BLASTN 2.2.3 [Apr-24-2002]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= PTA.sd.15559.C1
(7280 letters)
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
29,161 sequences; 44,058,232 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
At5g24350.1 68418.m02870 expressed protein weak similarity ... 1.442e+04 0.0
At1g49360.1 68414.m05533 F-box family protein contains Pfam... 40 0.26
At5g61220.1 68418.m07679 complex 1 family protein / LVR fam... 38 1.0
At3g52840.1 68416.m05823 beta-galactosidase, putative / lac... 38 1.0
At3g10010.1 68416.m01201 HhH-GPD base excision DNA repair f... 38 1.0
>At5g24350.1 68418.m02870 expressed protein weak similarity to
neuroblastoma-amplified protein [Homo sapiens] GI:4337460
Length = 7280
Score = 1.442e+04 bits (7276), Expect = 0.0
Identities = 7279/7280 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggaaagtcctggaagaaaagttttgtatgagatacgtcatcatgcttcattgccttat 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atggaaagtcctggaagaaaagttttgtatgagatacgtcatcatgcttcattgccttat 60
Query: 61 gttcctagatatcctcctcttcctcaggcagatggaactaattcgaaaggaggacttcgg 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gttcctagatatcctcctcttcctcaggcagatggaactaattcgaaaggaggacttcgg 120
Query: 121 tcacttgtttccatcaaaggtgttagtcaactcaaggaaaagtggagtgaatactggaat 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 tcacttgtttccatcaaaggtgttagtcaactcaaggaaaagtggagtgaatactggaat 180
Query: 181 ccgaaaaaaactaataagccggtgtcgttatttatttcaccaagaggagaacttgtggct 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ccgaaaaaaactaataagccggtgtcgttatttatttcaccaagaggagaacttgtggct 240
Query: 241 gtcacttctggaaatcacgttactatcttgcgaaaggatgatgattacaggaaaccttgt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gtcacttctggaaatcacgttactatcttgcgaaaggatgatgattacaggaaaccttgt 300
Query: 301 ggcaattttacatccagcatatcaggttcatttacttctggagtatggtccgaaaaacat 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ggcaattttacatccagcatatcaggttcatttacttctggagtatggtccgaaaaacat 360
Query: 361 gatgttcttggtcttgtggatgatagtgagaccctctttttcatcagagctaatggcgaa 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gatgttcttggtcttgtggatgatagtgagaccctctttttcatcagagctaatggcgaa 420
Query: 421 gaaataagtcaggtcacaaaaagaaacttgaaggtttctgcaccagtattaggattaatg 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gaaataagtcaggtcacaaaaagaaacttgaaggtttctgcaccagtattaggattaatg 480
Query: 481 gaggacgactctgatttgcaaccatcatgcttgtgttcgttcagtatacttacgtcagat 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gaggacgactctgatttgcaaccatcatgcttgtgttcgttcagtatacttacgtcagat 540
Query: 541 ggacgtattcatcatgtcgagatcagtagggagccaagtgcttctgccttttccaagcat 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 ggacgtattcatcatgtcgagatcagtagggagccaagtgcttctgccttttccaagcat 600
Query: 601 gcttcaaatagtgtctcaaagcaattccccaaccacgttttctgctttgattaccatcca 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gcttcaaatagtgtctcaaagcaattccccaaccacgttttctgctttgattaccatcca 660
Query: 661 gatctttcttttcttctcattgttggtagtgttgcaggcatatcatcgtcagggagttct 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 gatctttcttttcttctcattgttggtagtgttgcaggcatatcatcgtcagggagttct 720
Query: 721 ggttcatcgtgtatctcgctttggcgtaagtgtcagaatttaggtctggaattgttgtcc 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 ggttcatcgtgtatctcgctttggcgtaagtgtcagaatttaggtctggaattgttgtcc 780
Query: 781 accacaaagtttgatggcgtgtattgtgagaacaaagatgatcagttggcatatccaaag 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 accacaaagtttgatggcgtgtattgtgagaacaaagatgatcagttggcatatccaaag 840
Query: 841 actttaatctcccctcaagggtcacatgttgcaagtcttgatagcaatgggtgcgtgcat 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 actttaatctcccctcaagggtcacatgttgcaagtcttgatagcaatgggtgcgtgcat 900
Query: 901 attttccagttagataaagcaagattgacactttcgtgctgtccttctgaagacagttct 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 attttccagttagataaagcaagattgacactttcgtgctgtccttctgaagacagttct 960
Query: 961 gattcactgaagccagataagtcgctacaaagttggaaagaaagtttaagaaatgtcgta 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 gattcactgaagccagataagtcgctacaaagttggaaagaaagtttaagaaatgtcgta 1020
Query: 1021 gattttacttggtggtctgatcacgcccttgcaattttgaaaaggagcggtaacattagt 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 gattttacttggtggtctgatcacgcccttgcaattttgaaaaggagcggtaacattagt 1080
Query: 1081 atatttgacatcagtaggtgtgttatagttcaagaggatgctaccatttattctatgcct 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 atatttgacatcagtaggtgtgttatagttcaagaggatgctaccatttattctatgcct 1140
Query: 1141 gtcgtggaaagagttcagaaatatgaaggacacatttttcttttagaaagttcaacacag 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 gtcgtggaaagagttcagaaatatgaaggacacatttttcttttagaaagttcaacacag 1200
Query: 1201 gaagcaaaatcagctctggccaatgttgacagggacgcaagtgaatttcatcatactagt 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1201 gaagcaaaatcagctctggccaatgttgacagggacgcaagtgaatttcatcatactagt 1260
Query: 1261 gagcatagtatgttatggaggctaatatcatttactgagaaaacaattcctgaaatgtat 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1261 gagcatagtatgttatggaggctaatatcatttactgagaaaacaattcctgaaatgtat 1320
Query: 1321 aaaatcttagttgagaaatgccaatatcaagaagcgttagatttctctgatagtcatggc 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1321 aaaatcttagttgagaaatgccaatatcaagaagcgttagatttctctgatagtcatggc 1380
Query: 1381 ttggacagagatgaagttttcaagtcaagatggttgaagtcagaaaaaggagtcagtgat 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1381 ttggacagagatgaagttttcaagtcaagatggttgaagtcagaaaaaggagtcagtgat 1440
Query: 1441 gtgagcacgattctatcaaagataaaagataaagcttttgtgctctccgaatgcttagat 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1441 gtgagcacgattctatcaaagataaaagataaagcttttgtgctctccgaatgcttagat 1500
Query: 1501 agaattgggccaacagaagattccatgaaggccttacttgcgcatggactttatctaacc 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1501 agaattgggccaacagaagattccatgaaggccttacttgcgcatggactttatctaacc 1560
Query: 1561 aatcactatgtatttgctaaatctgaagatcaagaatcccaacaactttgggaatttcgt 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1561 aatcactatgtatttgctaaatctgaagatcaagaatcccaacaactttgggaatttcgt 1620
Query: 1621 ttggctaggcttcgtctattacagtttagtgaaaggcttgacacctatttggggataagc 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1621 ttggctaggcttcgtctattacagtttagtgaaaggcttgacacctatttggggataagc 1680
Query: 1681 atgggcagatattctgtgcaggattacagaaaatttcggagtaatcctatcaatcaggct 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1681 atgggcagatattctgtgcaggattacagaaaatttcggagtaatcctatcaatcaggct 1740
Query: 1741 gctatttcacttgctgagagcgggagaataggagccttaaacctgctatttaagcggcat 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1741 gctatttcacttgctgagagcgggagaataggagccttaaacctgctatttaagcggcat 1800
Query: 1801 ccttattcacttgtttcgtttatgctgcaaattttggcagctattcctgaaacagtccct 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1801 ccttattcacttgtttcgtttatgctgcaaattttggcagctattcctgaaacagtccct 1860
Query: 1861 gttgaaacgtatgcacatcttcttccgggaaaatctcctccaaccagtatggcagtgaga 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1861 gttgaaacgtatgcacatcttcttccgggaaaatctcctccaaccagtatggcagtgaga 1920
Query: 1921 gaagaagattgggttgaatgtgagaagatggttaagtttattaataacttgccggagaat 1980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1921 gaagaagattgggttgaatgtgagaagatggttaagtttattaataacttgccggagaat 1980
Query: 1981 ggcaagaatgattctctgattcaaactgagccaattgttagaaggtgtttggggtataat 2040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1981 ggcaagaatgattctctgattcaaactgagccaattgttagaaggtgtttggggtataat 2040
Query: 2041 tggccatcatcagaagaacttgctgcatggtacaaaagtagagctagagatattgattcg 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2041 tggccatcatcagaagaacttgctgcatggtacaaaagtagagctagagatattgattcg 2100
Query: 2101 accactgggctgttagacaactgcatttgcttgattgatattgcatgtcgaaaaggcata 2160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2101 accactgggctgttagacaactgcatttgcttgattgatattgcatgtcgaaaaggcata 2160
Query: 2161 tctgagttggaacagttccatgaggatctatcatacttgcaccagataatttattctgac 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2161 tctgagttggaacagttccatgaggatctatcatacttgcaccagataatttattctgac 2220
Query: 2221 gaaattggaggcgaaatctgcttcagcttaagccttgctgggtgggagcatttatctgat 2280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2221 gaaattggaggcgaaatctgcttcagcttaagccttgctgggtgggagcatttatctgat 2280
Query: 2281 tatgagaaatttaaaataatgcttgaaggggttaaagctgatactgtggttagaagattg 2340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2281 tatgagaaatttaaaataatgcttgaaggggttaaagctgatactgtggttagaagattg 2340
Query: 2341 catgagaaggcaattccatttatgcagaaaaggtttttggggacaaacaaccagaatgtg 2400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2341 catgagaaggcaattccatttatgcagaaaaggtttttggggacaaacaaccagaatgtg 2400
Query: 2401 gagtcctttctagttaaatggctgaaggagatggcagcaaaaagtgatatggatttatgc 2460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2401 gagtcctttctagttaaatggctgaaggagatggcagcaaaaagtgatatggatttatgc 2460
Query: 2461 tcaaaagttattgatgaagggtgcattgatttatatactgtttgtttttttaaggatgat 2520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2461 tcaaaagttattgatgaagggtgcattgatttatatactgtttgtttttttaaggatgat 2520
Query: 2521 gttgaagctgttgattgtgctctgcaatgtttgtatctgtgcaaagttacggataagtgg 2580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2521 gttgaagctgttgattgtgctctgcaatgtttgtatctgtgcaaagttacggataagtgg 2580
Query: 2581 aatgtcatggcaacaatgctatcaaagctaccaaagataaatgataaagctggtgaagac 2640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2581 aatgtcatggcaacaatgctatcaaagctaccaaagataaatgataaagctggtgaagac 2640
Query: 2641 attcagagaagactcaaacgggcagaaggtcatattgaagcagggaggcttttggagttt 2700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2641 attcagagaagactcaaacgggcagaaggtcatattgaagcagggaggcttttggagttt 2700
Query: 2701 tatcaggtccccaaaccaattaactattttcttgaggttcatttggatgaaaaaggtgta 2760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2701 tatcaggtccccaaaccaattaactattttcttgaggttcatttggatgaaaaaggtgta 2760
Query: 2761 aagcagattcttcgactcatgctttcgaaatttgttcgtcgtcaacctggacgatctgat 2820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2761 aagcagattcttcgactcatgctttcgaaatttgttcgtcgtcaacctggacgatctgat 2820
Query: 2821 aatgactgggcatgcatgtggcgtgatctgcgacagttgcaagagaaagccttttatttc 2880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2821 aatgactgggcatgcatgtggcgtgatctgcgacagttgcaagagaaagccttttatttc 2880
Query: 2881 cttgatcttgagtttgtgctaacagaattctgtagaggacttctaaaggctgggaagttt 2940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2881 cttgatcttgagtttgtgctaacagaattctgtagaggacttctaaaggctgggaagttt 2940
Query: 2941 tctctggctagaaattatctcaagggtacaggttcagttgctctgccatcagagaaggca 3000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2941 tctctggctagaaattatctcaagggtacaggttcagttgctctgccatcagagaaggca 3000
Query: 3001 gagagtctggttattaatgcggcaaaggaatacttcttctctgctccgagccttgcttct 3060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3001 gagagtctggttattaatgcggcaaaggaatacttcttctctgctccgagccttgcttct 3060
Query: 3061 gaagaaatatggaaagcaagggagtgcctgaatatattttctagtagccggactgttaaa 3120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3061 gaagaaatatggaaagcaagggagtgcctgaatatattttctagtagccggactgttaaa 3120
Query: 3121 gccgaggacgatatcattgatgcagttaccgttaggcttccaaagcttggggttagtctc 3180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3121 gccgaggacgatatcattgatgcagttaccgttaggcttccaaagcttggggttagtctc 3180
Query: 3181 ttaccagtgcagttcaaacaagtaaaagacccaatggagattattaagatggcaatcacg 3240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3181 ttaccagtgcagttcaaacaagtaaaagacccaatggagattattaagatggcaatcacg 3240
Query: 3241 ggcgatcctgaggcttatctacatggtgaagagcttattgaggttgctaaacttcttggg 3300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3241 ggcgatcctgaggcttatctacatggtgaagagcttattgaggttgctaaacttcttggg 3300
Query: 3301 ttgaattcttcagaagatatatcatctgtgaaagaagctattgctagagaagctgcaatt 3360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3301 ttgaattcttcagaagatatatcatctgtgaaagaagctattgctagagaagctgcaatt 3360
Query: 3361 gcaggggatatgcagctggcttttgatctatgccttgttctaaccaaagaggggcatggt 3420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3361 gcaggggatatgcagctggcttttgatctatgccttgttctaaccaaagaggggcatggt 3420
Query: 3421 cccatttgggatttaggtgctgcaatagcaagaagtcctgcacttgaacacatggatata 3480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3421 cccatttgggatttaggtgctgcaatagcaagaagtcctgcacttgaacacatggatata 3480
Query: 3481 agttctagaaagcagttgcttggttttgctttgggtcactgtgatgatgaatcgattagt 3540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3481 agttctagaaagcagttgcttggttttgctttgggtcactgtgatgatgaatcgattagt 3540
Query: 3541 gagttattgcacgcatggaaagattttgacctgcaaggccagtgcgagactctgggaatg 3600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3541 gagttattgcacgcatggaaagattttgacctgcaaggccagtgcgagactctgggaatg 3600
Query: 3601 ttatctgagtcgaattctcctgagtttcaaaagatggacggtgtttcttgtcttactgat 3660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3601 ttatctgagtcgaattctcctgagtttcaaaagatggacggtgtttcttgtcttactgat 3660
Query: 3661 ttccctcaaatgcttgatggactaagcagtgatcaacaactagatttggatagagccaaa 3720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3661 ttccctcaaatgcttgatggactaagcagtgatcaacaactagatttggatagagccaaa 3720
Query: 3721 gattcaatttcttgtgttgctaaggatatgccggttgatgatagcgtggacttggaatct 3780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3721 gattcaatttcttgtgttgctaaggatatgccggttgatgatagcgtggacttggaatct 3780
Query: 3781 ctgctaaaggaaaatgggaagcttttctcatttgctgcttcacatcttccttggttgctt 3840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3781 ctgctaaaggaaaatgggaagcttttctcatttgctgcttcacatcttccttggttgctt 3840
Query: 3841 aagctgggaagaaataggaaactggataaaagtctagtgcttgattcaattcctggaaag 3900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3841 aagctgggaagaaataggaaactggataaaagtctagtgcttgattcaattcctggaaag 3900
Query: 3901 cagtttgtcagcataaaagcaactgctctaattaccattctttcctggctggcaaagaat 3960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3901 cagtttgtcagcataaaagcaactgctctaattaccattctttcctggctggcaaagaat 3960
Query: 3961 ggttttgcgccaaaagatgagctgatagccatgattacagactccatcatcgaacatccg 4020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3961 ggttttgcgccaaaagatgagctgatagccatgattacagactccatcatcgaacatccg 4020
Query: 4021 gtaacaaaagaggaagacgtcataggatgctcctttctgttgaatctggtagatgcatct 4080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4021 gtaacaaaagaggaagacgtcataggatgctcctttctgttgaatctggtagatgcatct 4080
Query: 4081 aatgcagtagaagttatagagaagcagttgagaataagggggaactaccaagaaattcga 4140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4081 aatgcagtagaagttatagagaagcagttgagaataagggggaactaccaagaaattcga 4140
Query: 4141 agtatcatgagtctagggatgatatacagtttgctacatgactctggggtagagtgcaca 4200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4141 agtatcatgagtctagggatgatatacagtttgctacatgactctggggtagagtgcaca 4200
Query: 4201 gctcccatccagaggagagaactgctacagaagaactttgagagaaagcaaacagaaagt 4260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4201 gctcccatccagaggagagaactgctacagaagaactttgagagaaagcaaacagaaagt 4260
Query: 4261 ctcgctgatgatatgagcaagatcgacaaacttcaatcaactttttggaaggaatggaag 4320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4261 ctcgctgatgatatgagcaagatcgacaaacttcaatcaactttttggaaggaatggaag 4320
Query: 4321 cataaattagaggaaaaaatgcatgatgctgaccgttctaggatgctggagagaatcatt 4380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4321 cataaattagaggaaaaaatgcatgatgctgaccgttctaggatgctggagagaatcatt 4380
Query: 4381 cctggggttgagactgaaaggtttttgtctcatgatattgaatacattaaggttgctgtt 4440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4381 cctggggttgagactgaaaggtttttgtctcatgatattgaatacattaaggttgctgtt 4440
Query: 4441 ttctctctcattgaatctgtgaaatcagagaagaagctgattttgaaggatgtactaaaa 4500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4441 ttctctctcattgaatctgtgaaatcagagaagaagctgattttgaaggatgtactaaaa 4500
Query: 4501 ttagctgatacatatggcttgaagcaatcagaggtgatattaaggtatttaagctctatc 4560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4501 ttagctgatacatatggcttgaagcaatcagaggtgatattaaggtatttaagctctatc 4560
Query: 4561 ctttgctctgagatttggacaaatgaggacatcacggctgaaattttacaagtcaaggaa 4620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4561 ctttgctctgagatttggacaaatgaggacatcacggctgaaattttacaagtcaaggaa 4620
Query: 4621 gaaatactcacctttgcttcagacaccatagaaaccataagcacaatcgtgtacccagca 4680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4621 gaaatactcacctttgcttcagacaccatagaaaccataagcacaatcgtgtacccagca 4680
Query: 4681 gctagtggtcttaacaaacaacgccttgcttacatatatagcctcctttctgaatgctat 4740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4681 gctagtggtcttaacaaacaacgccttgcttacatatatagcctcctttctgaatgctat 4740
Query: 4741 tgtcatttggcagaaagcaaggaagcatcattgttggttcaaccgaattcttcctttgct 4800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4741 tgtcatttggcagaaagcaaggaagcatcattgttggttcaaccgaattcttcctttgct 4800
Query: 4801 gggttatcaaattggtataacgtccttaagcaagagtgcagtagagtgtcatttatcaaa 4860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4801 gggttatcaaattggtataacgtccttaagcaagagtgcagtagagtgtcatttatcaaa 4860
Query: 4861 gatttggatttcaaaaatatttcagaattgggaggtttgaattttgacagcttcaacaat 4920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4861 gatttggatttcaaaaatatttcagaattgggaggtttgaattttgacagcttcaacaat 4920
Query: 4921 gaagtccatgcgcacatcaatgagatgaacttggaagctttggccaaaatggtagaaact 4980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4921 gaagtccatgcgcacatcaatgagatgaacttggaagctttggccaaaatggtagaaact 4980
Query: 4981 ctaagtggcttatccatggaaaattcgtccaagggtctcatttcctgtcaagatgtctac 5040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4981 ctaagtggcttatccatggaaaattcgtccaagggtctcatttcctgtcaagatgtctac 5040
Query: 5041 aaacaatatattatgaatttgttagatacattggagagtagaagagatcttgattttgga 5100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5041 aaacaatatattatgaatttgttagatacattggagagtagaagagatcttgattttgga 5100
Query: 5101 agtgcagagagtttccagggcttcctcggtcaacttgagaagacatatgaccactgtaga 5160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5101 agtgcagagagtttccagggcttcctcggtcaacttgagaagacatatgaccactgtaga 5160
Query: 5161 gtatatgtcagaatcttggaacctttgcaggctgtggaaatcctgaaacggcatttcacg 5220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5161 gtatatgtcagaatcttggaacctttgcaggctgtggaaatcctgaaacggcatttcacg 5220
Query: 5221 ttagttctaccgccaaatggttcctatatgcacatccctgatagttctacatggcaagaa 5280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5221 ttagttctaccgccaaatggttcctatatgcacatccctgatagttctacatggcaagaa 5280
Query: 5281 tgtcttatcttactgattaacttttggataagattagctgatgagatgcaagaggtaaaa 5340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5281 tgtcttatcttactgattaacttttggataagattagctgatgagatgcaagaggtaaaa 5340
Query: 5341 tcatctaatccaagtttggtggagaatcttaccttgagccctgaatgcattagcagctgt 5400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5341 tcatctaatccaagtttggtggagaatcttaccttgagccctgaatgcattagcagctgt 5400
Query: 5401 tttactctactcataaaacttgtaatgtatgacagtctgtccccaagtcaggcttgggct 5460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5401 tttactctactcataaaacttgtaatgtatgacagtctgtccccaagtcaggcttgggct 5460
Query: 5461 gcaatacttgtctaccttagatctggcttggttggtgattgtgccactgaaatcttcaat 5520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5461 gcaatacttgtctaccttagatctggcttggttggtgattgtgccactgaaatcttcaat 5520
Query: 5521 ttctgcagagccatggtcttctctggttgtggattcgggcccatttctgatgtcttctca 5580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5521 ttctgcagagccatggtcttctctggttgtggattcgggcccatttctgatgtcttctca 5580
Query: 5581 gatatgtcctctcggtatccaacagctttgcaggatcttccacacctgtatttgagtgtc 5640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5581 gatatgtcctctcggtatccaacagctttgcaggatcttccacacctgtatttgagtgtc 5640
Query: 5641 cttgaacctattttacaagatttggtatctggggctcctgaaacacaaaatctttaccgg 5700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5641 cttgaacctattttacaagatttggtatctggggctcctgaaacacaaaatctttaccgg 5700
Query: 5701 ctgctctcttctcttagtaacttggaaggcaacctggaagaactgaaacgtgtcaggctt 5760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5701 ctgctctcttctcttagtaacttggaaggcaacctggaagaactgaaacgtgtcaggctt 5760
Query: 5761 gtagtctggaaacaactcgtaatattttctgagaacctggagttgccaagtcaagttcgc 5820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5761 gtagtctggaaacaactcgtaatattttctgagaacctggagttgccaagtcaagttcgc 5820
Query: 5821 gtctactccttagagcttatgcagttcatctcgggtaagaatatcaagggctcatcgtct 5880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5821 gtctactccttagagcttatgcagttcatctcgggtaagaatatcaagggctcatcgtct 5880
Query: 5881 gagctacaatcaaacgttatgccatgggacggttcggctgagttactatcatctatgcag 5940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5881 gagctacaatcaaacgttatgccatgggacggttcggctgagttactatcatctatgcag 5940
Query: 5941 aagactgaagccgcgcttaaccaagcgttgcctgaccaggctgatggctctagcaggctc 6000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5941 aagactgaagccgcgcttaaccaagcgttgcctgaccaggctgatggctctagcaggctc 6000
Query: 6001 acaaacactctggttgcacttaaatcatctcaggtcgctgtagcagccatctctccaggc 6060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6001 acaaacactctggttgcacttaaatcatctcaggtcgctgtagcagccatctctccaggc 6060
Query: 6061 ctagagatctccccggaggatttatctactgttgagacatctgtttcttgcttctctaaa 6120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6061 ctagagatctccccggaggatttatctactgttgagacatctgtttcttgcttctctaaa 6120
Query: 6121 ctctctgctgctgttactacagcttcacaagctgaagctcttttggctattttggaagga 6180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6121 ctctctgctgctgttactacagcttcacaagctgaagctcttttggctattttggaagga 6180
Query: 6181 tgggaagagctgtttgaagctaagaacgccgaactattgccatctaatgaggcaaccgac 6240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6181 tgggaagagctgtttgaagctaagaacgccgaactattgccatctaatgaggcaaccgac 6240
Query: 6241 caaggaaacgactggggtgatgatgattggaatgatggatgggaaacactgcaggaatca 6300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6241 caaggaaacgactggggtgatgatgattggaatgatggatgggaaacactgcaggaatca 6300
Query: 6301 gaacccgtggagaaagtaaaaaaagaatgcgtagtctcagctcatcctttacattcttgc 6360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6301 gaacccgtggagaaagtaaaaaaagaatgcgtagtctcagctcatcctttacattcttgc 6360
Query: 6361 tggctggatattttcagaaagtacattgcattgtccatgcccgaaaatgtactacaacta 6420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6361 tggctggatattttcagaaagtacattgcattgtccatgcccgaaaatgtactacaacta 6420
Query: 6421 atagatggttctcttcagaagcctgaagaggtgataattgaagaaactgaagcagaaagc 6480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6421 atagatggttctcttcagaagcctgaagaggtgataattgaagaaactgaagcagaaagc 6480
Query: 6481 ctgaccgggatcttagccaggaccgacccatttctcgcactaaagatttctcttttgtta 6540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6481 ctgaccgggatcttagccaggaccgacccatttctcgcactaaagatttctcttttgtta 6540
Query: 6541 ccctacaaacagatcagatctcagtgtctcagtgttgttgaagaacaattgaagcaagaa 6600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6541 ccctacaaacagatcagatctcagtgtctcagtgttgttgaagaacaattgaagcaagaa 6600
Query: 6601 ggcattccggagttatcgagtcagagccatcatgaagttcttctcctggttatatattct 6660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6601 ggcattccggagttatcgagtcagagccatcatgaagttcttctcctggttatatattct 6660
Query: 6661 gggactctctcaacgatcatctccaatgcttgctacggctcagtcttctccttcctctgt 6720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6661 gggactctctcaacgatcatctccaatgcttgctacggctcagtcttctccttcctctgt 6720
Query: 6721 tatctgattggaaagctatctcgagaattccaagaagagcggataacacaagctgacaac 6780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6721 tatctgattggaaagctatctcgagaattccaagaagagcggataacacaagctgacaac 6780
Query: 6781 agagaatcgaatgcaagttccgagagtcggtttatatcatgttttgggcaactcatgctc 6840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 6781 agagaatcgaatgcaagttccgagagtcggtttatatcatgttttgggcaactcatgttc 6840
Query: 6841 ccctgttttgtctcagggcttgttaaggcagatcagcagatattagcggggtttttggtg 6900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6841 ccctgttttgtctcagggcttgttaaggcagatcagcagatattagcggggtttttggtg 6900
Query: 6901 accaagttcatgcacagtaacccatctcttagtctgattaatgttgcagaggcaagtctg 6960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6901 accaagttcatgcacagtaacccatctcttagtctgattaatgttgcagaggcaagtctg 6960
Query: 6961 cggagatacttggataagcagctcgaatctttggagcatttggaggattcgtttgccgag 7020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6961 cggagatacttggataagcagctcgaatctttggagcatttggaggattcgtttgccgag 7020
Query: 7021 agctcagactttgaaacactgaagaatacagtctcaagcctaagaggcacttcaaaggaa 7080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 7021 agctcagactttgaaacactgaagaatacagtctcaagcctaagaggcacttcaaaggaa 7080
Query: 7081 gttatacgatctgcgttagcttctctctctaattgtacaaacagcagatgatttgacaat 7140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 7081 gttatacgatctgcgttagcttctctctctaattgtacaaacagcagatgatttgacaat 7140
Query: 7141 ggaggctttttctgtggcgaaacggtcacaaaaagggagtagtacataggagagggtaaa 7200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 7141 ggaggctttttctgtggcgaaacggtcacaaaaagggagtagtacataggagagggtaaa 7200
Query: 7201 tctgtttatgcgtttttacgtggttaatatagttttttttaacgttattttcgacaagaa 7260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 7201 tctgtttatgcgtttttacgtggttaatatagttttttttaacgttattttcgacaagaa 7260
Query: 7261 aactgtttttgaggtacccc 7280
||||||||||||||||||||
Sbjct: 7261 aactgtttttgaggtacccc 7280
>At1g49360.1 68414.m05533 F-box family protein contains Pfam PF00646: F-box domain
Length = 1572
Score = 40.1 bits (20), Expect = 0.26
Identities = 26/28 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1160 aatatgaaggacacatttttcttttaga 1187
||||||||||||| ||||||||| ||||
Sbjct: 1035 aatatgaaggacatatttttcttgtaga 1062
>At5g61220.1 68418.m07679 complex 1 family protein / LVR family protein contains
Pfam PF05347: Complex 1 protein (LYR family)
Length = 637
Score = 38.2 bits (19), Expect = 1.0
Identities = 19/19 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 358 catgatgttcttggtcttg 376
|||||||||||||||||||
Sbjct: 360 catgatgttcttggtcttg 342
>At3g52840.1 68416.m05823 beta-galactosidase, putative / lactase, putative similar
to beta-galactosidase precursor GI:3869280 from [Carica
papaya]
Length = 2476
Score = 38.2 bits (19), Expect = 1.0
Identities = 25/27 (92%)
Strand = Plus / Minus
Query: 3448 gcaagaagtcctgcacttgaacacatg 3474
|||||||||| || |||||||||||||
Sbjct: 1206 gcaagaagtcttggacttgaacacatg 1180
>At3g10010.1 68416.m01201 HhH-GPD base excision DNA repair family protein similar
to DEMETER protein [Arabidopsis thaliana] GI:21743571;
contains Pfam profile PF00730: HhH-GPD superfamily base
excision DNA repair protein
Length = 4115
Score = 38.2 bits (19), Expect = 1.0
Identities = 19/19 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 2877 tttccttgatcttgagttt 2895
|||||||||||||||||||
Sbjct: 3337 tttccttgatcttgagttt 3319
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
Posted date: Jun 25, 2004 12:58 PM
Number of letters in database: 44,058,232
Number of sequences in database: 29,161
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 238,513
Number of Sequences: 29161
Number of extensions: 238513
Number of successful extensions: 5329
Number of sequences better than 10.0: 30
length of query: 7280
length of database: 44,058,232
effective HSP length: 19
effective length of query: 7261
effective length of database: 43,504,173
effective search space: 315883800153
effective search space used: 315883800153
T: 0
A: 40
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 18 (36.2 bits)