BLASTN 2.2.3 [Apr-24-2002]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= At1g08260.F
(6816 letters)
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
29,161 sequences; 44,058,232 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
At1g08260.1 68414.m00911 DNA-directed DNA polymerase epsilo... 1.351e+04 0.0
At2g27120.1 68415.m03259 DNA-directed DNA polymerase epsilo... 1778 0.0
At1g08270.2 68414.m00912 expressed protein low similarity t... 404 e-111
At4g29960.1 68417.m04262 expressed protein 40 0.24
At3g09260.1 68416.m01100 glycosyl hydrolase family 1 protei... 40 0.24
>At1g08260.1 68414.m00911 DNA-directed DNA polymerase epsilon catalytic subunit,
putative similar to SP|Q07864 DNA polymerase epsilon,
catalytic subunit A (EC 2.7.7.7) (DNA polymerase II
subunit A) {Homo sapiens}; contains Pfam profiles:
PF03175 DNA polymerase type B, organellar and viral,
PF00136 DNA polymerase family B, PF03104 DNA polymerase
family B, exonuclease domain
Length = 6816
Score = 1.351e+04 bits (6816), Expect = 0.0
Identities = 6816/6816 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgagcggagataatcgaagacgggatcgaaaggatacgcggtggtcgaagaagcctaag 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atgagcggagataatcgaagacgggatcgaaaggatacgcggtggtcgaagaagcctaag 60
Query: 61 gtagtgaacactgcggaagatgaactcgaatctaaactcggatttgggcttttctctgaa 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gtagtgaacactgcggaagatgaactcgaatctaaactcggatttgggcttttctctgaa 120
Query: 121 ggtgaaacccgacttgggtggttactcacattctcatcgtcatcttgggaagatcgcgat 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ggtgaaacccgacttgggtggttactcacattctcatcgtcatcttgggaagatcgcgat 180
Query: 181 actgggaaagtctatagttgtgtggacctttactttgttactcaggacggcttttctttc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 actgggaaagtctatagttgtgtggacctttactttgttactcaggacggcttttctttc 240
Query: 241 aagacaaagtacaagttccgtccttacttttatgcagccacgaaagacaaaatggaattg 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 aagacaaagtacaagttccgtccttacttttatgcagccacgaaagacaaaatggaattg 300
Query: 301 gaactcgaagcctacttgagacgccgatatgaaagacaagttgctgatattgagattgtt 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gaactcgaagcctacttgagacgccgatatgaaagacaagttgctgatattgagattgtt 360
Query: 361 gaaaaagaagatcttgatcttaaaaatcatctatctggcctgcaaaaaaaatacctaaaa 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gaaaaagaagatcttgatcttaaaaatcatctatctggcctgcaaaaaaaatacctaaaa 420
Query: 421 atatcatttgatactgtgcaacaattgatggaagtcaagcgggatttgttacatattgtc 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 atatcatttgatactgtgcaacaattgatggaagtcaagcgggatttgttacatattgtc 480
Query: 481 gaacgaaaccaggcaaaatttgatgcacttgaagcatacgaatccatattggctggaaaa 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gaacgaaaccaggcaaaatttgatgcacttgaagcatacgaatccatattggctggaaaa 540
Query: 541 cgagaacaacgtcctcaagattgcttagactctatcgtggacctccgcgagtacgatgta 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 cgagaacaacgtcctcaagattgcttagactctatcgtggacctccgcgagtacgatgta 600
Query: 601 ccttatcatgttcgatttgcaattgataatgatgtgcggagtgggcaatggtacaatgtc 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 ccttatcatgttcgatttgcaattgataatgatgtgcggagtgggcaatggtacaatgtc 660
Query: 661 agtatttccagcaccgatgtcatattggagaagaggacagatcttcttcaacgcgcagaa 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 agtatttccagcaccgatgtcatattggagaagaggacagatcttcttcaacgcgcagaa 720
Query: 721 gtccgtgtttgtgccttcgatatagagacaacaaagcttccgttgaagtttcctgatgct 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 gtccgtgtttgtgccttcgatatagagacaacaaagcttccgttgaagtttcctgatgct 780
Query: 781 gaatatgatcaaattatgatgatatcctacatggtcgatgggcaaggttttctaattatt 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 gaatatgatcaaattatgatgatatcctacatggtcgatgggcaaggttttctaattatt 840
Query: 841 aacagagaggtaactgcttgtgttggcgaagatgtagaagatctggaatatacaccaaaa 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 aacagagaggtaactgcttgtgttggcgaagatgtagaagatctggaatatacaccaaaa 900
Query: 901 ccagaatttgaagggtatttcaaagttactaatgttaaaaatgaggttgaactcctccaa 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 ccagaatttgaagggtatttcaaagttactaatgttaaaaatgaggttgaactcctccaa 960
Query: 961 agatggttttaccatatgcaagagttgaaacccggtatttatgttacatacaacggtgac 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 agatggttttaccatatgcaagagttgaaacccggtatttatgttacatacaacggtgac 1020
Query: 1021 ttttttgactggccatttatagaacggagagcatctcatcatgggataaaaatgaatgag 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 ttttttgactggccatttatagaacggagagcatctcatcatgggataaaaatgaatgag 1080
Query: 1081 gaattgggattccgttgtgatcagaatcaaggtgaatgtcgagctaaattcgcttgtcat 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 gaattgggattccgttgtgatcagaatcaaggtgaatgtcgagctaaattcgcttgtcat 1140
Query: 1141 ttggattgttttgcttgggttaaacgtgatagctatcttcctcagggaagccatggtctg 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 ttggattgttttgcttgggttaaacgtgatagctatcttcctcagggaagccatggtctg 1200
Query: 1201 aaggctgttacaaaggcaaaactaggttatgatccactggaagtgaacccagaggacatg 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1201 aaggctgttacaaaggcaaaactaggttatgatccactggaagtgaacccagaggacatg 1260
Query: 1261 gttcggtttgcgatggaaaagccccagacaatggcctcctactctgtctctgatgctgtt 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1261 gttcggtttgcgatggaaaagccccagacaatggcctcctactctgtctctgatgctgtt 1320
Query: 1321 gcaacttattacctatacatgacatatgtcaatccattcattttttctctcgcaactatc 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1321 gcaacttattacctatacatgacatatgtcaatccattcattttttctctcgcaactatc 1380
Query: 1381 atcccaatggtccctgatgaggttttacgtaaagggagtggcaccctttgtgaaatgctt 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1381 atcccaatggtccctgatgaggttttacgtaaagggagtggcaccctttgtgaaatgctt 1440
Query: 1441 ctgatggttgaggtatcaacctatttaccacaagcacaggcttacaaggcaaatgttgta 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1441 ctgatggttgaggtatcaacctatttaccacaagcacaggcttacaaggcaaatgttgta 1500
Query: 1501 tgtcccaacaaaaatcaagctgaccctgagaaattctaccaaaatcaacttcttgaaagt 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1501 tgtcccaacaaaaatcaagctgaccctgagaaattctaccaaaatcaacttcttgaaagt 1560
Query: 1561 gagacatatattggtggtcatgtagagtgccttgaaagtggtcaactgatcgataacctt 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1561 gagacatatattggtggtcatgtagagtgccttgaaagtggtcaactgatcgataacctt 1620
Query: 1621 ggtcgtgatctggaatatgctatcactgtagaaggaaaaatgagaatggattcaatttcc 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1621 ggtcgtgatctggaatatgctatcactgtagaaggaaaaatgagaatggattcaatttcc 1680
Query: 1681 aattatgatgaagtgaaggacgaaatcaaggagaagcttgagaagttacgagatgaccct 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1681 aattatgatgaagtgaaggacgaaatcaaggagaagcttgagaagttacgagatgaccct 1740
Query: 1741 atacgggaagaggggcctcttatttatcaccttgatgtcgcagccatgtatccaaatatc 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1741 atacgggaagaggggcctcttatttatcaccttgatgtcgcagccatgtatccaaatatc 1800
Query: 1801 atcttaacaaacaggcttcaggtacatctaatctctccaccatcaatagttacggatgag 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1801 atcttaacaaacaggcttcaggtacatctaatctctccaccatcaatagttacggatgag 1860
Query: 1861 atttgcacagcatgtgatttcaaccgcccgggaaagacctgtcttagaaaacttgaatgg 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1861 atttgcacagcatgtgatttcaaccgcccgggaaagacctgtcttagaaaacttgaatgg 1920
Query: 1921 gtttggcgtggtgtgacattcatgggaaagaaaagtgattattaccatttgaagaagcag 1980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1921 gtttggcgtggtgtgacattcatgggaaagaaaagtgattattaccatttgaagaagcag 1980
Query: 1981 attgagtctgaatttgttgatgctggtgcaaatataatgtcttcaaaatcgttccttgat 2040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1981 attgagtctgaatttgttgatgctggtgcaaatataatgtcttcaaaatcgttccttgat 2040
Query: 2041 ctgccaaaggtggatcaacaatctaagctaaaagaacgactaaaaaaatattgtcaaaag 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2041 ctgccaaaggtggatcaacaatctaagctaaaagaacgactaaaaaaatattgtcaaaag 2100
Query: 2101 gcttataaacgagtacttgacaagccaattactgaagttcgtgaagctgggatatgcatg 2160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2101 gcttataaacgagtacttgacaagccaattactgaagttcgtgaagctgggatatgcatg 2160
Query: 2161 agagaaaaccctttctatgtggatactgttcggagctttcgagataggaggtatgaatac 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2161 agagaaaaccctttctatgtggatactgttcggagctttcgagataggaggtatgaatac 2220
Query: 2221 aaaacacttaacaaggtctggaagggaaaattgtcagaggccaaggcaagtggtaattca 2280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2221 aaaacacttaacaaggtctggaagggaaaattgtcagaggccaaggcaagtggtaattca 2280
Query: 2281 atcaagatccaggaagcacaggacatggtagtggtttacgattccttgcagctagctcat 2340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2281 atcaagatccaggaagcacaggacatggtagtggtttacgattccttgcagctagctcat 2340
Query: 2341 aagtgtatacttaattccttctatggatatgtcatgcgaaagggtgcaagatggtattcc 2400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2341 aagtgtatacttaattccttctatggatatgtcatgcgaaagggtgcaagatggtattcc 2400
Query: 2401 atggaaatggctggtgtagttacctatactggagccaaaatcatacagaatgcccgtttg 2460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2401 atggaaatggctggtgtagttacctatactggagccaaaatcatacagaatgcccgtttg 2460
Query: 2461 cttattgagcgaattgggaaaccacttgagttggatacagatggtatatggtgttgtctc 2520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2461 cttattgagcgaattgggaaaccacttgagttggatacagatggtatatggtgttgtctc 2520
Query: 2521 cctggatcttttcctgagaactttacttttaaaacaatagacatgaagaaactcaccatc 2580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2521 cctggatcttttcctgagaactttacttttaaaacaatagacatgaagaaactcaccatc 2580
Query: 2581 tcgtatccttgtgttatgcttaatgttgatgtggcaaagaataatacaaatgatcaatat 2640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2581 tcgtatccttgtgttatgcttaatgttgatgtggcaaagaataatacaaatgatcaatat 2640
Query: 2641 cagactcttgtagatcctgtacgcaagacatataaatcacatagtgaatgctcaattgaa 2700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2641 cagactcttgtagatcctgtacgcaagacatataaatcacatagtgaatgctcaattgaa 2700
Query: 2701 tttgaagtagatggaccgtacaaggcaatgattattcctgcatcgaaagaagaaggaatc 2760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2701 tttgaagtagatggaccgtacaaggcaatgattattcctgcatcgaaagaagaaggaatc 2760
Query: 2761 ttaatcaagaagcgttatgctgttttcaatcatgatggaaccttagcagaactcaagggg 2820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2761 ttaatcaagaagcgttatgctgttttcaatcatgatggaaccttagcagaactcaagggg 2820
Query: 2821 tttgagatcaagcgtagaggggagctgaaactcattaaagttttccaggccgagcttttt 2880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2821 tttgagatcaagcgtagaggggagctgaaactcattaaagttttccaggccgagcttttt 2880
Query: 2881 gacaaatttctccatggatcaactcttgaagagtgttattctgctgttgcagcggttgct 2940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2881 gacaaatttctccatggatcaactcttgaagagtgttattctgctgttgcagcggttgct 2940
Query: 2941 gatcgatggcttgacctactcgatgtatgtgaaatatcttgtttcttttgggtcatttat 3000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2941 gatcgatggcttgacctactcgatgtatgtgaaatatcttgtttcttttgggtcatttat 3000
Query: 3001 ctcataggttttctttcacattttctccagaatcaaggaaaagatattgccgatagtgaa 3060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3001 ctcataggttttctttcacattttctccagaatcaaggaaaagatattgccgatagtgaa 3060
Query: 3061 ctgctagattatatatcagaatcaagcacaatgagcaaatcgttagcagattatggtgag 3120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3061 ctgctagattatatatcagaatcaagcacaatgagcaaatcgttagcagattatggtgag 3120
Query: 3121 caaaagtcatgtgcagtgaccacagcaaaacgcctggctgaatttcttggtgttacaatg 3180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3121 caaaagtcatgtgcagtgaccacagcaaaacgcctggctgaatttcttggtgttacaatg 3180
Query: 3181 gtcaaagataaaggactacgttgccagtacattgttgcttgtgaaccaaagggtacaccg 3240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3181 gtcaaagataaaggactacgttgccagtacattgttgcttgtgaaccaaagggtacaccg 3240
Query: 3241 gtaagcgaacgtgctgttcctgttgccatatttacaacaaatccggaagttatgaagttt 3300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3241 gtaagcgaacgtgctgttcctgttgccatatttacaacaaatccggaagttatgaagttt 3300
Query: 3301 catttgcgaaaatggtgcaagacatcatcagatgtcggaattcgtctgattattgactgg 3360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3301 catttgcgaaaatggtgcaagacatcatcagatgtcggaattcgtctgattattgactgg 3360
Query: 3361 tcgtattacaagcagcgccttagttcagctatccaaaaagttattaccattcctgctgca 3420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3361 tcgtattacaagcagcgccttagttcagctatccaaaaagttattaccattcctgctgca 3420
Query: 3421 atgcagaaggtggcaaatcccgtgcctagggtgcttcatcctgactggctccataaaaag 3480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3421 atgcagaaggtggcaaatcccgtgcctagggtgcttcatcctgactggctccataaaaag 3480
Query: 3481 gtccgtgagaaagacgacaaatttcgccagagaaaactagttgatatgttcagctcagca 3540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3481 gtccgtgagaaagacgacaaatttcgccagagaaaactagttgatatgttcagctcagca 3540
Query: 3541 aataaagatgttgtgttggacacagatcttccggtgactaaagataatgtggaagatatt 3600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3541 aataaagatgttgtgttggacacagatcttccggtgactaaagataatgtggaagatatt 3600
Query: 3601 gaggatttttgcaaagaaaataggccttccgtcaaagggccaaagccaattgcgcgttcc 3660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3601 gaggatttttgcaaagaaaataggccttccgtcaaagggccaaagccaattgcgcgttcc 3660
Query: 3661 tatgaagtcaataaaaaacagtctgaatgtgagcagcaagagagctgggatacagagttc 3720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3661 tatgaagtcaataaaaaacagtctgaatgtgagcagcaagagagctgggatacagagttc 3720
Query: 3721 catgatatctcatttcagaacattgacaagagcgtaaactaccaaggatggcttgaactg 3780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3721 catgatatctcatttcagaacattgacaagagcgtaaactaccaaggatggcttgaactg 3780
Query: 3781 aaaaagagaaaatggaaagtaactctagagaagaagaaaaaacgaaggttgggtgatcta 3840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3781 aaaaagagaaaatggaaagtaactctagagaagaagaaaaaacgaaggttgggtgatcta 3840
Query: 3841 agatcttcaaaccaggttgatactcacgagataaatcaaaaagtcggtcagggaagagga 3900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3841 agatcttcaaaccaggttgatactcacgagataaatcaaaaagtcggtcagggaagagga 3900
Query: 3901 ggtgtgggttcatactttaggaggcctgaagaagctttgactagttcacattggcaggtg 3960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3901 ggtgtgggttcatactttaggaggcctgaagaagctttgactagttcacattggcaggtg 3960
Query: 3961 tgcacaataatacagctggtcccaagtccacagagcggacaattttttgcttgggtggtt 4020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3961 tgcacaataatacagctggtcccaagtccacagagcggacaattttttgcttgggtggtt 4020
Query: 4021 gtggaagggttgatgcttaagatcccattgtcgatcccaagggtgttttacattaattcc 4080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4021 gtggaagggttgatgcttaagatcccattgtcgatcccaagggtgttttacattaattcc 4080
Query: 4081 aaagttcctatagatgaatatttccaaggaaagtgtgtcaacaagattcttcctcatgga 4140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4081 aaagttcctatagatgaatatttccaaggaaagtgtgtcaacaagattcttcctcatgga 4140
Query: 4141 aggccttgttatagtttgactgaggcatgtgtcaagattcaagaagatcaatttaaaaaa 4200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4141 aggccttgttatagtttgactgaggcatgtgtcaagattcaagaagatcaatttaaaaaa 4200
Query: 4201 gaaagtaaaaagcgtgcagctcttcttgcagaccctggagttgagggcatatatgaaact 4260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4201 gaaagtaaaaagcgtgcagctcttcttgcagaccctggagttgagggcatatatgaaact 4260
Query: 4261 aaggtgcctctggagtttagtgctatatgtcagattggatgtgtatgcaaaattgataac 4320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4261 aaggtgcctctggagtttagtgctatatgtcagattggatgtgtatgcaaaattgataac 4320
Query: 4321 aaagccaagcaccgtaacacccaagatggatgggaagttggtgaacttcacatgaaaact 4380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4321 aaagccaagcaccgtaacacccaagatggatgggaagttggtgaacttcacatgaaaact 4380
Query: 4381 acaactgagtgtcactacttgaagcgttcaattccacttgtttacttgtataacagcacc 4440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4381 acaactgagtgtcactacttgaagcgttcaattccacttgtttacttgtataacagcacc 4440
Query: 4441 tcaacagggcgtgctatatatgttttatattgtcatgtatcgaagcttatgtctgccgtt 4500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4441 tcaacagggcgtgctatatatgttttatattgtcatgtatcgaagcttatgtctgccgtt 4500
Query: 4501 gtagttgatccttttaacggcaatgaattattaccatctgccttagagagacagtttaga 4560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4501 gtagttgatccttttaacggcaatgaattattaccatctgccttagagagacagtttaga 4560
Query: 4561 gatagttgcctagaattatcacttgattcattgtcttgggatggtatccgtttccaggtg 4620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4561 gatagttgcctagaattatcacttgattcattgtcttgggatggtatccgtttccaggtg 4620
Query: 4621 cactacgttgaccatcccgaagctgccaagaagataatacaaagagcaataagtgaatac 4680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4621 cactacgttgaccatcccgaagctgccaagaagataatacaaagagcaataagtgaatac 4680
Query: 4681 agagaagaaaattgtggaccaactgttgctgtcattgaatgccctgactttaccttcatg 4740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4681 agagaagaaaattgtggaccaactgttgctgtcattgaatgccctgactttaccttcatg 4740
Query: 4741 aaggaaggtattaaggccctagatgatttcccatgtgtgaggattcccttcaacgacgat 4800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4741 aaggaaggtattaaggccctagatgatttcccatgtgtgaggattcccttcaacgacgat 4800
Query: 4801 gacaatagttatcagcctgtctcctggcaacgtccagctgcaaaaatagcaatgttccgt 4860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4801 gacaatagttatcagcctgtctcctggcaacgtccagctgcaaaaatagcaatgttccgt 4860
Query: 4861 tgtgctgcagcatttcagtggttggatcggaggattacccaatcaagatacgcccatgtg 4920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4861 tgtgctgcagcatttcagtggttggatcggaggattacccaatcaagatacgcccatgtg 4920
Query: 4921 cctctggggaattttggacttgattggctaacattcacaatagatatcttcctatccagg 4980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4921 cctctggggaattttggacttgattggctaacattcacaatagatatcttcctatccagg 4980
Query: 4981 gcactccgtgaccagcaacaggtcctttgggtgtcagataatggtgttccagaccttgga 5040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4981 gcactccgtgaccagcaacaggtcctttgggtgtcagataatggtgttccagaccttgga 5040
Query: 5041 ggtataaacaatgaagaggcattctttgccgatgaggtgcaacagacaagtttagtattc 5100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5041 ggtataaacaatgaagaggcattctttgccgatgaggtgcaacagacaagtttagtattc 5100
Query: 5101 cctggagcgtatagaaaagtgtctgtggagttaaagatccataacttggctgttaatgcc 5160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5101 cctggagcgtatagaaaagtgtctgtggagttaaagatccataacttggctgttaatgcc 5160
Query: 5161 cttctgaaaagcaacctggtgaatgaaatggaaggaggcggttttatgggatttgaacag 5220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5161 cttctgaaaagcaacctggtgaatgaaatggaaggaggcggttttatgggatttgaacag 5220
Query: 5221 gatgtgaatcctagaggaattaattcaaacgataacaccagttttgatgagaccactgga 5280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5221 gatgtgaatcctagaggaattaattcaaacgataacaccagttttgatgagaccactgga 5280
Query: 5281 tgtgctcaagcatttcgtgtcctgaaacagttgattcatagttgcttgactgatgtgcgt 5340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5281 tgtgctcaagcatttcgtgtcctgaaacagttgattcatagttgcttgactgatgtgcgt 5340
Query: 5341 aaatctaaaaatatatatgctgattccattttgcaacgtttgtcttggtggctctgcagc 5400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5341 aaatctaaaaatatatatgctgattccattttgcaacgtttgtcttggtggctctgcagc 5400
Query: 5401 ccttcctcgaagctccatgatccagctcttcatctcatgcttcacaaggtcatgcaaaag 5460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5401 ccttcctcgaagctccatgatccagctcttcatctcatgcttcacaaggtcatgcaaaag 5460
Query: 5461 gtgtttgcactgctattgactgatttgcggagattaggtgctataataatatatgcagac 5520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5461 gtgtttgcactgctattgactgatttgcggagattaggtgctataataatatatgcagac 5520
Query: 5521 ttctcaaaggtcattatcgacacagtgaaatttgatctatctgcagctaaggcttattgt 5580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5521 ttctcaaaggtcattatcgacacagtgaaatttgatctatctgcagctaaggcttattgt 5580
Query: 5581 gaaagcttgctatcaacggtgcggaataggttggtttcttccttgctcgatatacatgtc 5640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5581 gaaagcttgctatcaacggtgcggaataggttggtttcttccttgctcgatatacatgtc 5640
Query: 5641 tatgaccttaagtctcatggactgcactcattttcctgccatgatttttgtgcttcgcct 5700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5641 tatgaccttaagtctcatggactgcactcattttcctgccatgatttttgtgcttcgcct 5700
Query: 5701 ctgacatataactacgctggtatccgagccgatgatgaaatttcacttgacgaagtgact 5760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5701 ctgacatataactacgctggtatccgagccgatgatgaaatttcacttgacgaagtgact 5760
Query: 5761 attgaaccaaagtggagtgttgcacgacatttacctgagtatattgaggtttggagacag 5820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5761 attgaaccaaagtggagtgttgcacgacatttacctgagtatattgaggtttggagacag 5820
Query: 5821 aaccctcactcaaaccaatgttcatttagtgaaaacaaaaaacatgtggcaacacatgga 5880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5821 aaccctcactcaaaccaatgttcatttagtgaaaacaaaaaacatgtggcaacacatgga 5880
Query: 5881 ccatttttcttggacactgacgcatttcatctatcttggcagagggatttcattataatc 5940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5881 ccatttttcttggacactgacgcatttcatctatcttggcagagggatttcattataatc 5940
Query: 5941 attgccaagtttatatttgacccctggaaatttgcgatagaaaataaaaagggcagttca 6000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5941 attgccaagtttatatttgacccctggaaatttgcgatagaaaataaaaagggcagttca 6000
Query: 6001 gagagtttagaggcacagatgatagaatatctaagagaacagattggatcaaccttcata 6060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6001 gagagtttagaggcacagatgatagaatatctaagagaacagattggatcaaccttcata 6060
Query: 6061 aatatgcttgtcaaaaaggttgatgatatcatgtcacacatgaaggagataaatgtttca 6120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6061 aatatgcttgtcaaaaaggttgatgatatcatgtcacacatgaaggagataaatgtttca 6120
Query: 6121 gatgcatctcgggtttctggtcaagctcccaaaggagattactcgttggaatttatacag 6180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6121 gatgcatctcgggtttctggtcaagctcccaaaggagattactcgttggaatttatacag 6180
Query: 6181 gttatctctgctgttctggctcttgaccaaaacgtccagcaagatgttctgttaaaaacc 6240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6181 gttatctctgctgttctggctcttgaccaaaacgtccagcaagatgttctgttaaaaacc 6240
Query: 6241 ctctttataactgatttcattcacaaatccaatcttatctctggaaatgtggttcttgaa 6300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6241 ctctttataactgatttcattcacaaatccaatcttatctctggaaatgtggttcttgaa 6300
Query: 6301 accatgtttaccaatagagctggatttttttttgaatgggtaatgagaaagagtctgttg 6360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6301 accatgtttaccaatagagctggatttttttttgaatgggtaatgagaaagagtctgttg 6360
Query: 6361 aagtacattaaagtaaaagagtgtgctgctgaagccgaatttcttgatcctgggccatcc 6420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6361 aagtacattaaagtaaaagagtgtgctgctgaagccgaatttcttgatcctgggccatcc 6420
Query: 6421 ttcatcttacctaatgtagcttgcagcaactgtgatgcctacagagacctagatatatgc 6480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6421 ttcatcttacctaatgtagcttgcagcaactgtgatgcctacagagacctagatatatgc 6480
Query: 6481 agagacccagcactgttaacagagaaagaatggtcatgtgcggatacacaatgtgggaag 6540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6481 agagacccagcactgttaacagagaaagaatggtcatgtgcggatacacaatgtgggaag 6540
Query: 6541 atatatgacagagagcagatggagagtagccttctagagatggtgagacagagagaaaga 6600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6541 atatatgacagagagcagatggagagtagccttctagagatggtgagacagagagaaaga 6600
Query: 6601 atgtaccatatgcaggatgtagtgtgcattaggtgcaatcaggtgaaagcggctcatttg 6660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6601 atgtaccatatgcaggatgtagtgtgcattaggtgcaatcaggtgaaagcggctcatttg 6660
Query: 6661 acagagcagtgtgagtgttctggttcctttagatgcaaggagagtgggtcagagttcagc 6720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6661 acagagcagtgtgagtgttctggttcctttagatgcaaggagagtgggtcagagttcagc 6720
Query: 6721 aagaggatggagatattcatggatatagcaaagcgccagaagtttagactgttagaagaa 6780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6721 aagaggatggagatattcatggatatagcaaagcgccagaagtttagactgttagaagaa 6780
Query: 6781 tacatctcttggatcatatatggccctagctattaa 6816
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6781 tacatctcttggatcatatatggccctagctattaa 6816
>At2g27120.1 68415.m03259 DNA-directed DNA polymerase epsilon catalytic subunit,
putative similar to SP|Q07864 DNA polymerase epsilon,
catalytic subunit A (EC 2.7.7.7) (DNA polymerase II
subunit A) {Homo sapiens}; contains Pfam profiles:
PF03175 DNA polymerase type B, organellar and viral,
PF00136 DNA polymerase family B, PF03104 DNA polymerase
family B, exonuclease domain
Length = 6417
Score = 1778 bits (897), Expect = 0.0
Identities = 1259/1381 (91%), Gaps = 9/1381 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 73 gcggaagatgaactcgaatctaaactcggatttgggcttttctctgaaggtgaaacccga 132
|||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||
Sbjct: 49 gcggcagatgaactcgaaactaaacttggatttgggcttttctcccaaggggaaacgcgg 108
Query: 133 cttgggtggttactcacattctcatcgtcatcttgggaagatcgcgatactgggaaagtc 192
|| |||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |
Sbjct: 109 ctcgggtggctactcacgtttgcatcatcatcttgggaagatgccgatactgggaaaacc 168
Query: 193 tatagttgtgtggacctttactttgttactcaggacggcttttctttcaagacaaagtac 252
| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||
Sbjct: 169 tttagttgtgtggaccttttctttgtcactcaggacggctcttcttttaagactaagtac 228
Query: 253 aagttccgtccttacttttatgcagccacgaaagacaaaatggaattggaactcgaagcc 312
|||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||| | ||||||
Sbjct: 229 aagttccgcccttacttgtatgccgccaccaaagacaatatggaactggaagttgaagcc 288
Query: 313 tacttgagacgccgatatgaaagacaagttgctgatattgagattgttgaaaaagaagat 372
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||
Sbjct: 289 tacttgagacgccgatatgaaagacaagttgctgatattcagattgttcacaaagaagat 348
Query: 373 cttgatcttaaaaatcatctatctggcctgcaaaaaaaatacctaaaaatatcatttgat 432
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||
Sbjct: 349 ctttatcttaaaaatcatctatctggcctgcaaaaaaaatatctcaaagtatcatttgac 408
Query: 433 actgtgcaacaattgatggaagtcaagcgggatttgttacatattgtcgaacgaaaccag 492
||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 409 actgtgcaacaattggtggaagtaaagagggatctgttgcatattgtcgaacgaaacctc 468
Query: 493 gcaaaatttgatgcacttgaagcatacgaatccatattggctggaaaacgagaacaacgt 552
||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 469 gcaaaatttaatgcacttgaagcttacgaatccatcttgtctggaaaacgagaacaacgt 528
Query: 553 cctcaagattgcttagactctatcgtggacctccgcgagtacgatgtaccttatcatgtt 612
|||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 529 cctcaagactgcttagactctgtggtggacctccgcgagtacgatgttccttatcatgtc 588
Query: 613 cgatttgcaattgataatgatgtgcggagtgggcaatggtacaatgtcagtatttccagc 672
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 589 cgatttgcaattgataatgatgtgcgtagtgggcaatggtacaatgtcagtatttccagc 648
Query: 673 accgatgtcatattggagaagaggacagatcttcttcaacgcgcagaagtccgtgtttgt 732
|| ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||
Sbjct: 649 actgatgtcatactagagaagaggacggatcttctccaacgcgcagaagttcgcgtttgt 708
Query: 733 gccttcgatatagagacaacaaagcttccgttgaagtttcctgatgctgaatatgatcaa 792
|| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct: 709 gcattcgatatagagacagtaaagcttccattgaagttcccggatgctgaatatgatcaa 768
Query: 793 attatgatgatatcctacatggtcgatgggcaaggttttctaattattaacagagaggta 852
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 769 attatgatgatatcctacatggttgatgggcaaggttttctaattactaacagagag--- 825
Query: 853 actgcttgtgttggcgaagatgtagaagatctggaatatacaccaaaaccagaatttgaa 912
||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct: 826 ------tgtgttggcaaagacatagaagatctggaatatacacccaaaccagagtttgaa 879
Query: 913 gggtatttcaaagttactaatgttaaaaatgaggttgaactcctccaaagatggttttac 972
|||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct: 880 gggtatttcaaagtcacgaatgttaccaacgaggttgaactcctccgaaaatggttttct 939
Query: 973 catatgcaagagttgaaacccggtatttatgttacatacaacggtgacttttttgactgg 1032
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 940 catatgcaagagttgaaacctggtatttatgttacatacaacggtgacttttttgactgg 999
Query: 1033 ccatttatagaacggagagcatctcatcatgggataaaaatgaatgaggaattgggattc 1092
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||
Sbjct: 1000 ccatttatagaacggagagcatctcatcatgggatcaaaatgaacgaggagttgggattc 1059
Query: 1093 cgttgtgatcagaatcaaggtgaatgtcgagctaaattcgcttgtcatttggattgtttt 1152
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||
Sbjct: 1060 cgttgtgatcaaaatcaaggtgaatgtcgagctaagtttgtgtgccatttggattgtttt 1119
Query: 1153 gcttgggttaaacgtgatagctatcttcctcagggaagccatggtctgaaggctgttaca 1212
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 1120 tcttgggtgaaacgtgatagctatcttcctcagggaagccagggtctgaaggctgttaca 1179
Query: 1213 aaggcaaaactaggttatgatccactggaagtgaacccagaggacatggttcggtttgcg 1272
|||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct: 1180 aaggtaaaactgggttacgatccactggaagtgaatcctgaggacatggttcggtttgca 1239
Query: 1273 atggaaaagccccagacaatggcctcctactctgtctctgatgctgttgcaacttattac 1332
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 1240 atggaaaagccacagacaatggcctcctactctgtctctgatgctgttgcaacttactac 1299
Query: 1333 ctatacatgacatatgtcaatccattcattttttctctcgcaactatcatcccaatggtc 1392
|||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 1300 ctatacatgacatatgtccatccgttcgttttttctctcgcaactatcattccaatggtc 1359
Query: 1393 cctgatgaggttttacgtaaagggagtggcaccctttgtgaaatgcttctgatggttgag 1452
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 1360 cctgatgaggttttacgcaaagggagtggcaccctttgtgaaatgcttttgatggttgag 1419
Query: 1453 g 1453
|
Sbjct: 1420 g 1420
Score = 1592 bits (803), Expect = 0.0
Identities = 1046/1127 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1837 ccaccatcaatagttacggatgagatttgcacagcatgtgatttcaaccgcccgggaaag 1896
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||
Sbjct: 1816 ccaccatcaatagttacggatgaggtttgcacagcatgtgatttcaacggcccggaaaag 1875
Query: 1897 acctgtcttagaaaacttgaatgggtttggcgtggtgtgacattcatgggaaagaaaagt 1956
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||
Sbjct: 1876 acctgtcttagaaaacttgaatgggtttggcgtggggtgacgttcaagggaaataaaagt 1935
Query: 1957 gattattaccatttgaagaagcagattgagtctgaatttgttgatgctggtgcaaatata 2016
|| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||
Sbjct: 1936 gaatattaccatctgaagaagcagattgagtctgaatctgttgatgctggagcaaatatg 1995
Query: 2017 atgtcttcaaaatcgttccttgatctgccaaaggtggatcaacaatctaagctaaaagaa 2076
|||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||
Sbjct: 1996 cagtcttcaaaaccttttcttgatctgccaaaggtggaacaacaatccaaattaaaagaa 2055
Query: 2077 cgactaaaaaaatattgtcaaaaggcttataaacgagtacttgacaagccaattactgaa 2136
||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 2056 cgactgaaaaaatactgtcaaaaggcatatagccgagtacttgacaagccaatcactgaa 2115
Query: 2137 gttcgtgaagctgggatatgcatgagagaaaaccctttctatgtggatactgttcggagc 2196
||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||
Sbjct: 2116 gttcgcgaggctgggatatgcatgagagaaaacccgttctatgtggacactgtgcgcagc 2175
Query: 2197 tttcgagataggaggtatgaatacaaaacacttaacaaggtctggaagggaaaattgtca 2256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 2176 tttcgagataggaggtatgaatacaaaacacttaacaaggtctggaagggaaagttgtca 2235
Query: 2257 gaggccaaggcaagtggtaattcaatcaagatccaggaagcacaggacatggtagtggtt 2316
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 2236 gaggccaaggcaagtggcaatttaatcaagatccaggaagcacatgacatggtagtggtt 2295
Query: 2317 tacgattccttgcagctagctcataagtgtatacttaattccttctatggatatgtcatg 2376
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 2296 tacgattccttgcagctagctcataagtgtatacttaattccttttatggatatgtcatg 2355
Query: 2377 cgaaagggtgcaagatggtattccatggaaatggctggtgtagttacctatactggagcc 2436
|||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct: 2356 cgaaagggcgcaagatggtactccatggaaatggctggggtagttacttatactggagcc 2415
Query: 2437 aaaatcatacagaatgcccgtttgcttattgagcgaattgggaaaccacttgagttggat 2496
|||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 2416 aaaatcatccagaatgctcgtttgcttattgaacgaattgggaaaccacttgagctggat 2475
Query: 2497 acagatggtatatggtgttgtctccctggatcttttcctgagaactttacttttaaaaca 2556
|||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 2476 acagatggtatatggtgtgctctacctggatcttttcctgagaactttacctttaaaacc 2535
Query: 2557 atagacatgaagaaactcaccatctcgtatccttgtgttatgcttaatgttgatgtggca 2616
||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||
Sbjct: 2536 atagatatgaagaaattcaccatctcgtatccgtgtgtaatacttaatgttgatgtggcg 2595
Query: 2617 aagaataatacaaatgatcaatatcagactcttgtagatcctgtacgcaagacatataaa 2676
||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 2596 aagaataattcaaatgaccaatatcagactctagtagatcctgtacgaaagacatataat 2655
Query: 2677 tcacatagtgaatgctcaattgaatttgaagtagatggaccgtacaaggcaatgattatt 2736
|||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2656 tcacgtagcgaatgctcaattgaatttgaagtggatggaccgtacaaggcaatgattatt 2715
Query: 2737 cctgcatcgaaagaagaaggaatcttaatcaagaagcgttatgctgttttcaatcatgat 2796
|||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 2716 cctgcatccaaggaagagggaatcttaattaagaagcggtatgctgttttcaatcatgac 2775
Query: 2797 ggaaccttagcagaactcaaggggtttgagatcaagcgtagaggggagctgaaactcatt 2856
|||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 2776 ggaaccatagcagaactcaaggggtttgagatgaagcgtagaggagagctgaaactcatt 2835
Query: 2857 aaagttttccaggccgagctttttgacaaatttctccatggatcaactcttgaagagtgt 2916
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 2836 aaagttttccaggccgagctatttgacaaatttctgcatggatcaacccttgaagagtgt 2895
Query: 2917 tattctgctgttgcagcggttgctgatcgatggcttgacctactcga 2963
||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct: 2896 tattctgctgttgcagctgttgcaaatcgttggcttgacctactcga 2942
Score = 1233 bits (622), Expect = 0.0
Identities = 1049/1193 (87%), Gaps = 15/1193 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3871 ataaatcaaaaagtcggtcagggaagaggaggtgtgggttcatactttaggaggcctgaa 3930
|||||| |||||||| || ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct: 3757 ataaataaaaaagtctgtaagggaagagtaggtgtaggctcatactttaggaggcctgaa 3816
Query: 3931 gaagctttgactagttcacattggcaggtgtgcacaataatacagctggtcccaagtcca 3990
||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| |||||||
Sbjct: 3817 gaagctttgactagttcctatttgcag---------ataatacagttggtccaaagtcca 3867
Query: 3991 cagagcggacaattttttgcttgggtggttgtggaagggttgatgcttaagatcccattg 4050
|||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 3868 cagagcgggcaattttttgcttgggttgttgtggaaggattgatgcttaagatcccattg 3927
Query: 4051 tcgatcccaagggtgttttacattaattccaaagttcctatagatgaatatttccaagga 4110
||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || | | ||| |||
Sbjct: 3928 acgatcccaagggtgttttacattaattccaaagcttctatagctggaaacttcacggga 3987
Query: 4111 aagtgtgtcaacaagattcttcctcatggaaggccttgttatagtttgactgaggcatgt 4170
|||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||| ||||
Sbjct: 3988 aagtgtatcaacaagattcttcctcacggaaagccttgttacaatttgatggagg----- 4042
Query: 4171 gtcaagattcaagaagatcaatttaaaaaagaaagtaaaaagcgtgcagctcttcttgca 4230
|||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||
Sbjct: 4043 -tcaatattcaggaagatcaatttataaaagaaagcaaaaagcttgccgctctacttgca 4101
Query: 4231 gaccctggagttgagggcatatatgaaactaaggtgcctctggagtttagtgctatatgt 4290
||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4102 gaccccgaaattgagggcatatatgaaactaagatgcctctggagtttagtgctatatgt 4161
Query: 4291 cagattggatgtgtatgcaaaattgataacaaagccaagcaccgtaacacccaagatgga 4350
|||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 4162 cagattggatgtgtatgcaaaattgaagacacggccaaacaccgtaacacccaagatgga 4221
Query: 4351 tgggaagttggtgaacttcacatgaaaactacaactgagtgtcactacttgaagcgttca 4410
||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| || |||
Sbjct: 4222 tggaaacttggtgaacttcacaggataactacaactgagtgtcgctacttggagaattct 4281
Query: 4411 attccacttgtttacttgtataacagcacctcaacagggcgtgctatatatgttttatat 4470
|||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||
Sbjct: 4282 attccacttgtttatttgtatcacagcacctcaacaggtcgtgctgtttatgttttatat 4341
Query: 4471 tgtcatgtatcgaagcttatgtctgccgttgtagttgatccttttaacggcaatgaatta 4530
||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||| | ||| ||||||
Sbjct: 4342 tgtcatgcttcgaagcttatgtctgttgtggtagtcaatccttacggtgacaaggaatta 4401
Query: 4531 ttaccatctgccttagagagacagtttagagatagttgcctagaattatcacttgattca 4590
||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||| ||| ||
Sbjct: 4402 ttatcatctgccctagagagacagtttagagatagatgccaagaactgtcacctgagcca 4461
Query: 4591 ttgtcttgggatggtatccgtttccaggtgcactacgttgaccatcccgaagctgccaag 4650
|| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| |||||||||| |
Sbjct: 4462 ttttcttgggatggtatccttttccaggtcgagtatgttgaccatccagaagctgccacg 4521
Query: 4651 aagataatacaaagagcaataagtgaatacagagaagaaaattgtggaccaactgttgct 4710
|| | |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct: 4522 aaatttttacaaaaagcgctctgtgaatacagagaagaaaattgtggagcaactgtggca 4581
Query: 4711 gtcattgaatgccctgactttaccttcatgaaggaaggtattaaggccctagatgatttc 4770
|||||||||||||||||||||| | || |||||||||| | |||||||| || ||||||
Sbjct: 4582 gtcattgaatgccctgactttaacaccacgaaggaaggtgtaaaggccctggaagatttc 4641
Query: 4771 ccatgtgtgaggattcccttcaacgacgatgacaatagttatcagcctgtctcctggcaa 4830
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4642 ccatgtgtgaggattcccttcaacgacgatgacaatagttatcagcctgtctcctggcaa 4701
Query: 4831 cgtccagctgcaaaaatagcaatgttccgttgtgctgcagcatttcagtggttggatcgg 4890
|||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||
Sbjct: 4702 cgtccagcagcaaaaatagcagtgctccgttgtgcttcagcaattcagtggttggaccgg 4761
Query: 4891 aggattacccaatcaagatacgcccatgtgcctctggggaattttggacttgattggcta 4950
|||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct: 4762 aggattgcccagtcaagatacgcccatgtgcctctggggaattttggacgtgattggtta 4821
Query: 4951 acattcacaatagatatcttcctatccagggcactccgtgaccagcaacaggtcctttgg 5010
|| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 4822 acgttcacagtagatatcttcctgtccagggcactccgtgaccagcaacaggttctttgg 4881
Query: 5011 gtgtcagataatggtgttccagaccttggaggtataaacaatgaagaggcatt 5063
|| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||
Sbjct: 4882 gtctcagataatggtgttccagaccttggagatataaacaatgaagagacatt 4934
Score = 587 bits (296), Expect = e-166
Identities = 416/456 (91%)
Strand = Plus / Plus
Query: 6339 ggtaatgagaaagagtctgttgaagtacattaaagtaaaagagtgtgctgctgaagccga 6398
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 5940 ggtaatgagaaagattctgttgaagtacattaaagtaaaagaatgtgctgctgaagccga 5999
Query: 6399 atttcttgatcctgggccatccttcatcttacctaatgtagcttgcagcaactgtgatgc 6458
|||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| | |||
Sbjct: 6000 atttattgatcctgggccatccttcatcttacccaacgtggcttgcagcaactgcggtgc 6059
Query: 6459 ctacagagacctagatatatgcagagacccagcactgttaacagagaaagaatggtcatg 6518
|||||||||||||||| | ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 6060 ctacagagacctagatttctgcagagactcagctctcttaacagaaaaagaatggtcatg 6119
Query: 6519 tgcggatacacaatgtgggaagatatatgacagagagcagatggagagtagccttctaga 6578
||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || | |
Sbjct: 6120 tgcggatccgcaatgtgtgaagatatatgacaaagagcagatagagagtagcattatcca 6179
Query: 6579 gatggtgagacagagagaaagaatgtaccatatgcaggatgtagtgtgcattaggtgcaa 6638
||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct: 6180 gatggtgagacagagggaaagaatgtaccagttgcaggatctagtgtgcaataggtgcaa 6239
Query: 6639 tcaggtgaaagcggctcatttgacagagcagtgtgagtgttctggttcctttagatgcaa 6698
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 6240 tcaggtgaaagccgctcatttgacagagcagtgtgagtgttctggatcctttagatgcaa 6299
Query: 6699 ggagagtgggtcagagttcagcaagaggatggagatattcatggatatagcaaagcgcca 6758
||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 6300 ggagagtggttcagatttccacaagaggattgagattttcttggatatagcaaagcgcca 6359
Query: 6759 gaagtttagactgttagaagaatacatctcttggat 6794
||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||
Sbjct: 6360 gaagtttagactgctagaagaatgcatctcctggat 6395
Score = 361 bits (182), Expect = 5e-98
Identities = 227/242 (93%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5350 aatatatatgctgattccattttgcaacgtttgtcttggtggctctgcagcccttcctcg 5409
|||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 5200 aatatatatgctgattccattttgcaacatctgtcttggtggctccgcagcccttcctca 5259
Query: 5410 aagctccatgatccagctcttcatctcatgcttcacaaggtcatgcaaaaggtgtttgca 5469
||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5260 aagcttcacgatccagctctccatctcatgcttcacaaggtcatgcaaaaggtgtttgcg 5319
Query: 5470 ctgctattgactgatttgcggagattaggtgctataataatatatgcagacttctcaaag 5529
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 5320 ctgcttttgactgatttgcggaggttaggtgctataataatatacgcagacttctcaaag 5379
Query: 5530 gtcattatcgacacagtgaaatttgatctatctgcagctaaggcttattgtgaaagcttg 5589
|||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||
Sbjct: 5380 gtcattatcgacacagggaaatttgatctatctgctgcaaagacttattgtgaaagcttg 5439
Query: 5590 ct 5591
||
Sbjct: 5440 ct 5441
Score = 351 bits (177), Expect = 5e-95
Identities = 225/241 (93%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3033 tcaaggaaaagatattgccgatagtgaactgctagattatatatcagaatcaagcacaat 3092
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 2946 tcaaggaaaagatattgccgatagtgaattgctagattatatatcagaatcaagcactat 3005
Query: 3093 gagcaaatcgttagcagattatggtgagcaaaagtcatgtgcagtgaccacagcaaaacg 3152
||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3006 gagcaaatcgttagcagattatggtcaacaaaagtcatgtgcagtgaccacagcaaaacg 3065
Query: 3153 cctggctgaatttcttggtgttacaatggtcaaagataaaggactacgttgccagtacat 3212
||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||
Sbjct: 3066 cctggctgattttcttggtgatacaatggtcaaagataaaggactgcgctgccaatacat 3125
Query: 3213 tgttgcttgtgaaccaaagggtacaccggtaagcgaacgtgctgttcctgttgccatatt 3272
|||||| |||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 3126 cgttgctcgtgaaccagaggggacacctgtaagtgaacgtgctgtccctgttgccatatt 3185
Query: 3273 t 3273
|
Sbjct: 3186 t 3186
Score = 307 bits (155), Expect = 7e-82
Identities = 203/219 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1603 caactgatcgataaccttggtcgtgatctggaatatgctatcactgtagaaggaaaaatg 1662
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 1597 caactgatcgataaccttggtcgggatctggaatatgctatcactgttgaaggaaaaatg 1656
Query: 1663 agaatggattcaatttccaattatgatgaagtgaaggacgaaatcaaggagaagcttgag 1722
|||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| | ||||| ||| ||||| |||
Sbjct: 1657 agaatggattcagtttccaattttgatgaagtaaaggaagtaatcagggaaaagctcgag 1716
Query: 1723 aagttacgagatgaccctatacgggaagaggggcctcttatttatcaccttgatgtcgca 1782
|||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1717 aagttacgggatgatcctatacgtgaagaggggcctcttatttatcaccttgatgtcgcg 1776
Query: 1783 gccatgtatccaaatatcatcttaacaaacaggcttcag 1821
|| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 1777 gcgatgtatccaaatattatcttaacaaacaggcttcag 1815
Score = 238 bits (120), Expect = 5e-61
Identities = 264/312 (84%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5920 cagagggatttcattataatcattgccaagtttatatttgacccctggaaatttgcgata 5979
|||| |||||| || ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||
Sbjct: 5629 cagaaggattttatcataattgttgccacgtttatatttggcccctggaaatttgcatta 5688
Query: 5980 gaaaataaaaagggcagttcagagagtttagaggcacagatgatagaatatctaagagaa 6039
|| || |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||
Sbjct: 5689 gagaaaaaaaggggcagtgcagagagtttagaggcagagatggtagaatatctcaaggaa 5748
Query: 6040 cagattggatcaaccttcataaatatgcttgtcaaaaaggttgatgatatcatgtcacac 6099
||||| ||| | ||||||| ||| |||| | ||| ||| | |||||| |||||||
Sbjct: 5749 cagataggaacccggttcataagcatgattgttgagaagattggtaatatcaggtcacac 5808
Query: 6100 atgaaggagataaatgtttcagatgcatctcgggtttctggtcaagctcccaaaggagat 6159
|| ||||| ||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5809 atcaaggatataaacgtgtcagatgcatcttgggcttctggtcaagctcccaaaggagat 5868
Query: 6160 tactcgttggaatttatacaggttatctctgctgttctggctcttgaccaaaacgtccag 6219
||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct: 5869 tacacgttcgaatttatacaaattattactgctgttctggctcttgatcaaaacgttcag 5928
Query: 6220 caagatgttctg 6231
||||||||||||
Sbjct: 5929 caagatgttctg 5940
Score = 220 bits (111), Expect = 1e-55
Identities = 204/235 (86%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3595 gatattgaggatttttgcaaagaaaataggccttccgtcaaagggccaaagccaattgcg 3654
|||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||
Sbjct: 3484 gatattgaagagttttgcaaagaaaacagaccttccgtaaaagggccaaagccagttgcg 3543
Query: 3655 cgttcctatgaagtcaataaaaaacagtctgaatgtgagcagcaagagagctgggataca 3714
||||| | ||||||| ||| ||| || ||||| || ||||||||||||| |||||| ||
Sbjct: 3544 cgttcatttgaagtcgatagaaatcactctgagggtaagcagcaagagagttgggatcca 3603
Query: 3715 gagttccatgatatctcatttcagaacattgacaagagcgtaaactaccaaggatggctt 3774
|||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||
Sbjct: 3604 gagttccatgatatctcattacagaacgttgacaagaatgtagattaccaaggatggctt 3663
Query: 3775 gaactgaaaaagagaaaatggaaagtaactctagagaagaagaaaaaacgaaggt 3829
|||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| ||||||
Sbjct: 3664 gaactggaaaaaagaaaatggaaaatgactctaacgaataagaaaaaaagaaggt 3718
Score = 192 bits (97), Expect = 3e-47
Identities = 118/125 (94%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1478 aggcttacaaggcaaatgttgtatgtcccaacaaaaatcaagctgaccctgagaaattct 1537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 1418 aggcttacaaggcaaatgttgtatgtcccaacaaaaatcaagctgaccctgagaagttct 1477
Query: 1538 accaaaatcaacttcttgaaagtgagacatatattggtggtcatgtagagtgccttgaaa 1597
||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct: 1478 accaaggtaaacttcttgaaagtgagacatatattggtggccatgtagagtgcctccaaa 1537
Query: 1598 gtggt 1602
|||||
Sbjct: 1538 gtggt 1542
Score = 188 bits (95), Expect = 4e-46
Identities = 214/255 (83%), Gaps = 9/255 (3%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3295 aagtttcatttgcgaaaatggtgcaagacatcatcagatgtcggaattcgtctgattatt 3354
|||||| || ||| |||||||||||||| ||||||| || ||||| ||| ||||||
Sbjct: 3208 aagttttatctgcaaaaatggtgcaagatatcatcatatactggaatccgttcaattatt 3267
Query: 3355 gactggtcgtattacaagcagcgccttagttcagctatccaaaaagttattaccattcct 3414
|||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 3268 gactggatgtattacaagcagcgtcttcattcagctattcaaaaagttattaccattcct 3327
Query: 3415 gctgcaatgcagaaggtggcaaatcccgtgcctagggtgcttcatcctgactggctccat 3474
|||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||| | |||||| |
Sbjct: 3328 gctgcaatgcagaaggtggcaaatcctgtacttagggtgcgtcatccttattggctcgag 3387
Query: 3475 aaaaaggtccgtgagaaagacgacaaatttcgccagagaaaactagttgatatgttcagc 3534
||||||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||
Sbjct: 3388 aaaaaggtctgt---------gacaaatttcgtcagggaaaaatagttgatatgtttagc 3438
Query: 3535 tcagcaaataaagat 3549
|||||||| ||||||
Sbjct: 3439 tcagcaaacaaagat 3453
Score = 157 bits (79), Expect = 2e-36
Identities = 115/127 (90%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5084 agacaagtttagtattccctggagcgtatagaaaagtgtctgtggagttaaagatccata 5143
|||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 4946 agacaagtttgctattccctggagcgtacagaaaagtgtctgtggagttaaaggtccata 5005
Query: 5144 acttggctgttaatgcccttctgaaaagcaacctggtgaatgaaatggaaggaggcggtt 5203
|| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
Sbjct: 5006 gattagctgttaatgcccttctgaaaagtgacctggtgagtgaaatggaaggaggcggct 5065
Query: 5204 ttatggg 5210
|| ||||
Sbjct: 5066 ttttggg 5072
Score = 101 bits (51), Expect = 8e-20
Identities = 89/101 (88%), Gaps = 3/101 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5708 ataactacgctggtatccgagc---cgatgatgaaatttcacttgacgaagtgactattg 5764
|||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||| |||||||
Sbjct: 5528 ataactacgctggtatccgagctaccggagatgaaatttcaggtaacgaagttactattg 5587
Query: 5765 aaccaaagtggagtgttgcacgacatttacctgagtatatt 5805
||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct: 5588 aaccaaagtggagcgttgcacggcatttacccgagtatatt 5628
Score = 73.8 bits (37), Expect = 2e-11
Identities = 79/93 (84%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5223 tgtgaatcctagaggaattaattcaaacgataacaccagttttgatgagaccactggatg 5282
||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||| | ||||||
Sbjct: 5073 tgtgaattctagaggaagtagcttaaacgataatggcagttttgatgagaataatggatg 5132
Query: 5283 tgctcaagcatttcgtgtcctgaaacagttgat 5315
|| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 5133 cgcgcaagcatttcgtgtcctgaaacaattgat 5165
>At1g08270.2 68414.m00912 expressed protein low similarity to SP|P46467 SKD1
protein (Vacuolar sorting protein 4b) {Mus musculus}
Length = 1034
Score = 404 bits (204), Expect = e-111
Identities = 204/204 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 6607 catatgcaggatgtagtgtgcattaggtgcaatcaggtgaaagcggctcatttgacagag 6666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 734 catatgcaggatgtagtgtgcattaggtgcaatcaggtgaaagcggctcatttgacagag 675
Query: 6667 cagtgtgagtgttctggttcctttagatgcaaggagagtgggtcagagttcagcaagagg 6726
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 674 cagtgtgagtgttctggttcctttagatgcaaggagagtgggtcagagttcagcaagagg 615
Query: 6727 atggagatattcatggatatagcaaagcgccagaagtttagactgttagaagaatacatc 6786
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 614 atggagatattcatggatatagcaaagcgccagaagtttagactgttagaagaatacatc 555
Query: 6787 tcttggatcatatatggccctagc 6810
||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 554 tcttggatcatatatggccctagc 531
Score = 105 bits (53), Expect = 5e-21
Identities = 53/53 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 6441 ttgcagcaactgtgatgcctacagagacctagatatatgcagagacccagcac 6493
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 786 ttgcagcaactgtgatgcctacagagacctagatatatgcagagacccagcac 734
>At4g29960.1 68417.m04262 expressed protein
Length = 1140
Score = 40.1 bits (20), Expect = 0.24
Identities = 20/20 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3809 agaagaagaaaaaacgaagg 3828
||||||||||||||||||||
Sbjct: 25 agaagaagaaaaaacgaagg 44
>At3g09260.1 68416.m01100 glycosyl hydrolase family 1 protein contains Pfam
PF00232 : Glycosyl hydrolase family 1 domain; TIGRFAM
TIGR01233: 6-phospho-beta-galactosidase; almost identical
to beta-glucosidase GI:1732570 from [Arabidopsis
thaliana]; similar to beta-glucosidase 1 (GI:12043529)
[Arabidopsis thaliana]
Length = 1800
Score = 40.1 bits (20), Expect = 0.24
Identities = 20/20 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 6352 agtctgttgaagtacattaa 6371
||||||||||||||||||||
Sbjct: 1246 agtctgttgaagtacattaa 1265
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
Posted date: Jun 25, 2004 12:58 PM
Number of letters in database: 44,058,232
Number of sequences in database: 29,161
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 212,057
Number of Sequences: 29161
Number of extensions: 212057
Number of successful extensions: 4781
Number of sequences better than 10.0: 24
length of query: 6816
length of database: 44,058,232
effective HSP length: 19
effective length of query: 6797
effective length of database: 43,504,173
effective search space: 295697863881
effective search space used: 295697863881
T: 0
A: 40
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 18 (36.2 bits)