BLASTN 2.2.3 [Apr-24-2002]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= At1g16800.F
(5820 letters)
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
29,161 sequences; 44,058,232 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
At1g16800.1 68414.m02018 tRNA-splicing endonuclease positiv... 1.154e+04 0.0
At5g05170.1 68418.m00550 cellulose synthase, catalytic subu... 40 0.21
At4g16710.2 68417.m02525 glycosyltransferase family protein... 40 0.21
At4g16710.1 68417.m02524 glycosyltransferase family protein... 40 0.21
At5g64160.1 68418.m08056 expressed protein 38 0.82
>At1g16800.1 68414.m02018 tRNA-splicing endonuclease positive effector-related
contains similarity to SEN1, a positive effector of
tRNA-splicing endonuclease [Saccharomyces cerevisiae]
gi|172574|gb|AAB63976
Length = 5820
Score = 1.154e+04 bits (5820), Expect = 0.0
Identities = 5820/5820 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgttgagtaaagtctccccaagtggagagctcttgaaccggtggaggagaatcgaggaa 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atgttgagtaaagtctccccaagtggagagctcttgaaccggtggaggagaatcgaggaa 60
Query: 61 gacgaagaggagaatgacgattctgatccttcagcagttcggcgtcttaatcagcgcaaa 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gacgaagaggagaatgacgattctgatccttcagcagttcggcgtcttaatcagcgcaaa 120
Query: 121 gaacaatggtttacggatgcattcactttattgatatcgttgccgaaagatactcatatt 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gaacaatggtttacggatgcattcactttattgatatcgttgccgaaagatactcatatt 180
Query: 181 tggtgtgggcacggggatataatgggacctcttatagagactttctacaattacttcaaa 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tggtgtgggcacggggatataatgggacctcttatagagactttctacaattacttcaaa 240
Query: 241 gatgatagagttgattcacctctcaaggtcttgtggaagagaatctctgaagagatgcgg 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gatgatagagttgattcacctctcaaggtcttgtggaagagaatctctgaagagatgcgg 300
Query: 301 ctttgtgcgcaatgcatttgtcagcaccatcagactcaagagatgtatgaaaaagagtat 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ctttgtgcgcaatgcatttgtcagcaccatcagactcaagagatgtatgaaaaagagtat 360
Query: 361 gagtgctcttctgttggtccattacttgttgtgttgcggaaacttgatgaggaaagggtg 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gagtgctcttctgttggtccattacttgttgtgttgcggaaacttgatgaggaaagggtg 420
Query: 421 acgaggcacttgcaagagatcaatttgaaaatagaaaaaggaacatatgatccagatcat 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 acgaggcacttgcaagagatcaatttgaaaatagaaaaaggaacatatgatccagatcat 480
Query: 481 catcatgctgaagttgttagtgttatgtacgaggttttgatgtttccattcttctttgat 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 catcatgctgaagttgttagtgttatgtacgaggttttgatgtttccattcttctttgat 540
Query: 541 gatatgtccttatgcactgagtttgagaaatttattgagtcaatcgacaacatacacgag 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gatatgtccttatgcactgagtttgagaaatttattgagtcaatcgacaacatacacgag 600
Query: 601 cttgcgtttgctgagaatcaagaatttccggtcagcaacccagttagagcgcctccagcc 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 cttgcgtttgctgagaatcaagaatttccggtcagcaacccagttagagcgcctccagcc 660
Query: 661 attgctcaagaaattcattggaattctggagatggagggactgccttccgcgtctcagga 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 attgctcaagaaattcattggaattctggagatggagggactgccttccgcgtctcagga 720
Query: 721 accgagaccaaggatatatctagaccgctcatctatatggcttgggatgacatcactgtc 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 accgagaccaaggatatatctagaccgctcatctatatggcttgggatgacatcactgtc 780
Query: 781 ccagttagcagtaacttcagccttttagcaagaagaattggccacaagattgctcttctt 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 ccagttagcagtaacttcagccttttagcaagaagaattggccacaagattgctcttctt 840
Query: 841 attgtactcagaggatacaagatgaacccaccttgccctccctttgagtgtgctcacatg 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 attgtactcagaggatacaagatgaacccaccttgccctccctttgagtgtgctcacatg 900
Query: 901 tggggcccatctcttgtgtcatcgtataaagattcttcacttcatatttcattgcgacaa 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 tggggcccatctcttgtgtcatcgtataaagattcttcacttcatatttcattgcgacaa 960
Query: 961 cctgccattgatcttgtccaagctatcctggtatctgatgcaacagccttactagcttcg 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 cctgccattgatcttgtccaagctatcctggtatctgatgcaacagccttactagcttcg 1020
Query: 1021 ttgctacgtaataatactggtaaatttatgggctatgagattcaatatgacgacgatgac 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 ttgctacgtaataatactggtaaatttatgggctatgagattcaatatgacgacgatgac 1080
Query: 1081 atggaatctgaaaagaatgatgaaatgacagttgatatagaaacttggctttcatcttct 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 atggaatctgaaaagaatgatgaaatgacagttgatatagaaacttggctttcatcttct 1140
Query: 1141 gctgttgaaatcaaaggcacgcttggatggaaggtagcaacaggatctgatgacgggggg 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 gctgttgaaatcaaaggcacgcttggatggaaggtagcaacaggatctgatgacgggggg 1200
Query: 1201 ccaggaaaggagtctaaaaactcagtgacagtatcaaagatgtgtcttacattgatacga 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1201 ccaggaaaggagtctaaaaactcagtgacagtatcaaagatgtgtcttacattgatacga 1260
Query: 1261 acattaaagagattgaccacttgttatctggtacaaattggtgacgagtgtcgaaaacag 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1261 acattaaagagattgaccacttgttatctggtacaaattggtgacgagtgtcgaaaacag 1320
Query: 1321 tggacctgggtaccagagatgggcgaaacgttcatcctttctctttcagacccagatgac 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1321 tggacctgggtaccagagatgggcgaaacgttcatcctttctctttcagacccagatgac 1380
Query: 1381 aatgtaaggcagtttggaaagtctatgctggaacacgtttcaaataccagaggtccattt 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1381 aatgtaaggcagtttggaaagtctatgctggaacacgtttcaaataccagaggtccattt 1440
Query: 1441 gagctctgtccttcaaagctttcagatcctgcaccattttttctttttattgttcaagtt 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1441 gagctctgtccttcaaagctttcagatcctgcaccattttttctttttattgttcaagtt 1500
Query: 1501 gctgaaggaagaggaggtggccattacagacgtagtgaagagttccgcagggggatgaca 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1501 gctgaaggaagaggaggtggccattacagacgtagtgaagagttccgcagggggatgaca 1560
Query: 1561 tgtgtacgtttgcttgagattcttcctgtcgttctgggaaaacttagagtaagccgtgaa 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1561 tgtgtacgtttgcttgagattcttcctgtcgttctgggaaaacttagagtaagccgtgaa 1620
Query: 1621 gagtcctgtgatactagaggaactttgaaagatgcgtctgatcttaaatggcttcctgat 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1621 gagtcctgtgatactagaggaactttgaaagatgcgtctgatcttaaatggcttcctgat 1680
Query: 1681 ctcattgattggggaaggtcacaacttaaggttgttgttgcgtattggaaacgagcatta 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1681 ctcattgattggggaaggtcacaacttaaggttgttgttgcgtattggaaacgagcatta 1740
Query: 1741 gtggctttgctagacatcttacaaggatcaaacagtgacgcttgttcttcggcagtccaa 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1741 gtggctttgctagacatcttacaaggatcaaacagtgacgcttgttcttcggcagtccaa 1800
Query: 1801 gctatcagacatgttctatcctctggtgatacaattgacaatgctctgactcttcttaat 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1801 gctatcagacatgttctatcctctggtgatacaattgacaatgctctgactcttcttaat 1860
Query: 1861 tcagatgatgttgacatcgagcaattagcagaacaaatctcacgccttgttcccaaggca 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1861 tcagatgatgttgacatcgagcaattagcagaacaaatctcacgccttgttcccaaggca 1920
Query: 1921 aatgagtaccagattctcaaacctgttgatgttgttggcaaattacaagataatatgatg 1980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1921 aatgagtaccagattctcaaacctgttgatgttgttggcaaattacaagataatatgatg 1980
Query: 1981 gatctaacagtggatgagacagaaaaggaatcgttgaaaaatttacctagtctgcataag 2040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1981 gatctaacagtggatgagacagaaaaggaatcgttgaaaaatttacctagtctgcataag 2040
Query: 2041 tctcatcaacctgacatcaataaaactcttctacctatcaaaaacatctcccagatctcc 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2041 tctcatcaacctgacatcaataaaactcttctacctatcaaaaacatctcccagatctcc 2100
Query: 2101 tctctgaagaagagtacttctagtattgatgcttcaaagctttcagcgttagttctttca 2160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2101 tctctgaagaagagtacttctagtattgatgcttcaaagctttcagcgttagttctttca 2160
Query: 2161 gagagagatgttacagttagctccagcaatattgttagggatcttcccacaacaaacgct 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2161 gagagagatgttacagttagctccagcaatattgttagggatcttcccacaacaaacgct 2220
Query: 2221 gaaccaagcaaggctgctggtatgagtagggaagcggaaaaaagacagaatgtggaagat 2280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2221 gaaccaagcaaggctgctggtatgagtagggaagcggaaaaaagacagaatgtggaagat 2280
Query: 2281 cctgtttcatctggaatcagacccaacttaaagaaggctactgatgaactcggccctcgt 2340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2281 cctgtttcatctggaatcagacccaacttaaagaaggctactgatgaactcggccctcgt 2340
Query: 2341 ggtacttcaaaagaggctcagaaatctgcgatttccaacgccaaaggcatggatttgaga 2400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2341 ggtacttcaaaagaggctcagaaatctgcgatttccaacgccaaaggcatggatttgaga 2400
Query: 2401 aaggtggtaaatgagacggaggttgatccacttgacttggctcttaaatctctgaaacgg 2460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2401 aaggtggtaaatgagacggaggttgatccacttgacttggctcttaaatctctgaaacgg 2460
Query: 2461 cagtcattacccctggcaaaatcagggcccattgttcccaaaagacaagtcattcaactt 2520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2461 cagtcattacccctggcaaaatcagggcccattgttcccaaaagacaagtcattcaactt 2520
Query: 2521 tgtgcacctgtcaacaagaaatccgatcgttggcagagacaagaagctggattcaaaaga 2580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2521 tgtgcacctgtcaacaagaaatccgatcgttggcagagacaagaagctggattcaaaaga 2580
Query: 2581 ttcagaccaccaaagcttgaagattggtttagaaagattttgcaaatggactactatgcg 2640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2581 ttcagaccaccaaagcttgaagattggtttagaaagattttgcaaatggactactatgcg 2640
Query: 2641 atagtgggattggcatcaacaaagaaagatgagagtcagaatgttggaaaatttagggaa 2700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2641 atagtgggattggcatcaacaaagaaagatgagagtcagaatgttggaaaatttagggaa 2700
Query: 2701 gttcctgtgcgctttggttcacctgagcaatatattcagatttttcagcccttggttttg 2760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2701 gttcctgtgcgctttggttcacctgagcaatatattcagatttttcagcccttggttttg 2760
Query: 2761 gaggagtttaaagcacagctgcaaagttccttccaggagatatcatcactggaggagata 2820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2761 gaggagtttaaagcacagctgcaaagttccttccaggagatatcatcactggaggagata 2820
Query: 2821 tattatggtgttatttcagtgttatcgattgaaagggttgacgattttcattttgttcgt 2880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2821 tattatggtgttatttcagtgttatcgattgaaagggttgacgattttcattttgttcgt 2880
Query: 2881 tttatgcaagacgaaaatgatgggtccaactcgaaaagtttctctgagaatgacttggtt 2940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2881 tttatgcaagacgaaaatgatgggtccaactcgaaaagtttctctgagaatgacttggtt 2940
Query: 2941 ttgttcacgaaagagcatccagaaaacagcaatgtcggtgtaaatatgatgggaaaggta 3000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2941 ttgttcacgaaagagcatccagaaaacagcaatgtcggtgtaaatatgatgggaaaggta 3000
Query: 3001 gaaggacgggaatgggatgacaaaaaacggaccagcattttgaatgtacggttgtatctt 3060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3001 gaaggacgggaatgggatgacaaaaaacggaccagcattttgaatgtacggttgtatctt 3060
Query: 3061 cagaatgcatcttcacggctgaatcaagctagaaggaatctcttggaacgtagccagtgg 3120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3061 cagaatgcatcttcacggctgaatcaagctagaaggaatctcttggaacgtagccagtgg 3120
Query: 3121 catgcaagtcgcattctcaacattacatcccaaattcgcgagtttcaagctttgtcgtgc 3180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3121 catgcaagtcgcattctcaacattacatcccaaattcgcgagtttcaagctttgtcgtgc 3180
Query: 3181 ataaaggatattcccgtacttcctctgatcttaagtcctatgaatgattctaattatgat 3240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3181 ataaaggatattcccgtacttcctctgatcttaagtcctatgaatgattctaattatgat 3240
Query: 3241 tccgaagttaaaagatcagatctgcgttcactaccacattctctacagcaaatacttaaa 3300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3241 tccgaagttaaaagatcagatctgcgttcactaccacattctctacagcaaatacttaaa 3300
Query: 3301 tcatctttcaatgagagtcaacttcaggctattagtgttgctattggctcatccaatttg 3360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3301 tcatctttcaatgagagtcaacttcaggctattagtgttgctattggctcatccaatttg 3360
Query: 3361 atgaaagcttttgacatttcacttatccagggtcctccagggactggcaagacgcgcact 3420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3361 atgaaagcttttgacatttcacttatccagggtcctccagggactggcaagacgcgcact 3420
Query: 3421 attgttgccattattagtggcttgcttgcatccgcctcacataaaactagtgacagggga 3480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3421 attgttgccattattagtggcttgcttgcatccgcctcacataaaactagtgacagggga 3480
Query: 3481 aattctgaaccaggtcatagttcttcaacctctaggcagggaatgaatccgagtgtcgct 3540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3481 aattctgaaccaggtcatagttcttcaacctctaggcagggaatgaatccgagtgtcgct 3540
Query: 3541 gttgcaagggcatggcaagatgcagctctggctaaacagctaaatgataacagcgaaacg 3600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3541 gttgcaagggcatggcaagatgcagctctggctaaacagctaaatgataacagcgaaacg 3600
Query: 3601 aatagaaagatagcagaaaagaatggtagaggaagggttctgatctgtgctcaatcaaat 3660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3601 aatagaaagatagcagaaaagaatggtagaggaagggttctgatctgtgctcaatcaaat 3660
Query: 3661 gctgcagttgatgaattagtttcaagaatatccagtttaggtatatatggcagggatggg 3720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3661 gctgcagttgatgaattagtttcaagaatatccagtttaggtatatatggcagggatggg 3720
Query: 3721 aagatgttcaaaccttatcttgtgagggttggaaatgcaaaaactgttcattcaaattca 3780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3721 aagatgttcaaaccttatcttgtgagggttggaaatgcaaaaactgttcattcaaattca 3780
Query: 3781 atgcccttctttcttgatacccttgttgatcagcggttggcagaggagagaatgcggata 3840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3781 atgcccttctttcttgatacccttgttgatcagcggttggcagaggagagaatgcggata 3840
Query: 3841 aacgaatctaagagtaataagggtgcagattcttctgcattactgcgctctaatctagaa 3900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3841 aacgaatctaagagtaataagggtgcagattcttctgcattactgcgctctaatctagaa 3900
Query: 3901 aaagtcgttgatcagatcacgcactttgaagctaagcgtgcaaacataaaccaggaaagt 3960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3901 aaagtcgttgatcagatcacgcactttgaagctaagcgtgcaaacataaaccaggaaagt 3960
Query: 3961 ttagacgccaaagataagccggagaatgaacaccacaacaaagatgatgatggcaagcta 4020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3961 ttagacgccaaagataagccggagaatgaacaccacaacaaagatgatgatggcaagcta 4020
Query: 4021 atgtccgatgcggagctaggaataagattgcgaaggttatatgagcaaaagagaaaaatt 4080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4021 atgtccgatgcggagctaggaataagattgcgaaggttatatgagcaaaagagaaaaatt 4080
Query: 4081 tacaaagatcttagtgctgttcaggctcaagagagaaaagcgaactatgaaatgagaaca 4140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4081 tacaaagatcttagtgctgttcaggctcaagagagaaaagcgaactatgaaatgagaaca 4140
Query: 4141 ttgaaacaaaagttgcggaagtccattcttaaagaagctcaaatagttgttacaacttta 4200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4141 ttgaaacaaaagttgcggaagtccattcttaaagaagctcaaatagttgttacaacttta 4200
Query: 4201 agtggttgtggaggagacctgtacagtgtgtgtgctgaatctttagcagcacataaattt 4260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4201 agtggttgtggaggagacctgtacagtgtgtgtgctgaatctttagcagcacataaattt 4260
Query: 4261 ggtagtccatctgaagataatttatttgatgcggtggtgattgacgaagcagctcaggcc 4320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4261 ggtagtccatctgaagataatttatttgatgcggtggtgattgacgaagcagctcaggcc 4320
Query: 4321 ctggagcctgctacgttgattcctctacaactgttaaagtcaagaggaacaaaatgtata 4380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4321 ctggagcctgctacgttgattcctctacaactgttaaagtcaagaggaacaaaatgtata 4380
Query: 4381 atggttggagacccaaagcagcttccagcaactgtgctctctaacgttgcaagtaaattt 4440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4381 atggttggagacccaaagcagcttccagcaactgtgctctctaacgttgcaagtaaattt 4440
Query: 4441 ttgtacgaatgtagcatgtttgaacgtctgcaaagggctgggtaccctatccttatgctt 4500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4441 ttgtacgaatgtagcatgtttgaacgtctgcaaagggctgggtaccctatccttatgctt 4500
Query: 4501 acccagcagtataggatgcatccagaaatttgtcgattcccgtctatgcatttctacgac 4560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4501 acccagcagtataggatgcatccagaaatttgtcgattcccgtctatgcatttctacgac 4560
Query: 4561 aataagttactaaatggtgttgacatgtcaagtaaatcagcaccattccacgagaaccat 4620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4561 aataagttactaaatggtgttgacatgtcaagtaaatcagcaccattccacgagaaccat 4620
Query: 4621 catcttggaccatatgttttctatgatattgttgatggccaagagcatcgaagtggcgat 4680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4621 catcttggaccatatgttttctatgatattgttgatggccaagagcatcgaagtggcgat 4680
Query: 4681 tctagctccgtatgcaatgaacaagaagctgaagctgctgttcaactgcttagatttttc 4740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4681 tctagctccgtatgcaatgaacaagaagctgaagctgctgttcaactgcttagatttttc 4740
Query: 4741 aagaagaggtacccctcagaatttgttgctggaaggattggcattataaccccttacaag 4800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4741 aagaagaggtacccctcagaatttgttgctggaaggattggcattataaccccttacaag 4800
Query: 4801 cgtcagcttgccgttttgcgttcgcgtttcactggtgcatttggggctcaagtaacagca 4860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4801 cgtcagcttgccgttttgcgttcgcgtttcactggtgcatttggggctcaagtaacagca 4860
Query: 4861 gatatggaaatgaatactgtggatggctttcaaggcaaagaagttgacatattagtatta 4920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4861 gatatggaaatgaatactgtggatggctttcaaggcaaagaagttgacatattagtatta 4920
Query: 4921 tccactgtaagagctacacattcggctcctgatggggtcaatcaaagtcggattggtttt 4980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4921 tccactgtaagagctacacattcggctcctgatggggtcaatcaaagtcggattggtttt 4980
Query: 4981 gttgcagatgttagacgcatgaatgttgctctcactagagccaaactctccctttgggtt 5040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4981 gttgcagatgttagacgcatgaatgttgctctcactagagccaaactctccctttgggtt 5040
Query: 5041 ttgggtaacacacgaaccttgcaaagagaccataactggggtgctcttgtgaaagatgca 5100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5041 ttgggtaacacacgaaccttgcaaagagaccataactggggtgctcttgtgaaagatgca 5100
Query: 5101 aaagaaagagaagtcatcataccagttaagcgaccgtacaactacatgtttggtgagaat 5160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5101 aaagaaagagaagtcatcataccagttaagcgaccgtacaactacatgtttggtgagaat 5160
Query: 5161 gtgatggaacaaaaccattctgagaatcttccaaagaattttcctaagcctgataaacag 5220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5161 gtgatggaacaaaaccattctgagaatcttccaaagaattttcctaagcctgataaacag 5220
Query: 5221 cattcacgccgcaaagaacagagagcagagacatcttctgatagaaaactgaggaaaact 5280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5221 cattcacgccgcaaagaacagagagcagagacatcttctgatagaaaactgaggaaaact 5280
Query: 5281 gatggagatgttgtgcctatctcatcaaaaggatcagagagtaagcacaccagacgaaat 5340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5281 gatggagatgttgtgcctatctcatcaaaaggatcagagagtaagcacaccagacgaaat 5340
Query: 5341 gcgaaagaagaagcttcatctcaaagggaaaaactagttgcaagctgtgagaaagtaaca 5400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5341 gcgaaagaagaagcttcatctcaaagggaaaaactagttgcaagctgtgagaaagtaaca 5400
Query: 5401 tccgaagagactctgagacggagccatgaaaagaaagaaaaaatgaaaggcagagagaaa 5460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5401 tccgaagagactctgagacggagccatgaaaagaaagaaaaaatgaaaggcagagagaaa 5460
Query: 5461 agcagtaatccagagattacagatgcaaatagttcgaagaacgaaaattcaaatgaatgg 5520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5461 agcagtaatccagagattacagatgcaaatagttcgaagaacgaaaattcaaatgaatgg 5520
Query: 5521 aagaaatctaagaaggcttcatcaaagcttgacagtagcaagagggcaaatcccacagat 5580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5521 aagaaatctaagaaggcttcatcaaagcttgacagtagcaagagggcaaatcccacagat 5580
Query: 5581 aaaattggacagcaagataggcaaataaacaagggcaatgcttctaatcaaggaggtgtt 5640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5581 aaaattggacagcaagataggcaaataaacaagggcaatgcttctaatcaaggaggtgtt 5640
Query: 5641 gaagatatgatatccaaacgaaagcagcagcgtgaagctgttgctgccattctcaattcg 5700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5641 gaagatatgatatccaaacgaaagcagcagcgtgaagctgttgctgccattctcaattcg 5700
Query: 5701 tctctgattccttcacataagcctaaacctccaaagcgaccattgtccccaggttcaacc 5760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5701 tctctgattccttcacataagcctaaacctccaaagcgaccattgtccccaggttcaacc 5760
Query: 5761 gccggcagtcatacaagaccacctaaggcgatcaaagagtcaaccaagaacaacagttaa 5820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5761 gccggcagtcatacaagaccacctaaggcgatcaaagagtcaaccaagaacaacagttaa 5820
>At5g05170.1 68418.m00550 cellulose synthase, catalytic subunit (Ath-B) nearly
identical to gi:2827143, cellulose synthase, catalytic
subunit (Ath-B)
Length = 3607
Score = 40.1 bits (20), Expect = 0.21
Identities = 20/20 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 56 aggaagacgaagaggagaat 75
||||||||||||||||||||
Sbjct: 42 aggaagacgaagaggagaat 23
>At4g16710.2 68417.m02525 glycosyltransferase family protein 28 low similarity to
C terminus subunit of GlcA transferase from Escherichia
coli [GI:2586169]; contains Pfam profile PF04101:
Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain
Length = 913
Score = 40.1 bits (20), Expect = 0.21
Identities = 23/24 (95%)
Strand = Plus / Minus
Query: 3255 atcagatctgcgttcactaccaca 3278
||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 543 atcagatcttcgttcactaccaca 520
>At4g16710.1 68417.m02524 glycosyltransferase family protein 28 low similarity to
C terminus subunit of GlcA transferase from Escherichia
coli [GI:2586169]; contains Pfam profile PF04101:
Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain
Length = 919
Score = 40.1 bits (20), Expect = 0.21
Identities = 23/24 (95%)
Strand = Plus / Minus
Query: 3255 atcagatctgcgttcactaccaca 3278
||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 549 atcagatcttcgttcactaccaca 526
>At5g64160.1 68418.m08056 expressed protein
Length = 840
Score = 38.2 bits (19), Expect = 0.82
Identities = 19/19 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 3864 tgcagattcttctgcatta 3882
|||||||||||||||||||
Sbjct: 470 tgcagattcttctgcatta 452
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
Posted date: Jun 25, 2004 12:58 PM
Number of letters in database: 44,058,232
Number of sequences in database: 29,161
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 202,061
Number of Sequences: 29161
Number of extensions: 202061
Number of successful extensions: 4701
Number of sequences better than 10.0: 30
length of query: 5820
length of database: 44,058,232
effective HSP length: 19
effective length of query: 5801
effective length of database: 43,504,173
effective search space: 252367707573
effective search space used: 252367707573
T: 0
A: 40
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 18 (36.2 bits)