BLASTN 2.2.3 [Apr-24-2002]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= PTA.sd.2672.C1
(1722 letters)
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
29,161 sequences; 44,058,232 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
At1g50010.1 68414.m05612 tubulin alpha-2/alpha-4 chain (TUA... 3402 0.0
At1g04820.1 68414.m00478 tubulin alpha-2/alpha-4 chain (TUA... 2329 0.0
At4g14960.2 68417.m02299 tubulin alpha-6 chain (TUA6) nearl... 2250 0.0
At4g14960.1 68417.m02298 tubulin alpha-6 chain (TUA6) nearl... 1911 0.0
At1g50020.1 68414.m05613 expressed protein 1752 0.0
>At1g50010.1 68414.m05612 tubulin alpha-2/alpha-4 chain (TUA2) identical to
tubulin alpha-2/alpha-4 chain SP|P29510 GB:P29510 from
[Arabidopsis thaliana]
Length = 1747
Score = 3402 bits (1716), Expect = 0.0
Identities = 1719/1720 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 agaaatcgaaaaaatcagatctagatctaaaagaagagcgtcttcataaacgcccttctt 62
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 agaaatcgaaaaaatcagatctagatctaaaagaagagcgtcttcataaacgcccttctt 60
Query: 63 cttcttcgtcttcttccctgcaaatctagtttctagatcttttctttcttccgcgaaacg 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 cttcttcgtcttcttccctgcaaatctagtttctagatcttttctttcttccgcgaaacg 120
Query: 123 aaaatgagagagtgcatttcgatccacattggtcaggccggtatccaggtcggaaatgct 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 aaaatgagagagtgcatttcgatccacattggtcaggccggtatccaggtcggaaatgct 180
Query: 183 tgctgggagctttactgtcttgaacatggcattcagcctgatggccagatgccgagtgac 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tgctgggagctttactgtcttgaacatggcattcagcctgatggccagatgccgagtgac 240
Query: 243 aagactgttggcggaggtgacgatgctttcaacaccttcttcagtgagaccggtgcaggg 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 aagactgttggcggaggtgacgatgctttcaacaccttcttcagtgagaccggtgcaggg 300
Query: 303 aagcacgtcccacgtgctgtctttgttgatcttgagccaactgtgatcgatgaggtcagg 362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 aagcacgtcccacgtgctgtctttgttgatcttgagccaactgtgatcgatgaggtcagg 360
Query: 363 actggtacttaccgtcagcttttccaccctgagcaactcatcagcggtaaagaagacgca 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 actggtacttaccgtcagcttttccaccctgagcaactcatcagcggtaaagaagacgca 420
Query: 423 gctaacaatttcgcccgtgggcattacaccattgggaaagagattgttgatctgtgcttg 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gctaacaatttcgcccgtgggcattacaccattgggaaagagattgttgatctgtgcttg 480
Query: 483 gaccgtatcagaaagctcgctgataactgtactggtctccaaggattcctcgtcttcaac 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gaccgtatcagaaagctcgctgataactgtactggtctccaaggattcctcgtcttcaac 540
Query: 543 gctgttggtggagggactggatctggtcttggatctctcctccttgagagactttctgtt 602
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gctgttggtggagggactggatctggtcttggatctctcctccttgagagactttctgtt 600
Query: 603 gactacgggaaaaagtccaagctgggtttcacagtttacccatctccacaggtctccacc 662
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gactacgggaaaaagtccaagttgggtttcacagtttacccatctccacaggtctccacc 660
Query: 663 tctgttgttgagccttacaacagtgtcctctccactcactcactcttggaacacactgat 722
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 tctgttgttgagccttacaacagtgtcctctccactcactcactcttggaacacactgat 720
Query: 723 gtctctatcctcctcgacaatgaagctatctatgacatctgcagacgttccctaagcatt 782
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 gtctctatcctcctcgacaatgaagctatctatgacatctgcagacgttccctaagcatt 780
Query: 783 gagagacccacctacaccaacctcaaccgtctcgtctctcaggttatctcatccttgact 842
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 gagagacccacctacaccaacctcaaccgtctcgtctctcaggttatctcatccttgact 840
Query: 843 gcttctctgaggttcgatggtgccttgaatgttgatgtgactgagttccaaaccaacttg 902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 gcttctctgaggttcgatggtgccttgaatgttgatgtgactgagttccaaaccaacttg 900
Query: 903 gtcccatacccaagaatccacttcatgctttcctcctatgccccagtcatctccgcagag 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 gtcccatacccaagaatccacttcatgctttcctcctatgccccagtcatctccgcagag 960
Query: 963 aaggccttccatgagcagctctcggttgctgagatcacaaacagtgcttttgagccagca 1022
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 aaggccttccatgagcagctctcggttgctgagatcacaaacagtgcttttgagccagca 1020
Query: 1023 tccatgatggcaaagtgtgaccctcgtcacggaaagtacatggcttgctgtttgatgtac 1082
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 tccatgatggcaaagtgtgaccctcgtcacggaaagtacatggcttgctgtttgatgtac 1080
Query: 1083 cgtggtgatgtcgtccccaaggatgtgaacgcagctgttggcaccatcaagaccaagcgt 1142
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 cgtggtgatgtcgtccccaaggatgtgaacgcagctgttggcaccatcaagaccaagcgt 1140
Query: 1143 actattcagtttgtggactggtgtcctactggattcaagtgtggaatcaactaccagcca 1202
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 actattcagtttgtggactggtgtcctactggattcaagtgtggaatcaactaccagcca 1200
Query: 1203 ccaactgttgttccaggaggtgatcttgctaaagtccagagagctgtgtgtatgatctca 1262
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1201 ccaactgttgttccaggaggtgatcttgctaaagtccagagagctgtgtgtatgatctca 1260
Query: 1263 aactccaccagtgttgctgaggtgttctcccgtattgatcacaagtttgatcttatgtac 1322
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1261 aactccaccagtgttgctgaggtgttctcccgtattgatcacaagtttgatcttatgtac 1320
Query: 1323 gcaaaacgtgctttcgttcactggtatgtgggtgagggtatggaagaaggagaattttca 1382
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1321 gcaaaacgtgctttcgttcactggtatgtgggtgagggtatggaagaaggagaattttca 1380
Query: 1383 gaggctcgtgaggatcttgcagcattggagaaggattacgaagaggttggtgctgaaggt 1442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1381 gaggctcgtgaggatcttgcagcattggagaaggattacgaagaggttggtgctgaaggt 1440
Query: 1443 ggtgacgatgaggatgatgaaggagaggagtactaagaaggttgtcggttttatgtggga 1502
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1441 ggtgacgatgaggatgatgaaggagaggagtactaagaaggttgtcggttttatgtggga 1500
Query: 1503 tttctattatctcgtgtttgtgtgaataggctcgaaactcttacgagtcgtacttgtgtt 1562
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1501 tttctattatctcgtgtttgtgtgaataggctcgaaactcttacgagtcgtacttgtgtt 1560
Query: 1563 ttcaaaaaccatatttctatctcttgcttgtggcggtagccatttgttctagttcgtttg 1622
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1561 ttcaaaaaccatatttctatctcttgcttgtggcggtagccatttgttctagttcgtttg 1620
Query: 1623 tttctgataatattttcatctccaagaactgaatttaagctgggtttggtttaaatcgat 1682
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1621 tttctgataatattttcatctccaagaactgaatttaagctgggtttggtttaaatcgat 1680
Query: 1683 tgtccaaaatctaaacaaatagaaacgtcaaattgttatt 1722
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1681 tgtccaaaatctaaacaaatagaaacgtcaaattgttatt 1720
>At1g04820.1 68414.m00478 tubulin alpha-2/alpha-4 chain (TUA4) nearly identical to
SP:P29510 Tubulin alpha-2/alpha-4 chain from [Arabidopsis
thaliana]
Length = 1692
Score = 2329 bits (1175), Expect = 0.0
Identities = 1316/1363 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 120 acgaaaatgagagagtgcatttcgatccacattggtcaggccggtatccaggtcggaaat 179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 104 acgaaaatgagagagtgcatttcgatccacattggtcaggctggtatccaggtcggaaat 163
Query: 180 gcttgctgggagctttactgtcttgaacatggcattcagcctgatggccagatgccgagt 239
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 164 gcttgctgggagctgtactgtcttgaacatggcattcagcctgatggccagatgccgagt 223
Query: 240 gacaagactgttggcggaggtgacgatgctttcaacaccttcttcagtgagaccggtgca 299
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 224 gacaagactgttggtggaggtgacgatgctttcaacaccttcttcagtgaaaccggtgca 283
Query: 300 gggaagcacgtcccacgtgctgtctttgttgatcttgagccaactgtgatcgatgaggtc 359
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 284 ggtaagcacgtcccacgtgctgtctttgttgatcttgagccaactgtgatcgacgaggtc 343
Query: 360 aggactggtacttaccgtcagcttttccaccctgagcaactcatcagcggtaaagaagac 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 344 aggactggtacttaccgtcagcttttccaccctgaacaactcatcagcggtaaagaagat 403
Query: 420 gcagctaacaatttcgcccgtgggcattacaccattgggaaagagattgttgatctgtgc 479
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 404 gcagctaacaatttcgcccgtggtcattacaccattgggaaagagattgttgacctgtgc 463
Query: 480 ttggaccgtatcagaaagctcgctgataactgtactggtctccaaggattcctcgtcttc 539
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 464 ttagaccgtatcagaaagcttgctgataactgtactggtctccaaggattcctcgtcttc 523
Query: 540 aacgctgttggtggagggactggatctggtcttggatctctcctccttgagagactttct 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 524 aacgctgttggtggagggactggatctggtcttggatctctcctccttgagagactttct 583
Query: 600 gttgactacgggaaaaagtccaagctgggtttcacagtttacccatctccacaggtctcc 659
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 584 gttgactacgggaaaaagtccaagttgggtttcacagtttacccatctccacaggtctct 643
Query: 660 acctctgttgttgagccttacaacagtgtcctctccactcactcactcttggaacacact 719
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 644 acctccgttgttgagccttacaacagtgtcctctccactcactctctcttggaacacact 703
Query: 720 gatgtctctatcctcctcgacaatgaagctatctatgacatctgcagacgttccctaagc 779
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 704 gatgtctccatcctcctcgacaatgaagctatctatgacatctgcagacgctccctaagc 763
Query: 780 attgagagacccacctacaccaacctcaaccgtctcgtctctcaggttatctcatccttg 839
||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct: 764 attgagagaccaacctacaccaacctcaaccgcctcgtctctcaggttatttcttccttg 823
Query: 840 actgcttctctgaggttcgatggtgccttgaatgttgatgtgactgagttccaaaccaac 899
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 824 actgcttctctgaggtttgatggtgccttaaatgttgatgtcactgagttccaaaccaac 883
Query: 900 ttggtcccatacccaagaatccacttcatgctttcctcctatgccccagtcatctccgca 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 884 ttggtcccatacccaagaatccacttcatgctttcctcctatgccccagtcatctccgca 943
Query: 960 gagaaggccttccatgagcagctctcggttgctgagatcacaaacagtgcttttgagcca 1019
||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 944 gagaaagccttccatgagcaactctcagttgctgagatcacaaacagtgcttttgagcca 1003
Query: 1020 gcatccatgatggcaaagtgtgaccctcgtcacggaaagtacatggcttgctgtttgatg 1079
|| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1004 gcttccatgatggctaagtgtgacccacgtcacggaaagtacatggcttgctgtttgatg 1063
Query: 1080 taccgtggtgatgtcgtccccaaggatgtgaacgcagctgttggcaccatcaagaccaag 1139
|||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1064 taccgtggtgatgttgtccccaaggatgtaaacgcagctgttggcaccatcaagaccaag 1123
Query: 1140 cgtactattcagtttgtggactggtgtcctactggattcaagtgtggaatcaactaccag 1199
|| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 1124 cgcactattcagtttgttgactggtgtcctactggattcaagtgtggtatcaactaccag 1183
Query: 1200 ccaccaactgttgttccaggaggtgatcttgctaaagtccagagagctgtgtgtatgatc 1259
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct: 1184 ccaccaacagttgttccaggaggtgatcttgctaaagtccagagagctgtttgcatgatc 1243
Query: 1260 tcaaactccaccagtgttgctgaggtgttctcccgtattgatcacaagtttgatcttatg 1319
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1244 tcaaactcgaccagtgttgctgaggtgttctcccgtattgatcacaagtttgatcttatg 1303
Query: 1320 tacgcaaaacgtgctttcgttcactggtatgtgggtgagggtatggaagaaggagaattt 1379
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1304 tacgccaaacgtgctttcgttcactggtatgtgggtgagggtatggaagaaggagaattc 1363
Query: 1380 tcagaggctcgtgaggatcttgcagcattggagaaggattacgaagaggttggtgctgaa 1439
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct: 1364 tcagaggcacgtgaggatcttgcagcattggagaaggattatgaagaggtcggtgctgaa 1423
Query: 1440 ggtggtgacgatgaggatgatgaaggagaggagtactaagaag 1482
|||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 1424 ggtggtgacgatgaagatgatgaaggagaggaatactaagaag 1466
Score = 60.0 bits (30), Expect = 7e-08
Identities = 33/34 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 36 aagagcgtcttcataaacgcccttcttcttcttc 69
||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 45 aagagcgtcttcataaacgcccttcgtcttcttc 78
Score = 54.0 bits (27), Expect = 4e-06
Identities = 30/31 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 66 cttcgtcttcttccctgcaaatctagtttct 96
||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 66 cttcgtcttcttccctggaaatctagtttct 96
Score = 34.2 bits (17), Expect = 3.8
Identities = 17/17 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 12 aaaaatcagatctagat 28
|||||||||||||||||
Sbjct: 9 aaaaatcagatctagat 25
>At4g14960.2 68417.m02299 tubulin alpha-6 chain (TUA6) nearly identical to
SP|P29511 Tubulin alpha-6 chain {Arabidopsis thaliana}
Length = 1741
Score = 2250 bits (1135), Expect = 0.0
Identities = 1372/1451 (94%), Gaps = 10/1451 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 32 aaagaagagcgtcttcataaacgcccttcttcttcttcgtcttcttccctgcaaatctag 91
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 28 aaagaagagcgtcttcataaacgccct---------tcgtcttcttccctgcaaatctat 78
Query: 92 tttctagatcttttctttcttccgcgaaacgaaaatgagagagtgcatttcgatccacat 151
||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 79 tttctagatcttt-ctttcttccgcgaaacgacaatgagagagtgcatttcgatccacat 137
Query: 152 tggtcaggccggtatccaggtcggaaatgcttgctgggagctttactgtcttgaacatgg 211
||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 138 tggtcaggctggtattcaagtcggaaatgcttgctgggagctttactgtcttgaacatgg 197
Query: 212 cattcagcctgatggccagatgccgagtgacaagactgttggcggaggtgacgatgcttt 271
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct: 198 cattcagcctgatggccagatgcctggtgacaagactgttggtggaggtgatgatgcttt 257
Query: 272 caacaccttcttcagtgagaccggtgcagggaagcacgtcccacgtgctgtctttgttga 331
|||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 258 caacaccttcttcagtgaaaccggtgcaggtaagcacgtcccacgtgctgtctttgttga 317
Query: 332 tcttgagccaactgtgatcgatgaggtcaggactggtacttaccgtcagcttttccaccc 391
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 318 tcttgagccaactgtgatcgacgaggtcaggactggtacttaccgtcagcttttccaccc 377
Query: 392 tgagcaactcatcagcggtaaagaagacgcagctaacaatttcgcccgtgggcattacac 451
||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 378 tgaacaactcatcagtggtaaagaagacgctgctaacaatttcgcccgtggtcattacac 437
Query: 452 cattgggaaagagattgttgatctgtgcttggaccgtatcagaaagctcgctgataactg 511
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 438 cattgggaaagagattgttgatctctgcttggaccggatcagaaagctcgctgataactg 497
Query: 512 tactggtctccaaggattcctcgtcttcaacgctgttggtggagggactggatctggtct 571
||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 498 tactggtcttcaaggattccttgttttcaacgctgttggtggtgggactggatctggtct 557
Query: 572 tggatctctcctccttgagagactttctgttgactacgggaaaaagtccaagctgggttt 631
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 558 tggatctcttctccttgagagactttctgttgactatgggaaaaagtccaagttgggttt 617
Query: 632 cacagtttacccatctccacaggtctccacctctgttgttgagccttacaacagtgtcct 691
||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 618 cactgtttacccatctccacaggtgtctacctctgtggttgagccttacaacagtgtcct 677
Query: 692 ctccactcactcactcttggaacacactgatgtctctatcctcctcgacaatgaagctat 751
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 678 ctccactcactctctcttggaacacactgatgtctccatcctcctcgacaatgaagctat 737
Query: 752 ctatgacatctgcagacgttccctaagcattgagagacccacctacaccaacctcaaccg 811
|||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 738 ctatgacatctgtagacgctcccttaacattgagagacctacctacaccaacctcaaccg 797
Query: 812 tctcgtctctcaggttatctcatccttgactgcttctctgaggttcgatggtgccttgaa 871
|||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 798 tctcgtctctcaggttatttcttccttgactgcttctctgaggttcgatggtgccttgaa 857
Query: 872 tgttgatgtgactgagttccaaaccaacttggtcccatacccaagaatccacttcatgct 931
||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 858 tgttgatgttactgagttccaaaccaacttggttccatacccaaggatccacttcatgct 917
Query: 932 ttcctcctatgccccagtcatctccgcagagaaggccttccatgagcagctctcggttgc 991
||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct: 918 ttcgtcctatgcaccagtcatctccgcggagaaggccttccatgagcaactctcagttgc 977
Query: 992 tgagatcacaaacagtgcttttgagccagcatccatgatggcaaagtgtgaccctcgtca 1051
||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct: 978 tgagatcacgaacagtgcctttgaacctgcttccatgatggcaaagtgtgacccgcgaca 1037
Query: 1052 cggaaagtacatggcttgctgtttgatgtaccgtggtgatgtcgtccccaaggatgtgaa 1111
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 1038 tggaaagtacatggcttgctgtttgatgtaccgtggtgatgtagtccccaaggatgtgaa 1097
Query: 1112 cgcagctgttggcaccatcaagaccaagcgtactattcagtttgtggactggtgtcctac 1171
|||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 1098 cgcagcggttggcaccatcaagaccaagcgaactattcagtttgttgactggtgtcctac 1157
Query: 1172 tggattcaagtgtggaatcaactaccagccaccaactgttgttccaggaggtgatcttgc 1231
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 1158 tggattcaagtgtggtatcaactaccagccaccaactgttgttcctggaggtgatcttgc 1217
Query: 1232 taaagtccagagagctgtgtgtatgatctcaaactccaccagtgttgctgaggtgttctc 1291
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 1218 taaagtccagagagctgtttgtatgatctcaaactcaaccagtgttgctgaggtattctc 1277
Query: 1292 ccgtattgatcacaagtttgatcttatgtacgcaaaacgtgctttcgttcactggtatgt 1351
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1278 ccgtattgatcacaagtttgatcttatgtacgccaaacgtgctttcgttcactggtatgt 1337
Query: 1352 gggtgagggtatggaagaaggagaattttcagaggctcgtgaggatcttgcagcattgga 1411
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1338 tggtgagggtatggaagaaggagaattctcagaggctcgtgaggatcttgcagcattgga 1397
Query: 1412 gaaggattacgaagaggttggtgctgaaggtggtgacgatgaggatgatgaaggagagga 1471
||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1398 gaaggattatgaagaggtcggtgctgaaggtggtgacgatgaggatgatgaaggagagga 1457
Query: 1472 gtactaagaag 1482
||||||||||
Sbjct: 1458 atactaagaag 1468
Score = 60.0 bits (30), Expect = 7e-08
Identities = 59/68 (86%), Gaps = 3/68 (4%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1531 ggctcgaaactcttacgagtcgtacttgtg---ttttcaaaaaccatatttctatctctt 1587
||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||
Sbjct: 1535 ggctcgaaactcttacgagtcttagttgtgtgtttttctaaacctatatttctatctctt 1594
Query: 1588 gcttgtgg 1595
||| ||||
Sbjct: 1595 gctggtgg 1602
>At4g14960.1 68417.m02298 tubulin alpha-6 chain (TUA6) nearly identical to
SP|P29511 Tubulin alpha-6 chain {Arabidopsis thaliana}
Length = 1656
Score = 1911 bits (964), Expect = 0.0
Identities = 1180/1252 (94%), Gaps = 10/1252 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 32 aaagaagagcgtcttcataaacgcccttcttcttcttcgtcttcttccctgcaaatctag 91
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 28 aaagaagagcgtcttcataaacgccct---------tcgtcttcttccctgcaaatctat 78
Query: 92 tttctagatcttttctttcttccgcgaaacgaaaatgagagagtgcatttcgatccacat 151
||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 79 tttctagatcttt-ctttcttccgcgaaacgacaatgagagagtgcatttcgatccacat 137
Query: 152 tggtcaggccggtatccaggtcggaaatgcttgctgggagctttactgtcttgaacatgg 211
||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 138 tggtcaggctggtattcaagtcggaaatgcttgctgggagctttactgtcttgaacatgg 197
Query: 212 cattcagcctgatggccagatgccgagtgacaagactgttggcggaggtgacgatgcttt 271
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct: 198 cattcagcctgatggccagatgcctggtgacaagactgttggtggaggtgatgatgcttt 257
Query: 272 caacaccttcttcagtgagaccggtgcagggaagcacgtcccacgtgctgtctttgttga 331
|||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 258 caacaccttcttcagtgaaaccggtgcaggtaagcacgtcccacgtgctgtctttgttga 317
Query: 332 tcttgagccaactgtgatcgatgaggtcaggactggtacttaccgtcagcttttccaccc 391
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 318 tcttgagccaactgtgatcgacgaggtcaggactggtacttaccgtcagcttttccaccc 377
Query: 392 tgagcaactcatcagcggtaaagaagacgcagctaacaatttcgcccgtgggcattacac 451
||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 378 tgaacaactcatcagtggtaaagaagacgctgctaacaatttcgcccgtggtcattacac 437
Query: 452 cattgggaaagagattgttgatctgtgcttggaccgtatcagaaagctcgctgataactg 511
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 438 cattgggaaagagattgttgatctctgcttggaccggatcagaaagctcgctgataactg 497
Query: 512 tactggtctccaaggattcctcgtcttcaacgctgttggtggagggactggatctggtct 571
||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 498 tactggtcttcaaggattccttgttttcaacgctgttggtggtgggactggatctggtct 557
Query: 572 tggatctctcctccttgagagactttctgttgactacgggaaaaagtccaagctgggttt 631
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 558 tggatctcttctccttgagagactttctgttgactatgggaaaaagtccaagttgggttt 617
Query: 632 cacagtttacccatctccacaggtctccacctctgttgttgagccttacaacagtgtcct 691
||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 618 cactgtttacccatctccacaggtgtctacctctgtggttgagccttacaacagtgtcct 677
Query: 692 ctccactcactcactcttggaacacactgatgtctctatcctcctcgacaatgaagctat 751
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 678 ctccactcactctctcttggaacacactgatgtctccatcctcctcgacaatgaagctat 737
Query: 752 ctatgacatctgcagacgttccctaagcattgagagacccacctacaccaacctcaaccg 811
|||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 738 ctatgacatctgtagacgctcccttaacattgagagacctacctacaccaacctcaaccg 797
Query: 812 tctcgtctctcaggttatctcatccttgactgcttctctgaggttcgatggtgccttgaa 871
|||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 798 tctcgtctctcaggttatttcttccttgactgcttctctgaggttcgatggtgccttgaa 857
Query: 872 tgttgatgtgactgagttccaaaccaacttggtcccatacccaagaatccacttcatgct 931
||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 858 tgttgatgttactgagttccaaaccaacttggttccatacccaaggatccacttcatgct 917
Query: 932 ttcctcctatgccccagtcatctccgcagagaaggccttccatgagcagctctcggttgc 991
||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct: 918 ttcgtcctatgcaccagtcatctccgcggagaaggccttccatgagcaactctcagttgc 977
Query: 992 tgagatcacaaacagtgcttttgagccagcatccatgatggcaaagtgtgaccctcgtca 1051
||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct: 978 tgagatcacgaacagtgcctttgaacctgcttccatgatggcaaagtgtgacccgcgaca 1037
Query: 1052 cggaaagtacatggcttgctgtttgatgtaccgtggtgatgtcgtccccaaggatgtgaa 1111
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 1038 tggaaagtacatggcttgctgtttgatgtaccgtggtgatgtagtccccaaggatgtgaa 1097
Query: 1112 cgcagctgttggcaccatcaagaccaagcgtactattcagtttgtggactggtgtcctac 1171
|||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 1098 cgcagcggttggcaccatcaagaccaagcgaactattcagtttgttgactggtgtcctac 1157
Query: 1172 tggattcaagtgtggaatcaactaccagccaccaactgttgttccaggaggtgatcttgc 1231
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 1158 tggattcaagtgtggtatcaactaccagccaccaactgttgttcctggaggtgatcttgc 1217
Query: 1232 taaagtccagagagctgtgtgtatgatctcaaactccaccagtgttgctgag 1283
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 1218 taaagtccagagagctgtttgtatgatctcaaactcaaccagtgttgctgag 1269
Score = 198 bits (100), Expect = 1e-49
Identities = 112/116 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1367 agaaggagaattttcagaggctcgtgaggatcttgcagcattggagaaggattacgaaga 1426
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 1268 agaaggagaattctcagaggctcgtgaggatcttgcagcattggagaaggattatgaaga 1327
Query: 1427 ggttggtgctgaaggtggtgacgatgaggatgatgaaggagaggagtactaagaag 1482
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 1328 ggtcggtgctgaaggtggtgacgatgaggatgatgaaggagaggaatactaagaag 1383
Score = 60.0 bits (30), Expect = 7e-08
Identities = 59/68 (86%), Gaps = 3/68 (4%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1531 ggctcgaaactcttacgagtcgtacttgtg---ttttcaaaaaccatatttctatctctt 1587
||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||
Sbjct: 1450 ggctcgaaactcttacgagtcttagttgtgtgtttttctaaacctatatttctatctctt 1509
Query: 1588 gcttgtgg 1595
||| ||||
Sbjct: 1510 gctggtgg 1517
>At1g50020.1 68414.m05613 expressed protein
Length = 1779
Score = 1752 bits (884), Expect = 0.0
Identities = 884/884 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 839 gactgcttctctgaggttcgatggtgccttgaatgttgatgtgactgagttccaaaccaa 898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1779 gactgcttctctgaggttcgatggtgccttgaatgttgatgtgactgagttccaaaccaa 1720
Query: 899 cttggtcccatacccaagaatccacttcatgctttcctcctatgccccagtcatctccgc 958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1719 cttggtcccatacccaagaatccacttcatgctttcctcctatgccccagtcatctccgc 1660
Query: 959 agagaaggccttccatgagcagctctcggttgctgagatcacaaacagtgcttttgagcc 1018
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1659 agagaaggccttccatgagcagctctcggttgctgagatcacaaacagtgcttttgagcc 1600
Query: 1019 agcatccatgatggcaaagtgtgaccctcgtcacggaaagtacatggcttgctgtttgat 1078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1599 agcatccatgatggcaaagtgtgaccctcgtcacggaaagtacatggcttgctgtttgat 1540
Query: 1079 gtaccgtggtgatgtcgtccccaaggatgtgaacgcagctgttggcaccatcaagaccaa 1138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1539 gtaccgtggtgatgtcgtccccaaggatgtgaacgcagctgttggcaccatcaagaccaa 1480
Query: 1139 gcgtactattcagtttgtggactggtgtcctactggattcaagtgtggaatcaactacca 1198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1479 gcgtactattcagtttgtggactggtgtcctactggattcaagtgtggaatcaactacca 1420
Query: 1199 gccaccaactgttgttccaggaggtgatcttgctaaagtccagagagctgtgtgtatgat 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1419 gccaccaactgttgttccaggaggtgatcttgctaaagtccagagagctgtgtgtatgat 1360
Query: 1259 ctcaaactccaccagtgttgctgaggtgttctcccgtattgatcacaagtttgatcttat 1318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1359 ctcaaactccaccagtgttgctgaggtgttctcccgtattgatcacaagtttgatcttat 1300
Query: 1319 gtacgcaaaacgtgctttcgttcactggtatgtgggtgagggtatggaagaaggagaatt 1378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1299 gtacgcaaaacgtgctttcgttcactggtatgtgggtgagggtatggaagaaggagaatt 1240
Query: 1379 ttcagaggctcgtgaggatcttgcagcattggagaaggattacgaagaggttggtgctga 1438
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1239 ttcagaggctcgtgaggatcttgcagcattggagaaggattacgaagaggttggtgctga 1180
Query: 1439 aggtggtgacgatgaggatgatgaaggagaggagtactaagaaggttgtcggttttatgt 1498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1179 aggtggtgacgatgaggatgatgaaggagaggagtactaagaaggttgtcggttttatgt 1120
Query: 1499 gggatttctattatctcgtgtttgtgtgaataggctcgaaactcttacgagtcgtacttg 1558
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1119 gggatttctattatctcgtgtttgtgtgaataggctcgaaactcttacgagtcgtacttg 1060
Query: 1559 tgttttcaaaaaccatatttctatctcttgcttgtggcggtagccatttgttctagttcg 1618
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1059 tgttttcaaaaaccatatttctatctcttgcttgtggcggtagccatttgttctagttcg 1000
Query: 1619 tttgtttctgataatattttcatctccaagaactgaatttaagctgggtttggtttaaat 1678
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 999 tttgtttctgataatattttcatctccaagaactgaatttaagctgggtttggtttaaat 940
Query: 1679 cgattgtccaaaatctaaacaaatagaaacgtcaaattgttatt 1722
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 939 cgattgtccaaaatctaaacaaatagaaacgtcaaattgttatt 896
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
Posted date: Jun 25, 2004 12:58 PM
Number of letters in database: 44,058,232
Number of sequences in database: 29,161
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 68,713
Number of Sequences: 29161
Number of extensions: 68713
Number of successful extensions: 4834
Number of sequences better than 10.0: 646
length of query: 1722
length of database: 44,058,232
effective HSP length: 18
effective length of query: 1704
effective length of database: 43,533,334
effective search space: 74180801136
effective search space used: 74180801136
T: 0
A: 40
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 17 (34.2 bits)