BLASTN 2.2.3 [Apr-24-2002]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= At1g67500.F
(5616 letters)
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
29,161 sequences; 44,058,232 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
At1g67500.1 68414.m07688 DNA polymerase family B protein si... 1.008e+04 0.0
At1g20060.1 68414.m02511 kinesin motor protein-related 42 0.051
At4g19640.1 68417.m02884 Ras-related GTP-binding protein, p... 40 0.20
At3g07400.1 68416.m00882 lipase class 3 family protein cont... 40 0.20
At5g67360.1 68418.m08494 cucumisin-like serine protease (AR... 38 0.79
>At1g67500.1 68414.m07688 DNA polymerase family B protein similar to SP|Q61493 DNA
polymerase zeta catalytic subunit (EC 2.7.7.7) {Mus
musculus}; contains Pfam profile PF00136: DNA polymerase
family B
Length = 5673
Score = 1.008e+04 bits (5083), Expect = 0.0
Identities = 5083/5083 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 429 tagctaccatccacccgatgtggctcgtgctgccagtcttcttctggcaggtgctgttct 488
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 417 tagctaccatccacccgatgtggctcgtgctgccagtcttcttctggcaggtgctgttct 476
Query: 489 tggtaaaagtttgcagccttacgagtctcatattccctttattctccagtttctggttga 548
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 477 tggtaaaagtttgcagccttacgagtctcatattccctttattctccagtttctggttga 536
Query: 549 ttataatttgtatggaatgggtcatgtgcatatatcaaagatgaagttccgtagcccagt 608
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 537 ttataatttgtatggaatgggtcatgtgcatatatcaaagatgaagttccgtagcccagt 596
Query: 609 gcctcaccatttccggccaaggagatttgatttggatgattgtccgggacaaaggattga 668
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 597 gcctcaccatttccggccaaggagatttgatttggatgattgtccgggacaaaggattga 656
Query: 669 cgaagtggctattacaaaggcaaattcaagtgctgctgcaagcgtcagttttcctgtttg 728
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 657 cgaagtggctattacaaaggcaaattcaagtgctgctgcaagcgtcagttttcctgtttg 716
Query: 729 gagcttgtcaacaatcccaggtcagtggatgtggaatctctctgaagaatctgatacacc 788
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 717 gagcttgtcaacaatcccaggtcagtggatgtggaatctctctgaagaatctgatacacc 776
Query: 789 gttgagccagagccagcataggcaccaacaccattacagacgtcagagtctctgtgaact 848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 777 gttgagccagagccagcataggcaccaacaccattacagacgtcagagtctctgtgaact 836
Query: 849 tgagggagatgctactagtagtgatattctcaatcaacagtttaaaatgtacaactccct 908
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 837 tgagggagatgctactagtagtgatattctcaatcaacagtttaaaatgtacaactccct 896
Query: 909 ttcacaagcccagtctgatactaacatggttcagtcgcttgtggcaatttgggaggagga 968
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 897 ttcacaagcccagtctgatactaacatggttcagtcgcttgtggcaatttgggaggagga 956
Query: 969 gtatgaaaggactggtgtgcatgatgcacctatacctcctgatcctggtaaaccctctgc 1028
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 957 gtatgaaaggactggtgtgcatgatgcacctatacctcctgatcctggtaaaccctctgc 1016
Query: 1029 agctgatgtgttgcagactatgtcagattatgttgggtttgggaatatgcttaaagaaat 1088
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1017 agctgatgtgttgcagactatgtcagattatgttgggtttgggaatatgcttaaagaaat 1076
Query: 1089 gctaaacaaagttgaattgtctccgcctggtatgaagcctactgcagtatcttcagctgg 1148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1077 gctaaacaaagttgaattgtctccgcctggtatgaagcctactgcagtatcttcagctgg 1136
Query: 1149 tccagatatgcatgccaaacctgaaattactgatctacaggctttgaatcatatggttgg 1208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1137 tccagatatgcatgccaaacctgaaattactgatctacaggctttgaatcatatggttgg 1196
Query: 1209 tacatgcagtgagtttcctgcatcagaacagctttctccacttggcgagaagagtgaaga 1268
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1197 tacatgcagtgagtttcctgcatcagaacagctttctccacttggcgagaagagtgaaga 1256
Query: 1269 agcatcaatggaaaatgatgaatatatgaaaacacccacggacagagatacacctgctca 1328
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1257 agcatcaatggaaaatgatgaatatatgaaaacacccacggacagagatacacctgctca 1316
Query: 1329 aatacaagatgctgaagccttgggtctctttaagtggtttgcctcatctcaggctgcaga 1388
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1317 aatacaagatgctgaagccttgggtctctttaagtggtttgcctcatctcaggctgcaga 1376
Query: 1389 ggacataaactcagatgatgagattctccgggaaactatccttagtcctcttttgccttt 1448
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1377 ggacataaactcagatgatgagattctccgggaaactatccttagtcctcttttgccttt 1436
Query: 1449 agcgtctattaacaaggttcttgaaatggctagtacagattatgtgagccaatcccaaaa 1508
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1437 agcgtctattaacaaggttcttgaaatggctagtacagattatgtgagccaatcccaaaa 1496
Query: 1509 ggaatgtcaagacattcttgattctcaggaaaatcttccagactttgggagttcgactaa 1568
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1497 ggaatgtcaagacattcttgattctcaggaaaatcttccagactttgggagttcgactaa 1556
Query: 1569 gagagctttacctagtaatcctgatagccagaatcttagaacttcatccgacaaacaatc 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1557 gagagctttacctagtaatcctgatagccagaatcttagaacttcatccgacaaacaatc 1616
Query: 1629 tcttgaaatagaagtcgctagtgatgttccagatagctccacttcaaatggagcaagcga 1688
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1617 tcttgaaatagaagtcgctagtgatgttccagatagctccacttcaaatggagcaagcga 1676
Query: 1689 aaattcattccggagatacagaaagagtgatttacatacgagtgaagtaatggagtataa 1748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1677 aaattcattccggagatacagaaagagtgatttacatacgagtgaagtaatggagtataa 1736
Query: 1749 gaacaggagcttctctaagagcaacaagcctagcaactcagtatggggacctttaccttt 1808
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1737 gaacaggagcttctctaagagcaacaagcctagcaactcagtatggggacctttaccttt 1796
Query: 1809 tacactgaccaaaaatcttcagaaggactttgacagtacaaatgctagtgataaacttgg 1868
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1797 tacactgaccaaaaatcttcagaaggactttgacagtacaaatgctagtgataaacttgg 1856
Query: 1869 tttaacaaagattagttcttaccccatgaatgagatgacagacaattatattgttccagt 1928
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1857 tttaacaaagattagttcttaccccatgaatgagatgacagacaattatattgttccagt 1916
Query: 1929 caaagaacatcaagcagatgtttgtaatacaattgacagaaacgttttggctggatgttc 1988
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1917 caaagaacatcaagcagatgtttgtaatacaattgacagaaacgttttggctggatgttc 1976
Query: 1989 tctgcgggacttgatgagaaaaaaacggttatgccatggagaatcgcctgtttcacagca 2048
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1977 tctgcgggacttgatgagaaaaaaacggttatgccatggagaatcgcctgtttcacagca 2036
Query: 2049 tatgaagtctaggaaggttagagattcccgacacggggaaaaaaatgagtgcaccttgag 2108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2037 tatgaagtctaggaaggttagagattcccgacacggggaaaaaaatgagtgcaccttgag 2096
Query: 2109 atgtgaggccaaaaaacaaggtcctgctctttctgcagaatttagcgaatttgtttgtgg 2168
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2097 atgtgaggccaaaaaacaaggtcctgctctttctgcagaatttagcgaatttgtttgtgg 2156
Query: 2169 cgatactccaaatttatctcctatagattctggaaattgcgagtgtaatatatccactga 2228
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2157 cgatactccaaatttatctcctatagattctggaaattgcgagtgtaatatatccactga 2216
Query: 2229 gtcatctgaacttcattctgttgatagatgttcagctaaagagacagcaagtcaaaacag 2288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2217 gtcatctgaacttcattctgttgatagatgttcagctaaagagacagcaagtcaaaacag 2276
Query: 2289 tgatgaagttttaaggaatttgtcatctaccactgttccatttggtaaggatccacaaac 2348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2277 tgatgaagttttaaggaatttgtcatctaccactgttccatttggtaaggatccacaaac 2336
Query: 2349 tgtggaatcaggaacactagtgtctagcaatatacatgttgggattgaaatagatagtgt 2408
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2337 tgtggaatcaggaacactagtgtctagcaatatacatgttgggattgaaatagatagtgt 2396
Query: 2409 ccaaaaatcggggagggagcaagagtcaactgccaatgaaactgatgagacgggaagatt 2468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2397 ccaaaaatcggggagggagcaagagtcaactgccaatgaaactgatgagacgggaagatt 2456
Query: 2469 aatatgcctaaccttaagcaagaagcctccttctctcgattgcctaagtgctggactgca 2528
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2457 aatatgcctaaccttaagcaagaagcctccttctctcgattgcctaagtgctggactgca 2516
Query: 2529 ggattctgcacattctcatgaaattcatgccagggaaaaacagcatgatgaatatgaggg 2588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2517 ggattctgcacattctcatgaaattcatgccagggaaaaacagcatgatgaatatgaggg 2576
Query: 2589 aaattccaacgacatcccgttttttcccttggaggacaacaaggaggaaaagaaacactt 2648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2577 aaattccaacgacatcccgttttttcccttggaggacaacaaggaggaaaagaaacactt 2636
Query: 2649 tttccaaggaacttcccttggtattcccttgcatcatctcaatgacggctccaatcttta 2708
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2637 tttccaaggaacttcccttggtattcccttgcatcatctcaatgacggctccaatcttta 2696
Query: 2709 cctactgacccctgccttttcacccccttctgtggattctgttttacaatggatatcgaa 2768
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2697 cctactgacccctgccttttcacccccttctgtggattctgttttacaatggatatcgaa 2756
Query: 2769 tgacaaaggagactctaatattgattcagaaaaacaaccattacgagataatcataatga 2828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2757 tgacaaaggagactctaatattgattcagaaaaacaaccattacgagataatcataatga 2816
Query: 2829 tcgtggagcaagtttcactgatcttgcttctgcatctaatgtggtgtctgtgtctgagca 2888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2817 tcgtggagcaagtttcactgatcttgcttctgcatctaatgtggtgtctgtgtctgagca 2876
Query: 2889 cgtggagcagcataataacctttttgtgaattcagaatcaaatgcttatacagagtcgga 2948
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2877 cgtggagcagcataataacctttttgtgaattcagaatcaaatgcttatacagagtcgga 2936
Query: 2949 gatagatctgaaacccaaaggaacgtttcttaatcttaacttgcaggccagtgtttccca 3008
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2937 gatagatctgaaacccaaaggaacgtttcttaatcttaacttgcaggccagtgtttccca 2996
Query: 3009 agagctgtctcagatttcaggccctgatgggaaatctgggcccactcccttaagtcaaat 3068
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2997 agagctgtctcagatttcaggccctgatgggaaatctgggcccactcccttaagtcaaat 3056
Query: 3069 gggattccgagatcctgcgagcatgggtgcggggcaacagcttacaattctgagtataga 3128
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3057 gggattccgagatcctgcgagcatgggtgcggggcaacagcttacaattctgagtataga 3116
Query: 3129 ggttcatgcagagtctagaggggacctgcgacctgatccacgatttgattctgtcaatgt 3188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3117 ggttcatgcagagtctagaggggacctgcgacctgatccacgatttgattctgtcaatgt 3176
Query: 3189 tatagctctcgtcgtgcagaatgacgatagttttgtagctgaagtatttgtgcttttatt 3248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3177 tatagctctcgtcgtgcagaatgacgatagttttgtagctgaagtatttgtgcttttatt 3236
Query: 3249 tagtccagatagcattgatcagagaaatgttgatggcctatctggatgcaagttgtctgt 3308
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3237 tagtccagatagcattgatcagagaaatgttgatggcctatctggatgcaagttgtctgt 3296
Query: 3309 attccttgaagagaggcaactattcagatattttattgagactttatgtaaatgggatcc 3368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3297 attccttgaagagaggcaactattcagatattttattgagactttatgtaaatgggatcc 3356
Query: 3369 agatgttcttctgggctgggatatacagggcggatccattggttttctagctgaaagagc 3428
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3357 agatgttcttctgggctgggatatacagggcggatccattggttttctagctgaaagagc 3416
Query: 3429 tgcacagcttggtataagatttctcaataatatatctaggacgccatctccgaccacaac 3488
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3417 tgcacagcttggtataagatttctcaataatatatctaggacgccatctccgaccacaac 3476
Query: 3489 aaacaattcagataataagagaaaacttggtaataatctgctgccagatccgttggtagc 3548
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3477 aaacaattcagataataagagaaaacttggtaataatctgctgccagatccgttggtagc 3536
Query: 3549 taatcctgctcaagtagaagaagtggtaattgaggacgagtggggccgcacacatgctag 3608
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3537 taatcctgctcaagtagaagaagtggtaattgaggacgagtggggccgcacacatgctag 3596
Query: 3609 tggtgttcatgttggaggtagaattgttctcaatgcatggcgtttgattcgcggggaagt 3668
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3597 tggtgttcatgttggaggtagaattgttctcaatgcatggcgtttgattcgcggggaagt 3656
Query: 3669 taaactcaacatgtacacgattgaagctgtgtcagaggctgttttgaggcagaaggttcc 3728
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3657 taaactcaacatgtacacgattgaagctgtgtcagaggctgttttgaggcagaaggttcc 3716
Query: 3729 atcaatcccctataaggtattgacagaatggttttcaagtggtcctgcgggtgcaagata 3788
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3717 atcaatcccctataaggtattgacagaatggttttcaagtggtcctgcgggtgcaagata 3776
Query: 3789 tagatgcatagaatatgtgattcggcgagcaaatttgaaccttgagataatgagccaact 3848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3777 tagatgcatagaatatgtgattcggcgagcaaatttgaaccttgagataatgagccaact 3836
Query: 3849 tgacatgataaatcgtacgtcagaacttgctcgtgtttttggtatagactttttctcagt 3908
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3837 tgacatgataaatcgtacgtcagaacttgctcgtgtttttggtatagactttttctcagt 3896
Query: 3909 tctctcccgaggttcacagtacagagtggaatccatgcttctgagattagcacatacaca 3968
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3897 tctctcccgaggttcacagtacagagtggaatccatgcttctgagattagcacatacaca 3956
Query: 3969 aaattatcttgctatttctccaggaaaccaacaggttgcctctcagccagctatggaatg 4028
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3957 aaattatcttgctatttctccaggaaaccaacaggttgcctctcagccagctatggaatg 4016
Query: 4029 tgtacctcttgtgatggaaccagaatctgccttttacgatgatcctgttattgtgttgga 4088
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4017 tgtacctcttgtgatggaaccagaatctgccttttacgatgatcctgttattgtgttgga 4076
Query: 4089 ttttcaatctctttacccttcaatgattatagcatataatctgtgcttttctacatgtct 4148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4077 ttttcaatctctttacccttcaatgattatagcatataatctgtgcttttctacatgtct 4136
Query: 4149 cggaaaacttgcacatttgaagatgaacacccttggggtcagctcatactctctagacct 4208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4137 cggaaaacttgcacatttgaagatgaacacccttggggtcagctcatactctctagacct 4196
Query: 4209 cgatgttcttcaggatttaaatcagatcctacagaccccaaacagtgtgatgtacgtgcc 4268
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4197 cgatgttcttcaggatttaaatcagatcctacagaccccaaacagtgtgatgtacgtgcc 4256
Query: 4269 accagaggtgcgtagaggaattttacctaggctgctagaggagattctgtctacaagaat 4328
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4257 accagaggtgcgtagaggaattttacctaggctgctagaggagattctgtctacaagaat 4316
Query: 4329 aatggtgaaaaaagcaatgaaaaagttgactccttcagaagcagttcttcaccggatatt 4388
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4317 aatggtgaaaaaagcaatgaaaaagttgactccttcagaagcagttcttcaccggatatt 4376
Query: 4389 taatgcgaggcagcttgctttaaagctgatagcaaatgtgacttatggttatactgctgc 4448
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4377 taatgcgaggcagcttgctttaaagctgatagcaaatgtgacttatggttatactgctgc 4436
Query: 4449 tggcttcagtggtcgaatgccttgtgcagagctggcagatagtattgtccagtgtggtcg 4508
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4437 tggcttcagtggtcgaatgccttgtgcagagctggcagatagtattgtccagtgtggtcg 4496
Query: 4509 tagcacacttgagaaggctatttcattcgtcaatgccaatgataattggaacgctagagt 4568
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4497 tagcacacttgagaaggctatttcattcgtcaatgccaatgataattggaacgctagagt 4556
Query: 4569 tgtatatggtgacactgatagtatgtttgtcctcctaaaaggacgaactgtaaaagaagc 4628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4557 tgtatatggtgacactgatagtatgtttgtcctcctaaaaggacgaactgtaaaagaagc 4616
Query: 4629 ttttgtagtcggacaagagattgcatctgcaataactgaaatgaacccacacccagtcac 4688
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4617 ttttgtagtcggacaagagattgcatctgcaataactgaaatgaacccacacccagtcac 4676
Query: 4689 tttaaagatggagaaagtctatcacccttgtttccttcttacgaagaagcgttatgttgg 4748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4677 tttaaagatggagaaagtctatcacccttgtttccttcttacgaagaagcgttatgttgg 4736
Query: 4749 gtacagttatgaaagtcccaatcagagagagcctatatttgatgcaaaaggtattgaaac 4808
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4737 gtacagttatgaaagtcccaatcagagagagcctatatttgatgcaaaaggtattgaaac 4796
Query: 4809 tgttcgaagagacacttgtgaagctgttgcgaaaactatggagcaatcgttgagactctt 4868
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4797 tgttcgaagagacacttgtgaagctgttgcgaaaactatggagcaatcgttgagactctt 4856
Query: 4869 ttttgaacagaagaacatctctaaggttaagtcgtacttgtatagacagtggaagcggat 4928
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4857 ttttgaacagaagaacatctctaaggttaagtcgtacttgtatagacagtggaagcggat 4916
Query: 4929 actatcagggagagtgtctcttcaagattttatctttgcaaaagaagttcggttgggtac 4988
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4917 actatcagggagagtgtctcttcaagattttatctttgcaaaagaagttcggttgggtac 4976
Query: 4989 ttacagcacaagagactcttcactccttcctccagcagctattgtggcaaccaaatcaat 5048
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4977 ttacagcacaagagactcttcactccttcctccagcagctattgtggcaaccaaatcaat 5036
Query: 5049 gaaagcagaccctcggacagagccacgctatgctgaacgagtgccttatgttgtgattca 5108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5037 gaaagcagaccctcggacagagccacgctatgctgaacgagtgccttatgttgtgattca 5096
Query: 5109 tggggagccaggagctcgacttgttgatatggttgttgatccactggttcttttggacgt 5168
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5097 tggggagccaggagctcgacttgttgatatggttgttgatccactggttcttttggacgt 5156
Query: 5169 cgatacaccctaccgactgaatgacttatactacatcaacaaacaaattataccagcttt 5228
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5157 cgatacaccctaccgactgaatgacttatactacatcaacaaacaaattataccagcttt 5216
Query: 5229 gcaaagggtatttggactcgtgggtgcagacttaaaccagtggtttttggagatgccccg 5288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5217 gcaaagggtatttggactcgtgggtgcagacttaaaccagtggtttttggagatgccccg 5276
Query: 5289 tctcaccagaagctcccttggtcaacgtcccttaaactctaaaaactcacacaaaacaag 5348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5277 tctcaccagaagctcccttggtcaacgtcccttaaactctaaaaactcacacaaaacaag 5336
Query: 5349 gattgattatttttatctatcgaaacattgcatcttgtgtggggaagttgttcaagaatc 5408
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5337 gattgattatttttatctatcgaaacattgcatcttgtgtggggaagttgttcaagaatc 5396
Query: 5409 tgctcaactatgcaaccggtgccttcaaaataaaagtgctgctgctgcaaccattgtttg 5468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5397 tgctcaactatgcaaccggtgccttcaaaataaaagtgctgctgctgcaaccattgtttg 5456
Query: 5469 gaagacttcaaagttggagagagagatgcaacacctagccacg 5511
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5457 gaagacttcaaagttggagagagagatgcaacacctagccacg 5499
Score = 825 bits (416), Expect = 0.0
Identities = 416/416 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggctgattctcaatccggttccaatgttttcagtttacggatagtttcaatcgattat 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atggctgattctcaatccggttccaatgttttcagtttacggatagtttcaatcgattat 60
Query: 61 tacatggcttctccaatccctggttataatatttgctacagtagcttccaaggtagtgag 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tacatggcttctccaatccctggttataatatttgctacagtagcttccaaggtagtgag 120
Query: 121 gtaaatgaagtccctgttataaggatatacggctctacacctgctggtcagaagacttgc 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gtaaatgaagtccctgttataaggatatacggctctacacctgctggtcagaagacttgc 180
Query: 181 ttgcacattcatcgtgctttaccatatctctatattccgtgctcagaaattccacttgag 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttgcacattcatcgtgctttaccatatctctatattccgtgctcagaaattccacttgag 240
Query: 241 catcataaaggagtggatggaagtacacttgctttatcccttgagttagagaaggctcta 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 catcataaaggagtggatggaagtacacttgctttatcccttgagttagagaaggctcta 300
Query: 301 aagcttaagggaaatgctgcttcaaaaaggcaacatatccatgattgtgagattgtaaga 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 aagcttaagggaaatgctgcttcaaaaaggcaacatatccatgattgtgagattgtaaga 360
Query: 361 gcaaagaagttttatgggtaccactcaacagaggaggcttttgtgaagatttatct 416
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gcaaagaagttttatgggtaccactcaacagaggaggcttttgtgaagatttatct 416
>At1g20060.1 68414.m02511 kinesin motor protein-related
Length = 2856
Score = 42.1 bits (21), Expect = 0.051
Identities = 21/21 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1526 ttgattctcaggaaaatcttc 1546
|||||||||||||||||||||
Sbjct: 251 ttgattctcaggaaaatcttc 231
>At4g19640.1 68417.m02884 Ras-related GTP-binding protein, putative similar to
GTP-binding protein RAB5A GI:1370178 from [Lotus
japonicus]
Length = 958
Score = 40.1 bits (20), Expect = 0.20
Identities = 23/24 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5444 gtgctgctgctgcaaccattgttt 5467
||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 407 gtgctgctgctgcaatcattgttt 430
>At3g07400.1 68416.m00882 lipase class 3 family protein contains Pfam profile
PF01764: Lipase
Length = 3643
Score = 40.1 bits (20), Expect = 0.20
Identities = 20/20 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1623 acaatctcttgaaatagaag 1642
||||||||||||||||||||
Sbjct: 1378 acaatctcttgaaatagaag 1397
>At5g67360.1 68418.m08494 cucumisin-like serine protease (ARA12) Asp48; almost
identical to cucumisin-like serine protease (ARA12)
GI:3176874 from [Arabidopsis thaliana]
Length = 2689
Score = 38.2 bits (19), Expect = 0.79
Identities = 19/19 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 2941 gagtcggagatagatctga 2959
|||||||||||||||||||
Sbjct: 299 gagtcggagatagatctga 281
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
Posted date: Jun 25, 2004 12:58 PM
Number of letters in database: 44,058,232
Number of sequences in database: 29,161
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 166,071
Number of Sequences: 29161
Number of extensions: 166071
Number of successful extensions: 3470
Number of sequences better than 10.0: 19
length of query: 5616
length of database: 44,058,232
effective HSP length: 19
effective length of query: 5597
effective length of database: 43,504,173
effective search space: 243492856281
effective search space used: 243492856281
T: 0
A: 40
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 18 (36.2 bits)