BLASTN 2.2.3 [Apr-24-2002]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= At2g27120.F
(6465 letters)
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
29,161 sequences; 44,058,232 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
At2g27120.1 68415.m03259 DNA-directed DNA polymerase epsilo... 7370 0.0
At1g08260.1 68414.m00911 DNA-directed DNA polymerase epsilo... 1778 0.0
At1g08270.2 68414.m00912 expressed protein low similarity t... 254 8e-66
At4g37780.1 68417.m05347 myb family transcription factor (M... 42 0.059
At2g42820.1 68415.m05301 abscisic acid-responsive HVA22 fam... 40 0.23
>At2g27120.1 68415.m03259 DNA-directed DNA polymerase epsilon catalytic subunit,
putative similar to SP|Q07864 DNA polymerase epsilon,
catalytic subunit A (EC 2.7.7.7) (DNA polymerase II
subunit A) {Homo sapiens}; contains Pfam profiles:
PF03175 DNA polymerase type B, organellar and viral,
PF00136 DNA polymerase family B, PF03104 DNA polymerase
family B, exonuclease domain
Length = 6417
Score = 7370 bits (3718), Expect = 0.0
Identities = 3718/3718 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgagcggaaggagatgtgatcggaggttgaatgtgcagaaagtttcagcggcagatgaa 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atgagcggaaggagatgtgatcggaggttgaatgtgcagaaagtttcagcggcagatgaa 60
Query: 61 ctcgaaactaaacttggatttgggcttttctcccaaggggaaacgcggctcgggtggcta 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 ctcgaaactaaacttggatttgggcttttctcccaaggggaaacgcggctcgggtggcta 120
Query: 121 ctcacgtttgcatcatcatcttgggaagatgccgatactgggaaaacctttagttgtgtg 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ctcacgtttgcatcatcatcttgggaagatgccgatactgggaaaacctttagttgtgtg 180
Query: 181 gaccttttctttgtcactcaggacggctcttcttttaagactaagtacaagttccgccct 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 gaccttttctttgtcactcaggacggctcttcttttaagactaagtacaagttccgccct 240
Query: 241 tacttgtatgccgccaccaaagacaatatggaactggaagttgaagcctacttgagacgc 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tacttgtatgccgccaccaaagacaatatggaactggaagttgaagcctacttgagacgc 300
Query: 301 cgatatgaaagacaagttgctgatattcagattgttcacaaagaagatctttatcttaaa 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 cgatatgaaagacaagttgctgatattcagattgttcacaaagaagatctttatcttaaa 360
Query: 361 aatcatctatctggcctgcaaaaaaaatatctcaaagtatcatttgacactgtgcaacaa 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 aatcatctatctggcctgcaaaaaaaatatctcaaagtatcatttgacactgtgcaacaa 420
Query: 421 ttggtggaagtaaagagggatctgttgcatattgtcgaacgaaacctcgcaaaatttaat 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ttggtggaagtaaagagggatctgttgcatattgtcgaacgaaacctcgcaaaatttaat 480
Query: 481 gcacttgaagcttacgaatccatcttgtctggaaaacgagaacaacgtcctcaagactgc 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gcacttgaagcttacgaatccatcttgtctggaaaacgagaacaacgtcctcaagactgc 540
Query: 541 ttagactctgtggtggacctccgcgagtacgatgttccttatcatgtccgatttgcaatt 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 ttagactctgtggtggacctccgcgagtacgatgttccttatcatgtccgatttgcaatt 600
Query: 601 gataatgatgtgcgtagtgggcaatggtacaatgtcagtatttccagcactgatgtcata 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gataatgatgtgcgtagtgggcaatggtacaatgtcagtatttccagcactgatgtcata 660
Query: 661 ctagagaagaggacggatcttctccaacgcgcagaagttcgcgtttgtgcattcgatata 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 ctagagaagaggacggatcttctccaacgcgcagaagttcgcgtttgtgcattcgatata 720
Query: 721 gagacagtaaagcttccattgaagttcccggatgctgaatatgatcaaattatgatgata 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 gagacagtaaagcttccattgaagttcccggatgctgaatatgatcaaattatgatgata 780
Query: 781 tcctacatggttgatgggcaaggttttctaattactaacagagagtgtgttggcaaagac 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 tcctacatggttgatgggcaaggttttctaattactaacagagagtgtgttggcaaagac 840
Query: 841 atagaagatctggaatatacacccaaaccagagtttgaagggtatttcaaagtcacgaat 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 atagaagatctggaatatacacccaaaccagagtttgaagggtatttcaaagtcacgaat 900
Query: 901 gttaccaacgaggttgaactcctccgaaaatggttttctcatatgcaagagttgaaacct 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 gttaccaacgaggttgaactcctccgaaaatggttttctcatatgcaagagttgaaacct 960
Query: 961 ggtatttatgttacatacaacggtgacttttttgactggccatttatagaacggagagca 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 ggtatttatgttacatacaacggtgacttttttgactggccatttatagaacggagagca 1020
Query: 1021 tctcatcatgggatcaaaatgaacgaggagttgggattccgttgtgatcaaaatcaaggt 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 tctcatcatgggatcaaaatgaacgaggagttgggattccgttgtgatcaaaatcaaggt 1080
Query: 1081 gaatgtcgagctaagtttgtgtgccatttggattgtttttcttgggtgaaacgtgatagc 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 gaatgtcgagctaagtttgtgtgccatttggattgtttttcttgggtgaaacgtgatagc 1140
Query: 1141 tatcttcctcagggaagccagggtctgaaggctgttacaaaggtaaaactgggttacgat 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 tatcttcctcagggaagccagggtctgaaggctgttacaaaggtaaaactgggttacgat 1200
Query: 1201 ccactggaagtgaatcctgaggacatggttcggtttgcaatggaaaagccacagacaatg 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1201 ccactggaagtgaatcctgaggacatggttcggtttgcaatggaaaagccacagacaatg 1260
Query: 1261 gcctcctactctgtctctgatgctgttgcaacttactacctatacatgacatatgtccat 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1261 gcctcctactctgtctctgatgctgttgcaacttactacctatacatgacatatgtccat 1320
Query: 1321 ccgttcgttttttctctcgcaactatcattccaatggtccctgatgaggttttacgcaaa 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1321 ccgttcgttttttctctcgcaactatcattccaatggtccctgatgaggttttacgcaaa 1380
Query: 1381 gggagtggcaccctttgtgaaatgcttttgatggttgaggcttacaaggcaaatgttgta 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1381 gggagtggcaccctttgtgaaatgcttttgatggttgaggcttacaaggcaaatgttgta 1440
Query: 1441 tgtcccaacaaaaatcaagctgaccctgagaagttctaccaaggtaaacttcttgaaagt 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1441 tgtcccaacaaaaatcaagctgaccctgagaagttctaccaaggtaaacttcttgaaagt 1500
Query: 1501 gagacatatattggtggccatgtagagtgcctccaaagtggtgttttcagatctgacatt 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1501 gagacatatattggtggccatgtagagtgcctccaaagtggtgttttcagatctgacatt 1560
Query: 1561 ccaaccagttttaagctcgacgcatccgcataccagcaactgatcgataaccttggtcgg 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1561 ccaaccagttttaagctcgacgcatccgcataccagcaactgatcgataaccttggtcgg 1620
Query: 1621 gatctggaatatgctatcactgttgaaggaaaaatgagaatggattcagtttccaatttt 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1621 gatctggaatatgctatcactgttgaaggaaaaatgagaatggattcagtttccaatttt 1680
Query: 1681 gatgaagtaaaggaagtaatcagggaaaagctcgagaagttacgggatgatcctatacgt 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1681 gatgaagtaaaggaagtaatcagggaaaagctcgagaagttacgggatgatcctatacgt 1740
Query: 1741 gaagaggggcctcttatttatcaccttgatgtcgcggcgatgtatccaaatattatctta 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1741 gaagaggggcctcttatttatcaccttgatgtcgcggcgatgtatccaaatattatctta 1800
Query: 1801 acaaacaggcttcagccaccatcaatagttacggatgaggtttgcacagcatgtgatttc 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1801 acaaacaggcttcagccaccatcaatagttacggatgaggtttgcacagcatgtgatttc 1860
Query: 1861 aacggcccggaaaagacctgtcttagaaaacttgaatgggtttggcgtggggtgacgttc 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1861 aacggcccggaaaagacctgtcttagaaaacttgaatgggtttggcgtggggtgacgttc 1920
Query: 1921 aagggaaataaaagtgaatattaccatctgaagaagcagattgagtctgaatctgttgat 1980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1921 aagggaaataaaagtgaatattaccatctgaagaagcagattgagtctgaatctgttgat 1980
Query: 1981 gctggagcaaatatgcagtcttcaaaaccttttcttgatctgccaaaggtggaacaacaa 2040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1981 gctggagcaaatatgcagtcttcaaaaccttttcttgatctgccaaaggtggaacaacaa 2040
Query: 2041 tccaaattaaaagaacgactgaaaaaatactgtcaaaaggcatatagccgagtacttgac 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2041 tccaaattaaaagaacgactgaaaaaatactgtcaaaaggcatatagccgagtacttgac 2100
Query: 2101 aagccaatcactgaagttcgcgaggctgggatatgcatgagagaaaacccgttctatgtg 2160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2101 aagccaatcactgaagttcgcgaggctgggatatgcatgagagaaaacccgttctatgtg 2160
Query: 2161 gacactgtgcgcagctttcgagataggaggtatgaatacaaaacacttaacaaggtctgg 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2161 gacactgtgcgcagctttcgagataggaggtatgaatacaaaacacttaacaaggtctgg 2220
Query: 2221 aagggaaagttgtcagaggccaaggcaagtggcaatttaatcaagatccaggaagcacat 2280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2221 aagggaaagttgtcagaggccaaggcaagtggcaatttaatcaagatccaggaagcacat 2280
Query: 2281 gacatggtagtggtttacgattccttgcagctagctcataagtgtatacttaattccttt 2340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2281 gacatggtagtggtttacgattccttgcagctagctcataagtgtatacttaattccttt 2340
Query: 2341 tatggatatgtcatgcgaaagggcgcaagatggtactccatggaaatggctggggtagtt 2400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2341 tatggatatgtcatgcgaaagggcgcaagatggtactccatggaaatggctggggtagtt 2400
Query: 2401 acttatactggagccaaaatcatccagaatgctcgtttgcttattgaacgaattgggaaa 2460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2401 acttatactggagccaaaatcatccagaatgctcgtttgcttattgaacgaattgggaaa 2460
Query: 2461 ccacttgagctggatacagatggtatatggtgtgctctacctggatcttttcctgagaac 2520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2461 ccacttgagctggatacagatggtatatggtgtgctctacctggatcttttcctgagaac 2520
Query: 2521 tttacctttaaaaccatagatatgaagaaattcaccatctcgtatccgtgtgtaatactt 2580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2521 tttacctttaaaaccatagatatgaagaaattcaccatctcgtatccgtgtgtaatactt 2580
Query: 2581 aatgttgatgtggcgaagaataattcaaatgaccaatatcagactctagtagatcctgta 2640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2581 aatgttgatgtggcgaagaataattcaaatgaccaatatcagactctagtagatcctgta 2640
Query: 2641 cgaaagacatataattcacgtagcgaatgctcaattgaatttgaagtggatggaccgtac 2700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2641 cgaaagacatataattcacgtagcgaatgctcaattgaatttgaagtggatggaccgtac 2700
Query: 2701 aaggcaatgattattcctgcatccaaggaagagggaatcttaattaagaagcggtatgct 2760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2701 aaggcaatgattattcctgcatccaaggaagagggaatcttaattaagaagcggtatgct 2760
Query: 2761 gttttcaatcatgacggaaccatagcagaactcaaggggtttgagatgaagcgtagagga 2820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2761 gttttcaatcatgacggaaccatagcagaactcaaggggtttgagatgaagcgtagagga 2820
Query: 2821 gagctgaaactcattaaagttttccaggccgagctatttgacaaatttctgcatggatca 2880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2821 gagctgaaactcattaaagttttccaggccgagctatttgacaaatttctgcatggatca 2880
Query: 2881 acccttgaagagtgttattctgctgttgcagctgttgcaaatcgttggcttgacctactc 2940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2881 acccttgaagagtgttattctgctgttgcagctgttgcaaatcgttggcttgacctactc 2940
Query: 2941 gagggtcaaggaaaagatattgccgatagtgaattgctagattatatatcagaatcaagc 3000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2941 gagggtcaaggaaaagatattgccgatagtgaattgctagattatatatcagaatcaagc 3000
Query: 3001 actatgagcaaatcgttagcagattatggtcaacaaaagtcatgtgcagtgaccacagca 3060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3001 actatgagcaaatcgttagcagattatggtcaacaaaagtcatgtgcagtgaccacagca 3060
Query: 3061 aaacgcctggctgattttcttggtgatacaatggtcaaagataaaggactgcgctgccaa 3120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3061 aaacgcctggctgattttcttggtgatacaatggtcaaagataaaggactgcgctgccaa 3120
Query: 3121 tacatcgttgctcgtgaaccagaggggacacctgtaagtgaacgtgctgtccctgttgcc 3180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3121 tacatcgttgctcgtgaaccagaggggacacctgtaagtgaacgtgctgtccctgttgcc 3180
Query: 3181 atatttcaaacagatgatcctgaaaaaaagttttatctgcaaaaatggtgcaagatatca 3240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3181 atatttcaaacagatgatcctgaaaaaaagttttatctgcaaaaatggtgcaagatatca 3240
Query: 3241 tcatatactggaatccgttcaattattgactggatgtattacaagcagcgtcttcattca 3300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3241 tcatatactggaatccgttcaattattgactggatgtattacaagcagcgtcttcattca 3300
Query: 3301 gctattcaaaaagttattaccattcctgctgcaatgcagaaggtggcaaatcctgtactt 3360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3301 gctattcaaaaagttattaccattcctgctgcaatgcagaaggtggcaaatcctgtactt 3360
Query: 3361 agggtgcgtcatccttattggctcgagaaaaaggtctgtgacaaatttcgtcagggaaaa 3420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3361 agggtgcgtcatccttattggctcgagaaaaaggtctgtgacaaatttcgtcagggaaaa 3420
Query: 3421 atagttgatatgtttagctcagcaaacaaagatcattcgacaactcaagataatgtagtg 3480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3421 atagttgatatgtttagctcagcaaacaaagatcattcgacaactcaagataatgtagtg 3480
Query: 3481 gcggatattgaagagttttgcaaagaaaacagaccttccgtaaaagggccaaagccagtt 3540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3481 gcggatattgaagagttttgcaaagaaaacagaccttccgtaaaagggccaaagccagtt 3540
Query: 3541 gcgcgttcatttgaagtcgatagaaatcactctgagggtaagcagcaagagagttgggat 3600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3541 gcgcgttcatttgaagtcgatagaaatcactctgagggtaagcagcaagagagttgggat 3600
Query: 3601 ccagagttccatgatatctcattacagaacgttgacaagaatgtagattaccaaggatgg 3660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3601 ccagagttccatgatatctcattacagaacgttgacaagaatgtagattaccaaggatgg 3660
Query: 3661 cttgaactggaaaaaagaaaatggaaaatgactctaacgaataagaaaaaaagaaggt 3718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3661 cttgaactggaaaaaagaaaatggaaaatgactctaacgaataagaaaaaaagaaggt 3718
Score = 4664 bits (2353), Expect = 0.0
Identities = 2376/2385 (99%), Gaps = 9/2385 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 4081 gtcaatattcaggaagatcaatttataaaagaaagcaaaaagcttgccgctctacttgca 4140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4042 gtcaatattcaggaagatcaatttataaaagaaagcaaaaagcttgccgctctacttgca 4101
Query: 4141 gaccccgaaattgagggcatatatgaaactaagatgcctctggagtttagtgctatatgt 4200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4102 gaccccgaaattgagggcatatatgaaactaagatgcctctggagtttagtgctatatgt 4161
Query: 4201 cagattggatgtgtatgcaaaattgaagacacggccaaacaccgtaacacccaagatgga 4260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4162 cagattggatgtgtatgcaaaattgaagacacggccaaacaccgtaacacccaagatgga 4221
Query: 4261 tggaaacttggtgaacttcacaggataactacaactgagtgtcgctacttggagaattct 4320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4222 tggaaacttggtgaacttcacaggataactacaactgagtgtcgctacttggagaattct 4281
Query: 4321 attccacttgtttatttgtatcacagcacctcaacaggtcgtgctgtttatgttttatat 4380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4282 attccacttgtttatttgtatcacagcacctcaacaggtcgtgctgtttatgttttatat 4341
Query: 4381 tgtcatgcttcgaagcttatgtctgttgtggtagtcaatccttacggtgacaaggaatta 4440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4342 tgtcatgcttcgaagcttatgtctgttgtggtagtcaatccttacggtgacaaggaatta 4401
Query: 4441 ttatcatctgccctagagagacagtttagagatagatgccaagaactgtcacctgagcca 4500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4402 ttatcatctgccctagagagacagtttagagatagatgccaagaactgtcacctgagcca 4461
Query: 4501 ttttcttgggatggtatccttttccaggtcgagtatgttgaccatccagaagctgccacg 4560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4462 ttttcttgggatggtatccttttccaggtcgagtatgttgaccatccagaagctgccacg 4521
Query: 4561 aaatttttacaaaaagcgctctgtgaatacagagaagaaaattgtggagcaactgtggca 4620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4522 aaatttttacaaaaagcgctctgtgaatacagagaagaaaattgtggagcaactgtggca 4581
Query: 4621 gtcattgaatgccctgactttaacaccacgaaggaaggtgtaaaggccctggaagatttc 4680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4582 gtcattgaatgccctgactttaacaccacgaaggaaggtgtaaaggccctggaagatttc 4641
Query: 4681 ccatgtgtgaggattcccttcaacgacgatgacaatagttatcagcctgtctcctggcaa 4740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4642 ccatgtgtgaggattcccttcaacgacgatgacaatagttatcagcctgtctcctggcaa 4701
Query: 4741 cgtccagcagcaaaaatagcagtgctccgttgtgcttcagcaattcagtggttggaccgg 4800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4702 cgtccagcagcaaaaatagcagtgctccgttgtgcttcagcaattcagtggttggaccgg 4761
Query: 4801 aggattgcccagtcaagatacgcccatgtgcctctggggaattttggacgtgattggtta 4860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4762 aggattgcccagtcaagatacgcccatgtgcctctggggaattttggacgtgattggtta 4821
Query: 4861 acgttcacagtagatatcttcctgtccagggcactccgtgaccagcaacaggttctttgg 4920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4822 acgttcacagtagatatcttcctgtccagggcactccgtgaccagcaacaggttctttgg 4881
Query: 4921 gtctcagataatggtgttccagaccttggagatataaacaatgaagagacatttctagct 4980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4882 gtctcagataatggtgttccagaccttggagatataaacaatgaagagacatttctagct 4941
Query: 4981 gatgagttacaagagacaagtttgctattccctggagcgtacagaaaagtgtctgtggag 5040
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4942 gatga---------gacaagtttgctattccctggagcgtacagaaaagtgtctgtggag 4992
Query: 5041 ttaaaggtccatagattagctgttaatgcccttctgaaaagtgacctggtgagtgaaatg 5100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4993 ttaaaggtccatagattagctgttaatgcccttctgaaaagtgacctggtgagtgaaatg 5052
Query: 5101 gaaggaggcggctttttgggtgtgaattctagaggaagtagcttaaacgataatggcagt 5160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5053 gaaggaggcggctttttgggtgtgaattctagaggaagtagcttaaacgataatggcagt 5112
Query: 5161 tttgatgagaataatggatgcgcgcaagcatttcgtgtcctgaaacaattgatcaagcgc 5220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5113 tttgatgagaataatggatgcgcgcaagcatttcgtgtcctgaaacaattgatcaagcgc 5172
Query: 5221 ttgttgcatgatgcgtgtaattctggcaatatatatgctgattccattttgcaacatctg 5280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5173 ttgttgcatgatgcgtgtaattctggcaatatatatgctgattccattttgcaacatctg 5232
Query: 5281 tcttggtggctccgcagcccttcctcaaagcttcacgatccagctctccatctcatgctt 5340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5233 tcttggtggctccgcagcccttcctcaaagcttcacgatccagctctccatctcatgctt 5292
Query: 5341 cacaaggtcatgcaaaaggtgtttgcgctgcttttgactgatttgcggaggttaggtgct 5400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5293 cacaaggtcatgcaaaaggtgtttgcgctgcttttgactgatttgcggaggttaggtgct 5352
Query: 5401 ataataatatacgcagacttctcaaaggtcattatcgacacagggaaatttgatctatct 5460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5353 ataataatatacgcagacttctcaaaggtcattatcgacacagggaaatttgatctatct 5412
Query: 5461 gctgcaaagacttattgtgaaagcttgctcacagtgatggggagtagagatatctttaag 5520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5413 gctgcaaagacttattgtgaaagcttgctcacagtgatggggagtagagatatctttaag 5472
Query: 5521 ttgatcttgcttgagccggttcactactggcactcgttacttttcatggaccagcataac 5580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5473 ttgatcttgcttgagccggttcactactggcactcgttacttttcatggaccagcataac 5532
Query: 5581 tacgctggtatccgagctaccggagatgaaatttcaggtaacgaagttactattgaacca 5640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5533 tacgctggtatccgagctaccggagatgaaatttcaggtaacgaagttactattgaacca 5592
Query: 5641 aagtggagcgttgcacggcatttacccgagtatattcagaaggattttatcataattgtt 5700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5593 aagtggagcgttgcacggcatttacccgagtatattcagaaggattttatcataattgtt 5652
Query: 5701 gccacgtttatatttggcccctggaaatttgcattagagaaaaaaaggggcagtgcagag 5760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5653 gccacgtttatatttggcccctggaaatttgcattagagaaaaaaaggggcagtgcagag 5712
Query: 5761 agtttagaggcagagatggtagaatatctcaaggaacagataggaacccggttcataagc 5820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5713 agtttagaggcagagatggtagaatatctcaaggaacagataggaacccggttcataagc 5772
Query: 5821 atgattgttgagaagattggtaatatcaggtcacacatcaaggatataaacgtgtcagat 5880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5773 atgattgttgagaagattggtaatatcaggtcacacatcaaggatataaacgtgtcagat 5832
Query: 5881 gcatcttgggcttctggtcaagctcccaaaggagattacacgttcgaatttatacaaatt 5940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5833 gcatcttgggcttctggtcaagctcccaaaggagattacacgttcgaatttatacaaatt 5892
Query: 5941 attactgctgttctggctcttgatcaaaacgttcagcaagatgttctggtaatgagaaag 6000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5893 attactgctgttctggctcttgatcaaaacgttcagcaagatgttctggtaatgagaaag 5952
Query: 6001 attctgttgaagtacattaaagtaaaagaatgtgctgctgaagccgaatttattgatcct 6060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5953 attctgttgaagtacattaaagtaaaagaatgtgctgctgaagccgaatttattgatcct 6012
Query: 6061 gggccatccttcatcttacccaacgtggcttgcagcaactgcggtgcctacagagaccta 6120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6013 gggccatccttcatcttacccaacgtggcttgcagcaactgcggtgcctacagagaccta 6072
Query: 6121 gatttctgcagagactcagctctcttaacagaaaaagaatggtcatgtgcggatccgcaa 6180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6073 gatttctgcagagactcagctctcttaacagaaaaagaatggtcatgtgcggatccgcaa 6132
Query: 6181 tgtgtgaagatatatgacaaagagcagatagagagtagcattatccagatggtgagacag 6240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6133 tgtgtgaagatatatgacaaagagcagatagagagtagcattatccagatggtgagacag 6192
Query: 6241 agggaaagaatgtaccagttgcaggatctagtgtgcaataggtgcaatcaggtgaaagcc 6300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6193 agggaaagaatgtaccagttgcaggatctagtgtgcaataggtgcaatcaggtgaaagcc 6252
Query: 6301 gctcatttgacagagcagtgtgagtgttctggatcctttagatgcaaggagagtggttca 6360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6253 gctcatttgacagagcagtgtgagtgttctggatcctttagatgcaaggagagtggttca 6312
Query: 6361 gatttccacaagaggattgagattttcttggatatagcaaagcgccagaagtttagactg 6420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6313 gatttccacaagaggattgagattttcttggatatagcaaagcgccagaagtttagactg 6372
Query: 6421 ctagaagaatgcatctcctggattttatttgccaccagctgttga 6465
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6373 ctagaagaatgcatctcctggattttatttgccaccagctgttga 6417
Score = 567 bits (286), Expect = e-160
Identities = 286/286 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3760 ataaataaaaaagtctgtaagggaagagtaggtgtaggctcatactttaggaggcctgaa 3819
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3757 ataaataaaaaagtctgtaagggaagagtaggtgtaggctcatactttaggaggcctgaa 3816
Query: 3820 gaagctttgactagttcctatttgcagataatacagttggtccaaagtccacagagcggg 3879
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3817 gaagctttgactagttcctatttgcagataatacagttggtccaaagtccacagagcggg 3876
Query: 3880 caattttttgcttgggttgttgtggaaggattgatgcttaagatcccattgacgatccca 3939
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3877 caattttttgcttgggttgttgtggaaggattgatgcttaagatcccattgacgatccca 3936
Query: 3940 agggtgttttacattaattccaaagcttctatagctggaaacttcacgggaaagtgtatc 3999
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3937 agggtgttttacattaattccaaagcttctatagctggaaacttcacgggaaagtgtatc 3996
Query: 4000 aacaagattcttcctcacggaaagccttgttacaatttgatggagg 4045
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3997 aacaagattcttcctcacggaaagccttgttacaatttgatggagg 4042
>At1g08260.1 68414.m00911 DNA-directed DNA polymerase epsilon catalytic subunit,
putative similar to SP|Q07864 DNA polymerase epsilon,
catalytic subunit A (EC 2.7.7.7) (DNA polymerase II
subunit A) {Homo sapiens}; contains Pfam profiles:
PF03175 DNA polymerase type B, organellar and viral,
PF00136 DNA polymerase family B, PF03104 DNA polymerase
family B, exonuclease domain
Length = 6816
Score = 1778 bits (897), Expect = 0.0
Identities = 1259/1381 (91%), Gaps = 9/1381 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 49 gcggcagatgaactcgaaactaaacttggatttgggcttttctcccaaggggaaacgcgg 108
|||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||
Sbjct: 73 gcggaagatgaactcgaatctaaactcggatttgggcttttctctgaaggtgaaacccga 132
Query: 109 ctcgggtggctactcacgtttgcatcatcatcttgggaagatgccgatactgggaaaacc 168
|| |||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |
Sbjct: 133 cttgggtggttactcacattctcatcgtcatcttgggaagatcgcgatactgggaaagtc 192
Query: 169 tttagttgtgtggaccttttctttgtcactcaggacggctcttcttttaagactaagtac 228
| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||
Sbjct: 193 tatagttgtgtggacctttactttgttactcaggacggcttttctttcaagacaaagtac 252
Query: 229 aagttccgcccttacttgtatgccgccaccaaagacaatatggaactggaagttgaagcc 288
|||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||| | ||||||
Sbjct: 253 aagttccgtccttacttttatgcagccacgaaagacaaaatggaattggaactcgaagcc 312
Query: 289 tacttgagacgccgatatgaaagacaagttgctgatattcagattgttcacaaagaagat 348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||
Sbjct: 313 tacttgagacgccgatatgaaagacaagttgctgatattgagattgttgaaaaagaagat 372
Query: 349 ctttatcttaaaaatcatctatctggcctgcaaaaaaaatatctcaaagtatcatttgac 408
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||
Sbjct: 373 cttgatcttaaaaatcatctatctggcctgcaaaaaaaatacctaaaaatatcatttgat 432
Query: 409 actgtgcaacaattggtggaagtaaagagggatctgttgcatattgtcgaacgaaacctc 468
||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 433 actgtgcaacaattgatggaagtcaagcgggatttgttacatattgtcgaacgaaaccag 492
Query: 469 gcaaaatttaatgcacttgaagcttacgaatccatcttgtctggaaaacgagaacaacgt 528
||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 493 gcaaaatttgatgcacttgaagcatacgaatccatattggctggaaaacgagaacaacgt 552
Query: 529 cctcaagactgcttagactctgtggtggacctccgcgagtacgatgttccttatcatgtc 588
|||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 553 cctcaagattgcttagactctatcgtggacctccgcgagtacgatgtaccttatcatgtt 612
Query: 589 cgatttgcaattgataatgatgtgcgtagtgggcaatggtacaatgtcagtatttccagc 648
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 613 cgatttgcaattgataatgatgtgcggagtgggcaatggtacaatgtcagtatttccagc 672
Query: 649 actgatgtcatactagagaagaggacggatcttctccaacgcgcagaagttcgcgtttgt 708
|| ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||
Sbjct: 673 accgatgtcatattggagaagaggacagatcttcttcaacgcgcagaagtccgtgtttgt 732
Query: 709 gcattcgatatagagacagtaaagcttccattgaagttcccggatgctgaatatgatcaa 768
|| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct: 733 gccttcgatatagagacaacaaagcttccgttgaagtttcctgatgctgaatatgatcaa 792
Query: 769 attatgatgatatcctacatggttgatgggcaaggttttctaattactaacagagag--- 825
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 793 attatgatgatatcctacatggtcgatgggcaaggttttctaattattaacagagaggta 852
Query: 826 ------tgtgttggcaaagacatagaagatctggaatatacacccaaaccagagtttgaa 879
||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct: 853 actgcttgtgttggcgaagatgtagaagatctggaatatacaccaaaaccagaatttgaa 912
Query: 880 gggtatttcaaagtcacgaatgttaccaacgaggttgaactcctccgaaaatggttttct 939
|||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct: 913 gggtatttcaaagttactaatgttaaaaatgaggttgaactcctccaaagatggttttac 972
Query: 940 catatgcaagagttgaaacctggtatttatgttacatacaacggtgacttttttgactgg 999
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 973 catatgcaagagttgaaacccggtatttatgttacatacaacggtgacttttttgactgg 1032
Query: 1000 ccatttatagaacggagagcatctcatcatgggatcaaaatgaacgaggagttgggattc 1059
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||
Sbjct: 1033 ccatttatagaacggagagcatctcatcatgggataaaaatgaatgaggaattgggattc 1092
Query: 1060 cgttgtgatcaaaatcaaggtgaatgtcgagctaagtttgtgtgccatttggattgtttt 1119
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||
Sbjct: 1093 cgttgtgatcagaatcaaggtgaatgtcgagctaaattcgcttgtcatttggattgtttt 1152
Query: 1120 tcttgggtgaaacgtgatagctatcttcctcagggaagccagggtctgaaggctgttaca 1179
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 1153 gcttgggttaaacgtgatagctatcttcctcagggaagccatggtctgaaggctgttaca 1212
Query: 1180 aaggtaaaactgggttacgatccactggaagtgaatcctgaggacatggttcggtttgca 1239
|||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct: 1213 aaggcaaaactaggttatgatccactggaagtgaacccagaggacatggttcggtttgcg 1272
Query: 1240 atggaaaagccacagacaatggcctcctactctgtctctgatgctgttgcaacttactac 1299
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 1273 atggaaaagccccagacaatggcctcctactctgtctctgatgctgttgcaacttattac 1332
Query: 1300 ctatacatgacatatgtccatccgttcgttttttctctcgcaactatcattccaatggtc 1359
|||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 1333 ctatacatgacatatgtcaatccattcattttttctctcgcaactatcatcccaatggtc 1392
Query: 1360 cctgatgaggttttacgcaaagggagtggcaccctttgtgaaatgcttttgatggttgag 1419
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 1393 cctgatgaggttttacgtaaagggagtggcaccctttgtgaaatgcttctgatggttgag 1452
Query: 1420 g 1420
|
Sbjct: 1453 g 1453
Score = 1592 bits (803), Expect = 0.0
Identities = 1046/1127 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1816 ccaccatcaatagttacggatgaggtttgcacagcatgtgatttcaacggcccggaaaag 1875
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||
Sbjct: 1837 ccaccatcaatagttacggatgagatttgcacagcatgtgatttcaaccgcccgggaaag 1896
Query: 1876 acctgtcttagaaaacttgaatgggtttggcgtggggtgacgttcaagggaaataaaagt 1935
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||
Sbjct: 1897 acctgtcttagaaaacttgaatgggtttggcgtggtgtgacattcatgggaaagaaaagt 1956
Query: 1936 gaatattaccatctgaagaagcagattgagtctgaatctgttgatgctggagcaaatatg 1995
|| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||
Sbjct: 1957 gattattaccatttgaagaagcagattgagtctgaatttgttgatgctggtgcaaatata 2016
Query: 1996 cagtcttcaaaaccttttcttgatctgccaaaggtggaacaacaatccaaattaaaagaa 2055
|||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||
Sbjct: 2017 atgtcttcaaaatcgttccttgatctgccaaaggtggatcaacaatctaagctaaaagaa 2076
Query: 2056 cgactgaaaaaatactgtcaaaaggcatatagccgagtacttgacaagccaatcactgaa 2115
||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 2077 cgactaaaaaaatattgtcaaaaggcttataaacgagtacttgacaagccaattactgaa 2136
Query: 2116 gttcgcgaggctgggatatgcatgagagaaaacccgttctatgtggacactgtgcgcagc 2175
||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||
Sbjct: 2137 gttcgtgaagctgggatatgcatgagagaaaaccctttctatgtggatactgttcggagc 2196
Query: 2176 tttcgagataggaggtatgaatacaaaacacttaacaaggtctggaagggaaagttgtca 2235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 2197 tttcgagataggaggtatgaatacaaaacacttaacaaggtctggaagggaaaattgtca 2256
Query: 2236 gaggccaaggcaagtggcaatttaatcaagatccaggaagcacatgacatggtagtggtt 2295
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 2257 gaggccaaggcaagtggtaattcaatcaagatccaggaagcacaggacatggtagtggtt 2316
Query: 2296 tacgattccttgcagctagctcataagtgtatacttaattccttttatggatatgtcatg 2355
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 2317 tacgattccttgcagctagctcataagtgtatacttaattccttctatggatatgtcatg 2376
Query: 2356 cgaaagggcgcaagatggtactccatggaaatggctggggtagttacttatactggagcc 2415
|||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct: 2377 cgaaagggtgcaagatggtattccatggaaatggctggtgtagttacctatactggagcc 2436
Query: 2416 aaaatcatccagaatgctcgtttgcttattgaacgaattgggaaaccacttgagctggat 2475
|||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 2437 aaaatcatacagaatgcccgtttgcttattgagcgaattgggaaaccacttgagttggat 2496
Query: 2476 acagatggtatatggtgtgctctacctggatcttttcctgagaactttacctttaaaacc 2535
|||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 2497 acagatggtatatggtgttgtctccctggatcttttcctgagaactttacttttaaaaca 2556
Query: 2536 atagatatgaagaaattcaccatctcgtatccgtgtgtaatacttaatgttgatgtggcg 2595
||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||
Sbjct: 2557 atagacatgaagaaactcaccatctcgtatccttgtgttatgcttaatgttgatgtggca 2616
Query: 2596 aagaataattcaaatgaccaatatcagactctagtagatcctgtacgaaagacatataat 2655
||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 2617 aagaataatacaaatgatcaatatcagactcttgtagatcctgtacgcaagacatataaa 2676
Query: 2656 tcacgtagcgaatgctcaattgaatttgaagtggatggaccgtacaaggcaatgattatt 2715
|||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2677 tcacatagtgaatgctcaattgaatttgaagtagatggaccgtacaaggcaatgattatt 2736
Query: 2716 cctgcatccaaggaagagggaatcttaattaagaagcggtatgctgttttcaatcatgac 2775
|||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 2737 cctgcatcgaaagaagaaggaatcttaatcaagaagcgttatgctgttttcaatcatgat 2796
Query: 2776 ggaaccatagcagaactcaaggggtttgagatgaagcgtagaggagagctgaaactcatt 2835
|||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 2797 ggaaccttagcagaactcaaggggtttgagatcaagcgtagaggggagctgaaactcatt 2856
Query: 2836 aaagttttccaggccgagctatttgacaaatttctgcatggatcaacccttgaagagtgt 2895
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 2857 aaagttttccaggccgagctttttgacaaatttctccatggatcaactcttgaagagtgt 2916
Query: 2896 tattctgctgttgcagctgttgcaaatcgttggcttgacctactcga 2942
||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct: 2917 tattctgctgttgcagcggttgctgatcgatggcttgacctactcga 2963
Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0
Identities = 924/1041 (88%)
Strand = Plus / Plus
Query: 4080 tgtcaatattcaggaagatcaatttataaaagaaagcaaaaagcttgccgctctacttgc 4139
|||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||
Sbjct: 4170 tgtcaagattcaagaagatcaatttaaaaaagaaagtaaaaagcgtgcagctcttcttgc 4229
Query: 4140 agaccccgaaattgagggcatatatgaaactaagatgcctctggagtttagtgctatatg 4199
|||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4230 agaccctggagttgagggcatatatgaaactaaggtgcctctggagtttagtgctatatg 4289
Query: 4200 tcagattggatgtgtatgcaaaattgaagacacggccaaacaccgtaacacccaagatgg 4259
||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 4290 tcagattggatgtgtatgcaaaattgataacaaagccaagcaccgtaacacccaagatgg 4349
Query: 4260 atggaaacttggtgaacttcacaggataactacaactgagtgtcgctacttggagaattc 4319
|||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| || |||
Sbjct: 4350 atgggaagttggtgaacttcacatgaaaactacaactgagtgtcactacttgaagcgttc 4409
Query: 4320 tattccacttgtttatttgtatcacagcacctcaacaggtcgtgctgtttatgttttata 4379
|||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||
Sbjct: 4410 aattccacttgtttacttgtataacagcacctcaacagggcgtgctatatatgttttata 4469
Query: 4380 ttgtcatgcttcgaagcttatgtctgttgtggtagtcaatccttacggtgacaaggaatt 4439
|||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||| | ||| |||||
Sbjct: 4470 ttgtcatgtatcgaagcttatgtctgccgttgtagttgatccttttaacggcaatgaatt 4529
Query: 4440 attatcatctgccctagagagacagtttagagatagatgccaagaactgtcacctgagcc 4499
|||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||| ||| |
Sbjct: 4530 attaccatctgccttagagagacagtttagagatagttgcctagaattatcacttgattc 4589
Query: 4500 attttcttgggatggtatccttttccaggtcgagtatgttgaccatccagaagctgccac 4559
||| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 4590 attgtcttgggatggtatccgtttccaggtgcactacgttgaccatcccgaagctgccaa 4649
Query: 4560 gaaatttttacaaaaagcgctctgtgaatacagagaagaaaattgtggagcaactgtggc 4619
||| | |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct: 4650 gaagataatacaaagagcaataagtgaatacagagaagaaaattgtggaccaactgttgc 4709
Query: 4620 agtcattgaatgccctgactttaacaccacgaaggaaggtgtaaaggccctggaagattt 4679
|||||||||||||||||||||| | || |||||||||| | |||||||| || |||||
Sbjct: 4710 tgtcattgaatgccctgactttaccttcatgaaggaaggtattaaggccctagatgattt 4769
Query: 4680 cccatgtgtgaggattcccttcaacgacgatgacaatagttatcagcctgtctcctggca 4739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4770 cccatgtgtgaggattcccttcaacgacgatgacaatagttatcagcctgtctcctggca 4829
Query: 4740 acgtccagcagcaaaaatagcagtgctccgttgtgcttcagcaattcagtggttggaccg 4799
||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||
Sbjct: 4830 acgtccagctgcaaaaatagcaatgttccgttgtgctgcagcatttcagtggttggatcg 4889
Query: 4800 gaggattgcccagtcaagatacgcccatgtgcctctggggaattttggacgtgattggtt 4859
||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
Sbjct: 4890 gaggattacccaatcaagatacgcccatgtgcctctggggaattttggacttgattggct 4949
Query: 4860 aacgttcacagtagatatcttcctgtccagggcactccgtgaccagcaacaggttctttg 4919
||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 4950 aacattcacaatagatatcttcctatccagggcactccgtgaccagcaacaggtcctttg 5009
Query: 4920 ggtctcagataatggtgttccagaccttggagatataaacaatgaagagacatttctagc 4979
||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||
Sbjct: 5010 ggtgtcagataatggtgttccagaccttggaggtataaacaatgaagaggcattctttgc 5069
Query: 4980 tgatgagttacaagagacaagtttgctattccctggagcgtacagaaaagtgtctgtgga 5039
|||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 5070 cgatgaggtgcaacagacaagtttagtattccctggagcgtatagaaaagtgtctgtgga 5129
Query: 5040 gttaaaggtccatagattagctgttaatgcccttctgaaaagtgacctggtgagtgaaat 5099
||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct: 5130 gttaaagatccataacttggctgttaatgcccttctgaaaagcaacctggtgaatgaaat 5189
Query: 5100 ggaaggaggcggctttttggg 5120
|||||||||||| ||| ||||
Sbjct: 5190 ggaaggaggcggttttatggg 5210
Score = 587 bits (296), Expect = e-166
Identities = 416/456 (91%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5988 ggtaatgagaaagattctgttgaagtacattaaagtaaaagaatgtgctgctgaagccga 6047
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 6339 ggtaatgagaaagagtctgttgaagtacattaaagtaaaagagtgtgctgctgaagccga 6398
Query: 6048 atttattgatcctgggccatccttcatcttacccaacgtggcttgcagcaactgcggtgc 6107
|||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| | |||
Sbjct: 6399 atttcttgatcctgggccatccttcatcttacctaatgtagcttgcagcaactgtgatgc 6458
Query: 6108 ctacagagacctagatttctgcagagactcagctctcttaacagaaaaagaatggtcatg 6167
|||||||||||||||| | ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 6459 ctacagagacctagatatatgcagagacccagcactgttaacagagaaagaatggtcatg 6518
Query: 6168 tgcggatccgcaatgtgtgaagatatatgacaaagagcagatagagagtagcattatcca 6227
||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || | |
Sbjct: 6519 tgcggatacacaatgtgggaagatatatgacagagagcagatggagagtagccttctaga 6578
Query: 6228 gatggtgagacagagggaaagaatgtaccagttgcaggatctagtgtgcaataggtgcaa 6287
||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct: 6579 gatggtgagacagagagaaagaatgtaccatatgcaggatgtagtgtgcattaggtgcaa 6638
Query: 6288 tcaggtgaaagccgctcatttgacagagcagtgtgagtgttctggatcctttagatgcaa 6347
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 6639 tcaggtgaaagcggctcatttgacagagcagtgtgagtgttctggttcctttagatgcaa 6698
Query: 6348 ggagagtggttcagatttccacaagaggattgagattttcttggatatagcaaagcgcca 6407
||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 6699 ggagagtgggtcagagttcagcaagaggatggagatattcatggatatagcaaagcgcca 6758
Query: 6408 gaagtttagactgctagaagaatgcatctcctggat 6443
||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||
Sbjct: 6759 gaagtttagactgttagaagaatacatctcttggat 6794
Score = 486 bits (245), Expect = e-135
Identities = 478/557 (85%), Gaps = 9/557 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3484 gatattgaagagttttgcaaagaaaacagaccttccgtaaaagggccaaagccagttgcg 3543
|||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||
Sbjct: 3595 gatattgaggatttttgcaaagaaaataggccttccgtcaaagggccaaagccaattgcg 3654
Query: 3544 cgttcatttgaagtcgatagaaatcactctgagggtaagcagcaagagagttgggatcca 3603
||||| | ||||||| ||| ||| || ||||| || ||||||||||||| |||||| ||
Sbjct: 3655 cgttcctatgaagtcaataaaaaacagtctgaatgtgagcagcaagagagctgggataca 3714
Query: 3604 gagttccatgatatctcattacagaacgttgacaagaatgtagattaccaaggatggctt 3663
|||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||
Sbjct: 3715 gagttccatgatatctcatttcagaacattgacaagagcgtaaactaccaaggatggctt 3774
Query: 3664 gaactggaaaaaagaaaatggaaaatgactctaacgaataagaaaaaaagaaggtttgat 3723
|||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| ||||||| | |
Sbjct: 3775 gaactgaaaaagagaaaatggaaagtaactctagagaagaagaaaaaacgaaggttgggt 3834
Query: 3724 gatctaaagccttgtaatcagattgatgcacacaagataaataaaaaagtctgtaaggga 3783
||||||| ||| || ||| ||||| | ||| |||||||| |||||||| || |||||
Sbjct: 3835 gatctaagatcttcaaaccaggttgatactcacgagataaatcaaaaagtcggtcaggga 3894
Query: 3784 agagtaggtgtaggctcatactttaggaggcctgaagaagctttgactagttcctatttg 3843
|||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
Sbjct: 3895 agaggaggtgtgggttcatactttaggaggcctgaagaagctttgactagttcacattgg 3954
Query: 3844 cag---------ataatacagttggtccaaagtccacagagcgggcaattttttgcttgg 3894
||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 3955 caggtgtgcacaataatacagctggtcccaagtccacagagcggacaattttttgcttgg 4014
Query: 3895 gttgttgtggaaggattgatgcttaagatcccattgacgatcccaagggtgttttacatt 3954
|| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4015 gtggttgtggaagggttgatgcttaagatcccattgtcgatcccaagggtgttttacatt 4074
Query: 3955 aattccaaagcttctatagctggaaacttcacgggaaagtgtatcaacaagattcttcct 4014
|||||||||| | |||||| || | | ||| ||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 4075 aattccaaagttcctatagatgaatatttccaaggaaagtgtgtcaacaagattcttcct 4134
Query: 4015 cacggaaagccttgtta 4031
|| |||| |||||||||
Sbjct: 4135 catggaaggccttgtta 4151
Score = 361 bits (182), Expect = 5e-98
Identities = 227/242 (93%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5248 aatatatatgctgattccattttgcaacatctgtcttggtggctccgcagcccttcctca 5307
|||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 5350 aatatatatgctgattccattttgcaacgtttgtcttggtggctctgcagcccttcctcg 5409
Query: 5308 aagcttcacgatccagctctccatctcatgcttcacaaggtcatgcaaaaggtgtttgcg 5367
||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5410 aagctccatgatccagctcttcatctcatgcttcacaaggtcatgcaaaaggtgtttgca 5469
Query: 5368 ctgcttttgactgatttgcggaggttaggtgctataataatatacgcagacttctcaaag 5427
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 5470 ctgctattgactgatttgcggagattaggtgctataataatatatgcagacttctcaaag 5529
Query: 5428 gtcattatcgacacagggaaatttgatctatctgctgcaaagacttattgtgaaagcttg 5487
|||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||
Sbjct: 5530 gtcattatcgacacagtgaaatttgatctatctgcagctaaggcttattgtgaaagcttg 5589
Query: 5488 ct 5489
||
Sbjct: 5590 ct 5591
Score = 351 bits (177), Expect = 5e-95
Identities = 225/241 (93%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2946 tcaaggaaaagatattgccgatagtgaattgctagattatatatcagaatcaagcactat 3005
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 3033 tcaaggaaaagatattgccgatagtgaactgctagattatatatcagaatcaagcacaat 3092
Query: 3006 gagcaaatcgttagcagattatggtcaacaaaagtcatgtgcagtgaccacagcaaaacg 3065
||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3093 gagcaaatcgttagcagattatggtgagcaaaagtcatgtgcagtgaccacagcaaaacg 3152
Query: 3066 cctggctgattttcttggtgatacaatggtcaaagataaaggactgcgctgccaatacat 3125
||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||
Sbjct: 3153 cctggctgaatttcttggtgttacaatggtcaaagataaaggactacgttgccagtacat 3212
Query: 3126 cgttgctcgtgaaccagaggggacacctgtaagtgaacgtgctgtccctgttgccatatt 3185
|||||| |||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 3213 tgttgcttgtgaaccaaagggtacaccggtaagcgaacgtgctgttcctgttgccatatt 3272
Query: 3186 t 3186
|
Sbjct: 3273 t 3273
Score = 307 bits (155), Expect = 6e-82
Identities = 203/219 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1597 caactgatcgataaccttggtcgggatctggaatatgctatcactgttgaaggaaaaatg 1656
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 1603 caactgatcgataaccttggtcgtgatctggaatatgctatcactgtagaaggaaaaatg 1662
Query: 1657 agaatggattcagtttccaattttgatgaagtaaaggaagtaatcagggaaaagctcgag 1716
|||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| | ||||| ||| ||||| |||
Sbjct: 1663 agaatggattcaatttccaattatgatgaagtgaaggacgaaatcaaggagaagcttgag 1722
Query: 1717 aagttacgggatgatcctatacgtgaagaggggcctcttatttatcaccttgatgtcgcg 1776
|||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1723 aagttacgagatgaccctatacgggaagaggggcctcttatttatcaccttgatgtcgca 1782
Query: 1777 gcgatgtatccaaatattatcttaacaaacaggcttcag 1815
|| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 1783 gccatgtatccaaatatcatcttaacaaacaggcttcag 1821
Score = 238 bits (120), Expect = 5e-61
Identities = 264/312 (84%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5677 cagaaggattttatcataattgttgccacgtttatatttggcccctggaaatttgcatta 5736
|||| |||||| || ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||
Sbjct: 5920 cagagggatttcattataatcattgccaagtttatatttgacccctggaaatttgcgata 5979
Query: 5737 gagaaaaaaaggggcagtgcagagagtttagaggcagagatggtagaatatctcaaggaa 5796
|| || |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||
Sbjct: 5980 gaaaataaaaagggcagttcagagagtttagaggcacagatgatagaatatctaagagaa 6039
Query: 5797 cagataggaacccggttcataagcatgattgttgagaagattggtaatatcaggtcacac 5856
||||| ||| | ||||||| ||| |||| | ||| ||| | |||||| |||||||
Sbjct: 6040 cagattggatcaaccttcataaatatgcttgtcaaaaaggttgatgatatcatgtcacac 6099
Query: 5857 atcaaggatataaacgtgtcagatgcatcttgggcttctggtcaagctcccaaaggagat 5916
|| ||||| ||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6100 atgaaggagataaatgtttcagatgcatctcgggtttctggtcaagctcccaaaggagat 6159
Query: 5917 tacacgttcgaatttatacaaattattactgctgttctggctcttgatcaaaacgttcag 5976
||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct: 6160 tactcgttggaatttatacaggttatctctgctgttctggctcttgaccaaaacgtccag 6219
Query: 5977 caagatgttctg 5988
||||||||||||
Sbjct: 6220 caagatgttctg 6231
Score = 192 bits (97), Expect = 3e-47
Identities = 118/125 (94%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1418 aggcttacaaggcaaatgttgtatgtcccaacaaaaatcaagctgaccctgagaagttct 1477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 1478 aggcttacaaggcaaatgttgtatgtcccaacaaaaatcaagctgaccctgagaaattct 1537
Query: 1478 accaaggtaaacttcttgaaagtgagacatatattggtggccatgtagagtgcctccaaa 1537
||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct: 1538 accaaaatcaacttcttgaaagtgagacatatattggtggtcatgtagagtgccttgaaa 1597
Query: 1538 gtggt 1542
|||||
Sbjct: 1598 gtggt 1602
Score = 188 bits (95), Expect = 4e-46
Identities = 214/255 (83%), Gaps = 9/255 (3%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3208 aagttttatctgcaaaaatggtgcaagatatcatcatatactggaatccgttcaattatt 3267
|||||| || ||| |||||||||||||| ||||||| || ||||| ||| ||||||
Sbjct: 3295 aagtttcatttgcgaaaatggtgcaagacatcatcagatgtcggaattcgtctgattatt 3354
Query: 3268 gactggatgtattacaagcagcgtcttcattcagctattcaaaaagttattaccattcct 3327
|||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 3355 gactggtcgtattacaagcagcgccttagttcagctatccaaaaagttattaccattcct 3414
Query: 3328 gctgcaatgcagaaggtggcaaatcctgtacttagggtgcgtcatccttattggctcgag 3387
|||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||| | |||||| |
Sbjct: 3415 gctgcaatgcagaaggtggcaaatcccgtgcctagggtgcttcatcctgactggctccat 3474
Query: 3388 aaaaaggtctgt---------gacaaatttcgtcagggaaaaatagttgatatgtttagc 3438
||||||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||
Sbjct: 3475 aaaaaggtccgtgagaaagacgacaaatttcgccagagaaaactagttgatatgttcagc 3534
Query: 3439 tcagcaaacaaagat 3453
|||||||| ||||||
Sbjct: 3535 tcagcaaataaagat 3549
Score = 101 bits (51), Expect = 7e-20
Identities = 89/101 (88%), Gaps = 3/101 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5576 ataactacgctggtatccgagctaccggagatgaaatttcaggtaacgaagttactattg 5635
|||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||| |||||||
Sbjct: 5708 ataactacgctggtatccgagc---cgatgatgaaatttcacttgacgaagtgactattg 5764
Query: 5636 aaccaaagtggagcgttgcacggcatttacccgagtatatt 5676
||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct: 5765 aaccaaagtggagtgttgcacgacatttacctgagtatatt 5805
Score = 73.8 bits (37), Expect = 2e-11
Identities = 79/93 (84%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5121 tgtgaattctagaggaagtagcttaaacgataatggcagttttgatgagaataatggatg 5180
||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||| | ||||||
Sbjct: 5223 tgtgaatcctagaggaattaattcaaacgataacaccagttttgatgagaccactggatg 5282
Query: 5181 cgcgcaagcatttcgtgtcctgaaacaattgat 5213
|| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 5283 tgctcaagcatttcgtgtcctgaaacagttgat 5315
>At1g08270.2 68414.m00912 expressed protein low similarity to SP|P46467 SKD1
protein (Vacuolar sorting protein 4b) {Mus musculus}
Length = 1034
Score = 254 bits (128), Expect = 8e-66
Identities = 170/184 (92%)
Strand = Plus / Minus
Query: 6260 tgcaggatctagtgtgcaataggtgcaatcaggtgaaagccgctcatttgacagagcagt 6319
|||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 730 tgcaggatgtagtgtgcattaggtgcaatcaggtgaaagcggctcatttgacagagcagt 671
Query: 6320 gtgagtgttctggatcctttagatgcaaggagagtggttcagatttccacaagaggattg 6379
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |
Sbjct: 670 gtgagtgttctggttcctttagatgcaaggagagtgggtcagagttcagcaagaggatgg 611
Query: 6380 agattttcttggatatagcaaagcgccagaagtttagactgctagaagaatgcatctcct 6439
|||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
Sbjct: 610 agatattcatggatatagcaaagcgccagaagtttagactgttagaagaatacatctctt 551
Query: 6440 ggat 6443
||||
Sbjct: 550 ggat 547
Score = 61.9 bits (31), Expect = 6e-08
Identities = 46/51 (90%)
Strand = Plus / Minus
Query: 6090 ttgcagcaactgcggtgcctacagagacctagatttctgcagagactcagc 6140
|||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||
Sbjct: 786 ttgcagcaactgtgatgcctacagagacctagatatatgcagagacccagc 736
>At4g37780.1 68417.m05347 myb family transcription factor (MYB87) identical to
AtMYB87 R2R3-MYB transcription factor GI:2832559 from
[Arabidopsis thaliana]; contains Pfam profile: PF00249
myb-like DNA-binding domain
Length = 1052
Score = 42.1 bits (21), Expect = 0.059
Identities = 21/21 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2841 tttccaggccgagctatttga 2861
|||||||||||||||||||||
Sbjct: 747 tttccaggccgagctatttga 767
>At2g42820.1 68415.m05301 abscisic acid-responsive HVA22 family protein contains
Pfam profile PF03134: TB2/DP1, HVA22 family
Length = 843
Score = 40.1 bits (20), Expect = 0.23
Identities = 20/20 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 380 aaaaaaaatatctcaaagta 399
||||||||||||||||||||
Sbjct: 44 aaaaaaaatatctcaaagta 25
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
Posted date: Jun 25, 2004 12:58 PM
Number of letters in database: 44,058,232
Number of sequences in database: 29,161
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 184,110
Number of Sequences: 29161
Number of extensions: 184110
Number of successful extensions: 3951
Number of sequences better than 10.0: 21
length of query: 6465
length of database: 44,058,232
effective HSP length: 19
effective length of query: 6446
effective length of database: 43,504,173
effective search space: 280427899158
effective search space used: 280427899158
T: 0
A: 40
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 18 (36.2 bits)