BLASTN 2.2.3 [Apr-24-2002]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= At3g48770.F
(5700 letters)
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
29,161 sequences; 44,058,232 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
At3g48770.1 68416.m05326 hypothetical protein 1.130e+04 0.0
At3g28020.1 68416.m03498 hypothetical protein 180 9e-44
At5g66380.1 68418.m08370 mitochondrial substrate carrier fa... 42 0.052
At3g15470.1 68416.m01962 WD-40 repeat family protein contai... 40 0.20
At5g52130.1 68418.m06470 hypothetical protein 38 0.81
>At3g48770.1 68416.m05326 hypothetical protein
Length = 5700
Score = 1.130e+04 bits (5700), Expect = 0.0
Identities = 5700/5700 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggagaaggctttttcaccaaatacaagcaatataaagcaagagaaatcgtcgaaccgt 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atggagaaggctttttcaccaaatacaagcaatataaagcaagagaaatcgtcgaaccgt 60
Query: 61 tccagtcatcacaaacaagatttggcttggaactatgttagagaagctattgattcaaga 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tccagtcatcacaaacaagatttggcttggaactatgttagagaagctattgattcaaga 120
Query: 121 cggagaaaagttataacttgtggcttttgtggtaaacaatacgttggaagtgaaataaat 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cggagaaaagttataacttgtggcttttgtggtaaacaatacgttggaagtgaaataaat 180
Query: 181 agaatgaaacatcacttggctggattgaataatagaagtgcatgccaaaaggtttcttcc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 agaatgaaacatcacttggctggattgaataatagaagtgcatgccaaaaggtttcttcc 240
Query: 241 gaggttcaacattcgatgagaaaatcattggaagaaaacaaagagaaaccgaagaaaata 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gaggttcaacattcgatgagaaaatcattggaagaaaacaaagagaaaccgaagaaaata 300
Query: 301 atcgttgtggatcttgatatgcaagacgatgaagtaaatgttggtcaaagttctcatcaa 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 atcgttgtggatcttgatatgcaagacgatgaagtaaatgttggtcaaagttctcatcaa 360
Query: 361 tcttgcagttcttcaagtcgaaaaagaaaggttcaacattcgatgagaaaatcattggaa 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 tcttgcagttcttcaagtcgaaaaagaaaggttcaacattcgatgagaaaatcattggaa 420
Query: 421 gaaaccgaagagaaactgaagcaaataattgttgttgatcttgatatgcaagacaatgaa 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gaaaccgaagagaaactgaagcaaataattgttgttgatcttgatatgcaagacaatgaa 480
Query: 481 gtaaatgttggtcaaagttctcttcaatcattcagttcttcaaatcgaaaaagaaagaga 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gtaaatgttggtcaaagttctcttcaatcattcagttcttcaaatcgaaaaagaaagaga 540
Query: 541 gaaaccaaaacaaaaccagtaataatagagacaatgacggaatcggctaagcaacacatt 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gaaaccaaaacaaaaccagtaataatagagacaatgacggaatcggctaagcaacacatt 600
Query: 601 gaacgaattcgtcggactaagttttcaatcggtggagctgagaatccgttgacggaggat 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gaacgaattcgtcggactaagttttcaatcggtggagctgagaatccgttgacggaggat 660
Query: 661 cttcatcaagctgtgaagaatctctccgctgagctctatgcaaaggatgttcactttctt 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 cttcatcaagctgtgaagaatctctccgctgagctctatgcaaaggatgttcactttctt 720
Query: 721 atggaacttatccaaaatgcggaagataacgagtatccagaaggtgtggatccatctctt 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 atggaacttatccaaaatgcggaagataacgagtatccagaaggtgtggatccatctctt 780
Query: 781 gaatttgtgataacatctgaggatatcacaaacaccggagctccagccactcttcttatt 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 gaatttgtgataacatctgaggatatcacaaacaccggagctccagccactcttcttatt 840
Query: 841 ttcaacaatgagaaaggtttctctgagaaaaacattgagtccatctgcagtgttggacgg 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 ttcaacaatgagaaaggtttctctgagaaaaacattgagtccatctgcagtgttggacgg 900
Query: 901 tctacaaagaaaggcaatcgaaaatgcggttacatcggagagaaaggaatcggtttcaag 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 tctacaaagaaaggcaatcgaaaatgcggttacatcggagagaaaggaatcggtttcaag 960
Query: 961 agtgtgtttctgattacgtcgcagccttatatcttcagcaatggctatcagattcgcttc 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 agtgtgtttctgattacgtcgcagccttatatcttcagcaatggctatcagattcgcttc 1020
Query: 1021 aatgaggcaccttgcagccactgcagccttggctacattgttcctgagtgggttgaccaa 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 aatgaggcaccttgcagccactgcagccttggctacattgttcctgagtgggttgaccaa 1080
Query: 1081 catccttctcttgttgatatacaaaggatgtatggttcgggttctgctcttccgaccaca 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 catccttctcttgttgatatacaaaggatgtatggttcgggttctgctcttccgaccaca 1140
Query: 1141 accattatcttgcctttgaagagtgacaaagtaaagccggtgaaagaacagctttccaat 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 accattatcttgcctttgaagagtgacaaagtaaagccggtgaaagaacagctttccaat 1200
Query: 1201 gttcatcctgaggttctgttgtttttgtcaaagatcaaacgtctctctatcagagaacat 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1201 gttcatcctgaggttctgttgtttttgtcaaagatcaaacgtctctctatcagagaacat 1260
Query: 1261 tgcctagatcctaagctcagtactgtgaactcaatagggattgttagtgagactaacttt 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1261 tgcctagatcctaagctcagtactgtgaactcaatagggattgttagtgagactaacttt 1320
Query: 1321 gtgacgaggaagagcattgatgcggagtcatacacgatacatctctcagcttctgagaaa 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1321 gtgacgaggaagagcattgatgcggagtcatacacgatacatctctcagcttctgagaaa 1380
Query: 1381 gggaaaaactctgaacaagaatgctcctactatatgtggaggcaaaagtttccagtgaaa 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1381 gggaaaaactctgaacaagaatgctcctactatatgtggaggcaaaagtttccagtgaaa 1440
Query: 1441 catgagaaccgtgtggacaggagaagcgaagttgaggagtgggtgatcactttagcgttt 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1441 catgagaaccgtgtggacaggagaagcgaagttgaggagtgggtgatcactttagcgttt 1500
Query: 1501 ccattcggagagcgtcttggccatggaaataactctcctggtatctatgcgtttcttccc 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1501 ccattcggagagcgtcttggccatggaaataactctcctggtatctatgcgtttcttccc 1560
Query: 1561 acagaaatggtaacaaactttcccttcatcattcaagccgatttcattctagcatcgtct 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1561 acagaaatggtaacaaactttcccttcatcattcaagccgatttcattctagcatcgtct 1620
Query: 1621 agagaaatgatccttttagatgatatatggaaccaagggattctcaactgtgtacctcta 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1621 agagaaatgatccttttagatgatatatggaaccaagggattctcaactgtgtacctcta 1680
Query: 1681 gcatttttgaatgcattcacgtctttggtcaaaacgactgatgctccagtgtctagtttg 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1681 gcatttttgaatgcattcacgtctttggtcaaaacgactgatgctccagtgtctagtttg 1740
Query: 1741 ctgcctgcttttaggttcttgcctgtaaaagaatctaactatgcaaagctgaatgtggtc 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1741 ctgcctgcttttaggttcttgcctgtaaaagaatctaactatgcaaagctgaatgtggtc 1800
Query: 1801 cgagaatctatcagggcaagggtttgtgcagaggaaattgtaccaagcatatctcatcaa 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1801 cgagaatctatcagggcaagggtttgtgcagaggaaattgtaccaagcatatctcatcaa 1860
Query: 1861 ggacagaagttcttttacaagccgtgtgaagttggtcgtctcatacctactttctgggac 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1861 ggacagaagttcttttacaagccgtgtgaagttggtcgtctcatacctactttctgggac 1920
Query: 1921 atcttagagaaagcaggaagtgaaggtgcgagtctgcagaacatatcatcacatggcatc 1980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1921 atcttagagaaagcaggaagtgaaggtgcgagtctgcagaacatatcatcacatggcatc 1980
Query: 1981 tacattttgaattccgcttttgacagaacagaatatgacaacgttttgaacttcttgggt 2040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1981 tacattttgaattccgcttttgacagaacagaatatgacaacgttttgaacttcttgggt 2040
Query: 2041 ctgaagcaagtaagcaacgaatggtatgtaaaatgcattcagggctgtgatctcgtgaca 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2041 ctgaagcaagtaagcaacgaatggtatgtaaaatgcattcagggctgtgatctcgtgaca 2100
Query: 2101 agtgtgtcagaagctacgtatgtggaggttctactcttcatcgctgagaattggcagtgc 2160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2101 agtgtgtcagaagctacgtatgtggaggttctactcttcatcgctgagaattggcagtgc 2160
Query: 2161 aggtttcagaatacaaatatggggaaagttccccttatcaagtatgttgtccaaaaggga 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2161 aggtttcagaatacaaatatggggaaagttccccttatcaagtatgttgtccaaaaggga 2220
Query: 2221 gtgagttctctcagcagtttgggtggtttcagtcctaggactttatgcttgtccacagag 2280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2221 gtgagttctctcagcagtttgggtggtttcagtcctaggactttatgcttgtccacagag 2280
Query: 2281 aagaaccaggcatggctacttgattggaacgatgagttcagatgtatgtctaacttcgtc 2340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2281 aagaaccaggcatggctacttgattggaacgatgagttcagatgtatgtctaacttcgtc 2340
Query: 2341 ttcatgccaccaacaacccggacagcgttgaaagtgtgctccaagaaggagataattcat 2400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2341 ttcatgccaccaacaacccggacagcgttgaaagtgtgctccaagaaggagataattcat 2400
Query: 2401 acttggctcaaagagaacgttaaagtcattactcttagtgtctctgactatgcaaaacat 2460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2401 acttggctcaaagagaacgttaaagtcattactcttagtgtctctgactatgcaaaacat 2460
Query: 2461 ctccgtgagaatcttaatggagataagaggcttgttgttgcatatgcacactttctgcat 2520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2461 ctccgtgagaatcttaatggagataagaggcttgttgttgcatatgcacactttctgcat 2520
Query: 2521 cactcaatctcaaaggattttttatcaaaagaagaagcgggtaaatgctgcaaagacatg 2580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2521 cactcaatctcaaaggattttttatcaaaagaagaagcgggtaaatgctgcaaagacatg 2580
Query: 2581 ccgcttgtggacaactatgggaatgtaaacataagcaggaatggggttcttgttccagct 2640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2581 ccgcttgtggacaactatgggaatgtaaacataagcaggaatggggttcttgttccagct 2640
Query: 2641 agtgcaggtaaatgggttagcttagttggttccaatccgtggagacatagtggctacatt 2700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2641 agtgcaggtaaatgggttagcttagttggttccaatccgtggagacatagtggctacatt 2700
Query: 2701 gaactttcagaagagtatttgttgtcgaacaggttcgctggtcttcggtctaacaagaaa 2760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2701 gaactttcagaagagtatttgttgtcgaacaggttcgctggtcttcggtctaacaagaaa 2760
Query: 2761 gaccttctcgggttcttgaaatcttctgttgaggctggagatatacctgacatagaacct 2820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2761 gaccttctcgggttcttgaaatcttctgttgaggctggagatatacctgacatagaacct 2820
Query: 2821 cctaatgttgctatacctgcattgtcagggcctcttacaaaggagaatgttttgttgctg 2880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2821 cctaatgttgctatacctgcattgtcagggcctcttacaaaggagaatgttttgttgctg 2880
Query: 2881 ttagagtggattaataagtgtaacagacattctcttcgttccaactttttgaattctgtt 2940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2881 ttagagtggattaataagtgtaacagacattctcttcgttccaactttttgaattctgtt 2940
Query: 2941 agaggaggaagttggctgagaacaacaatgaatggggtttctgattatcggccgccttct 3000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2941 agaggaggaagttggctgagaacaacaatgaatggggtttctgattatcggccgccttct 3000
Query: 3001 cagtcgttttatcatacttcatcatggggaagtattcttcagaacggttcaattcttgtt 3060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3001 cagtcgttttatcatacttcatcatggggaagtattcttcagaacggttcaattcttgtt 3060
Query: 3061 gatattccgctcgttgatcgaagctactatggcaacgagattgagaagtacaaagaagag 3120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3061 gatattccgctcgttgatcgaagctactatggcaacgagattgagaagtacaaagaagag 3120
Query: 3121 ttgaaaattgctggtgtcatgtttgagttcagtgaagtatgtagatttgttggcaaccac 3180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3121 ttgaaaattgctggtgtcatgtttgagttcagtgaagtatgtagatttgttggcaaccac 3180
Query: 3181 ctgatgagtttagctgagacgtcaacacagtcaagcgcaaacgtgttctcaatactgaaa 3240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3181 ctgatgagtttagctgagacgtcaacacagtcaagcgcaaacgtgttctcaatactgaaa 3240
Query: 3241 ttcatcaggtacttgagagagaagcgcctctcaccagctgatttcatcactgctgtcaaa 3300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3241 ttcatcaggtacttgagagagaagcgcctctcaccagctgatttcatcactgctgtcaaa 3300
Query: 3301 aatggtccttggctgaagactatttctggttaccgatctccagatggagctgttttgttc 3360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3301 aatggtccttggctgaagactatttctggttaccgatctccagatggagctgttttgttc 3360
Query: 3361 agcgaggaatggaaagctgcgtcgttgatcagtgacatcccattcattgacagaggtttc 3420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3361 agcgaggaatggaaagctgcgtcgttgatcagtgacatcccattcattgacagaggtttc 3420
Query: 3421 tatggtgtagttagcctcaatggttataaggaagagcttgagttgcttggcgttgtagtt 3480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3421 tatggtgtagttagcctcaatggttataaggaagagcttgagttgcttggcgttgtagtt 3480
Query: 3481 aagtttcctgataactacagcctcatcgtttcacatttgaatactgcaaagctgacttac 3540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3481 aagtttcctgataactacagcctcatcgtttcacatttgaatactgcaaagctgacttac 3540
Query: 3541 ttgacacctgatgcaatgttcctagtacttgactgcatgcgtcaactgagtccacatagg 3600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3541 ttgacacctgatgcaatgttcctagtacttgactgcatgcgtcaactgagtccacatagg 3600
Query: 3601 ctgatcaatgccctgtggaattcttctcagtgcttcaagacaaagaagaatggctataaa 3660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3601 ctgatcaatgccctgtggaattcttctcagtgcttcaagacaaagaagaatggctataaa 3660
Query: 3661 tctcctgctgaatgtttcatacctgatccagagtggacttgtcttctttctgtttttgat 3720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3661 tctcctgctgaatgtttcatacctgatccagagtggacttgtcttctttctgtttttgat 3720
Query: 3721 tgcttccctttgatcgatgatgatttctatggcagcagaatctttgcctacaaaggagaa 3780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3721 tgcttccctttgatcgatgatgatttctatggcagcagaatctttgcctacaaaggagaa 3780
Query: 3781 ctgaagcagattggtgttaagcttcagcttgaagaagctgtgaaaatgtttgtgagtaca 3840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3781 ctgaagcagattggtgttaagcttcagcttgaagaagctgtgaaaatgtttgtgagtaca 3840
Query: 3841 tttaaacagaaagctatctcctctgggctaacacgatgtaccgcatcgtctcttttatct 3900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3841 tttaaacagaaagctatctcctctgggctaacacgatgtaccgcatcgtctcttttatct 3900
Query: 3901 tgctacaagaagctgatgggaagtttgtacaaatatcctgaagaacttatgaaaagcttc 3960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3901 tgctacaagaagctgatgggaagtttgtacaaatatcctgaagaacttatgaaaagcttc 3960
Query: 3961 aaacagtttcaatggctgcataccaaacttggtgattttcgtgcaccaaaggactgtatt 4020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3961 aaacagtttcaatggctgcataccaaacttggtgattttcgtgcaccaaaggactgtatt 4020
Query: 4021 ctctttgattcagaatgggaacctctccgcctcatagcgaatcttccctttatcgatgat 4080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4021 ctctttgattcagaatgggaacctctccgcctcatagcgaatcttccctttatcgatgat 4080
Query: 4081 ggtccgaactggtatggcaagagcatacacgagttcagaaaagagctcgagagtttggga 4140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4081 ggtccgaactggtatggcaagagcatacacgagttcagaaaagagctcgagagtttggga 4140
Query: 4141 gttacagttgagctgaggaaaggcatgagccatgtgatcagctccttaagtctccctgat 4200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4141 gttacagttgagctgaggaaaggcatgagccatgtgatcagctccttaagtctccctgat 4200
Query: 4201 ccatctcgcatcgctccttcaagcgccttgtctctttttaggtgcatcaagttcttgcgt 4260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4201 ccatctcgcatcgctccttcaagcgccttgtctctttttaggtgcatcaagttcttgcgt 4260
Query: 4261 gaagacagatttcagcaactccctaaagagcttcttgataaggtctcagtaaaatggttg 4320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4261 gaagacagatttcagcaactccctaaagagcttcttgataaggtctcagtaaaatggttg 4320
Query: 4321 aagacacatgcaggttaccgcagtcccgaggagtgtctcttgtttgataggacctggaag 4380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4321 aagacacatgcaggttaccgcagtcccgaggagtgtctcttgtttgataggacctggaag 4380
Query: 4381 ttagagccgtgtgatggtcccttcatcgacgaagagtattatggctcagatattaattcg 4440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4381 ttagagccgtgtgatggtcccttcatcgacgaagagtattatggctcagatattaattcg 4440
Query: 4441 tttagagaagagcttattgcgataggagttggtcatgattcagacaaagcttgccagttg 4500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4441 tttagagaagagcttattgcgataggagttggtcatgattcagacaaagcttgccagttg 4500
Query: 4501 cttgcaagaaatgtctataaactctcagaaactgatgctatttcccgggtttatagattt 4560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4501 cttgcaagaaatgtctataaactctcagaaactgatgctatttcccgggtttatagattt 4560
Query: 4561 cttagtgaagctgaatggaaacctgagaaaggtgcctcttcaggtcggatttggatacca 4620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4561 cttagtgaagctgaatggaaacctgagaaaggtgcctcttcaggtcggatttggatacca 4620
Query: 4621 agtgatgagaaatgggctgatatttctagttgtgtgctctttgacaaagataagctcttt 4680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4621 agtgatgagaaatgggctgatatttctagttgtgtgctctttgacaaagataagctcttt 4680
Query: 4681 ggatcaaagtttaacgttcttgaaaaccactattgtagtggtaaggatcataaccttctt 4740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4681 ggatcaaagtttaacgttcttgaaaaccactattgtagtggtaaggatcataaccttctt 4740
Query: 4741 ggtttcttctcatctgcatttggcgtgagaattaatccgtctattgaagattactgcgag 4800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4741 ggtttcttctcatctgcatttggcgtgagaattaatccgtctattgaagattactgcgag 4800
Query: 4801 ttgtggaaatattgggagaaaactaagaacagattgtctagtcatgagtgttgtgcgttc 4860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4801 ttgtggaaatattgggagaaaactaagaacagattgtctagtcatgagtgttgtgcgttc 4860
Query: 4861 tggagctttgttgtgcgacatggtgacacggtgaaagcagagaagctcctctctgagtcc 4920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4861 tggagctttgttgtgcgacatggtgacacggtgaaagcagagaagctcctctctgagtcc 4920
Query: 4921 ttttcgcgtttgcctgtacactcaccggattgcaacaacaacgacggagtcatgttatct 4980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4921 ttttcgcgtttgcctgtacactcaccggattgcaacaacaacgacggagtcatgttatct 4980
Query: 4981 agcataagcgacgtgttcatagctgatgacttgctcttgaaagatatgtttattgattct 5040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4981 agcataagcgacgtgttcatagctgatgacttgctcttgaaagatatgtttattgattct 5040
Query: 5041 cctgttttcgtttggtatccaactccaagcattcctacattgtcccgaaccagacttatt 5100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5041 cctgttttcgtttggtatccaactccaagcattcctacattgtcccgaaccagacttatt 5100
Query: 5101 gagatttatcgaaacatcggtgtcaaagaggtctccaaatgcgtcgagatcgcagaagct 5160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5101 gagatttatcgaaacatcggtgtcaaagaggtctccaaatgcgtcgagatcgcagaagct 5160
Query: 5161 gatctaaccggattcaaaaccgagctgcaagaggttgttgatccaaagaagaacctgatt 5220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5161 gatctaaccggattcaaaaccgagctgcaagaggttgttgatccaaagaagaacctgatt 5220
Query: 5221 ggaccggggctagtgaagctcattctcgcgttcctctctgatccatctctcaaggtagaa 5280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5221 ggaccggggctagtgaagctcattctcgcgttcctctctgatccatctctcaaggtagaa 5280
Query: 5281 actgctgaacgtttaagaatcatacatagccttgttgacatcgacgttaaagaaacttcg 5340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5281 actgctgaacgtttaagaatcatacatagccttgttgacatcgacgttaaagaaacttcg 5340
Query: 5341 gagactatcacaacggagtatactctgagtctaccttcaaagggagagaagctgattgca 5400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5341 gagactatcacaacggagtatactctgagtctaccttcaaagggagagaagctgattgca 5400
Query: 5401 aaggctaagaggatgataagatgggaaagggagaaaggagtggtttatgcagagaagatg 5460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5401 aaggctaagaggatgataagatgggaaagggagaaaggagtggtttatgcagagaagatg 5460
Query: 5461 gagaaaacttgtggtaaaagaaagcttttggagtacgccacgtgtttcgctgaggtgatt 5520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5461 gagaaaacttgtggtaaaagaaagcttttggagtacgccacgtgtttcgctgaggtgatt 5520
Query: 5521 gctaagggtgtgatgtgggagagagaggatctgatcggacggttatcagagcttgtgaag 5580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5521 gctaagggtgtgatgtgggagagagaggatctgatcggacggttatcagagcttgtgaag 5580
Query: 5581 atggcttacttggttgagtttgatgaagaggctttagagtttcttatgaagtctaagaac 5640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5581 atggcttacttggttgagtttgatgaagaggctttagagtttcttatgaagtctaagaac 5640
Query: 5641 cttcaggtctatgaagaagatgagaaactaatctcagatgagttctctcaagtaaactaa 5700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5641 cttcaggtctatgaagaagatgagaaactaatctcagatgagttctctcaagtaaactaa 5700
>At3g28020.1 68416.m03498 hypothetical protein
Length = 741
Score = 180 bits (91), Expect = 9e-44
Identities = 151/171 (88%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1042 tgcagccttggctacattgttcctgagtgggttgaccaacatccttctcttgttgatata 1101
|||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||
Sbjct: 109 tgcaaccttggctacattgttcctgagtgggttgagaaacgtccttctctggtcgatatt 168
Query: 1102 caaaggatgtatggttcgggttctgctcttccgaccacaaccattatcttgcctttgaag 1161
|||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||
Sbjct: 169 caaaagattaatggttttggttctgctattccgaccacaacaataatcatgcctttgaaa 228
Query: 1162 agtgacaaagtaaagccggtgaaagaacagctttccaatgttcatcctgag 1212
||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct: 229 agtgacaaagtaaagccagtgaaagaacaactctccaatgttcatcctgag 279
Score = 81.8 bits (41), Expect = 6e-14
Identities = 77/89 (86%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1637 tagatgatatatggaaccaagggattctcaactgtgtacctctagcatttttgaatgcat 1696
|||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||
Sbjct: 545 tagatgatatgtggaaccaagggattctcagctgtgttccttctgcatttgtgaatgcat 604
Query: 1697 tcacgtctttggtcaaaacgactgatgct 1725
|||| ||||| || |||| ||| ||||||
Sbjct: 605 tcacttctttagtgaaaaagacagatgct 633
Score = 75.8 bits (38), Expect = 4e-12
Identities = 118/144 (81%), Gaps = 3/144 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1422 gcaaaagtttccagtgaaacatgagaaccgtgtggacaggagaagcgaagttgaggagtg 1481
||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
Sbjct: 372 gcaaaagttaacggtgaaaaatgagaaccgtgtgggaaggagaggcgaagttgaggaatt 431
Query: 1482 ggtgatcactttagcgtttccattcggagagcgtcttggccatggaaataact---ctcc 1538
| ||| || || | ||||| | ||||||| ||||||| || |||| ||| || ||||
Sbjct: 432 gttgacaacgttggtgtttctactcggagaccgtcttgcccttggagatagctttcctcc 491
Query: 1539 tggtatctatgcgtttcttcccac 1562
| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 492 tagtatctatgcgtttcttcccac 515
Score = 65.9 bits (33), Expect = 4e-09
Identities = 75/89 (84%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1746 tgcttttaggttcttgcctgtaaaagaatctaactatgcaaagctgaatgtggtccgaga 1805
||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | | || |||||| ||||||||
Sbjct: 630 tgcttttagtttcttgcctgtgaaggtatctaactacgaagagttgaatgatgtccgaga 689
Query: 1806 atctatcagggcaagggtttgtgcagagg 1834
|||||| | ||||||||||| |||||||
Sbjct: 690 atctattatggcaagggttttggcagagg 718
Score = 58.0 bits (29), Expect = 9e-07
Identities = 47/53 (88%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1297 gggattgttagtgagactaactttgtgacgaggaagagcattgatgcggagtc 1349
||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 319 gggattgttagcgagactaatttggtgtcaaggaagagcattgatgctgagtc 371
Score = 54.0 bits (27), Expect = 1e-05
Identities = 75/91 (82%)
Strand = Plus / Plus
Query: 578 cggaatcggctaagcaacacattgaacgaattcgtcggactaagttttcaatcggtggag 637
|||||||| | ||||||||||| || | ||| || ||||||||| ||||| || |||
Sbjct: 5 cggaatcgacaaagcaacacatcgatctaatccgggagactaagttctcaattggcagag 64
Query: 638 ctgagaatccgttgacggaggatcttcatca 668
|| | ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 65 cttataatcctttgacggaggatcttcatca 95
>At5g66380.1 68418.m08370 mitochondrial substrate carrier family protein contains
Pfam profile: PF00153 mitochondrial carrier protein
Length = 1180
Score = 42.1 bits (21), Expect = 0.052
Identities = 21/21 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 5591 tggttgagtttgatgaagagg 5611
|||||||||||||||||||||
Sbjct: 567 tggttgagtttgatgaagagg 547
>At3g15470.1 68416.m01962 WD-40 repeat family protein contains Pfam PF00400: WD
domain, G-beta repeat; similar to WD-repeat protein 5 (WD
repeat protein BIG-3) (SP: Q9UGP9) [Homo sapiens]
Length = 3370
Score = 40.1 bits (20), Expect = 0.20
Identities = 23/24 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 527 gaaaaagaaagagagaaaccaaaa 550
|||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 3196 gaaatagaaagagagaaaccaaaa 3219
>At5g52130.1 68418.m06470 hypothetical protein
Length = 492
Score = 38.2 bits (19), Expect = 0.81
Identities = 19/19 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 3042 gaacggttcaattcttgtt 3060
|||||||||||||||||||
Sbjct: 191 gaacggttcaattcttgtt 173
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
Posted date: Jun 25, 2004 12:58 PM
Number of letters in database: 44,058,232
Number of sequences in database: 29,161
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 204,556
Number of Sequences: 29161
Number of extensions: 204556
Number of successful extensions: 4796
Number of sequences better than 10.0: 33
length of query: 5700
length of database: 44,058,232
effective HSP length: 19
effective length of query: 5681
effective length of database: 43,504,173
effective search space: 247147206813
effective search space used: 247147206813
T: 0
A: 40
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 18 (36.2 bits)