BLASTN 2.2.3 [Apr-24-2002]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= PTA.sd.7484.C1
(6933 letters)
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
29,161 sequences; 44,058,232 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
At3g01460.1 68416.m00070 PHD finger family protein / methyl... 1.366e+04 0.0
At3g03940.1 68416.m00412 protein kinase family protein cont... 40 0.25
At5g43840.1 68418.m05360 heat shock transcription factor fa... 38 0.98
At4g38600.1 68417.m05464 HECT-domain-containing protein / u... 38 0.98
At4g38600.2 68417.m05463 HECT-domain-containing protein / u... 38 0.98
>At3g01460.1 68416.m00070 PHD finger family protein / methyl-CpG binding
domain-containing protein contains Pfam profiles PF00628:
PHD-finger (2 copies), PF01429: Methyl-CpG binding domain
Length = 7457
Score = 1.366e+04 bits (6893), Expect = 0.0
Identities = 6927/6933 (99%), Gaps = 4/6933 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggaacccactgattctactaacgagcaactcggagacactaagaccgccgctgtcaag 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atggaacccactgattctactaacgagcaactcggagacactaagaccgccgctgtcaag 60
Query: 61 gaagagagtcgctcctttctcggcatcgatctcaacgaaatccctaccggcgctactctc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gaagagagtcgctcctttctcggcatcgatctcaacgaaatccctaccggcgctactctc 120
Query: 121 ggcggtggttgcaccgctggtcaggatgacgacggcgaatatgaacctgttgaagttgtt 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ggcggtggttgcaccgctggtcaggatgacgacggcgaatatgaacctgttgaagttgtt 180
Query: 181 aggtcaattcacgataacccggacccagcccctggagcccctgccgaggttcctgaaccg 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 aggtcaattcacgataacccggacccagcccctggagcccctgccgaggttcctgaaccg 240
Query: 241 gatcgggatgcttcgtgcggcgcgtgtggaagacctgagtctatagagctcgttgtagtc 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gatcgggatgcttcgtgcggcgcgtgtggaagacctgagtctatagagctcgttgtagtc 300
Query: 301 tgcgatgcctgtgagcgaggctttcatatgtcttgtgtcaacgatggagttgaggcggct 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 tgcgatgcctgtgagcgaggctttcatatgtcttgtgtcaacgatggagttgaggcggct 360
Query: 361 ccttccgccgattggatgtgcagcgactgtcgtactggcggcgagaggagcaaactgtgg 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 ccttccgccgattggatgtgcagcgactgtcgtactggcggcgagaggagcaaactgtgg 420
Query: 421 ccgttgggggttaagtccaagctcattctggacatgaacgcctcgccgcccagtgatgct 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ccgttgggggttaagtccaagctcattctggacatgaacgcctcgccgcccagtgatgct 480
Query: 481 gagggatacggagctgaggagacgtctgattcgagaaagcatatgctcgccagcagctct 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gagggatacggagctgaggagacgtctgattcgagaaagcatatgctcgccagcagctct 540
Query: 541 tgcattggaaactcttttgattatgcaatgatgcattcaagcttctcaagtctcggtaga 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 tgcattggaaactcttttgattatgcaatgatgcattcaagcttctcaagtctcggtaga 600
Query: 601 ggacatgctagtctcgaagcttcagggttaatgtctcgtaatactaaaatgagtatggat 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 ggacatgctagtctcgaagcttcagggttaatgtctcgtaatactaaaatgagtatggat 660
Query: 661 gcattgggttcacataatctaggttttggattcccattaaacttgaacaatagtagtttg 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 gcattgggttcacataatctaggttttggattcccattaaacttgaacaatagtagtttg 720
Query: 721 cccatgagatttccatccttggatccaagtgagttgtttctgcaaaatctcaggcatttc 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 cccatgagatttccatccttggatccaagtgagttgtttctgcaaaatctcaggcatttc 780
Query: 781 atatctgaaaggcatggagtattggaagatggctggcgtgtcgaattcagacaaccttta 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 atatctgaaaggcatggagtattggaagatggctggcgtgtcgaattcagacaaccttta 840
Query: 841 aatggttatcagttatgtgcagtgtattgtgctccgaatggaaaaacatttagttcaata 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 aatggttatcagttatgtgcagtgtattgtgctccgaatggaaaaacatttagttcaata 900
Query: 901 caagaagttgcttgttatctgggcttggcaattaatggtaactacagctgtatggatgct 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 caagaagttgcttgttatctgggcttggcaattaatggtaactacagctgtatggatgct 960
Query: 961 gaaatcaggaatgagaattctcttcttcaagaaagattgcatacgcccaagagaagaaag 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 gaaatcaggaatgagaattctcttcttcaagaaagattgcatacgcccaagagaagaaag 1020
Query: 1021 acatcaagatggccaaacaatggtttccctgagcaaaagggtagttcagtgagtgctcaa 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 acatcaagatggccaaacaatggtttccctgagcaaaagggtagttcagtgagtgctcaa 1080
Query: 1081 ctcaggcgttttccattcaatggtcagaccatgtctcctttcgccgttaaatctggtact 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 ctcaggcgttttccattcaatggtcagaccatgtctcctttcgccgttaaatctggtact 1140
Query: 1141 cattttcaggctggtggttctcttagctctggaaataatggatgcggttgtgaggaagct 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 cattttcaggctggtggttctcttagctctggaaataatggatgcggttgtgaggaagct 1200
Query: 1201 aagaatggatgtccgatgcagtttgaagatttctttgttctgtcgcttggacgaattgac 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1201 aagaatggatgtccgatgcagtttgaagatttctttgttctgtcgcttggacgaattgac 1260
Query: 1261 ataagacagtcttaccataatgtcaacgtgatttatccaataggatataagtcctgctgg 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1261 ataagacagtcttaccataatgtcaacgtgatttatccaataggatataagtcctgctgg 1320
Query: 1321 catgacaagatcacggggtcactatttacatgtgaagtatctgatggcaattctggtccc 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1321 catgacaagatcacggggtcactatttacatgtgaagtatctgatggcaattctggtccc 1380
Query: 1381 attttcaaggttacacggtcaccatgctcgaaatcatttattccagctggatcaactgtc 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1381 attttcaaggttacacggtcaccatgctcgaaatcatttattccagctggatcaactgtc 1440
Query: 1441 ttctcctgcccaaagattgatgaaatggtggaacagaacagtgacaaacttagtaatcgt 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1441 ttctcctgcccaaagattgatgaaatggtggaacagaacagtgacaaacttagtaatcgt 1500
Query: 1501 agagatagtactcaagagcgtgatgatgacgctagtgttgagatccttctttcggaacac 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1501 agagatagtactcaagagcgtgatgatgacgctagtgttgagatccttctttcggaacac 1560
Query: 1561 tgcccacctcttggagatgatatattgtcttgtttacgtgagaagagtttctccaagaca 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1561 tgcccacctcttggagatgatatattgtcttgtttacgtgagaagagtttctccaagaca 1620
Query: 1621 gtcaattccctgcgctcagaggttgattcttctcgagtagattttgataaaaatttatcc 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1621 gtcaattccctgcgctcagaggttgattcttctcgagtagattttgataaaaatttatcc 1680
Query: 1681 tatgatcaggaccatggggttgaaattggtgacattgttgtggaagaagattcattgtct 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1681 tatgatcaggaccatggggttgaaattggtgacattgttgtggaagaagattcattgtct 1740
Query: 1741 gatgcatggaaaaaagtgtctcaaaaacttgttgatgcatgttcaattgtactgaagcag 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1741 gatgcatggaaaaaagtgtctcaaaaacttgttgatgcatgttcaattgtactgaagcag 1800
Query: 1801 aagggtaccctgaatttcctatgtaagcatgttgacagagaaacaagtgaaatcaactgg 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1801 aagggtaccctgaatttcctatgtaagcatgttgacagagaaacaagtgaaatcaactgg 1860
Query: 1861 gataccatgaatgagaaagacaatgtaattttatcgttgtcaaaattttgctgttcgttg 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1861 gataccatgaatgagaaagacaatgtaattttatcgttgtcaaaattttgctgttcgttg 1920
Query: 1921 gctccttgcagtgtcacgtgtggtgaaaaggataaaagcgaatttgcagcagtagttgat 1980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1921 gctccttgcagtgtcacgtgtggtgaaaaggataaaagcgaatttgcagcagtagttgat 1980
Query: 1981 gctttgtcaaggtggctcgatcaaaacagatttggacttgatgcagattttgtacaggaa 2040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1981 gctttgtcaaggtggctcgatcaaaacagatttggacttgatgcagattttgtacaggaa 2040
Query: 2041 atgattgaacatatgcctggtgccgaatcatgtacgaattataggactctgaagagtaga 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2041 atgattgaacatatgcctggtgccgaatcatgtacgaattataggactctgaagagtaga 2100
Query: 2101 agttcttcttctgttcctataactgtagcggaaggagcgctagtggtcaaaccaaaaggt 2160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2101 agttcttcttctgttcctataactgtagcggaaggagcgctagtggtcaaaccaaaaggt 2160
Query: 2161 ggggaaaatgtcaaggacgaagttttcggtgagatttctcggaaagccaagaagcctaaa 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2161 ggggaaaatgtcaaggacgaagttttcggtgagatttctcggaaagccaagaagcctaaa 2220
Query: 2221 ctaaatggtggtcatggtgtcagaaatctacaccctcctcctgggaggccaatgtgtttg 2280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2221 ctaaatggtggtcatggtgtcagaaatctacaccctcctcctgggaggccaatgtgtttg 2280
Query: 2281 aggctccctcctgggcttgttggtgacttccttcaggtatctgaagtgttctggcgtttc 2340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2281 aggctccctcctgggcttgttggtgacttccttcaggtatctgaagtgttctggcgtttc 2340
Query: 2341 catgaaattttgggttttgaagaggctttctcacctgaaaaccttgaacaggagcttatc 2400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2341 catgaaattttgggttttgaagaggctttctcacctgaaaaccttgaacaggagcttatc 2400
Query: 2401 aatccagtgtttgatggtttgtttcttgataaacctgggaaagatgataagagaagtgag 2460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2401 aatccagtgtttgatggtttgtttcttgataaacctgggaaagatgataagagaagtgag 2460
Query: 2461 attaactttactgataaggattctacagctactaaacttttttctttgttcgatgaatct 2520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2461 attaactttactgataaggattctacagctactaaacttttttctttgttcgatgaatct 2520
Query: 2521 cgccaaccttttcctgcaaaaaatacctctgcttctgaactaaaggagaaaaaggcaggg 2580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2521 cgccaaccttttcctgcaaaaaatacctctgcttctgaactaaaggagaaaaaggcaggg 2580
Query: 2581 gattcttctgattttaagatttcagattcctctcgtgggtcgtgtgtgggtgcacttcta 2640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2581 gattcttctgattttaagatttcagattcctctcgtgggtcgtgtgtgggtgcacttcta 2640
Query: 2641 acaagggctcacatttcgcttctgcaagtgctaatatgtgagctgcaatccaaggtagct 2700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2641 acaagggctcacatttcgcttctgcaagtgctaatatgtgagctgcaatccaaggtagct 2700
Query: 2701 gcatttgttgatccaaactttgattctggcgaatcgagatccagacgaggacgaaaaaag 2760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2701 gcatttgttgatccaaactttgattctggcgaatcgagatccagacgaggacgaaaaaag 2760
Query: 2761 gatgacagtacactttctgctaaaagaaataagctgcatatgcttcctgttaatgagttc 2820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2761 gatgacagtacactttctgctaaaagaaataagctgcatatgcttcctgttaatgagttc 2820
Query: 2821 acttggcctgaattggcccgtaggtacatcttgtctcttttatccatggatgggaacctc 2880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2821 acttggcctgaattggcccgtaggtacatcttgtctcttttatccatggatgggaacctc 2880
Query: 2881 gaatcagcagagattgctgcacgtgaaagtggtaaggtattccgttgcttacaaggggat 2940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2881 gaatcagcagagattgctgcacgtgaaagtggtaaggtattccgttgcttacaaggggat 2940
Query: 2941 ggtggtttgctttgcggctcgcttacaggagtggctgggatggaagcagattcaatgtta 3000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2941 ggtggtttgctttgcggctcgcttacaggagtggctgggatggaagcagattcaatgtta 3000
Query: 3001 cttgcagaggctattaagaaaatatctggttcgttgacaagcgaaaatgatgttctttct 3060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3001 cttgcagaggctattaagaaaatatctggttcgttgacaagcgaaaatgatgttctttct 3060
Query: 3061 gtggaagatgatgattccgatggccttgatgctactgagacaaacacttgcagtggtgat 3120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3061 gtggaagatgatgattccgatggccttgatgctactgagacaaacacttgcagtggtgat 3120
Query: 3121 attccagagtgggctcaggttttggaacctgtgaaaaagcttccaacaaatgttgggact 3180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3121 attccagagtgggctcaggttttggaacctgtgaaaaagcttccaacaaatgttgggact 3180
Query: 3181 agaatcagaaagtgtgtctatgaagctttagagagaaatccaccagagtgggcaaagaag 3240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3181 agaatcagaaagtgtgtctatgaagctttagagagaaatccaccagagtgggcaaagaag 3240
Query: 3241 atattggagcattctatcagtaaagaaatatataaaggcaatgcatcaggaccaacaaag 3300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3241 atattggagcattctatcagtaaagaaatatataaaggcaatgcatcaggaccaacaaag 3300
Query: 3301 aaagctgtcctctcattgctagcggatattcgaggtggagacttggtgcagaggtctatt 3360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3301 aaagctgtcctctcattgctagcggatattcgaggtggagacttggtgcagaggtctatt 3360
Query: 3361 aaaggaaccaaaaagcggacatatataaagtgtatctgatgtcattatgaagaaatgccg 3420
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3361 aaaggaaccaaaaagcggacatatat-aagtgtatctgatgtcattatgaagaaatgccg 3419
Query: 3421 tgctgtattgcgtggtgttgcagctgcagacgaggataaagtcctttgcactttactggg 3480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3420 tgctgtattgcgtggtgttgcagctgcagacgaggataaagtcctttgcactttactggg 3479
Query: 3481 aagaaagttactgaattccagtgataatgatgatgacgggctcctgggatcacctgcaat 3540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3480 aagaaagttactgaattccagtgataatgatgatgacgggctcctgggatcacctgcaat 3539
Query: 3541 gggttcgcgtcccttagacttcagaactattgatttgaggttggctgctggtgcgtatga 3600
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3540 ggtttcgcgtcccttagacttcagaactattgatttgaggttggctgctggtgcgtatga 3599
Query: 3601 cggatcaactgaagcttttcttgaagatgttcttgagctgtggagtagtatacgtgttat 3660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3600 cggatcaactgaagcttttcttgaagatgttcttgagctgtggagtagtatacgtgttat 3659
Query: 3661 gtatgcagatcagcccgattgtgtggacctggttgcaacattgtctgaaaaattcaagtc 3720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3660 gtatgcagatcagcccgattgtgtggacctggttgcaacattgtctgaaaaattcaagtc 3719
Query: 3721 gttatacgaggctgaggttgtaccacttgttcagaaacttaaggactacaggaaattgga 3780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3720 gttatacgaggctgaggttgtaccacttgttcagaaacttaaggactacaggaaattgga 3779
Query: 3781 atgcctaagtgcagagatgaagaaggaaattaaggacatagttgtttcagtaaataagct 3840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3780 atgcctaagtgcagagatgaagaaggaaattaaggacatagttgtttcagtaaataagct 3839
Query: 3841 tcccaaggccccgtgggatgagggggtatgtaaagtatgtggcgttgacaaagatgatga 3900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3840 tcccaaggccccgtgggatgagggggtatgtaaagtatgtggcgttgacaaagatgatga 3899
Query: 3901 cagtgttctcttgtgtgatacatgcgatgctgagtatcacacatattgtttaaatccacc 3960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3900 cagtgttctcttgtgtgatacatgcgatgctgagtatcacacatattgtttaaatccacc 3959
Query: 3961 tcttattagaattcctgatggaaattggtattgtccatcttgtgtcattgccaagcgcat 4020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3960 tcttattagaattcctgatggaaattggtattgtccatcttgtgtcattgccaagcgcat 4019
Query: 4021 ggctcaagaggctttggaatcttacaaactagttaggcggcggaaaggtagaaagtatca 4080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4020 ggctcaagaggctttggaatcttacaaactagttaggcggcggaaaggtagaaagtatca 4079
Query: 4081 gggggaactcacccgagcttctatggaactgactgctcacctggcagatgtgatggaaga 4140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4080 gggggaactcacccgagcttctatggaactgactgctcacctggcagatgtgatggaaga 4139
Query: 4141 aaaggactactgggagtttagtgctgaggagagaatcttgctgcttaagcttctatgcga 4200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4140 aaaggactactgggagtttagtgctgaggagagaatcttgctgcttaagcttctatgcga 4199
Query: 4201 tgaactgcttagttcatctcttgtccatcaacaccttgagcagtgtgccgaagcaataat 4260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4200 tgaactgcttagttcatctcttgtccatcaacaccttgagcagtgtgccgaagcaataat 4259
Query: 4261 tgaaatgcagcagaagttacgctctctttcctcagaatggaaaaacgcaaaaatgcggca 4320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4260 tgaaatgcagcagaagttacgctctctttcctcagaatggaaaaacgcaaaaatgcggca 4319
Query: 4321 agaattcctgacggctaaactggcaaaggttgaaccgagtattctgaaggaagtgggcga 4380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4320 agaattcctgacggctaaactggcaaaggttgaaccgagtattctgaaggaagtgggcga 4379
Query: 4381 accacataattcaagctactttgcagaccaaatgggatgtgatccacaaccacaggaggg 4440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4380 accacataattcaagctactttgcagaccaaatgggatgtgatccacaaccacaggaggg 4439
Query: 4441 cgttggagacggagttactcgtgatgatgagacttcctctactgcatatcttaacaagaa 4500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4440 cgttggagacggagttactcgtgatgatgagacttcctctactgcatatcttaacaagaa 4499
Query: 4501 tcaaggtaaatctccacttgaaaccgatactcaacccggagagtcgcatgttaatttcgg 4560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4500 tcaaggtaaatctccacttgaaaccgatactcaacccggagagtcgcatgttaatttcgg 4559
Query: 4561 tgagagcaaaatttcctccccggaaacaatatcatcccctgggaggcatgagctacctat 4620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4560 tgagagcaaaatttcctccccggaaacaatatcatcccctgggaggcatgagctacctat 4619
Query: 4621 agcagatacctctcctcttgtaacagataatctgcctgaaaaagatacctcggagacctt 4680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4620 agcagatacctctcctcttgtaacagataatctgcctgaaaaagatacctcggagacctt 4679
Query: 4681 gcttaagtcagttggaaggaatcatgaaacacattcaccaaattccaatgcagtagaatt 4740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4680 gcttaagtcagttggaaggaatcatgaaacacattcaccaaattccaatgcagtagaatt 4739
Query: 4741 gccgacagctcatgatgcatcttctcaggcttcccaagagttgcaggcttgtcagcagga 4800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4740 gccgacagctcatgatgcatcttctcaggcttcccaagagttgcaggcttgtcagcagga 4799
Query: 4801 tttgagtgccactagtaatgaaattcagaatcttcagcaatcaattagaagcatagaatc 4860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4800 tttgagtgccactagtaatgaaattcagaatcttcagcaatcaattagaagcatagaatc 4859
Query: 4861 acagcttctaaagcaatctatacggagagattttctgggaaccgatgctagtggtcggtt 4920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4860 acagcttctaaagcaatctatacggagagattttctgggaaccgatgctagtggtcggtt 4919
Query: 4921 atattggggttgctgcttcccagatgaaaatcctcgtatattggttgatggaagcatatc 4980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4920 atattggggttgctgcttcccagatgaaaatcctcgtatattggttgatggaagcatatc 4979
Query: 4981 tttgcagaaacctgttcaagccgatttgataagttcaaaagtcccctctccgtttctcca 5040
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4980 tttgcagaaacctgttcaagccgatttgataggttcaaaagtcccctctccgtttctcca 5039
Query: 5041 taccgttgaccatggaagactaaggctttcaccctggacgtattatgaaactgaaaccga 5100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5040 taccgttgaccatggaagactaaggctttcaccctggacgtattatgaaactgaaaccga 5099
Query: 5101 gatcagtgagcttgtccaatggcttcatgatgatgatctgaaagaaagagacctagagag 5160
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 5100 gatcagtgagcttgtccaatggcttcatgatgatgatctgaaagaaagagacct-gagag 5158
Query: 5161 agtctattttgtggtggaaaaggttacgatatggagacgttcaaaaggaaaagaaacaag 5220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5159 agtctattttgtggtggaaaaggttacgatatggagacgttcaaaaggaaaagaaacaag 5218
Query: 5221 ctcagaatttatctgctccggtatttgctacgggtcttgagaccaaggctgccatgtcaa 5280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5219 ctcagaatttatctgctccggtatttgctacgggtcttgagaccaaggctgccatgtcaa 5278
Query: 5281 tggagaagagatatggtccatgcatcaaactggagatggaaaccttaaaaaaacggggga 5340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5279 tggagaagagatatggtccatgcatcaaactggagatggaaaccttaaaaaaacggggga 5338
Query: 5341 agaagacaaaggttgcagagcgagagaaattgtgtagatgcgaatgcttggaatccattt 5400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5339 agaagacaaaggttgcagagcgagagaaattgtgtagatgcgaatgcttggaatccattt 5398
Query: 5401 tgccatctatgattcactgcctcatatgccataaaacattcgcaagtgatgatgagtttg 5460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5399 tgccatctatgattcactgcctcatatgccataaaacattcgcaagtgatgatgagtttg 5458
Query: 5461 aggatcacactgagagtaagtgtattccttattcattagcaactgaagaaggcaaggaca 5520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5459 aggatcacactgagagtaagtgtattccttattcattagcaactgaagaaggcaaggaca 5518
Query: 5521 tctctgattcttcaaaagccaaagaaagtctgaaatccgattatcttaatgtaaagtcta 5580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5519 tctctgattcttcaaaagccaaagaaagtctgaaatccgattatcttaatgtaaagtcta 5578
Query: 5581 gtgccggcaaagatgtagctgaaatatccaatgtttctgaacttgattctgggttgataa 5640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5579 gtgccggcaaagatgtagctgaaatatccaatgtttctgaacttgattctgggttgataa 5638
Query: 5641 gatatcaagaagaagaatctatttccccataccattttgaggagatctgttccaagtttg 5700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5639 gatatcaagaagaagaatctatttccccataccattttgaggagatctgttccaagtttg 5698
Query: 5701 tgacaaaggattgcaacagagatttggttaaagagatcggtctgatcagttcaaatggca 5760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5699 tgacaaaggattgcaacagagatttggttaaagagatcggtctgatcagttcaaatggca 5758
Query: 5761 ttccaacatttcttccatcgtcatctactcatcttaacgactccgtgctcatctctgcca 5820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5759 ttccaacatttcttccatcgtcatctactcatcttaacgactccgtgctcatctctgcca 5818
Query: 5821 aatccaataagccagatggtggtgattcaggggatcaggtcatttttgctggtcctgaaa 5880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5819 aatccaataagccagatggtggtgattcaggggatcaggtcatttttgctggtcctgaaa 5878
Query: 5881 ccaatgttgaaggcttaaattctgaatctaacatgtcattcgatagatctgtcacagaca 5940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5879 ccaatgttgaaggcttaaattctgaatctaacatgtcattcgatagatctgtcacagaca 5938
Query: 5941 gtcacgggggtccactggataaaccaagtggactgggttttggcttctcagagcaaaaga 6000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5939 gtcacgggggtccactggataaaccaagtggactgggttttggcttctcagagcaaaaga 5998
Query: 6001 ataagaaatcttcaggtagtgggttgaaaagctgctgtgtggttccacaggctgctttga 6060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5999 ataagaaatcttcaggtagtgggttgaaaagctgctgtgtggttccacaggctgctttga 6058
Query: 6061 aacgagtaactggcaaagctttgccgggtttcaggttcctgaaaaccaacttgcttgata 6120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6059 aacgagtaactggcaaagctttgccgggtttcaggttcctgaaaaccaacttgcttgata 6118
Query: 6121 tggatgtagcactgcctgaagaagctttaagaccatcgaaatcacatccaaaccgtagaa 6180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6119 tggatgtagcactgcctgaagaagctttaagaccatcgaaatcacatccaaaccgtagaa 6178
Query: 6181 gagcttggcgtgtatttgttaaatcgtcgcaaagtatatacgagttggttcaggcaacaa 6240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6179 gagcttggcgtgtatttgttaaatcgtcgcaaagtatatacgagttggttcaggcaacaa 6238
Query: 6241 ttgtggtagaagatatgattaagacagagtacttgaaaaatgaatggtggtactggtctt 6300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6239 ttgtggtagaagatatgattaagacagagtacttgaaaaatgaatggtggtactggtctt 6298
Query: 6301 ctctttcagcggctgctaaaatctcgactctctcagcgttatccgtccgtatcttctccc 6360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6299 ctctttcagcggctgctaaaatctcgactctctcagcgttatccgtccgtatcttctccc 6358
Query: 6361 tcgacgctgctatcatttatgataaacccataactccatcaaatcctatcgatgaaacaa 6420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6359 tcgacgctgctatcatttatgataaacccataactccatcaaatcctatcgatgaaacaa 6418
Query: 6421 agccgatcatcagcttaccggaccaaaagtcacagccggtttcggattctcaagaaagaa 6480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6419 agccgatcatcagcttaccggaccaaaagtcacagccggtttcggattctcaagaaagaa 6478
Query: 6481 gcagcagagttagaagatctggcaagaaaaggaaagaacccgagggatcctagttaatta 6540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6479 gcagcagagttagaagatctggcaagaaaaggaaagaacccgagggatcctagttaatta 6538
Query: 6541 ttaaacccacgggaaaaagaaaacctcgtgagcccagccagggagaatgtgaaccggaaa 6600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6539 ttaaacccacgggaaaaagaaaacctcgtgagcccagccagggagaatgtgaaccggaaa 6598
Query: 6601 tatggatttattattccggtatagtcaaaagtggagccaatgtgtatgtggtagatatag 6660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6599 tatggatttattattccggtatagtcaaaagtggagccaatgtgtatgtggtagatatag 6658
Query: 6661 gcaatgtttcaatctatctggaaccggacctgtaagttccggatgttgagatccgttttg 6720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6659 gcaatgtttcaatctatctggaaccggacctgtaagttccggatgttgagatccgttttg 6718
Query: 6721 gtggttcatcatcataagaggcctaagtcctgtttagatctttttcttggaatggaggtt 6780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6719 gtggttcatcatcataagaggcctaagtcctgtttagatctttttcttggaatggaggtt 6778
Query: 6781 caacaggtggatgagccaaggaaagtatgtgtacacatatatgttagaagactaactagt 6840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 6779 caacaggtggatgagccaaggaaagtatgtgtacacatatatg-tagaagactaactagt 6837
Query: 6841 gtggaattaattagtatcaaagtcgctttttagacattagctgatgttagaacggaaact 6900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6838 gtggaattaattagtatcaaagtcgctttttagacattagctgatgttagaacggaaact 6897
Query: 6901 tcaaattattctttataatctctctctttctct 6933
|| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6898 tc-aattattctttataatctctctctttctct 6929
>At3g03940.1 68416.m00412 protein kinase family protein contains Pfam domains,
PF00069: Protein kinase domain
Length = 2629
Score = 40.1 bits (20), Expect = 0.25
Identities = 20/20 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 5143 agaaagagacctagagagag 5162
||||||||||||||||||||
Sbjct: 95 agaaagagacctagagagag 76
>At5g43840.1 68418.m05360 heat shock transcription factor family protein contains
Pfam profile: PF00447 HSF-type DNA-binding domain
Length = 849
Score = 38.2 bits (19), Expect = 0.98
Identities = 19/19 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1008 caagagaagaaagacatca 1026
|||||||||||||||||||
Sbjct: 318 caagagaagaaagacatca 336
>At4g38600.1 68417.m05464 HECT-domain-containing protein / ubiquitin-transferase
family protein similar to SP|Q14669Thyroid receptor
interacting protein 12 (TRIP12) {Homo sapiens}; contains
Pfam profile PF00632: HECT-domain (ubiquitin-transferase)
Length = 6139
Score = 38.2 bits (19), Expect = 0.98
Identities = 19/19 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2979 gatggaagcagattcaatg 2997
|||||||||||||||||||
Sbjct: 3775 gatggaagcagattcaatg 3793
>At4g38600.2 68417.m05463 HECT-domain-containing protein / ubiquitin-transferase
family protein similar to SP|Q14669Thyroid receptor
interacting protein 12 (TRIP12) {Homo sapiens}; contains
Pfam profile PF00632: HECT-domain (ubiquitin-transferase)
Length = 5954
Score = 38.2 bits (19), Expect = 0.98
Identities = 19/19 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2979 gatggaagcagattcaatg 2997
|||||||||||||||||||
Sbjct: 3681 gatggaagcagattcaatg 3699
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
Posted date: Jun 25, 2004 12:58 PM
Number of letters in database: 44,058,232
Number of sequences in database: 29,161
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 239,108
Number of Sequences: 29161
Number of extensions: 239108
Number of successful extensions: 5571
Number of sequences better than 10.0: 35
length of query: 6933
length of database: 44,058,232
effective HSP length: 19
effective length of query: 6914
effective length of database: 43,504,173
effective search space: 300787852122
effective search space used: 300787852122
T: 0
A: 40
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 18 (36.2 bits)