtttccccctgtagagtctacatcctctcatacaatatcc 4560
Query: 4561 ctggagaaactttcttttgagaatttgaagtcttacctggacaagaatcctgattgttca 4620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4561 ctggagaaactttcttttgagaatttgaagtcttacctggacaagaatcctgattgttca 4620
Query: 4621 agattgcgagcatcaatggaaggatttcttgatgcatatgatcccagcacatctgctact 4680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4621 agattgcgagcatcaatggaaggatttcttgatgcatatgatcccagcacatctgctact 4680
Query: 4681 ccagccggtgtttttgtcaatcgtgttgaggaaagtgagtttgaatgtgttccaacatgc 4740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4681 ccagccggtgtttttgtcaatcgtgttgaggaaagtgagtttgaatgtgttccaacatgc 4740
Query: 4741 ctcatggataacgtgctctcttttctgaatgatgtaagggaagatctccgtgcctccatg 4800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4741 ctcatggataacgtgctctcttttctgaatgatgtaagggaagatctccgtgcctccatg 4800
Query: 4801 gcaaaggatgtagttaccataaaaaatgaaggcttcaagattgatgaagagcccaagcgt 4860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4801 gcaaaggatgtagttaccataaaaaatgaaggcttcaagattgatgaagagcccaagcgt 4860
Query: 4861 cggttgatcatgtccacgacagatgaagaaaggctttctgagccatcttcgttggatttc 4920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4861 cggttgatcatgtccacgacagatgaagaaaggctttctgagccatcttcgttggatttc 4920
Query: 4921 cagaggaagatcactctttccaaacatgagaagcaagatgctagttcaacttctgtgctc 4980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4921 cagaggaagatcactctttccaaacatgagaagcaagatgctagttcaacttctgtgctc 4980
Query: 4981 cgaaacggggaaacttacaagcggctctttgaaatggaaaaagaagatgagctcgtgact 5040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4981 cgaaacggggaaacttacaagcggctctttgaaatggaaaaagaagatgagctcgtgact 5040
Query: 5041 cagctcttacgatctagaagcatggaggtcgaaaggttgaaatctggtcgacagagtttg 5100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5041 cagctcttacgatctagaagcatggaggtcgaaaggttgaaatctggtcgacagagtttg 5100
Query: 5101 atccttgtggcttcattggttgatcgtattcctaatcttgctggattagcccggacatgt 5160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5101 atccttgtggcttcattggttgatcgtattcctaatcttgctggattagcccggacatgt 5160
Query: 5161 gaggtgtttaaagcatcaagtcttgctgttgcagatgcaagcataatacacgacaaacag 5220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5161 gaggtgtttaaagcatcaagtcttgctgttgcagatgcaagcataatacacgacaaacag 5220
Query: 5221 ttccaactaattagtgtgactgctgagaaatgggttccaatcatggaagtccccgtaaac 5280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5221 ttccaactaattagtgtgactgctgagaaatgggttccaatcatggaagtccccgtaaac 5280
Query: 5281 agtttgaaactgttcttggagaagaagaaacgggaagggttctcaatcttgggactggaa 5340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5281 agtttgaaactgttcttggagaagaagaaacgggaagggttctcaatcttgggactggaa 5340
Query: 5341 cagacagcgaatagcgtttcacttgacaaataccaattcccaaagaagacggttttggtg 5400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5341 cagacagcgaatagcgtttcacttgacaaataccaattcccaaagaagacggttttggtg 5400
Query: 5401 ctgggtcgtgaaaaggaaggcatcccagtggatataatccatatattggatgcttgtatc 5460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5401 ctgggtcgtgaaaaggaaggcatcccagtggatataatccatatattggatgcttgtatc 5460
Query: 5461 gagatcccacaacttggagttgttaggtccctcaatgttcatgtcagtggtgccattgcc 5520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5461 gagatcccacaacttggagttgttaggtccctcaatgttcatgtcagtggtgccattgcc 5520
Query: 5521 ctttgggaatacactcggcagcaacgcatttga 5553
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5521 ctttgggaatacactcggcagcaacgcatttga 5553
>At3g58470.1 68416.m06517 expressed protein several hypothetical proteins -
Saccharomyces cerevisiae
Length = 1029
Score = 46.1 bits (23), Expect = 0.003
Identities = 23/23 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5012 aaatggaaaaagaagatgagctc 5034
|||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aaatggaaaaagaagatgagctc 83
>At5g66600.1 68418.m08395 expressed protein contains Pfam profile PF04784:
Protein of unknown function, DUF547; expression
supported by MPSS
Length = 1845
Score = 40.1 bits (20), Expect = 0.20
Identities = 20/20 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 101 tatctccttcaactcttttc 120
||||||||||||||||||||
Sbjct: 115 tatctccttcaactcttttc 96
>At5g55920.1 68418.m06975 nucleolar protein, putative similar to SP|P46087
Proliferating-cell nucleolar antigen p120
(Proliferation-associated nucleolar protein p120) {Homo
sapiens}, SP|P40991 Nucleolar protein NOP2 {Saccharomyces
cerevisiae}; contains Pfam profile PF01189: NOL1/NOP2/sun
family
Length = 2372
Score = 40.1 bits (20), Expect = 0.20
Identities = 20/20 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 962 aaagttttgtttcagaaaaa 981
||||||||||||||||||||
Sbjct: 2308 aaagttttgtttcagaaaaa 2327
>At2g23980.1 68415.m02863 cyclic nucleotide-regulated ion channel / cyclic
nucleotide-gated channel (CNGC6) identical to cyclic
nucleotide and calmodulin-regulated ion channel (cngc6)
GI:4581207 from [Arabidopsis thaliana]
Length = 2493
Score = 40.1 bits (20), Expect = 0.20
Identities = 20/20 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 228 ttgtcatctactaaagaatt 247
||||||||||||||||||||
Sbjct: 2250 ttgtcatctactaaagaatt 2269
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
Posted date: Jun 25, 2004 12:58 PM
Number of letters in database: 44,058,232
Number of sequences in database: 29,161
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 182,726
Number of Sequences: 29161
Number of extensions: 182726
Number of successful extensions: 3948
Number of sequences better than 10.0: 27
length of query: 5553
length of database: 44,058,232
effective HSP length: 19
effective length of query: 5534
effective length of database: 43,504,173
effective search space: 240752093382
effective search space used: 240752093382
T: 0
A: 40
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 18 (36.2 bits)