BLASTN 2.2.3 [Apr-24-2002]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= PTA.sd.6968.C1
(6907 letters)
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
29,161 sequences; 44,058,232 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
At2g42270.1 68415.m05232 U5 small nuclear ribonucleoprotein... 1.368e+04 0.0
At1g20960.1 68414.m02624 U5 small nuclear ribonucleoprotein... 3642 0.0
At2g42280.1 68415.m05233 basic helix-loop-helix (bHLH) fami... 153 2e-35
At3g28870.1 68416.m03604 hypothetical protein 103 2e-20
At2g42280.2 68415.m05234 basic helix-loop-helix (bHLH) fami... 88 1e-15
>At2g42270.1 68415.m05232 U5 small nuclear ribonucleoprotein helicase, putative
Length = 6906
Score = 1.368e+04 bits (6899), Expect = 0.0
Identities = 6906/6907 (99%), Gaps = 1/6907 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgacgaatttgggtggtggtggtgcggaggagcaagccaggttgaagcagtatgggtac 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atgacgaatttgggtggtggtggtgcggaggagcaagccaggttgaagcagtatgggtac 60
Query: 61 aaagtcaattccagtcttgttcttaacagtgatgagcgtcgtcgtgatacgcatgaatct 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aaagtcaattccagtcttgttcttaacagtgatgagcgtcgtcgtgatacgcatgaatct 120
Query: 121 tctggtgaaccggagagtctcaggggtaggattgatccgaaatcctttggagatcgtgtc 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 tctggtgaaccggagagtctcaggggtaggattgatccgaaatcctttggagatcgtgtc 180
Query: 181 gttaggggaaggcctcatgagttagatgagcggcttaataaatctaagaagaagaaggaa 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 gttaggggaaggcctcatgagttagatgagcggcttaataaatctaagaagaagaaggaa 240
Query: 241 cgttgtgatgatttggtgtctgctcgtgagagcaaaagagttcgtcttagggaggtgagt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 cgttgtgatgatttggtgtctgctcgtgagagcaaaagagttcgtcttagggaggtgagt 300
Query: 301 gtacttaatgatacggaggatggtgtttatcagccgaagactaaggaaacaagggttgct 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtacttaatgatacggaggatggtgtttatcagccgaagactaaggaaacaagggttgct 360
Query: 361 tttgagattatgcttggtcttatccagcagcaattgggtgggcagcctttggacattgtt 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 tttgagattatgcttggtcttatccagcagcaattgggtgggcagcctttggacattgtt 420
Query: 421 tgcggtgcggctgatgagattttggcagttcttaagaatgaatccgtcaaaaaccatgaa 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 tgcggtgcggctgatgagattttggcagttcttaagaatgaatccgtcaaaaaccatgaa 480
Query: 481 aagaaggtagagattgagaaactactaaacgttattactgatcaggttttcagtcagttt 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aagaaggtagagattgagaaactactaaacgttattactgatcaggttttcagtcagttt 540
Query: 541 gtttcgattggaaaactgattacagactatgaagagggtggtgattctttaagtggtaaa 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gtttcgattggaaaactgattacagactatgaagagggtggtgattctttaagtggtaaa 600
Query: 601 gctagtgaggatggaggacttgattatgatattggtgttgcccttgaatgtgaagaggat 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gctagtgaggatggaggacttgattatgatattggtgttgcccttgaatgtgaagaggat 660
Query: 661 gatgatgagagtgatcttgatatggtccaggatgaaaaagatgaggaggatgaagatgtt 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 gatgatgagagtgatcttgatatggtccaggatgaaaaagatgaggaggatgaagatgtt 720
Query: 721 gttgagcttaacaaaactggagttgtccaggtgggtgtggcaataaacggcgaggatgca 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 gttgagcttaacaaaactggagttgtccaggtgggtgtggcaataaacggcgaggatgca 780
Query: 781 agacaggcaaaggaggatacgagtcttaatgttctggatattgatgcttattggcttcag 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 agacaggcaaaggaggatacgagtcttaatgttctggatattgatgcttattggcttcag 840
Query: 841 agaaagatatctcaagaatatgagcagaagattgatgcacaagagtgccaggaactcgca 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 agaaagatatctcaagaatatgagcagaagattgatgcacaagagtgccaggaactcgca 900
Query: 901 gaagagctgcttaagatacttgctgagggtaatgatagggatgttgagatcaagctgctt 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 gaagagctgcttaagatacttgctgagggtaatgatagggatgttgagatcaagctgctt 960
Query: 961 gagcaccttcagtttgaaaagttcagccttgttaaatttctgttgcaaaaccgtcttaaa 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 gagcaccttcagtttgaaaagttcagccttgttaaatttctgttgcaaaaccgtcttaaa 1020
Query: 1021 gttgtgtggtgcacccgtttggctaggggaagagaccaggaagagaggaatcaaattgag 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 gttgtgtggtgcacccgtttggctaggggaagagaccaggaagagaggaatcaaattgag 1080
Query: 1081 gaggagatgttggggttaggttcagagttggcagcaattgttaaggagttgcatgccaaa 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 gaggagatgttggggttaggttcagagttggcagcaattgttaaggagttgcatgccaaa 1140
Query: 1141 agagcaacagccaaagaaagggaggagaaacgggagaaagatatcaaagaagaagctcaa 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 agagcaacagccaaagaaagggaggagaaacgggagaaagatatcaaagaagaagctcaa 1200
Query: 1201 catcttatggatgatgattctggtgttgacggagacagaggcatgagagatgttgatgat 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1201 catcttatggatgatgattctggtgttgacggagacagaggcatgagagatgttgatgat 1260
Query: 1261 ttagatttggagaatggttggttgaagggccagcgtcaggtgatggacctggagagcctt 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1261 ttagatttggagaatggttggttgaagggccagcgtcaggtgatggacctggagagcctt 1320
Query: 1321 gcttttaaccaaggtggtttcacgagggagaataacaagtgtgagcttcctgatcgctct 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1321 gcttttaaccaaggtggtttcacgagggagaataacaagtgtgagcttcctgatcgctct 1380
Query: 1381 ttcagaatacgtggcaaggaatttgatgaggttcatgtgccgtgggtttctaaaaagttt 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1381 ttcagaatacgtggcaaggaatttgatgaggttcatgtgccgtgggtttctaaaaagttt 1440
Query: 1441 gatagtaatgaaaagcttgtgaaaattagcgatttgccagagtgggcccaaccagctttt 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1441 gatagtaatgaaaagcttgtgaaaattagcgatttgccagagtgggcccaaccagctttt 1500
Query: 1501 aggggaatgcagcagttgaatagggttcagagcaaagtgtacggcactgctctttttaag 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1501 aggggaatgcagcagttgaatagggttcagagcaaagtgtacggcactgctctttttaag 1560
Query: 1561 gctgacaacattcttctttgtgctccaactggtgctgggaagaccaatgttgccgtgctc 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1561 gctgacaacattcttctttgtgctccaactggtgctgggaagaccaatgttgccgtgctc 1620
Query: 1621 accatactgcaccagcttggattgaatatgaaccctggtggaacgtttaatcatggtaat 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1621 accatactgcaccagcttggattgaatatgaaccctggtggaacgtttaatcatggtaat 1680
Query: 1681 tacaaaattgtctatgttgcaccaatgaaagcccttgttgctgaggtcgtggatagtcta 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1681 tacaaaattgtctatgttgcaccaatgaaagcccttgttgctgaggtcgtggatagtcta 1740
Query: 1741 tctcaacgtttgaaggattttggagttactgtgaaggaactcagtggggatcagtccctt 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1741 tctcaacgtttgaaggattttggagttactgtgaaggaactcagtggggatcagtccctt 1800
Query: 1801 actgggcaagaaatcaaagagactcagataattgttacaacgccagagaagtgggatatc 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1801 actgggcaagaaatcaaagagactcagataattgttacaacgccagagaagtgggatatc 1860
Query: 1861 atcaccaggaaatctggagatcgcacttatacacagcttgtgaggcttcttataatcgac 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1861 atcaccaggaaatctggagatcgcacttatacacagcttgtgaggcttcttataatcgac 1920
Query: 1921 gaaattcatcttcttgatgataatcgagggcctgtgcttgaaagtattgtcgctaggact 1980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1921 gaaattcatcttcttgatgataatcgagggcctgtgcttgaaagtattgtcgctaggact 1980
Query: 1981 cttaggcagattgaaagcacaaaggagcatattcgtctggtaggtttatctgcaacactg 2040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1981 cttaggcagattgaaagcacaaaggagcatattcgtctggtaggtttatctgcaacactg 2040
Query: 2041 ccaaattgtgacgatgtggcttcatttttgcgagtggatcttaaaaatgggttgtttata 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2041 ccaaattgtgacgatgtggcttcatttttgcgagtggatcttaaaaatgggttgtttata 2100
Query: 2101 tttgaccgtagctacagacctgtgcctctcggtcagcagtatataggaattaatgtgaaa 2160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2101 tttgaccgtagctacagacctgtgcctctcggtcagcagtatataggaattaatgtgaaa 2160
Query: 2161 aagccgttacggaggttccagttgatgaatgatatatgttatcagaaagtagtggctgtt 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2161 aagccgttacggaggttccagttgatgaatgatatatgttatcagaaagtagtggctgtt 2220
Query: 2221 gctggaaaacaccaggtccttatttttgttcattcgaggaaggaaacagcaaaaactgca 2280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2221 gctggaaaacaccaggtccttatttttgttcattcgaggaaggaaacagcaaaaactgca 2280
Query: 2281 agggcaatacgggacacagctatggcaaatgataccctcagcagattcttgaaggaagat 2340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2281 agggcaatacgggacacagctatggcaaatgataccctcagcagattcttgaaggaagat 2340
Query: 2341 agtcaaagtcgtgaaattcttaagtgtttagctggacttctcaagaataatgacctgaaa 2400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2341 agtcaaagtcgtgaaattcttaagtgtttagctggacttctcaagaataatgacctgaaa 2400
Query: 2401 gagcttctgccttatggttttgcaattcatcatgctgggttgacaaggactgatcgtgag 2460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2401 gagcttctgccttatggttttgcaattcatcatgctgggttgacaaggactgatcgtgag 2460
Query: 2461 atagttgagaatcaatttcgctgggggaatttgcaagtgttgatttccacggcaactctt 2520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2461 atagttgagaatcaatttcgctgggggaatttgcaagtgttgatttccacggcaactctt 2520
Query: 2521 gcctggggtgtgaatttgcctgcacatactgtcattatcaaaggaacccaagtatataat 2580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2521 gcctggggtgtgaatttgcctgcacatactgtcattatcaaaggaacccaagtatataat 2580
Query: 2581 cctgagagaggggagtggatggagctgagtcctttagatgttatgcagatgattggtcgt 2640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2581 cctgagagaggggagtggatggagctgagtcctttagatgttatgcagatgattggtcgt 2640
Query: 2641 gccggaagacctcaatatgaccaacaaggggagggaataataatcactggatacagcaag 2700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2641 gccggaagacctcaatatgaccaacaaggggagggaataataatcactggatacagcaag 2700
Query: 2701 ctacagtattatcttcgtttgatgaatgagcaactacctattgaaagccagtttatttcc 2760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2701 ctacagtattatcttcgtttgatgaatgagcaactacctattgaaagccagtttatttcc 2760
Query: 2761 aaacttgctgatcagctcaatgctgaaattgtgcttggaaccattcagaatgctagagaa 2820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2761 aaacttgctgatcagctcaatgctgaaattgtgcttggaaccattcagaatgctagagaa 2820
Query: 2821 gcttgccactggcttggctatacatatttatatgtccgcatggttcgtaatccgacactg 2880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2821 gcttgccactggcttggctatacatatttatatgtccgcatggttcgtaatccgacactg 2880
Query: 2881 tatggcgtatcgcctgatgcccttgcaaaagacttgctattggaggagagaagagctgat 2940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2881 tatggcgtatcgcctgatgcccttgcaaaagacttgctattggaggagagaagagctgat 2940
Query: 2941 ctgatacattctgctgccactatcttggacaagaacaacctgattaagtacgacaggaaa 3000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2941 ctgatacattctgctgccactatcttggacaagaacaacctgattaagtacgacaggaaa 3000
Query: 3001 agtggacacttccaggttactgatttgggacgcattgctagctactactacataagccat 3060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3001 agtggacacttccaggttactgatttgggacgcattgctagctactactacataagccat 3060
Query: 3061 ggaacaatagctgcatacaatgagaatctgaagccaacaatgaatgatatagagctttgt 3120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3061 ggaacaatagctgcatacaatgagaatctgaagccaacaatgaatgatatagagctttgt 3120
Query: 3121 cgtctgttctctctgagtgaggagttcaagtatgtcactgttcgacaagatgagaagatg 3180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3121 cgtctgttctctctgagtgaggagttcaagtatgtcactgttcgacaagatgagaagatg 3180
Query: 3181 gaactggcaaagcttttggatcgtgtaccaattccggtaaaggaaacactagaagatccc 3240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3181 gaactggcaaagcttttggatcgtgtaccaattccggtaaaggaaacactagaagatccc 3240
Query: 3241 agtgcaaagatcaacgttttgctgcaagtatatatttcaaagctaaagctcgagggtctt 3300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3241 agtgcaaagatcaacgttttgctgcaagtatatatttcaaagctaaagctcgagggtctt 3300
Query: 3301 tctttgacatctgacatggtttatattacccaaagtgctggacgtttgttacgagctatt 3360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3301 tctttgacatctgacatggtttatattacccaaagtgctggacgtttgttacgagctatt 3360
Query: 3361 tttgagattgtgttgaagagggggtgggctcaactgtctcagaaagctctcaacttgtct 3420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3361 tttgagattgtgttgaagagggggtgggctcaactgtctcagaaagctctcaacttgtct 3420
Query: 3421 aaaatggtagggaagaggatgtggagtgttcagacacccctctggcagtttcctggaatt 3480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3421 aaaatggtagggaagaggatgtggagtgttcagacacccctctggcagtttcctggaatt 3480
Query: 3481 cccaaggagattctgatgaagttggagaaaaacgatctggtgtgggagaggtactatgat 3540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3481 cccaaggagattctgatgaagttggagaaaaacgatctggtgtgggagaggtactatgat 3540
Query: 3541 ctatcttcacaggagctaggagagcttatttgtaatcctaagatgggcagaccacttcac 3600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3541 ctatcttcacaggagctaggagagcttatttgtaatcctaagatgggcagaccacttcac 3600
Query: 3601 aagtatatccatcagttcccaaaactgaaacttgcagcacatgttcagccgatttctcgt 3660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3601 aagtatatccatcagttcccaaaactgaaacttgcagcacatgttcagccgatttctcgt 3660
Query: 3661 tctgttctgcaggttgagctcacggtgacacctgatttccactgggatgacaaagcaaat 3720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3661 tctgttctgcaggttgagctcacggtgacacctgatttccactgggatgacaaagcaaat 3720
Query: 3721 aaatatgttgaaccgttttggataattgtggaagacaatgatggtgaaaagatccttcat 3780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3721 aaatatgttgaaccgttttggataattgtggaagacaatgatggtgaaaagatccttcat 3780
Query: 3781 catgagtactttctttttaaaaaacgggttattgatgaggaccacactttgaacttcact 3840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3781 catgagtactttctttttaaaaaacgggttattgatgaggaccacactttgaacttcact 3840
Query: 3841 gtaccaatctctgagccaattcccccacagtatttcatccgagtggtttcagacaaatgg 3900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3841 gtaccaatctctgagccaattcccccacagtatttcatccgagtggtttcagacaaatgg 3900
Query: 3901 cttgactcgccgactgtgttacctgtatctttcaggcatcttattcttccagaaaaatac 3960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3901 cttgactcgccgactgtgttacctgtatctttcaggcatcttattcttccagaaaaatac 3960
Query: 3961 ccaccacctacagagctactggatttgcagcccctcccggtgatggccctaagaaatcct 4020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3961 ccaccacctacagagctactggatttgcagcccctcccggtgatggccctaagaaatcct 4020
Query: 4021 tcttatgaaactctttatcaggatttcaagcatttcaatccagtgcagactcaggtcttt 4080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4021 tcttatgaaactctttatcaggatttcaagcatttcaatccagtgcagactcaggtcttt 4080
Query: 4081 actgttttgtataacacaagtgacaatgtagtggttgctgctccaacaggaagtgggaag 4140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4081 actgttttgtataacacaagtgacaatgtagtggttgctgctccaacaggaagtgggaag 4140
Query: 4141 actatatgtgcggagtttgctatattaaggaatcatctcgaaggacctgattctgcaatg 4200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4141 actatatgtgcggagtttgctatattaaggaatcatctcgaaggacctgattctgcaatg 4200
Query: 4201 cgtgttgtctatatagcacctcttgaggctattgccaaggagcagtttcgtgattgggag 4260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4201 cgtgttgtctatatagcacctcttgaggctattgccaaggagcagtttcgtgattgggag 4260
Query: 4261 aaaaagttcggaaaggggcttggtttacgggttgttgagttaactggggagacattattg 4320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4261 aaaaagttcggaaaggggcttggtttacgggttgttgagttaactggggagacattattg 4320
Query: 4321 gatcttaagttgcttgagaaaggtcagataatcataagtactcctgagaaatgggacgct 4380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4321 gatcttaagttgcttgagaaaggtcagataatcataagtactcctgagaaatgggacgct 4380
Query: 4381 ctgtcccggaggtggaaacagagaaaatatatccagcaggttagtttgtttatcgttgac 4440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4381 ctgtcccggaggtggaaacagagaaaatatatccagcaggttagtttgtttatcgttgac 4440
Query: 4441 gagcttcatttaattgggggtcaaggtggtcaagtgttggaggtaattgtctctagaatg 4500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4441 gagcttcatttaattgggggtcaaggtggtcaagtgttggaggtaattgtctctagaatg 4500
Query: 4501 agatatatttcaagtcaggttgggaataaaatcaggattgttgcattatcaacttccctt 4560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4501 agatatatttcaagtcaggttgggaataaaatcaggattgttgcattatcaacttccctt 4560
Query: 4561 gcaaatgccaaagatcttggagagtggattggggccagttcatgtggcgtttttaacttc 4620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4561 gcaaatgccaaagatcttggagagtggattggggccagttcatgtggcgtttttaacttc 4620
Query: 4621 ccgcctaatgttcgtcctgtcccactggagatccacattcatggggtggacatattgagt 4680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4621 ccgcctaatgttcgtcctgtcccactggagatccacattcatggggtggacatattgagt 4680
Query: 4681 tttgaagccaggatgcaggcgatgactaagccaacatacactgccatagtacagcatgcc 4740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4681 tttgaagccaggatgcaggcgatgactaagccaacatacactgccatagtacagcatgcc 4740
Query: 4741 aagaacaagaaaccagctatcgtttttgtcccgacccgtaaacatgtccgccttactgct 4800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4741 aagaacaagaaaccagctatcgtttttgtcccgacccgtaaacatgtccgccttactgct 4800
Query: 4801 gtggatctgatagcatactcgcacatggacaacatgaagagccctgatttccttttaggg 4860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4801 gtggatctgatagcatactcgcacatggacaacatgaagagccctgatttccttttaggg 4860
Query: 4861 aatctggaagaattagagccttttttaatacaaatttgtgaggaaactctgaaggagact 4920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4861 aatctggaagaattagagccttttttaatacaaatttgtgaggaaactctgaaggagact 4920
Query: 4921 ttacgccatggcattggctacctgcacgagggtttaagcaatctggatcaggagattgtg 4980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4921 ttacgccatggcattggctacctgcacgagggtttaagcaatctggatcaggagattgtg 4980
Query: 4981 actcagctttttgaagctggacggattcaggtatgtgtaatgtctagttcattgtgttgg 5040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4981 actcagctttttgaagctggacggattcaggtatgtgtaatgtctagttcattgtgttgg 5040
Query: 5041 ggtactccattgaaggcacatttggttgttgtaatgggaacacatttctacgatggacgg 5100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5041 ggtactccattgaaggcacatttggttgttgtaatgggaacacatttctacgatggacgg 5100
Query: 5101 gaaaattctcattcggattaccccatctctaatctgctccaaatgatggggcgtggtagc 5160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5101 gaaaattctcattcggattaccccatctctaatctgctccaaatgatggggcgtggtagc 5160
Query: 5161 cgacctctgcttgacgacgctgggaagtgtgtgatcttctgtcatgcaccacgtaaagag 5220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5161 cgacctctgcttgacgacgctgggaagtgtgtgatcttctgtcatgcaccacgtaaagag 5220
Query: 5221 tattacaagaaatttttgtatgaagctcttccggttgagagtcatcttcaacatttcttg 5280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5221 tattacaagaaatttttgtatgaagctcttccggttgagagtcatcttcaacatttcttg 5280
Query: 5281 catgataatttcaatgcagaagtagttgctagagttatagagaacaaacaagatgctgtg 5340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5281 catgataatttcaatgcagaagtagttgctagagttatagagaacaaacaagatgctgtg 5340
Query: 5341 gattatcttacctggagcttcatgtacaggaggcttccccagaaccctaactactacaat 5400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5341 gattatcttacctggagcttcatgtacaggaggcttccccagaaccctaactactacaat 5400
Query: 5401 ctcctgggagtgagccacagacatttatctgatcacctctcagagctcgttgaaaacact 5460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5401 ctcctgggagtgagccacagacatttatctgatcacctctcagagctcgttgaaaacact 5460
Query: 5461 ttgtctgatcttgaagtgagtaaatgcattgaaatagacaatgagttggatctctctcct 5520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5461 ttgtctgatcttgaagtgagtaaatgcattgaaatagacaatgagttggatctctctcct 5520
Query: 5521 ctcaatcttggtatgattgcgtcatattactacataaattacaccaccattgagcgattc 5580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5521 ctcaatcttggtatgattgcgtcatattactacataaattacaccaccattgagcgattc 5580
Query: 5581 agttctctcttggcttccaagaccaagatgaagggtcttcttgagatcttgacttcagct 5640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5581 agttctctcttggcttccaagaccaagatgaagggtcttcttgagatcttgacttcagct 5640
Query: 5641 tcggagtatgacttgattcctatacgtcctggtgaagaggacgcagttcggagactcatc 5700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5641 tcggagtatgacttgattcctatacgtcctggtgaagaggacgcagttcggagactcatc 5700
Query: 5701 aatcaccagaggttctcttttcaaaacccaagatgcacagaccctcgtgtgaagacaagc 5760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5701 aatcaccagaggttctcttttcaaaacccaagatgcacagaccctcgtgtgaagacaagc 5760
Query: 5761 gcacttcttcaggcgcatttctcaaggcaaaaaatcagcgggaaccttgtaatggatcag 5820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5761 gcacttcttcaggcgcatttctcaaggcaaaaaatcagcgggaaccttgtaatggatcag 5820
Query: 5821 tgtgaggtccttttatcagcaacaaggcttcttcaagcaatggtcgatgtgatatcgagc 5880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5821 tgtgaggtccttttatcagcaacaaggcttcttcaagcaatggtcgatgtgatatcgagc 5880
Query: 5881 aatggctgtctgaatcttgctcttttagctatggaagtaagccagatggtgactcaaggc 5940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5881 aatggctgtctgaatcttgctcttttagctatggaagtaagccagatggtgactcaaggc 5940
Query: 5941 atgtgggatcgagactccatgcttctgcagcttcctcacttcacaaaggacttagccaaa 6000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5941 atgtgggatcgagactccatgcttctgcagcttcctcacttcacaaaggacttagccaaa 6000
Query: 6001 aggtgccatgagaatccggggaataacattgaaaccatatttgatcttgtggaaatggaa 6060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6001 aggtgccatgagaatccggggaataacattgaaaccatatttgatcttgtggaaatggaa 6060
Query: 6061 gatgacaaacgccaagagcttctccaaatgtcagacgctcagcttcttgacattgccaga 6120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6061 gatgacaaacgccaagagcttctccaaatgtcagacgctcagcttcttgacattgccaga 6120
Query: 6121 ttctgcaaccgcttccccaacattgaccttacatatgagattgtgggaagtaacgaggta 6180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6121 ttctgcaaccgcttccccaacattgaccttacatatgagattgtgggaagtaacgaggta 6180
Query: 6181 agccctggaaaagatatcacattgcaggtattactggagagagacatggagggaaggacc 6240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6181 agccctggaaaagatatcacattgcaggtattactggagagagacatggagggaaggacc 6240
Query: 6241 gaggtgggacctgtggacgcgccaagatatcctaagactaaagaagaaggttggtggcta 6300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6241 gaggtgggacctgtggacgcgccaagatatcctaagactaaagaagaaggttggtggcta 6300
Query: 6301 gtcgttggagaagccaagacgaaccagttgatggccatcaagagaatctccctgcaacgg 6360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6301 gtcgttggagaagccaagacgaaccagttgatggccatcaagagaatctccctgcaacgg 6360
Query: 6361 aaggcgcaggtgaagctggagtttgcagtaccaactgaaacaggagagaagtcgtataca 6420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6361 aaggcgcaggtgaagctggagtttgcagtaccaactgaaacaggagagaagtcgtataca 6420
Query: 6421 ctctacttcatgtgcgattcttacttgggttgtgaccaggagtattctttcactgttgat 6480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6421 ctctacttcatgtgcgattcttacttgggttgtgaccaggagtattctttcactgttgat 6480
Query: 6481 gtcaaagattctgatgccgcagatcacatggaagaatgatttatgttttctgattctgca 6540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6481 gtcaaagattctgatgccgcagatcacatggaagaatgatttatgttttctgattctgca 6540
Query: 6541 tcgtagctggagtttgcagtaccaactgaaccaggagagaagtcgtatacactctacttc 6600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6541 tcgtagctggagtttgcagtaccaactgaaccaggagagaagtcgtatacactctacttc 6600
Query: 6601 atgtgtgattcttactttggttgtgaccaggagtagtcttactggtgatatcaaagattc 6660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6601 atgtgtgattcttactttggttgtgaccaggagtagtcttactggtgatatcaaagattc 6660
Query: 6661 tgacgctgcagatcacatggaagaataatttatgttttctgcttagttttcgagtctttc 6720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6661 tgacgctgcagatcacatggaagaataatttatgttttctgcttagttttcgagtctttc 6720
Query: 6721 tttgttcttctggtcataattttcgcatttagctaccgtagttgatcttaccttttgtag 6780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6721 tttgttcttctggtcataattttcgcatttagctaccgtagttgatcttaccttttgtag 6780
Query: 6781 tacaacatttgattagtagattctgcattgtaataatgaaataagaacaaatcgagtact 6840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6781 tacaacatttgattagtagattctgcattgtaataatgaaataagaacaaatcgagtact 6840
Query: 6841 attttattacttagaattttgttggaagcagatgcttttctccgagagcttacatagaca 6900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 6841 attttattacttagaattttgttggaagcagatgcttttct-cgagagcttacatagaca 6899
Query: 6901 atttggt 6907
|||||||
Sbjct: 6900 atttggt 6906
>At1g20960.1 68414.m02624 U5 small nuclear ribonucleoprotein helicase, putative
similar to SP|O75643 U5 small nuclear ribonucleoprotein
200 kDa helicase {Homo sapiens}; contains Pfam profiles
PF00270: DEAD/DEAH box helicase, PF00271: Helicase
conserved C-terminal domain, PF02889: Sec63 domain
Length = 6516
Score = 3642 bits (1837), Expect = 0.0
Identities = 3562/4137 (86%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2383 aagaataatgacctgaaagagcttctgccttatggttttgcaattcatcatgctgggttg 2442
||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2380 aagaatagtgacctaaaagatattctgccttacggttttgcaattcatcatgctgggtta 2439
Query: 2443 acaaggactgatcgtgagatagttgagaatcaatttcgctgggggaatttgcaagtgttg 2502
||||| |||||||||||| ||||||| || ||| |||| || ||||||| |||
Sbjct: 2440 tcaaggggtgatcgtgagattgttgagactcttttttctcaggggcatgtgcaagtcttg 2499
Query: 2503 atttccacggcaactcttgcctggggtgtgaatttgcctgcacatactgtcattatcaaa 2562
||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||
Sbjct: 2500 gtttccacagcaactctcgcatggggtgtgaatctgcctgcacataccgtaattataaaa 2559
Query: 2563 ggaacccaagtatataatcctgagagaggggagtggatggagctgagtcctttagatgtt 2622
|||||||| || ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 2560 ggaacccaggtgtataatcctgaaaaaggggcgtggatggagctgagtcctctagatgtt 2619
Query: 2623 atgcagatgattggtcgtgccggaagacctcaatatgaccaacaaggggagggaataata 2682
||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||
Sbjct: 2620 atgcagatgcttggtcgtgctggaagacctcagtatgatcaacatggggagggtataatt 2679
Query: 2683 atcactggatacagcaagctacagtattatcttcgtttgatgaatgagcaactacctatt 2742
|| ||||| |||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2680 ataactggctacagcgagctgcaatattatctttctttgatgaatgagcaactacctatt 2739
Query: 2743 gaaagccagtttatttccaaacttgctgatcagctcaatgctgaaattgtgcttggaacc 2802
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2740 gaaagccagtttatttccaaacttgctgatcagcttaatgctgaaattgtgcttggaacc 2799
Query: 2803 attcagaatgctagagaagcttgccactggcttggctatacatatttatatgtccgcatg 2862
|||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||| |||| |||
Sbjct: 2800 gttcagaatgctagagaggcttgccattggcttggttacacgtatttgtatatccgtatg 2859
Query: 2863 gttcgtaatccgacactgtatggcgtatcgcctgatgcccttgcaaaagacttgctattg 2922
||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | |||
Sbjct: 2860 gttcgtaatccaacgttgtatggcttagcgcctgatgcccttgcaaaagacgtagttttg 2919
Query: 2923 gaggagagaagagctgatctgatacattctgctgccactatcttggacaagaacaacctg 2982
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||
Sbjct: 2920 gaggagagaagagctgacctgatacattcggctgctactatcttggacaaaaacaacttg 2979
Query: 2983 attaagtacgacaggaaaagtggacacttccaggttactgatttgggacgcattgctagc 3042
||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || |||
Sbjct: 2980 gttaagtatgacaggaaaagtggatacttccaagttacagatttgggacgcatagcaagc 3039
Query: 3043 tactactacataagccatggaacaatagctgcatacaatgagaatctgaagccaacaatg 3102
||||| ||||||| |||||| || |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct: 3040 tactattacataacccatgggaccatagctacatacaatgagcatttgaagccaacaatg 3099
Query: 3103 aatgatatagagctttgtcgtctgttctctctgagtgaggagttcaagtatgtcactgtt 3162
||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct: 3100 ggtgatatagatctttatcgtctgttctccctgagtgacgagttcaagtatgtgactgtt 3159
Query: 3163 cgacaagatgagaagatggaactggcaaagcttttggatcgtgtaccaattccggtaaag 3222
|| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| | |||
Sbjct: 3160 cggcaagatgagaagatggaactggcgaaacttttggatcgtgtcccaattccgatcaag 3219
Query: 3223 gaaacactagaagatcccagtgcaaagatcaacgttttgctgcaagtatatatttcaaag 3282
||||| | || || |||||||| || || || || |||||||| | |||||||||| ||
Sbjct: 3220 gaaactttggaggagcccagtgccaaaataaatgtattgctgcaggcatatatttcacag 3279
Query: 3283 ctaaagctcgagggtctttctttgacatctgacatggtttatattacccaaagtgctgga 3342
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||
Sbjct: 3280 ctaaagcttgagggtctttctttgacatctgacatggtttacattacgcagagtgctgga 3339
Query: 3343 cgtttgttacgagctatttttgagattgtgttgaagagggggtgggctcaactgtctcag 3402
||| | | |||||| ||| ||| ||||| |||||| |||| ||||||||| || | ||
Sbjct: 3340 cgtcttgtgcgagctctttatgaaattgtattgaagcggggatgggctcaattggcagag 3399
Query: 3403 aaagctctcaacttgtctaaaatggtagggaagaggatgtggagtgttcagacacccctc 3462
|| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3400 aaggctctgaacttgtctaaaatggtagggaagaggatgtggagtgttcagacacccctg 3459
Query: 3463 tggcagtttcctggaattcccaaggagattctgatgaagttggagaaaaacgatctggtg 3522
| ||||||| |||| | |||| || ||| ||||| |||||||||| || ||| |||||
Sbjct: 3460 cgtcagtttcatggactctccaatgatattttgatgcagttggagaagaaggatttggtg 3519
Query: 3523 tgggagaggtactatgatctatcttcacaggagctaggagagcttatttgtaatcctaag 3582
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||
Sbjct: 3520 tgggagaggtactatgatctatccgcacaggagctaggagagcttattcgcagtcctaag 3579
Query: 3583 atgggcagaccacttcacaagtatatccatcagttcccaaaactgaaacttgcagcacat 3642
||||||| || |||||||||| || || |||||||||||| ||| ||| | ||||||
Sbjct: 3580 atgggcaagccgcttcacaagttcattcaccagttcccaaaagtgactctttctgcacat 3639
Query: 3643 gttcagccgatttctcgttctgttctgcaggttgagctcacggtgacacctgatttccac 3702
|||||||| ||| |||| |||||||| | || ||||| || || |||||||||||||
Sbjct: 3640 gttcagcctattactcgcactgttctgaatgtggagcttacagttacacctgatttcctg 3699
Query: 3703 tgggatgacaaagcaaataaatatgttgaaccgttttggataattgtggaagacaatgat 3762
||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3700 tgggacgagaaaattcataaatatgttgagccgttttggataattgtggaagacaatgat 3759
Query: 3763 ggtgaaaagatccttcatcatgagtactttctttttaaaaaacgggttattgatgaggac 3822
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || | | ||||||||||||
Sbjct: 3760 ggtgaaaagatccttcatcacgagtattttcttttgaagaagcagtatattgatgaggat 3819
Query: 3823 cacactttgaacttcactgtaccaatctctgagccaattcccccacagtatttcatccga 3882
||||||||| |||||||||| ||||| | ||| || | || || |||||||| | |||
Sbjct: 3820 cacactttgcacttcactgtgccaatttttgaaccgttgccacctcagtattttgttcga 3879
Query: 3883 gtggtttcagacaaatggcttgactcgccgactgtgttacctgtatctttcaggcatctt 3942
|||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 3880 gtggtttcagacaagtggcttggctcggagactgtgttgcctgtatctttcaggcatctt 3939
Query: 3943 attcttccagaaaaatacccaccacctacagagctactggatttgcagcccctcccggtg 4002
||||||||||| || || ||||| || |||||| ||||||| ||||| || ||||| |||
Sbjct: 3940 attcttccagagaagtatccacctccgacagagttactggacttgcaacctctcccagtg 3999
Query: 4003 atggccctaagaaatccttcttatgaaactctttatcaggatttcaagcatttcaatcca 4062
| ||| ||||| ||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4000 acggcgctaaggaatccgaattatgagatactctatcaggatttcaagcatttcaatcca 4059
Query: 4063 gtgcagactcaggtctttactgttttgtataacacaagtgacaatgtagtggttgctgct 4122
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||
Sbjct: 4060 gtgcagactcaggtctttactgttttgtataacactaacgacaatgtgttggttgctgct 4119
Query: 4123 ccaacaggaagtgggaagactatatgtgcggagtttgctatattaaggaatcatctcgaa 4182
||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||
Sbjct: 4120 ccaacgggaagtgggaaaactatttgtgcggagttcgctattttgaggaatcatcatgaa 4179
Query: 4183 ggacctgattctgcaatgcgtgttgtctatatagcacctcttgaggctattgccaaggag 4242
||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 4180 ggacctgatgctacaatgcgtgttgtttatattgcaccacttgaggctattgccaaggag 4239
Query: 4243 cagtttcgtgattgggagaaaaagttcggaaaggggcttggtttacgggttgttgagtta 4302
||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 4240 cagtttcgtatctgggaggggaagtttgggaagggtcttggtttacgggttgttgagcta 4299
Query: 4303 actggggagacattattggatcttaagttgcttgagaaaggtcagataatcataagtact 4362
|||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 4300 actggggagacagcattggatcttaagctgcttgagaaaggccagataatcataagtact 4359
Query: 4363 cctgagaaatgggacgctctgtcccggaggtggaaacagagaaaatatatccagcaggtt 4422
|||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | || || |||
Sbjct: 4360 cctgagaaatgggatgctctttcccgcaggtggaaacagagaaaatatgttcaacaagtt 4419
Query: 4423 agtttgtttatcgttgacgagcttcatttaattgggggtcaaggtggtcaagtgttggag 4482
||| | || ||||| ||||| || ||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||
Sbjct: 4420 agtcttttcatcgtcgacgaactccatctaattggaggtcaacatggtccagtgttggag 4479
Query: 4483 gtaattgtctctagaatgagatatatttcaagtcaggttgggaataaaatcaggattgtt 4542
||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct: 4480 gtaatcgtttccagaatgagatatatttcaagtcaggtcattaataagatcaggattgtt 4539
Query: 4543 gcattatcaacttcccttgcaaatgccaaagatcttggagagtggattggggccagttca 4602
|| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 4540 gcgctatccacttcgcttgcaaatgcaaaagatcttggggagtggattggggccagttcc 4599
Query: 4603 tgtggcgtttttaacttcccgcctaatgttcgtcctgtcccactggagatccacattcat 4662
||| |||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 4600 cacggccttttcaacttccctcccggagtccgtcctgttccactggagatccacattcag 4659
Query: 4663 ggggtggacatattgagttttgaagccaggatgcaggcgatgactaagccaacatacact 4722
|| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||
Sbjct: 4660 ggagtggatatatccagttttgaagccaggatgcaggcgatgaccaaaccaacctacacc 4719
Query: 4723 gccatagtacagcatgccaagaacaagaaaccagctatcgtttttgtcccgacccgtaaa 4782
|||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||
Sbjct: 4720 gccatagttcagcacgccaagaacaagaagccggctattgttttcgtcccaacccgtaaa 4779
Query: 4783 catgtccgccttactgctgtggatctgatagcatactcgcacatggacaacatgaagagc 4842
||||||||| | ||||||||||||||||| || || || |||||||| ||| | ||||
Sbjct: 4780 catgtccgcttgactgctgtggatctgatggcttattctcacatggataacccgcagagt 4839
Query: 4843 cctgatttccttttagggaatctggaagaattagagccttttttaatacaaatttgtgag 4902
||||||||| | |||||||| ||||||||| | || |||||| | |||||| | |||
Sbjct: 4840 cctgatttcttgttagggaagctggaagaactggacccttttgttgaacaaatccgcgag 4899
Query: 4903 gaaactctgaaggagactttacgccatggcattggctacctgcacgagggtttaagcaat 4962
||||| ||||||||||| | | ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| |
Sbjct: 4900 gaaacactgaaggagacactgtgtcatggtattggatacttgcatgagggtttaagcagt 4959
Query: 4963 ctggatcaggagattgtgactcagctttttgaagctggacggattcaggtatgtgtaatg 5022
|||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct: 4960 ctggatcaggagattgtgacacagctctttgaagctggacggattcaggtttgtgtgatg 5019
Query: 5023 tctagttcattgtgttggggtactccattgaaggcacatttggttgttgtaatgggaaca 5082
||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| || |||||||||||
Sbjct: 5020 agcagttcattgtgttggggcactccattaactgcgcatttggtggtcgtaatgggaacg 5079
Query: 5083 catttctacgatggacgggaaaattctcattcggattaccccatctctaatctgctccaa 5142
|| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| || || || ||||||| ||
Sbjct: 5080 cagtattacgatgggagggaaaattcacattctgattatccagtccctgatctgcttcag 5139
Query: 5143 atgatggggcgtggtagccgacctctgcttgacgacgctgggaagtgtgtgatcttctgt 5202
||||||||||||| ||||||||| || |||||| | || ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 5140 atgatggggcgtgctagccgaccacttcttgacaatgccgggaagtgtgtgatcttttgt 5199
Query: 5203 catgcaccacgtaaagagtattacaagaaatttttgtatgaagctcttccggttgagagt 5262
|||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||| | || || || |||
Sbjct: 5200 catgcaccgcggaaggagtattacaagaagtttttgtacgaagccttccctgtggaaagt 5259
Query: 5263 catcttcaacatttcttgcatgataatttcaatgcagaagtagttgctagagttatagag 5322
|| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||
Sbjct: 5260 cagctccagcatttcttgcatgataatttcaacgcagaagtggttgctggggttatagag 5319
Query: 5323 aacaaacaagatgctgtggattatcttacctggagcttcatgtacaggaggcttccccag 5382
||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5320 aacaagcaagatgccgtggattatcttacatggactttcatgtacaggaggcttccccag 5379
Query: 5383 aaccctaactactacaatctcctgggagtgagccacagacatttatctgatcacctctca 5442
|||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||
Sbjct: 5380 aaccctaactactacaatctccaaggtgttagccacaggcatttgtctgatcacctatca 5439
Query: 5443 gagctcgttgaaaacactttgtctgatcttgaagtgagtaaatgcattgaaatagacaat 5502
||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||
Sbjct: 5440 gagctggttgagaacaccttgtctgatcttgaagccagtaaatgcattgaggtagaggat 5499
Query: 5503 gagttggatctctctcctctcaatcttggtatgattgcgtcatattactacataaattac 5562
||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| | |||
Sbjct: 5500 gagatggaactctctcctctcaaccttggtatgattgcatcctattattacatcagttat 5559
Query: 5563 accaccattgagcgattcagttctctcttggcttccaagaccaagatgaagggtcttctt 5622
|||||||||||||| |||||||| || ||| |||| || |||||||||||||| ||||||
Sbjct: 5560 accaccattgagcgcttcagttcactgttgtcttctaaaaccaagatgaagggacttctt 5619
Query: 5623 gagatcttgacttcagcttcggagtatgacttgattcctatacgtcctggtgaagaggac 5682
|| ||||| || || ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct: 5620 gaaatcttaacatcggcttcagagtatgacatgattcctatacggcctggcgaagaggac 5679
Query: 5683 gcagttcggagactcatcaatcaccagaggttctcttttcaaaacccaagatgcacagac 5742
| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||
Sbjct: 5680 accgttcgaagattaatcaatcaccagaggttctcttttgaaaacccaaaatgcacagac 5739
Query: 5743 cctcgtgtgaagacaagcgcacttcttcaggcgcatttctcaaggcaaaaaatcagcggg 5802
|||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct: 5740 cctcatgtgaaggcaaacgcgcttcttcaggcgcatttctcaaggcaaaacattggcggg 5799
Query: 5803 aaccttgtaatggatcagtgtgaggtccttttatcagcaacaaggcttcttcaagcaatg 5862
||| | | |||||||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||
Sbjct: 5800 aacttggcaatggatcagcgtgatgtccttctatctgcaaccagacttcttcaagcgatg 5859
Query: 5863 gtcgatgtgatatcgagcaatggctgtctgaatcttgctcttttagctatggaagtaagc 5922
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 5860 gtcgatgtgatatcaagcaatggctggctgaatcttgctctgctagctatggaagtaagc 5919
Query: 5923 cagatggtgactcaaggcatgtgggatcgagactccatgcttctgcagcttcctcacttc 5982
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 5920 cagatggtgactcaaggcatgtgggagcgggactccatgcttctgcagctccctcacttc 5979
Query: 5983 acaaaggacttagccaaaaggtgccatgagaatccggggaataacattgaaaccatattt 6042
||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||
Sbjct: 5980 acaaaagacttggccaagaggtgccaggagaatccagggaaaaacattgaaaccgtattc 6039
Query: 6043 gatcttgtggaaatggaagatgacaaacgccaagagcttctccaaatgtcagacgctcag 6102
||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct: 6040 gatcttgtggagatggaggatgaagaacgccaagagcttctcaagatgtcagacgctcag 6099
Query: 6103 cttcttgacattgccagattctgcaaccgcttccccaacattgaccttacatatgagatt 6162
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||
Sbjct: 6100 cttctagacattgccagattctgcaaccgcttcccaaacatcgaccttacttacgagatt 6159
Query: 6163 gtgggaagtaacgaggtaagccctggaaaagatatcacattgcaggtattactggagaga 6222
||||| ||| | ||||| | ||| || ||||| | |||||||| || | || ||||||
Sbjct: 6160 gtgggcagtgaagaggtgaacccagggaaagaggttacattgcaagtgatgcttgagaga 6219
Query: 6223 gacatggagggaaggaccgaggtgggacctgtggacgcgccaagatatcctaagactaaa 6282
||||||||||| ||||| || |||||||||||||| | | || ||||| ||||| |||
Sbjct: 6220 gacatggaggggaggacagaagtgggacctgtggattcactgaggtatcccaagaccaaa 6279
Query: 6283 gaagaaggttggtggctagtcgttggagaagccaagacgaaccagttgatggccatcaag 6342
|||||||| |||||||| ||||| || || ||||||| ||||||||| |||| ||||||
Sbjct: 6280 gaagaaggatggtggctggtcgtgggcgacaccaagacaaaccagttgctggcaatcaag 6339
Query: 6343 agaatctccctgcaacggaaggcgcaggtgaagctggagtttgcagtaccaactgaaaca 6402
| |||| |||||||||| | | ||||||||||||| || ||| ||| | |||| ||
Sbjct: 6340 cgtgtctcattgcaacggaaagtgaaggtgaagctggatttcacagcaccgagtgaacca 6399
Query: 6403 ggagagaagtcgtatacactctacttcatgtgcgattcttacttgggttgtgaccaggag 6462
||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||
Sbjct: 6400 ggagagaagtcatacacactatacttcatgtgtgactcttacttggggtgtgaccaagag 6459
Query: 6463 tattctttcactgttgatgtcaaagattctgatgccgcagatcacatggaagaatga 6519
|| || ||| ||||||||||||||| || | || | ||||| |||||||||||||
Sbjct: 6460 tactcgttctctgttgatgtcaaaggatccggcgctggagatcgcatggaagaatga 6516
Score = 961 bits (485), Expect = 0.0
Identities = 956/1113 (85%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1231 ggagacagaggcatgagagatgttgatgatttagatttggagaatggttggttgaagggc 1290
|||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||| |||||||
Sbjct: 1228 ggaggcagaggcaggagagatgttgctgatagagattcagagagtgggtgggtgaagggt 1287
Query: 1291 cagcgtcaggtgatggacctggagagccttgcttttaaccaaggtggtttcacgagggag 1350
||||||||| || |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| | || || |
Sbjct: 1288 cagcgtcagatgctggacctggagagcttggcttttgaccaaggtggtcttctgatggcg 1347
Query: 1351 aataacaagtgtgagcttcctgatcgctctttcagaatacgtggcaaggaatttgatgag 1410
||||| |||||||| || || | |||||| ||||| | |||||||| || ||||||
Sbjct: 1348 aataagaagtgtgacctcccccctggctcttacagaagtcatggcaagggatatgatgaa 1407
Query: 1411 gttcatgtgccgtgggtttctaaaaagtttgatagtaatgaaaagcttgtgaaaattagc 1470
||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||
Sbjct: 1408 gttcatgtgccttgggtttctaaaaaggttgataggaatgagaagctagtgaagattacg 1467
Query: 1471 gatttgccagagtgggcccaaccagcttttaggggaatgcagcagttgaatagggttcag 1530
|| |||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct: 1468 gaaatgcctgattgggcgcaaccggcttttaagggaatgcaacagttgaacagggttcag 1527
Query: 1531 agcaaagtgtacggcactgctctttttaaggctgacaacattcttctttgtgctccaact 1590
||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||
Sbjct: 1528 agcaaagtgtatgacactgcgcttttcaaggcagagaatattcttctttgtgctccaact 1587
Query: 1591 ggtgctgggaagaccaatgttgccgtgctcaccatactgcaccagcttggattgaatatg 1650
||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | |||||| |
Sbjct: 1588 ggtgctgggaaaaccaatgttgctatgctcaccatactgcagcaacttgaaatgaatagg 1647
Query: 1651 aaccctggtggaacgtttaatcatggtaattacaaaattgtctatgttgcaccaatgaaa 1710
||| | | |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 1648 aacacagatggaacttataaccatggagattacaaaattgtctatgttgcacccatgaaa 1707
Query: 1711 gcccttgttgctgaggtcgtggatagtctatctcaacgtttgaaggattttggagttact 1770
|||||||||||||| || || | || | | ||| | ||| ||||||||| |||||||| |
Sbjct: 1708 gcccttgttgctgaagttgtaggtaatttgtctaatcgtctgaaggattatggagttatt 1767
Query: 1771 gtgaaggaactcagtggggatcagtcccttactgggcaagaaatcaaagagactcagata 1830
|||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||
Sbjct: 1768 gtgagagaactcagtggggatcagtccctaaccggaagagaaattgaagagactcagata 1827
Query: 1831 attgttacaacgccagagaagtgggatatcatcaccaggaaatctggagatcgcacttat 1890
||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||
Sbjct: 1828 attgttacaacaccagagaaatgggatatcatcactaggaagtctggagaccgaacttat 1887
Query: 1891 acacagcttgtgaggcttcttataatcgacgaaattcatcttcttgatgataatcgaggg 1950
|| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||||||||
Sbjct: 1888 actcagcttgtgagacttcttataattgatgaaattcatctccttcatgacaatcgaggg 1947
Query: 1951 cctgtgcttgaaagtattgtcgctaggactcttaggcagattgaaagcacaaaggagcat 2010
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||| ||
Sbjct: 1948 cctgtgcttgaaagcattgttgctaggactcttaggcaaattgaaaccacgaaagagaat 2007
Query: 2011 attcgtctggtaggtttatctgcaacactgccaaattgtgacgatgtggcttcatttttg 2070
||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| || ||||| | |||||||
Sbjct: 2008 attcgtctggttggtttatctgctacattgccaaattatgaagacgtggccttatttttg 2067
Query: 2071 cgagtggatcttaaaaatgggttgtttatatttgaccgtagctacagacctgtgcctctc 2130
|| || |||||||| || || ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct: 2068 cgggttgatcttaagaaaggtttgtttaaatttgaccgcagctacagacccgtgcctctc 2127
Query: 2131 ggtcagcagtatataggaattaatgtgaaaaagccgttacggaggttccagttgatgaat 2190
|||||||||||| ||||| | |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct: 2128 catcagcagtatattggaatcagtgtgaagaaaccgttgcagaggttccagttgatgaat 2187
Query: 2191 gatatatgttatcagaaagtagtggctgttgctggaaaacaccaggtccttatttttgtt 2250
||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 2188 gatctttgttatcagaaagtattggctggtgctggaaagcaccaggtccttatttttgtt 2247
Query: 2251 cattcgaggaaggaaacagcaaaaactgcaagggcaatacgggacacagctatggcaaat 2310
||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||| || ||||| ||
Sbjct: 2248 cattcaaggaaggaaacatcaaaaactgctagagcaataagggacactgcaatggcgaac 2307
Query: 2311 gataccctcagcagattcttgaaggaagatagt 2343
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2308 gataccctcagcagattcttgaaggaagatagt 2340
Score = 305 bits (154), Expect = 3e-81
Identities = 313/366 (85%)
Strand = Plus / Plus
Query: 804 tcttaatgttctggatattgatgcttattggcttcagagaaagatatctcaagaatatga 863
||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||
Sbjct: 804 tcttaatgttcaagacattgatgcatattggctccagagaaagatctctcaagcgtatga 863
Query: 864 gcagaagattgatgcacaagagtgccaggaactcgcagaagagctgcttaagatacttgc 923
||| |||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||
Sbjct: 864 acagcagattgatccacaacaatgccaggtactcgcagaagagctactaaagatactcgc 923
Query: 924 tgagggtaatgatagggatgttgagatcaagctgcttgagcaccttcagtttgaaaagtt 983
||| || ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||
Sbjct: 924 tgaaggggatgatagggttgttgaggacaagctgcttatgcaccttcagtacgaaaaatt 983
Query: 984 cagccttgttaaatttctgttgcaaaaccgtcttaaagttgtgtggtgcacccgtttggc 1043
|||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 984 tagccttgtcaagtttctgctgcgtaaccgtcttaaagttgtgtggtgcactcgtttggc 1043
Query: 1044 taggggaagagaccaggaagagaggaatcaaattgaggaggagatgttggggttaggttc 1103
||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |
Sbjct: 1044 tagggcagaagaccaggaagagaggaatagaatcgaggaggagatgagggggttaggccc 1103
Query: 1104 agagttggcagcaattgttaaggagttgcatgccaaaagagcaacagccaaagaaaggga 1163
||||||| |||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||
Sbjct: 1104 agagttgacagcaattgtggagcagttgcatgcaacaagagcaacagcgaaagagaggga 1163
Query: 1164 ggagaa 1169
||||||
Sbjct: 1164 ggagaa 1169
Score = 101 bits (51), Expect = 8e-20
Identities = 147/179 (82%)
Strand = Plus / Plus
Query: 283 cgtcttagggaggtgagtgtacttaatgatacggaggatggtgtttatcagccgaagact 342
||||| ||||| | |||||| || | |||||| || |||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 283 cgtctaagggaagagagtgtgctgactgatactgatgatgcggtttatcagccgaagact 342
Query: 343 aaggaaacaagggttgcttttgagattatgcttggtcttatccagcagcaattgggtggg 402
||||| || |||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||
Sbjct: 343 aaggagacgagggctgcttatgaagccatgcttggtcttatccagaagcagttgggtggg 402
Query: 403 cagcctttggacattgtttgcggtgcggctgatgagattttggcagttcttaagaatga 461
|| ||| | |||||| | ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct: 403 caacctccgagtattgttagtggtgcagcggatgagattttggctgttctcaagaatga 461
Score = 81.8 bits (41), Expect = 7e-14
Identities = 62/69 (89%)
Strand = Plus / Plus
Query: 6567 tgaaccaggagagaagtcgtatacactctacttcatgtgtgattcttactttggttgtga 6626
|||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||
Sbjct: 6393 tgaaccaggagagaagtcatacacactatacttcatgtgtgactcttacttggggtgtga 6452
Query: 6627 ccaggagta 6635
||| |||||
Sbjct: 6453 ccaagagta 6461
Score = 38.2 bits (19), Expect = 0.98
Identities = 49/59 (83%)
Strand = Plus / Plus
Query: 572 aagagggtggtgattctttaagtggtaaagctagtgaggatggaggacttgattatgat 630
||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||| ||| |||||| |||||
Sbjct: 572 aagagggtggtgattctggtggtggtagagctaatgatgatgaagggcttgatgatgat 630
Score = 38.2 bits (19), Expect = 0.98
Identities = 19/19 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 651 tgaagaggatgatgatgag 669
|||||||||||||||||||
Sbjct: 696 tgaagaggatgatgatgag 714
>At2g42280.1 68415.m05233 basic helix-loop-helix (bHLH) family protein
Length = 1614
Score = 153 bits (77), Expect = 2e-35
Identities = 84/85 (98%), Gaps = 1/85 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 6823 aagaacaaatcgagtactattttattacttagaattttgttggaagcagatgcttttctc 6882
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1614 aagaacaaatcgagtactattttattacttagaattttgttggaagcagatgcttttct- 1556
Query: 6883 cgagagcttacatagacaatttggt 6907
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1555 cgagagcttacatagacaatttggt 1531
>At3g28870.1 68416.m03604 hypothetical protein
Length = 1068
Score = 103 bits (52), Expect = 2e-20
Identities = 76/84 (90%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5916 agtaagccagatggtgactcaaggcatgtgggatcgagactccatgcttctgcagcttcc 5975
||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||| |||||| ||
Sbjct: 820 agtaagccagatggtgactcagggcatgtgggagcgggcctctatgcttcggcagctccc 879
Query: 5976 tcacttcacaaaggacttagccaa 5999
|||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 880 tcacttcacaaaggacttggccaa 903
Score = 91.7 bits (46), Expect = 8e-17
Identities = 112/134 (83%)
Strand = Plus / Plus
Query: 6386 cagtaccaactgaaacaggagagaagtcgtatacactctacttcatgtgcgattcttact 6445
||||||| | |||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||
Sbjct: 935 cagtaccgagtgaaccaggagagaagtcatacacactatactttatgtgtgactcttact 994
Query: 6446 tgggttgtgaccaggagtattctttcactgttgatgtcaaagattctgatgccgcagatc 6505
|||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||| ||||| |||| | | |||||
Sbjct: 995 tgggctgtgaccaagagtactctttctcggttgatgacaaaggatctggcgttggagatc 1054
Query: 6506 acatggaagaatga 6519
||||||||||||||
Sbjct: 1055 acatggaagaatga 1068
Score = 81.8 bits (41), Expect = 7e-14
Identities = 110/132 (83%), Gaps = 2/132 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 6557 cagtaccaactgaaccaggagagaagtcgtatacactctacttcatgtgtgattcttact 6616
||||||| | |||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||
Sbjct: 935 cagtaccgagtgaaccaggagagaagtcatacacactatactttatgtgtgactcttact 994
Query: 6617 ttggttgtgaccaggagtagtcttact--ggtgatatcaaagattctgacgctgcagatc 6674
| || |||||||| ||||| |||| || | |||| ||||| |||| || || |||||
Sbjct: 995 tgggctgtgaccaagagtactctttctcggttgatgacaaaggatctggcgttggagatc 1054
Query: 6675 acatggaagaat 6686
||||||||||||
Sbjct: 1055 acatggaagaat 1066
>At2g42280.2 68415.m05234 basic helix-loop-helix (bHLH) family protein
Length = 1662
Score = 87.7 bits (44), Expect = 1e-15
Identities = 51/52 (98%), Gaps = 1/52 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 6856 attttgttggaagcagatgcttttctccgagagcttacatagacaatttggt 6907
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1662 attttgttggaagcagatgcttttct-cgagagcttacatagacaatttggt 1612
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
Posted date: Jun 25, 2004 12:58 PM
Number of letters in database: 44,058,232
Number of sequences in database: 29,161
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 231,692
Number of Sequences: 29161
Number of extensions: 231692
Number of successful extensions: 5612
Number of sequences better than 10.0: 50
length of query: 6907
length of database: 44,058,232
effective HSP length: 19
effective length of query: 6888
effective length of database: 43,504,173
effective search space: 299656743624
effective search space used: 299656743624
T: 0
A: 40
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 18 (36.2 bits)