BLASTN 2.2.3 [Apr-24-2002]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= PTA.CL.8.cl.806.Contig1
(1751 letters)
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
29,161 sequences; 44,058,232 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
At5g60390.1 68418.m07574 elongation factor 1-alpha / EF-1-a... 3330 0.0
At1g07940.1 68414.m00863 elongation factor 1-alpha / EF-1-a... 2153 0.0
At1g07920.1 68414.m00861 elongation factor 1-alpha / EF-1-a... 2147 0.0
At1g07930.1 68414.m00862 elongation factor 1-alpha / EF-1-a... 2139 0.0
At1g35550.1 68414.m04414 elongation factor Tu C-terminal do... 381 e-104
>At5g60390.1 68418.m07574 elongation factor 1-alpha / EF-1-alpha identical to
SWISS-PROT:P13905 elongation factor 1-alpha (EF-1-alpha)
[Arabidopsis thaliana]
Length = 1761
Score = 3330 bits (1680), Expect = 0.0
Identities = 1728/1744 (99%)
Strand = Plus / Minus
Query: 8 ttgtcagaaaacactaagcacaagttaattctaacgaaactatagaaccctatctcttac 67
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1761 ttgtcagaaaacactaagcacaagttaattctaacgaaactatagaaccctatctcttac 1702
Query: 68 atagatcttaaaacgctaagtatggttgggttgatctctgaatgattgtttaaacaagaa 127
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1701 atagatcttaaaacgctaagtatggttgggttgatctctgaatgattgtttaaacaagaa 1642
Query: 128 caaagaaagacagcaactttgtaacacaactcctaaataagtttcaagcaaaattatccg 187
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1641 caaagaaagacagcaactttgtaacacaactcctaaataagtttcaagcaaaattatccg 1582
Query: 188 gaaactgcataattgaaaaccataataaaaagtctcagagatatccaaaaaggagggaga 247
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1581 gaaactgcataattgaaaaccataataaaaagtctcagagatatccaaaaaggagggaga 1522
Query: 248 gagaaagtcacagaaataaagagaaaaaagaaaaaggctcaaacgccatcaaagttttaa 307
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1521 gagaaagtcacagaaataaagagaaaaaagaaaaaggctcaaacgccatcaaagttttaa 1462
Query: 308 gaaccaaagaaaaccataagagagtcgatcataacgaaagtctcatcatttggcaccctt 367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1461 gaaccaaagaaaaccataagagagtcgatcataacgaaagtctcatcatttggcaccctt 1402
Query: 368 cttcactgcagccttggtgaccttggctccagttgggtccttcttgtccacgctcttaat 427
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1401 cttcactgcagccttggtgaccttggctccagttgggtccttcttgtccacgctcttaat 1342
Query: 428 aacaccaacagcaacggtctgcctcatgtccctaacagcgaaacgtcccaaaggtgggta 487
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1341 aacaccaacagcaacggtctgcctcatgtccctaacagcgaaacgtcccaaaggtgggta 1282
Query: 488 ctcggagaaagtctcaacaaccatgggcttggttggggtcatcttaaccataccagcgtc 547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1281 ctcggagaaagtctcaacaaccatgggcttggttggggtcatcttaaccataccagcgtc 1222
Query: 548 accattcttcaaaaacttgggctccttctcaatctccttaccagaacgcctgtcaatctt 607
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1221 accattcttcaaaaacttgggctccttctcaatctccttaccagaacgcctgtcaatctt 1162
Query: 608 ggtcaagatctcagagaacttgactgcaatgtgagaggtgtggcaatccaggactggggc 667
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct: 1161 ggtcaagatctcagagaacttgactgcaatgtgagaggtgtggcaatcgagaactggggc 1102
Query: 668 gtaaccgttaccaatctgaccagggtggttcatgatgatgacctgggaggtgaagttagc 727
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 1101 gtaaccgttaccaatctgaccagggtggttcatgatgatgacctgggaggtgaagttggc 1042
Query: 728 agcacccttggcagggtcatccttggagttggaggcgacgtaccctctcttaagatcctt 787
|||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 1041 ggcacccttagctggatcatccttggagttagaggcaacgtatcctctcttaagatcctt 982
Query: 788 gacagcaacattcttaacattgaacccaacgttgtcacctggaagtgcctcaagaagaga 847
||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 981 gacagcaacattcttgacattgaatccaacattgtcaccgggaagtgcctcaagaagaga 922
Query: 848 ctcgtggtgcatctcaacagacttgacctcagtggtcaatcctgtgggagcaaaggtaac 907
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 921 ctcgtggtgcatctcaacagacttaacctcagtggtcaaccctgtgggagcaaaggtaac 862
Query: 908 aaccataccaggcttgatcataccagtctcaacacgtcccactggcaccgttccaatacc 967
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 861 aaccataccaggcttgatcataccagtctcaacacgtcccactggcaccgttccaatacc 802
Query: 968 accaatcttgtagacatcctgaagtggaagacgaaggggcttgtctgatggcctcttggg 1027
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 801 accaatcttgtagacatcctgaagtggaagacgaaggggcttgtctgatggcctcttggg 742
Query: 1028 ctcgttgatctggtcaagagcctcaagaagagttggtcccttgtaccagtcaaggttggt 1087
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 741 ctcgttgatctggtcaagagcctcaagaagagttggtcccttgtaccagtcaaggttggt 682
Query: 1088 tgacctctcaatcatgttgtctccctcgaatccagagattggcacaaatgggattttgtc 1147
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 681 tgacctctcaatcatgttgtctccctcgaatccagagattggcacaaatgggattttgtc 622
Query: 1148 agggttgtatccgaccttcttcaggtatgaagacacctccttgatgatttcatcgtacct 1207
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 621 agggttgtatccgaccttcttcaggtatgaagacacctccttgatgatttcatcgtacct 562
Query: 1208 agccttggagtatttgggggtggtggcatccatcttgttacaacagcaaatcatctgctt 1267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 561 agccttggagtatttgggggtggtggcatccatcttgttacaacagcaaatcatctgctt 502
Query: 1268 gacaccaagggtgaaagcaagaagagcgtgctcacgggtctgaccatccttagagatacc 1327
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 501 gacaccaagggtgaaagcaagaagagcgtgctcacgggtctgaccatccttagagatacc 442
Query: 1328 agcctcaaaacctccagtggtggagtcaatgataagaacagcacaatcagcctgggaggt 1387
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 441 agcctcaaaacctccagtggtggagtcaatgataagaacagcacaatcagcctgggaggt 382
Query: 1388 accagtaatcatgttcttgatgaaatcacgatgtcctggggcatcaatgactgtgcagta 1447
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 381 accagtaatcatgttcttgatgaaatcacgatgtcctggggcatcaatgactgtgcagta 322
Query: 1448 gtacttggtggtctcgaacttccatagagcaatatcgatggtaataccacgctcacgctc 1507
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 321 gtacttggtggtctcgaacttccatagagcaatatcgatggtaataccacgctcacgctc 262
Query: 1508 ggccttaagtttgtccaacacccatgcgtacttgaaggacctcttgttcatctcagcagc 1567
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 261 ggccttaagtttgtccaacacccatgcgtacttgaaggacctcttgttcatctcagcagc 202
Query: 1568 ctccttctcgaacctctcgatgacacgcttgtcaataccaccaagcttatagatcaagtg 1627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 201 ctccttctcgaacctctcgatgacacgcttgtcaataccaccaagcttatagatcaagtg 142
Query: 1628 accagttgtggtcgattttccagaatcaacatgaccaatgaccacaatgttaatgtgaaa 1687
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 141 accagttgtggtcgattttccagaatcaacatgaccaatgaccacaatgttaatgtgaaa 82
Query: 1688 cttctctttacccatagctgcaagtaagaatctgaaaggagtcttgcggctacgaaaatg 1747
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 81 cttctctttacccatagctgcaagtaagaatctgaaaggagtcttgcggctacgaaaatg 22
Query: 1748 tgag 1751
||||
Sbjct: 21 tgag 18
>At1g07940.1 68414.m00863 elongation factor 1-alpha / EF-1-alpha identical to
GB:CAA34456 from [Arabidopsis thaliana] (Plant Mol. Biol.
14 (1), 107-110 (1990))
Length = 1864
Score = 2153 bits (1086), Expect = 0.0
Identities = 1281/1346 (95%)
Strand = Plus / Minus
Query: 357 ttggcacccttcttcactgcagccttggtgaccttggctccagttgggtccttcttgtcc 416
|||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1463 ttggcacccttcttgactgcagccttggtaaccttggctccagttgggtccttcttgtca 1404
Query: 417 acgctcttaataacaccaacagcaacggtctgcctcatgtccctaacagcgaaacgtccc 476
|| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 1403 acactcttgataacaccgactgcaacagtctgcctcatgtccctcacagcgaaacgtcca 1344
Query: 477 aaaggtgggtactcggagaaagtctcaacaaccatgggcttggttggggtcatcttaacc 536
| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct: 1343 agtggtgggtactcagagaaggtctccacaaccatgggcttggttggagtcatcttcacc 1284
Query: 537 ataccagcgtcaccattcttcaaaaacttgggctccttctcaatctccttaccagaacgc 596
|||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1283 ataccagcatcaccattcttcaagaatttaggctccttctcaatctccttaccagaacgc 1224
Query: 597 ctgtcaatcttggtcaagatctcagagaacttgactgcaatgtgagaggtgtggcaatcc 656
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1223 ctgtcaatcttggtcaagatctcagagaacttgactgcaatgtgagaggtgtggcaatcc 1164
Query: 657 aggactggggcgtaaccgttaccaatctgaccagggtggttcatgatgatgacctgggag 716
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1163 aggactggggcgtaaccgttaccaatctgaccagggtggttcatgatgatgacctgggag 1104
Query: 717 gtgaagttagcagcacccttggcagggtcatccttggagttggaggcgacgtaccctctc 776
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 1103 gtgaagttagcagcacccttggcagggtcatccttggagttggatgcgacgtaccctctc 1044
Query: 777 ttaagatccttgacagcaacattcttaacattgaacccaacgttgtcacctggaagtgcc 836
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1043 ttaagatccttgacagcaacattcttaacattgaacccaacgttgtcacctggaagtgcc 984
Query: 837 tcaagaagagactcgtggtgcatctcaacagacttgacctcagtggtcaatcctgtggga 896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 983 tcaagaagagactcgtggtgcatctcaacagacttgacctcagtggtcaatcctgtggga 924
Query: 897 gcaaaggtaacaaccataccaggcttgatcataccagtctcaacacgtcccactggcacc 956
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 923 gcaaaggtcacaaccataccaggcttgatcataccagtctcaacacgtcccactggcacc 864
Query: 957 gttccaataccaccaatcttgtagacatcctgaagtggaagacgaaggggcttgtctgat 1016
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 863 gttccaataccaccaatcttgtagacatcctgaagtgggagacgaaggggcttgtctgac 804
Query: 1017 ggcctcttgggctcgttgatctggtcaagagcctcaagaagagttggtcccttgtaccag 1076
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 803 ggcctcttgggctcgttgatctggtcaagagcctcaaggagagttggtcccttgtaccag 744
Query: 1077 tcaaggttggttgacctctcaatcatgttgtctccctcgaatccagagattggcacaaat 1136
||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct: 743 tcaaggttggtggacctctcaatcatgttgtcaccctcaaatccagagatgggcacaaat 684
Query: 1137 gggattttgtcagggttgtatccgaccttcttcaggtatgaagacacctccttgatgatt 1196
||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 683 gggattttgtcggggttgtaaccaaccttcttcaagtaggaagacacctccttgatgatt 624
Query: 1197 tcatcgtacctagccttggagtatttgggggtggtggcatccatcttgttacaacagcaa 1256
||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 623 tcatcgtacctggccttggagtacttgggggtagtggcatccatcttgttacaacagcag 564
Query: 1257 atcatctgcttgacaccaagggtgaaagcaagaagagcgtgctcacgggtctgaccatcc 1316
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 563 atcatctgcttgacaccaagggtgaaagcaagtagagcgtgctcacgggtctgaccatcc 504
Query: 1317 ttagagataccagcctcaaaacctccagtggtggagtcaatgataagaacagcacaatca 1376
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 503 ttggagataccagcctcaaaaccaccagtggtggagtcaatgataaggacagcacaatca 444
Query: 1377 gcctgggaggtaccagtaatcatgttcttgatgaaatcacgatgtcctggggcatcaatg 1436
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||
Sbjct: 443 gcctgggaggtaccagtgatcatgttcttgatgaaatcacgatggccaggagcatcaatg 384
Query: 1437 actgtgcagtagtacttggtggtctcgaacttccatagagcaatatcgatggtaatacca 1496
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||
Sbjct: 383 acagtgcagtagtacttggtggtctcgaacttccagagagcaatgtcaatggtgatacca 324
Query: 1497 cgctcacgctcggccttaagtttgtccaacacccatgcgtacttgaaggacctcttgttc 1556
||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 323 cgctcacgctcagccttaagtttgtccaaaacccatgcgtacttgaaggacctcttgttc 264
Query: 1557 atctcagcagcctccttctcgaacctctcgatgacacgcttgtcaataccaccaagctta 1616
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||
Sbjct: 263 atctcagcagcctccttctcgaacctctcaatgacacgcttgtcaataccacccaacttg 204
Query: 1617 tagatcaagtgaccagttgtggtcgattttccagaatcaacatgaccaatgaccacaatg 1676
||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||
Sbjct: 203 tagatcaagtgtccagtggtggtcgactttccagaatcgacgtggccaatgaccacaatg 144
Query: 1677 ttaatgtgaaacttctctttacccat 1702
|| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 143 ttgatgtgaaacttctctttacccat 118
>At1g07920.1 68414.m00861 elongation factor 1-alpha / EF-1-alpha identical to
GB:CAA34456 from [Arabidopsis thaliana] (Plant Mol. Biol.
14 (1), 107-110 (1990))
Length = 1782
Score = 2147 bits (1083), Expect = 0.0
Identities = 1278/1343 (95%)
Strand = Plus / Minus
Query: 360 gcacccttcttcactgcagccttggtgaccttggctccagttgggtccttcttgtccacg 419
||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct: 1455 gcacccttcttgacggcagccttggtaaccttggctccggttgggtccttcttgtcaaca 1396
Query: 420 ctcttaataacaccaacagcaacggtctgcctcatgtccctaacagcgaaacgtcccaaa 479
||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct: 1395 ctcttgataacaccgactgcaacagtctgcctcatgtccctcacagcgaaacgtccaagt 1336
Query: 480 ggtgggtactcggagaaagtctcaacaaccatgggcttggttggggtcatcttaaccata 539
||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct: 1335 ggtgggtactcagagaaggtctccacaaccatgggcttggttggagtcatcttcaccata 1276
Query: 540 ccagcgtcaccattcttcaaaaacttgggctccttctcaatctccttaccagaacgcctg 599
||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1275 ccagcatcaccattcttcaagaacttgggctccttctcaatctccttaccagaacgcctg 1216
Query: 600 tcaatcttggtcaagatctcagagaacttgactgcaatgtgagaggtgtggcaatccagg 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1215 tcaatcttggtcaagatctcagagaacttgactgcaatgtgagaggtgtggcaatccagg 1156
Query: 660 actggggcgtaaccgttaccaatctgaccagggtggttcatgatgatgacctgggaggtg 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1155 actggggcgtaaccgttaccaatctgaccagggtggttcatgatgatgacctgggaggtg 1096
Query: 720 aagttagcagcacccttggcagggtcatccttggagttggaggcgacgtaccctctctta 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 1095 aagttagcagcacccttggcagggtcatccttggagttggatgcgacgtaccctctctta 1036
Query: 780 agatccttgacagcaacattcttaacattgaacccaacgttgtcacctggaagtgcctca 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1035 agatccttgacagcaacattcttaacattgaacccaacgttgtcacctggaagtgcctca 976
Query: 840 agaagagactcgtggtgcatctcaacagacttgacctcagtggtcaatcctgtgggagca 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 975 agaagagactcgtggtgcatctcaacagacttgacctcagtggtcaatcctgtgggagca 916
Query: 900 aaggtaacaaccataccaggcttgatcataccagtctcaacacgtcccactggcaccgtt 959
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 915 aaggtcacaaccataccaggcttgatcataccagtctcaacacgtcccactggcaccgtt 856
Query: 960 ccaataccaccaatcttgtagacatcctgaagtggaagacgaaggggcttgtctgatggc 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 855 ccaataccaccaatcttgtagacatcctgaagtgggagacgaaggggcttgtctgacggc 796
Query: 1020 ctcttgggctcgttgatctggtcaagagcctcaagaagagttggtcccttgtaccagtca 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 795 ctcttgggctcgttgatctggtcaagagcctcaaggagagttggtcccttgtaccagtca 736
Query: 1080 aggttggttgacctctcaatcatgttgtctccctcgaatccagagattggcacaaatggg 1139
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 735 aggttggtggacctctcaatcatgttgtcaccctcaaatccagagatgggcacaaatggg 676
Query: 1140 attttgtcagggttgtatccgaccttcttcaggtatgaagacacctccttgatgatttca 1199
|||||||| |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 675 attttgtcggggttgtaaccaaccttcttcaagtaggaagacacctccttgatgatttca 616
Query: 1200 tcgtacctagccttggagtatttgggggtggtggcatccatcttgttacaacagcaaatc 1259
|||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 615 tcgtacctggccttggagtacttgggggtagtggcatccatcttgttacaacagcagatc 556
Query: 1260 atctgcttgacaccaagggtgaaagcaagaagagcgtgctcacgggtctgaccatcctta 1319
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 555 atctgcttgacaccaagggtgaaagcaagtagagcgtgctcacgggtctgaccatccttg 496
Query: 1320 gagataccagcctcaaaacctccagtggtggagtcaatgataagaacagcacaatcagcc 1379
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 495 gagataccagcctcaaaaccaccagtggtggagtcaatgataaggacagcacaatcagcc 436
Query: 1380 tgggaggtaccagtaatcatgttcttgatgaaatcacgatgtcctggggcatcaatgact 1439
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||
Sbjct: 435 tgggaggtaccagtgatcatgttcttgatgaaatcacgatggccaggagcatcaatgaca 376
Query: 1440 gtgcagtagtacttggtggtctcgaacttccatagagcaatatcgatggtaataccacgc 1499
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||
Sbjct: 375 gtgcagtagtacttggtggtctcgaacttccagagagcaatgtcaatggtgataccacgc 316
Query: 1500 tcacgctcggccttaagtttgtccaacacccatgcgtacttgaaggacctcttgttcatc 1559
|||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 tcacgctcagccttaagtttgtccaaaacccatgcgtacttgaaggacctcttgttcatc 256
Query: 1560 tcagcagcctccttctcgaacctctcgatgacacgcttgtcaataccaccaagcttatag 1619
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||
Sbjct: 255 tcagcagcctccttctcgaacctctcaatgacacgcttgtcaataccacccaacttgtag 196
Query: 1620 atcaagtgaccagttgtggtcgattttccagaatcaacatgaccaatgaccacaatgtta 1679
|||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||
Sbjct: 195 atcaagtgcccagtggtggtcgactttccagaatcgacgtggccaatgaccacaatgttg 136
Query: 1680 atgtgaaacttctctttacccat 1702
|||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 atgtgaaacttctctttacccat 113
>At1g07930.1 68414.m00862 elongation factor 1-alpha / EF-1-alpha identical to
GB:CAA34456 from [Arabidopsis thaliana] (Plant Mol. Biol.
14 (1), 107-110 (1990))
Length = 1778
Score = 2139 bits (1079), Expect = 0.0
Identities = 1277/1343 (95%)
Strand = Plus / Minus
Query: 360 gcacccttcttcactgcagccttggtgaccttggctccagttgggtccttcttgtccacg 419
||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct: 1439 gcacccttcttaactgcagccttggtaaccttggctccggttgggtccttcttgtcaaca 1380
Query: 420 ctcttaataacaccaacagcaacggtctgcctcatgtccctaacagcgaaacgtcccaaa 479
||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 1379 ctcttgataacaccgactgcaacagtctgcctcatgtccctaacagcgaaacgtccaagt 1320
Query: 480 ggtgggtactcggagaaagtctcaacaaccatgggcttggttggggtcatcttaaccata 539
||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct: 1319 ggtgggtactcagagaaggtctccacaaccatgggcttggttggagtcatcttcaccata 1260
Query: 540 ccagcgtcaccattcttcaaaaacttgggctccttctcaatctccttaccagaacgcctg 599
||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1259 ccagcatcaccattcttcaagaatttgggctccttctcaatctccttaccagaacgcctg 1200
Query: 600 tcaatcttggtcaagatctcagagaacttgactgcaatgtgagaggtgtggcaatccagg 659
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 1199 tcaatcttggtcaagatctcagagaacttgactgcaatgtgagaggtgtggcaatccaag 1140
Query: 660 actggggcgtaaccgttaccaatctgaccagggtggttcatgatgatgacctgggaggtg 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1139 actggggcgtaaccgttaccaatctgaccagggtggttcatgatgatgacctgggaggtg 1080
Query: 720 aagttagcagcacccttggcagggtcatccttggagttggaggcgacgtaccctctctta 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1079 aagttagcagcacccttggcagggtcatccttggagttggaggcgacgtaccctctctta 1020
Query: 780 agatccttgacagcaacattcttaacattgaacccaacgttgtcacctggaagtgcctca 839
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1019 agatccttcacggcaacattcttaacattgaacccaacgttgtcacctggaagtgcctca 960
Query: 840 agaagagactcgtggtgcatctcaacagacttgacctcagtggtcaatcctgtgggagca 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 959 agaagagactcgtggtgcatctcaacagacttgacctcagtggtcaatcctgtgggagca 900
Query: 900 aaggtaacaaccataccaggcttgatcataccagtctcaacacgtcccactggcaccgtt 959
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 899 aaggtcacaaccataccaggcttgatcataccagtctcaacacgtcccactggcaccgtt 840
Query: 960 ccaataccaccaatcttgtagacatcctgaagtggaagacgaaggggcttgtctgatggc 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 839 ccaataccaccaatcttgtagacatcctgaagtgggagacgaaggggcttgtctgacggc 780
Query: 1020 ctcttgggctcgttgatctggtcaagagcctcaagaagagttggtcccttgtaccagtca 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 779 ctcttgggctcgttgatctggtcaagagcctcaaggagagttggtcccttgtaccagtca 720
Query: 1080 aggttggttgacctctcaatcatgttgtctccctcgaatccagagattggcacaaatggg 1139
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 719 aggttggtggacctctcaatcatgttgtcaccctcaaatccagagatgggcacaaatggg 660
Query: 1140 attttgtcagggttgtatccgaccttcttcaggtatgaagacacctccttgatgatttca 1199
|||||||| |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 659 attttgtcggggttgtaaccaaccttcttcaagtaggaagacacctccttgatgatttca 600
Query: 1200 tcgtacctagccttggagtatttgggggtggtggcatccatcttgttacaacagcaaatc 1259
|||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 599 tcgtacctggccttggagtacttgggggtagtggcatccatcttgttacaacagcagatc 540
Query: 1260 atctgcttgacaccaagggtgaaagcaagaagagcgtgctcacgggtctgaccatcctta 1319
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 539 atctgcttgacaccaagggtgaaagcaaggagagcgtgctcacgggtctgaccatccttg 480
Query: 1320 gagataccagcctcaaaacctccagtggtggagtcaatgataagaacagcacaatcagcc 1379
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 479 gagataccagcctcaaaaccaccagtggtggagtcaatgataaggacagcacaatcagcc 420
Query: 1380 tgggaggtaccagtaatcatgttcttgatgaaatcacgatgtcctggggcatcaatgact 1439
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||
Sbjct: 419 tgggaggtaccagtgatcatgttcttgatgaaatcacgatgaccaggagcatcaatgaca 360
Query: 1440 gtgcagtagtacttggtggtctcgaacttccatagagcaatatcgatggtaataccacgc 1499
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||
Sbjct: 359 gtgcagtagtacttggtggtctcgaacttccagagagcaatgtcaatggtgataccacgc 300
Query: 1500 tcacgctcggccttaagtttgtccaacacccatgcgtacttgaaggacctcttgttcatc 1559
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 299 tcacgctcagccttaagtttgtccaacacccatgcgtacttgaaggacctcttgttcatc 240
Query: 1560 tcagcagcctccttctcgaacctctcgatgacacgcttgtcaataccaccaagcttatag 1619
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||
Sbjct: 239 tcagcagcctccttctcgaacctctcgatcacacgcttgtcaataccacccaacttgtag 180
Query: 1620 atcaagtgaccagttgtggtcgattttccagaatcaacatgaccaatgaccacaatgtta 1679
|||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||
Sbjct: 179 atcaagtgtccagtggttgtcgactttccagaatcgacgtggccaatgaccacaatgttg 120
Query: 1680 atgtgaaacttctctttacccat 1702
|||||||||||||||||||||||
Sbjct: 119 atgtgaaacttctctttacccat 97
>At1g35550.1 68414.m04414 elongation factor Tu C-terminal domain-containing
protein similar to SP|P13905 Elongation factor 1-alpha
(EF-1-alpha) {Arabidopsis thaliana}; contains Pfam
profile PF03143: Elongation factor Tu C-terminal domain
Length = 531
Score = 381 bits (192), Expect = e-104
Identities = 342/392 (87%)
Strand = Plus / Minus
Query: 390 ttggctccagttgggtccttcttgtccacgctcttaataacaccaacagcaacggtctgc 449
||||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||| |||||| ||||||| |||
Sbjct: 527 ttggctccacttgggtccttcttgacaacactcttgataactccaacaccaacggtttgc 468
Query: 450 ctcatgtccctaacagcgaaacgtcccaaaggtgggtactcggagaaagtctcaacaacc 509
||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | ||| ||| |||||| |||
Sbjct: 467 ctcatgtccctaatagcaaaacgtcccaggggtgggtacgcagagtaagcctcaaccacc 408
Query: 510 atgggcttggttggggtcatcttaaccataccagcgtcaccattcttcaaaaacttgggc 569
|| |||||||| || ||||| |||| ||| | || |||| ||||| |||||||| |||
Sbjct: 407 ataggcttggtgggagtcatattaataatagcggcctcactgttctttaaaaactttggc 348
Query: 570 tccttctcaatctccttaccagaacgcctgtcaatcttggtcaagatctcagagaacttg 629
|||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 347 tccttctcaatctcatgaccagtacgccagtcaatcttggtcaagatctcagagaacttg 288
Query: 630 actgcaatgtgagaggtgtggcaatccaggactggggcgtaaccgttaccaatctgacca 689
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| || ||||||||||
Sbjct: 287 actgcaatgtgagaggtgtggcaatcaagaactggggtgtaaccatttttaatctgacca 228
Query: 690 gggtggttcatgatgatgacctgggaggtgaagttagcagcacccttggcagggtcatcc 749
||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||
Sbjct: 227 aggtggttcatgatgacgacctgggaggtgaagctagcagcaacctttgcaggatcatcc 168
Query: 750 ttggagttggaggcgacgtaccctctcttaag 781
|||||||| |||||||||||||| | ||||||
Sbjct: 167 ttggagtttgaggcgacgtacccacgcttaag 136
Database: ../PTA.blast_byTAIR/DB/ATH1_cdna_cm_20040228.fa
Posted date: Jun 25, 2004 12:58 PM
Number of letters in database: 44,058,232
Number of sequences in database: 29,161
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 53,618
Number of Sequences: 29161
Number of extensions: 53618
Number of successful extensions: 1247
Number of sequences better than 10.0: 29
length of query: 1751
length of database: 44,058,232
effective HSP length: 18
effective length of query: 1733
effective length of database: 43,533,334
effective search space: 75443267822
effective search space used: 75443267822
T: 0
A: 40
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 17 (34.2 bits)